; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G015780 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G015780
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein SRC1
Genome locationchr03:26813736..26814050
RNA-Seq ExpressionLsi03G015780
SyntenyLsi03G015780
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR039285 - Dehydrin HIRD11-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596975.1 Protein SRC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-2373.58Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SS
        M+G +EKIGEKLHIGGDH K EHKGEHH+  K +H  E KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHGD HD+KGEK  KKKK++KKKGE  HH+GGH SS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SS

Query:  SDSDSD
        SDSDSD
Subjt:  SDSDSD

XP_008443295.1 PREDICTED: protein SRC1 [Cucumis melo]2.3e-2978.1Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHDGGHSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGD     HKGEHHDAHKG+HHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIHG      EK EKKKK++KKKGEH H H GG SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHDGGHSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

XP_011652200.1 protein SRC1 [Cucumis sativus]9.8e-2575.68Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDA----HKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEG-HKEGLIDKIKDKIH-GDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHD
        MSGFIEKIGEKLHIGGD     HKGEHHDA    HKG+HHDEHKKH   EEHHGEG HKEG++DKIKDKIH GDH E  EK EKKKK++KKKGEH H H+
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDA----HKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEG-HKEGLIDKIKDKIH-GDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHD

Query:  GGHSSSDSDSD
        GG SSSDSDSD
Subjt:  GGHSSSDSDSD

XP_022942109.1 protein SRC1-like [Cucurbita moschata]1.1e-2373.58Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SS
        M+G +EKIGEKLHIGGDH K EHKGEHH+    D H+  KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHGD HDEKGEK  KKKK++KKKGE  HH+GGH SS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SS

Query:  SDSDSD
        SDSDSD
Subjt:  SDSDSD

XP_038903205.1 protein SRC1 [Benincasa hispida]3.1e-3988.46Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGHSSSD
        MSGFIEKIGEKLHIGGDHN    KGEHHD HKG+HHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLI+KIKDKIHGDHDEKGEK +K+KK++KKKGEHHHHDGGHSSSD
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGHSSSD

Query:  SDSD
        SDSD
Subjt:  SDSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B8E4 protein SRC11.1e-2978.1Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHDGGHSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGD     HKGEHHDAHKG+HHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIHG      EK EKKKK++KKKGEH H H GG SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHDGGHSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

A0A5A7UF86 Zinc transporter ZIP61.1e-2978.1Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHDGGHSSS
        MSGFIEKIGEKLHIGGD     HKGEHHDAHKG+HHDEHKKH K EEHHGEGHKEG+I+KIKDKIHG      EK EKKKK++KKKGEH H H GG SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEH-HHHDGGHSSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

A0A6J1FQD3 protein SRC1-like5.2e-2473.58Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SS
        M+G +EKIGEKLHIGGDH K EHKGEHH+    D H+  KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHGD HDEKGEK  KKKK++KKKGE  HH+GGH SS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGD-HDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SS

Query:  SDSDSD
        SDSDSD
Subjt:  SDSDSD

A0A6J1I7B7 protein SRC1-like4.9e-2267.62Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SSS
        MSG +EKIGEKLHIGGDH K EHKG+HH+    D H+  KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHG  D   EK EKKKKK++KK +  H +GGH SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

A0A6J1IAZ2 protein SRC1-like2.2e-2268.57Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SSS
        MSG +EKIGEKLHIGGDH K EHKGEHH+    D H+  KKHG+  EHHGEGHKEGL++KIKDKIHG  D   EK EKKKKK++KK +  H +GGH SSS
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH-SSS

Query:  DSDSD
        DSDSD
Subjt:  DSDSD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04132 Protein SRC14.0e-2166.67Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHH----DAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH
        MSG I KI E LH+GG H K EHKGEHH      HKG+HH EHK   K E+HHGE HKEGL+DKIKDKIHGD  +KG   EKKKKK+KKK EH H   GH
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHH----DAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH

Query:  SSSDSDSD
        SSS SDSD
Subjt:  SSSDSDSD

Q9SLJ2 Dehydrin HIRD112.4e-1350.93Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH
        M+G I KIG+ LHIGG + + EHK E          +EHKKH   +EH    HKEG++DKIKDKIHG     HD +G+  + +KKK+K K E  HHD GH
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH

Query:  SSSDSDSD
         SS SDSD
Subjt:  SSSDSDSD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54410.1 dehydrin family protein1.7e-1450.93Show/hide
Query:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH
        M+G I KIG+ LHIGG + + EHK E          +EHKKH   +EH    HKEG++DKIKDKIHG     HD +G+  + +KKK+K K E  HHD GH
Subjt:  MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHG----DHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGH

Query:  SSSDSDSD
         SS SDSD
Subjt:  SSSDSDSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGGATTCATCGAGAAAATTGGTGAGAAGCTCCATATTGGAGGAGATCACAACAAAGCCGAGCATAAAGGTGAGCATCACGATGCCCACAAAGGCGACCATCACGA
TGAACACAAGAAGCACGGCAAATCGGAGGAGCACCATGGAGAAGGCCATAAGGAAGGGCTGATTGACAAGATCAAGGACAAGATCCATGGCGATCATGATGAGAAAGGTG
AGAAAGCCGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGCACCACCACCACGACGGCGGCCATAGCAGCAGCGATAGCGACAGCGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGGATTCATCGAGAAAATTGGTGAGAAGCTCCATATTGGAGGAGATCACAACAAAGCCGAGCATAAAGGTGAGCATCACGATGCCCACAAAGGCGACCATCACGA
TGAACACAAGAAGCACGGCAAATCGGAGGAGCACCATGGAGAAGGCCATAAGGAAGGGCTGATTGACAAGATCAAGGACAAGATCCATGGCGATCATGATGAGAAAGGTG
AGAAAGCCGAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGGGTGAGCACCACCACCACGACGGCGGCCATAGCAGCAGCGATAGCGACAGCGACTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGFIEKIGEKLHIGGDHNKAEHKGEHHDAHKGDHHDEHKKHGKSEEHHGEGHKEGLIDKIKDKIHGDHDEKGEKAEKKKKKEKKKGEHHHHDGGHSSSDSDSD