; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G014280 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G014280
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionzinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12
Genome locationchr03:25247337..25248392
RNA-Seq ExpressionLsi03G014280
SyntenyLsi03G014280
Gene Ontology termsGO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000058 - Zinc finger, AN1-type
IPR035896 - AN1-like Zinc finger


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008443470.1 PREDICTED: zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 [Cucumis melo]1.1e-10694.36Show/hide
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XP_011652261.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 [Cucumis sativus]5.2e-10491.79Show/hide
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XP_023526966.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-9688.14Show/hide
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XP_023526967.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-9587.63Show/hide
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XP_038906198.1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 [Benincasa hispida]2.0e-10895.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHV5 Uncharacterized protein2.5e-10491.79Show/hide
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A0A1S3B8V3 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 125.4e-10794.36Show/hide
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A0A5D3D0N1 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 125.4e-10794.36Show/hide
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A0A6J1J3K1 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X28.1e-9587.11Show/hide
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        KPTC+ RRCREILTFSNTCVCKTCR+KVCLKHRFPAEH CGR        VD GRWNEKFMAAL LRSGGDCGKR RPTAA GSS   PSVKAC
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A0A6J1J8Q5 zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 12 isoform X18.1e-9587.11Show/hide
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        MAA GGTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSD NSRKVVVCEICS SIETT KDGGDE+RILERHHESGDCDP KKK
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        KPTC+ RRCREILTFSNTCVCKTCR+KVCLKHRFPAEH CGR        VD GRWNEKFMAAL LRSGGDCGKR RPTAA GSS   PSVKAC
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0D5B9 Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 161.7e-3345.77Show/hide
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        GT  FP+LG+HC   DC+Q+DFLPFTCD C  VFCL+HR + SH CP +++    V++C +C+  +     +  ++  I    H + DCDPS      KK
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Query:  PTCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP
          C V  CRE LTFSNT  CK C  + CLKHRF  +H C  P
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Q67YE6 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 121.5e-6158.12Show/hide
Query:  AGGGTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSKKKKP
        AGGGTEAFPDLG HCQ  DC  LDFLPFTCDGC+ VFCLEHR +KSH+CPKSD  SR V +CE CS +IETTG D      +LE+H  SGDCDP+KKKKP
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Query:  TCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRPSSTATAVVDKGRWNEKFMAALGLRSGGDCGKRERPTAAKGSSPTAPSVKA
        TC V+RC+EILTF+N   CK C +K CLKHRFP +H C +            RWNE+FM AL LR+   CG+      +  SS ++PSV++
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Q6H595 Zinc finger AN1 domain-containing stress-associated protein 171.4e-4652.35Show/hide
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        GTEAFPDLG  C   DC+QLDFLPF CDGC K FC EHR ++ H C ++    R VVVCE C  +IE   G  GGD+  +LE H  S  CDP++K+KP C
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Query:  AVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRPSSTATAVVDKGRWNEKFMAALGLRSGGDCGK
         V RC+E LTFSNT  CK C  KVCLKHRFPA+H C        A    G  ++   AA   RS G CG+
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Q8VZ42 Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 119.1e-3547.18Show/hide
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        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +VFCL+HR +  H CPK DR    VV+C +C+  +     +  ++  I    H + DCDPS  +K T  
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Query:  --CAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP
          C V RC+E LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H C  P
Subjt:  --CAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP

Q9SCM4 Zinc finger AN1 and C2H2 domain-containing stress-associated protein 133.1e-3547.18Show/hide
Query:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSK----KKK
        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +V+CL+HR +  HDCPK +R    VV+C +C+  +     +  ++  I    H + DCDPS      KK
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Query:  PTCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP
          C V RCRE+LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H C  P
Subjt:  PTCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41835.1 zinc finger (C2H2 type, AN1-like) family protein6.5e-3647.18Show/hide
Query:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSKKKKPT--
        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +VFCL+HR +  H CPK DR    VV+C +C+  +     +  ++  I    H + DCDPS  +K T  
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Query:  --CAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP
          C V RC+E LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H C  P
Subjt:  --CAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP

AT3G28210.1 zinc finger (AN1-like) family protein1.1e-6258.12Show/hide
Query:  AGGGTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSKKKKP
        AGGGTEAFPDLG HCQ  DC  LDFLPFTCDGC+ VFCLEHR +KSH+CPKSD  SR V +CE CS +IETTG D      +LE+H  SGDCDP+KKKKP
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Query:  TCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRPSSTATAVVDKGRWNEKFMAALGLRSGGDCGKRERPTAAKGSSPTAPSVKA
        TC V+RC+EILTF+N   CK C +K CLKHRFP +H C +            RWNE+FM AL LR+   CG+      +  SS ++PSV++
Subjt:  TCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRPSSTATAVVDKGRWNEKFMAALGLRSGGDCGKRERPTAAKGSSPTAPSVKA

AT3G57480.1 zinc finger (C2H2 type, AN1-like) family protein2.2e-3647.18Show/hide
Query:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSK----KKK
        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +V+CL+HR +  HDCPK +R    VV+C +C+  +     +  ++  I    H + DCDPS      KK
Subjt:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSK----KKK

Query:  PTCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP
          C V RCRE+LTFSNT  C+ C +  CLKHRF  +H C  P
Subjt:  PTCAVRRCREILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRP

AT5G48205.1 zinc ion binding3.8e-1236.36Show/hide
Query:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPS------KK
        GT  FPDLG+HC    C Q+DFLPFTCD C +V CL+H  +  +  P  D N                            ++H    DCDPS      KK
Subjt:  GTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPS------KK

Query:  KKPTCAVRRC
        KK  C V  C
Subjt:  KKPTCAVRRC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCGGCGGAGGAACAGAGGCTTTCCCCGATCTCGGCCGCCACTGCCAGCACTCCGATTGCCACCAACTCGATTTCCTCCCCTTCACCTGCGACGGTTGCCAAAA
GGTGTTCTGTTTGGAGCATCGCGGTTTCAAATCCCACGACTGCCCTAAATCCGATCGGAACAGCAGAAAAGTGGTGGTTTGCGAAATCTGCTCGACGTCGATCGAGACCA
CCGGGAAGGACGGCGGCGACGAGACCAGGATTTTGGAAAGGCATCACGAATCGGGAGATTGCGATCCGAGCAAGAAGAAGAAACCCACATGTGCTGTGAGGCGGTGCCGG
GAAATTCTTACGTTTTCCAATACTTGTGTGTGTAAAACCTGCCGGATGAAGGTGTGTTTGAAGCACCGGTTTCCGGCGGAGCATGGTTGTGGACGGCCGTCGTCGACGGC
AACGGCAGTGGTGGATAAAGGTCGGTGGAATGAGAAGTTTATGGCGGCTTTGGGGTTGAGGAGCGGCGGCGATTGTGGGAAGAGGGAACGTCCGACGGCGGCGAAGGGAT
CTTCTCCGACTGCCCCATCTGTTAAAGCTTGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTCAATTAGAAGCCTATAAATAACTCAAATTTCCTCCATTTTCTTCGCTATTATCTAACAAACCAAATCTTCTTCCACATATTTCATCCTTATTTCTAATCTCCCTTCAC
TTCCAATTCCAAAACCTTCCGACGAACAAATCGCCATGGCCGCCGGCGGAGGAACAGAGGCTTTCCCCGATCTCGGCCGCCACTGCCAGCACTCCGATTGCCACCAACTC
GATTTCCTCCCCTTCACCTGCGACGGTTGCCAAAAGGTGTTCTGTTTGGAGCATCGCGGTTTCAAATCCCACGACTGCCCTAAATCCGATCGGAACAGCAGAAAAGTGGT
GGTTTGCGAAATCTGCTCGACGTCGATCGAGACCACCGGGAAGGACGGCGGCGACGAGACCAGGATTTTGGAAAGGCATCACGAATCGGGAGATTGCGATCCGAGCAAGA
AGAAGAAACCCACATGTGCTGTGAGGCGGTGCCGGGAAATTCTTACGTTTTCCAATACTTGTGTGTGTAAAACCTGCCGGATGAAGGTGTGTTTGAAGCACCGGTTTCCG
GCGGAGCATGGTTGTGGACGGCCGTCGTCGACGGCAACGGCAGTGGTGGATAAAGGTCGGTGGAATGAGAAGTTTATGGCGGCTTTGGGGTTGAGGAGCGGCGGCGATTG
TGGGAAGAGGGAACGTCCGACGGCGGCGAAGGGATCTTCTCCGACTGCCCCATCTGTTAAAGCTTGTTGATTGGAAATTAATTGTATGAACCATAAAATTTGGTGGCAGT
TCCTCCATTTGTTTCATAGAGAAATGGTCATAATTAATAAAGCCTCTCTTTAATAATCTTCTCATAAAAGTTATATTGTAAAGATTAATCCACAAATTTATACATGTAGC
TTTATCAAATTCTTGTTACAAGGATTCAATTGATATTGCTAAGGGCCTACATAATTTTACTAATATTTAATTTTGTGTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAGGGTEAFPDLGRHCQHSDCHQLDFLPFTCDGCQKVFCLEHRGFKSHDCPKSDRNSRKVVVCEICSTSIETTGKDGGDETRILERHHESGDCDPSKKKKPTCAVRRCR
EILTFSNTCVCKTCRMKVCLKHRFPAEHGCGRPSSTATAVVDKGRWNEKFMAALGLRSGGDCGKRERPTAAKGSSPTAPSVKAC