; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G013880 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G013880
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionCytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome locationchr03:24855442..24859992
RNA-Seq ExpressionLsi03G013880
SyntenyLsi03G013880
Gene Ontology termsGO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001750 - NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit
IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AOX48830.1 cytochrome c biogenesis protein [Coccinia grandis]1.3e-4793.97Show/hide
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YP_009431692.1 cytochrome c biogenesis protein [Citrullus rehmii]1.7e-4793.1Show/hide
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YP_009456196.1 cytochrome c biogenesis protein [Lagenaria siceraria]2.4e-4995.69Show/hide
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A0A1P8LE41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA8.4e-4893.1Show/hide
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A0A2I6C0D7 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.2e-4995.69Show/hide
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A0A2Z2CGJ0 Cytochrome c biogenesis protein CcsA6.4e-4893.97Show/hide
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A0A7G9IT87 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.2e-4995.69Show/hide
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A0A7T3UT97 Cytochrome c heme attachment protein5.8e-4994.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1NWJ8 Cytochrome c biogenesis protein CcsA4.0e-3978.45Show/hide
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Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA2.4e-3975.86Show/hide
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Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA1.3e-4079.31Show/hide
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Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA3.0e-5093.1Show/hide
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Q49KU9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA2.0e-3875.86Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein3.0e-2143.26Show/hide
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ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein5.4e-3162.71Show/hide
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ATMG00060.1 NADH dehydrogenase subunit 5C5.8e-0937.72Show/hide
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ATMG00513.1 NADH dehydrogenase 5A5.8e-0937.72Show/hide
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ATMG00665.1 NADH dehydrogenase 5B5.8e-0937.72Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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