; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G010550 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G010550
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationchr03:20298056..20298487
RNA-Seq ExpressionLsi03G010550
SyntenyLsi03G010550
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-5088.33Show/hide
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KGN52797.1 hypothetical protein Csa_014956 [Cucumis sativus]4.2e-5088.52Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]2.7e-4986.78Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]4.6e-4986.78Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-4986.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein2.0e-5088.52Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 336.9e-5188.33Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 11.3e-4986.78Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 12.2e-4986.78Show/hide
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A0A6J5XM33 Uncharacterized protein4.1e-2756.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 335.1e-2754.55Show/hide
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        C+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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Q945T0 Rapid alkalinization factor4.5e-2351.69Show/hide
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        P  L + +   AFF+S +     A     +  W+    +   C G SI EC+    EFE+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+PG
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.4e-2145.93Show/hide
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        G S +  A  +    +   V + S+  ++ S++ +  +   E  C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR 
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        N IPCSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.6e-2064Show/hide
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        C G SI+EC+    E E DS+I+RRILA   YISY ++R N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 15.3e-2454.05Show/hide
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        L   + F +SS  + A   +    ++W +T    + C+G SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY 
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 13.8e-2554.05Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 191.1e-1645.74Show/hide
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AT3G05490.1 ralf-like 222.5e-2164Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.0e-2245.93Show/hide
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AT4G15800.1 ralf-like 333.6e-2854.55Show/hide
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        G S+ P A+ + I T+ F  +       A++S SS  ++  E++CNG +I+EC ++    EFEMDSEINRRILAT+ YISY +LR N +PCSRRG+SYYN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCATTTTCACCATAGCATTCTTCGTCTCTTCGTCCTCTATAACGGCCACGGCGATGAGTAGCGACAGTAGTCTTAGTTGGCTCTCAACCGAAGCTCGATGCAAT
GGGCGTTCGATAAGCGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTG
AGAGCGAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGGGCCGAGGCTAACCCGTATCAGCGGGGTTGTACCGCCATTACTCGT
TGTAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAAGAAGCTCTTTCCCTTGGCAAACTTGGAATTCATTCAAGTGGGAAGGAATGAAGAAGGCAACCATTGGCAACTCTTCTTCTCCACCTGCCTTATGTATG
CTCATTTTCACCATAGCATTCTTCGTCTCTTCGTCCTCTATAACGGCCACGGCGATGAGTAGCGACAGTAGTCTTAGTTGGCTCTCAACCGAAGCTCGATGCAAT
GGGCGTTCGATAAGCGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTG
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TGTAGAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRSSFPWQTWNSFKWEGMKKATIGNSSSPPALCMLIFTIAFFVSSSSITATAMSSDSSLSWLSTEARCNGRSISECMMNIEFEMDSEINRRILATSSYISYKSL
RANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCRS