; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G018370 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G018370
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionNDR1/HIN1-Like protein 3-like
Genome locationchr03:29818529..29820331
RNA-Seq ExpressionLsi03G018370
SyntenyLsi03G018370
Gene Ontology termsGO:0098542 - defense response to other organism (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR044839 - Protein NDR1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0043824.1 NDR1/HIN1-Like protein 3-like [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-6985.09Show/hide
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KAE8651106.1 hypothetical protein Csa_001623 [Cucumis sativus]6.0e-7587.86Show/hide
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TYK25308.1 NDR1/HIN1-Like protein 3-like [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-7486.13Show/hide
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XP_004136710.2 uncharacterized protein LOC101218041 [Cucumis sativus]8.6e-7488.24Show/hide
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XP_038904446.1 NDR1/HIN1-like protein 10 [Benincasa hispida]1.3e-7790.17Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBJ3 LEA_2 domain-containing protein3.7e-7086.96Show/hide
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A0A1S3B7X9 NDR1/HIN1-Like protein 3-like6.9e-6985.53Show/hide
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A0A5A7TKH6 NDR1/HIN1-Like protein 3-like1.8e-6985.09Show/hide
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A0A5D3DNY5 NDR1/HIN1-Like protein 3-like1.4e-7486.13Show/hide
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A0A6J1KYH7 NDR1/HIN1-like protein 31.3e-6272.83Show/hide
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        VL+L+SL I+WLITM NK+KF V  A+LTQFNFTDD+QLLF L++NM VKNPNR F VFFD I+V +LYQDIKFSN S+SPFYQGQ+G  LL L+FDGQQ
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        LMNL+AEQLAVF LEKLV+IF++K+EL L +RV I LI+IKL PKV CGLNLPLIS GR+F RF+IIGC+VAY
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C615 Putative syntaxin-248.0e-1431.43Show/hide
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        +N VKFQV +A LT F+   ++ L + LSLN++++N      + +D  +  V Y + +   V +  FY G +   LL   F+GQ L+ L   +   F  +
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Query:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI-GLIRIKLNPKVRCGLNLPL
        +   ++ I V+L ++ RV +  L+   + P VRC L +PL
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Q9FI03 NDR1/HIN1-like protein 261.2e-0632.35Show/hide
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        +L+ +F++WLI    + +F +T A++   N T  S  L   S+ +T+  KNPN+   +++D + V   Y+  +  S  SL PFYQ  E  +LL     G 
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Query:  QL
        +L
Subjt:  QL

Q9FNH6 NDR1/HIN1-like protein 38.8e-2136Show/hide
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        VL+ I+  I+WLI   N +KF VT+A LT+F     + L + L LN T++NPNR   V++D I+V   Y D +F  + ++S FYQG +  +++  +  GQ
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Query:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRCGLNLPLISHGRSFFRFRIIGCYVAY
        QL+ LD  +      +    I+ I  +L L +R + GLI+  +  PK++C L +PL S+  S F F+   C V +
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Q9SJ52 NDR1/HIN1-like protein 108.2e-1933.76Show/hide
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        V++ ++  I WLI     +KF VT+A+LT+F+ T  D+ L + L+L + V+NPN+   +++D I+    Y+  +FS ++L+PFYQG +  ++L   F GQ
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Query:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRC-GLNLPL
         L+  +A Q      E++  +++I+++  L +R ++G ++  ++ PKV C  L LPL
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Q9SRN1 NDR1/HIN1-like protein 22.0e-1733.14Show/hide
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        V++ ++  ILWLI   N VKF V +ANL +F+F  ++ L + L LN T++NPN+   V++D   V   Y D +F + ++S FYQG +  +++  + +GQ 
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Query:  LMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRC-GLNLPL-ISHGRSFFRFRIIGC
        L+ L          ++   I+ I  +L L +R +   I+  KL PK++C  L +PL  S+    F+F+ + C
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32270.1 syntaxin, putative5.7e-1531.43Show/hide
Query:  TNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLE
        +N VKFQV +A LT F+   ++ L + LSLN++++N      + +D  +  V Y + +   V +  FY G +   LL   F+GQ L+ L   +   F  +
Subjt:  TNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQLAVFTLE

Query:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI-GLIRIKLNPKVRCGLNLPL
        +   ++ I V+L ++ RV +  L+   + P VRC L +PL
Subjt:  KLVDIFSIKVELLLHMRVQI-GLIRIKLNPKVRCGLNLPL

AT2G35460.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family4.2e-1832.76Show/hide
Query:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDS-QLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQ
        V + +   ILW I   N VKFQVT A+LT+F F   S  L + +SLN +++NPN+   + +D ++V   Y D +FS  +++ FYQG +  +++    +GQ
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Query:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRCGLNLPL-ISHGRSFFRFRIIGCYV
        +L+ L A     F  ++   ++ I V+L   +R + G +    + PK++C L +PL  S     F+F    C+V
Subjt:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRCGLNLPL-ISHGRSFFRFRIIGCYV

AT2G35980.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family5.8e-2033.76Show/hide
Query:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTD-DSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQ
        V++ ++  I WLI     +KF VT+A+LT+F+ T  D+ L + L+L + V+NPN+   +++D I+    Y+  +FS ++L+PFYQG +  ++L   F GQ
Subjt:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTD-DSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQ

Query:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRC-GLNLPL
         L+  +A Q      E++  +++I+++  L +R ++G ++  ++ PKV C  L LPL
Subjt:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRC-GLNLPL

AT3G11650.1 NDR1/HIN1-like 21.4e-1833.14Show/hide
Query:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQ
        V++ ++  ILWLI   N VKF V +ANL +F+F  ++ L + L LN T++NPN+   V++D   V   Y D +F + ++S FYQG +  +++  + +GQ 
Subjt:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQ

Query:  LMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRC-GLNLPL-ISHGRSFFRFRIIGC
        L+ L          ++   I+ I  +L L +R +   I+  KL PK++C  L +PL  S+    F+F+ + C
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AT5G06320.1 NDR1/HIN1-like 36.2e-2236Show/hide
Query:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFS-NVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQ
        VL+ I+  I+WLI   N +KF VT+A LT+F     + L + L LN T++NPNR   V++D I+V   Y D +F  + ++S FYQG +  +++  +  GQ
Subjt:  VLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFS-NVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQ

Query:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRCGLNLPLISHGRSFFRFRIIGCYVAY
        QL+ LD  +      +    I+ I  +L L +R + GLI+  +  PK++C L +PL S+  S F F+   C V +
Subjt:  QLMNLDAEQLAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRI-KLNPKVRCGLNLPLISHGRSFFRFRIIGCYVAY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGGTTTTAATTCTCATTTCCTTGTTCATCTTATGGCTCATCACCATGACCAATAAAGTCAAATTCCAAGTGACCAACGCCAACCTGACCCAATTCAACTTCACCGA
CGACAGCCAACTCCTCTTCCAACTCAGCCTTAACATGACTGTCAAAAACCCTAATCGCGGCTTTGAAGTTTTCTTTGACAGCATCAAAGTGGTTGTGTTGTATCAAGACA
TTAAGTTTAGCAACGTATCGCTGTCGCCATTTTACCAAGGCCAAGAGGGAAGAAGCTTGCTGAATTTAAGGTTTGATGGTCAGCAATTGATGAATCTTGACGCTGAGCAG
CTGGCTGTGTTCACTCTTGAGAAACTTGTTGATATCTTCTCTATTAAAGTGGAGCTTCTTCTTCATATGAGGGTTCAGATTGGTCTCATTAGGATCAAACTCAATCCCAA
GGTTCGTTGTGGCCTTAATCTTCCCTTGATTTCTCATGGAAGATCGTTTTTTCGCTTTCGGATTATTGGATGCTATGTCGCTTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGGTTTTAATTCTCATTTCCTTGTTCATCTTATGGCTCATCACCATGACCAATAAAGTCAAATTCCAAGTGACCAACGCCAACCTGACCCAATTCAACTTCACCGA
CGACAGCCAACTCCTCTTCCAACTCAGCCTTAACATGACTGTCAAAAACCCTAATCGCGGCTTTGAAGTTTTCTTTGACAGCATCAAAGTGGTTGTGTTGTATCAAGACA
TTAAGTTTAGCAACGTATCGCTGTCGCCATTTTACCAAGGCCAAGAGGGAAGAAGCTTGCTGAATTTAAGGTTTGATGGTCAGCAATTGATGAATCTTGACGCTGAGCAG
CTGGCTGTGTTCACTCTTGAGAAACTTGTTGATATCTTCTCTATTAAAGTGGAGCTTCTTCTTCATATGAGGGTTCAGATTGGTCTCATTAGGATCAAACTCAATCCCAA
GGTTCGTTGTGGCCTTAATCTTCCCTTGATTTCTCATGGAAGATCGTTTTTTCGCTTTCGGATTATTGGATGCTATGTCGCTTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKVLILISLFILWLITMTNKVKFQVTNANLTQFNFTDDSQLLFQLSLNMTVKNPNRGFEVFFDSIKVVVLYQDIKFSNVSLSPFYQGQEGRSLLNLRFDGQQLMNLDAEQ
LAVFTLEKLVDIFSIKVELLLHMRVQIGLIRIKLNPKVRCGLNLPLISHGRSFFRFRIIGCYVAY