CuGenDBv2

Gene ID	Lsi03G021670
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Tubulin beta chain
Genome location	chr03:32775128..32777506
RNA-Seq Expression	Lsi03G021670
Synteny	Lsi03G021670
Gene Ontology terms	GO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process) GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005874 - microtubule (cellular component) GO:0005525 - GTP binding (molecular function) GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily IPR023123 - Tubulin, C-terminal IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain IPR017975 - Tubulin, conserved site IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain IPR002453 - Beta tubulin IPR000217 - Tubulin

Homology

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QFZ79247.1 tubulin beta chain-like protein [Luffa aegyptiaca]

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AT5G62700.1 tubulin beta chain 3

1.1e-256

95.29

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Sequences

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CDS sequence

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TGGTGATTCCGATCTTCAACTTGACCGGATTAATGTATACTACAATGAAGCCAGTTGCGGCCGATTTGTTCCTCGTGCTGTGCTTATGGATCTTGAGCCTGGTGTTATGG
ATAGTATCAGATCTGGACCTTACGGTCAGGTTTTCAGACCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCTGGTGCTGGAAACAACTGGGCTAAAGGACATTACACCGAAGGTGCC
GAGCTTATTGATTCTGTTCTTGATGTTGTTCGTAAGGAGGCTGAGAACTGTGACTGCCTGCAAGGGTTTCAGGTGTGCCATTCTTTGGGAGGAGGGACCGGATCTGGAAT
GGGAACTCTTCTGATTTCCAAGATCAGAGAAGAATACCCTGATAGAATGATGCTTACGTTCTCCGTTTTCCCATCTCCTAAAGTTTCTGATACTGTTGTTGAGCCTTACA
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ATCAATGTTCAGAACAAGAATTCTTCATACTTCGTTGAATGGATCCCCAATAATGTGAAATCTACAGTCTGTGATATCCCTCCAACTGGGTTGAAAATGGCCTCAACTTT
CCTTGGGAATTCAACATCGATCCAAGAGATGTTTCGCCGTGTTAGTGAGCAGTTTACGGCTATGTTTAGGAGGAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGGGAGGGTATGG
ATGAGATGGAGTTTACTGAGGCTGAAAGCAATATGAATGATCTGGTTTCTGAGTATCAGCAATACCAAGATGCTACGGCTGAAGATGAAGAATACTACGAAGATGAAGAT
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mRNA sequence

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CTATAAAGATCCCTCCGTCCCCACTTTTCCCTTTAACTTCATTTCTCTTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTAGGGTTTCTTCTACCTTTTCTCTGGTTTTT
CAATTTCGATTTCAATTTTCACTTCCCATTTCTTGTAAAAATGCGTGAGATTCTTCACATCCAAGGTGGCCAATGTGGCAACCAGATCGGTGCCAAGTTCTGGGAAGTGG
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CCTCGTGCTGTGCTTATGGATCTTGAGCCTGGTGTTATGGATAGTATCAGATCTGGACCTTACGGTCAGGTTTTCAGACCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCTGGTGC
TGGAAACAACTGGGCTAAAGGACATTACACCGAAGGTGCCGAGCTTATTGATTCTGTTCTTGATGTTGTTCGTAAGGAGGCTGAGAACTGTGACTGCCTGCAAGGGTTTC
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CCATCTCCTAAAGTTTCTGATACTGTTGTTGAGCCTTACAACGCAACCCTCTCTGTTCATCAACTTGTTGAAAACGCCGACGAGTGTATGGTACTTGATAACGAGGCTCT
CTACGATATTTGCTTCCGTACCTTGAAGCTGTCCACTCCAAGCTTCGGTGATCTTAACCATCTGATTTCTGCAACAATGTCTGGTGTGACCTGCTGCTTGCGATTCCCTG
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TTTTATTTTGATAATTCACCGGACAGGAGGTAAGCATTTGAATTGGAATTGCTATTGATCTGTGTCACATATATATGAATTCTGCAATGACGCAACAATTACTTGTGGTT
GTTCAATTAGAATTTGAGAGTTCGCACATGGATGCTGCCCTCTTATTCAAAGCAAACAACATGGTTTGTTCACTTTCTGAATCTAAGATAGATCTAGTGCTAGTGTTCTT
C

Protein sequence

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INVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFLGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEDEEYYEDED
GVEHDE

Lsi03G021670 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome