; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G013590 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G013590
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationchr03:24507575..24508108
RNA-Seq ExpressionLsi03G013590
SyntenyLsi03G013590
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]1.1e-9298.31Show/hide
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XP_022935530.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]8.1e-8893.79Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]5.4e-9297.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein5.3e-9398.31Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.2e-9297.74Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.2e-9297.74Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like5.1e-8895.56Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like3.9e-8893.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 61.1e-3963.64Show/hide
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.5e-3952Show/hide
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        L    + L +Y    I A++  S        ++      ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 256.3e-5183.78Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 61.1e-3963.64Show/hide
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           L +Y  +   A++ S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES7.0e-5077.42Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 254.5e-5283.78Show/hide
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        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  S   A +P +
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein5.0e-5177.42Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCATGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACCCGATTGCGTTTTCGCCCCGTATTTCCCGCCCGAAGAGCCCCA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IRYACSEIPASSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSTSSYGHYYSGLYFSPWSNNNNGPCGDGHDKGEYK