; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G022100 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G022100
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationchr03:33134177..33141006
RNA-Seq ExpressionLsi03G022100
SyntenyLsi03G022100
Gene Ontology termsGO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR013830 - SGNH hydrolase-type esterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily
IPR045136 - Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase Iah1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580476.1 GDSL esterase/lipase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.1e-7277.54Show/hide
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KAG7017226.1 GDSL esterase/lipase [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.1e-7277.54Show/hide
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XP_022934480.1 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X1 [Cucurbita moschata]4.1e-7277.54Show/hide
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XP_022934481.1 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X2 [Cucurbita moschata]4.1e-7277.54Show/hide
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XP_038903461.1 GDSL esterase/lipase CPRD49-like [Benincasa hispida]3.0e-7580.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1F1X9 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X22.0e-7277.54Show/hide
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A0A6J1F7U0 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X12.0e-7277.54Show/hide
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A0A6J1J303 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X39.8e-7277.01Show/hide
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A0A6J1J6J0 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X29.8e-7277.01Show/hide
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A0A6J1J830 GDSL esterase/lipase At2g38180-like isoform X19.8e-7277.01Show/hide
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        NMKKI +HLKSLSEKTRVIFLTAPPVSYALIKEKLSEE A+CRTLESCRKYAEAC ELC+ IDVKCIDVWSAIQKRDDWLTSCFT G
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80443 GDSL esterase/lipase At2g381808.3e-4451.87Show/hide
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        MVGP RP  VLFGSSIVQ SF D GWG+ LA+LY+R                          KD+ IQPSLVIVYFGGND+  P P+    +VPL E++E
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        NM+KI  HL SLS+KTRVIFLT PP++   I E +  +  + R+ E CR YAE  + LC  I+VK ID+W+AIQ++DDWL SCFT G
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Q3SZ16 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog3.4e-1328.49Show/hide
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        P  +LFG SI Q SF  GGWG+ LA++  RK   +                            P  V ++FG ND+ L    +   +VPL E+V N++ +
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Query:  ALHLKSLS-EKTRVIFLTAPPVSYALIKEKLSEELAECRTLES-CRKYAEACIELCEMIDVKCIDVWSAIQK
          +L+S+   + R+I +T PP+  A   ++  ++  +   L S   +YA AC+++ +      +D+WS +QK
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Q6NMR9 GDSL esterase/lipase At5g459201.9e-1934.02Show/hide
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        LFG SI + SF DGGWG+ LA+L  RK                             D    P+ V V+FG NDA LP   S   +VPL EY +N++ I  
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Query:  HLKSLSEKTRVIFLTAPPVS------YALIKEKLSEELAECRTLESCRKYAEACIELCEMIDVKCIDVWSAIQKRDDWLTSCFTLGWDSFNSRR
         LK+   +T +I +T PP+       Y  I+   +  L E RT E    YA+ACI + E   +   D+WS +Q+  +W T C    WD  +  R
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Q9FM04 GDSL esterase/lipase At5g629303.1e-2235.16Show/hide
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        RP  VLFG SI   SF  GGWGS LA+ Y+RK                           S+  P    ++FG NDA L   TS   +VP+ EY +N++KI
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          HLK  S    ++ +T PP+      SYA  +  EK  +E    RT E+   YA+ C+ L E + ++C+++WS +Q+ +DW
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Q9SRM5 GDSL esterase/lipase CPRD491.4e-4651.06Show/hide
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        MVGPARP  VLFGSSIVQ+SFG GGWG+IL+ +YAR                          KD+A+QPSLVIVYFGGND++ P  +    +VPL EYV+
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        NMKKIALHL+SLS+ TR+IFL++PPV  A +++  S  L+E  RT + C+ Y++AC+ELC+ + ++ +D++S  QK DDW T CFT G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38180.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein5.9e-4551.87Show/hide
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        MVGP RP  VLFGSSIVQ SF D GWG+ LA+LY+R                          KD+ IQPSLVIVYFGGND+  P P+    +VPL E++E
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        NM+KI  HL SLS+KTRVIFLT PP++   I E +  +  + R+ E CR YAE  + LC  I+VK ID+W+AIQ++DDWL SCFT G
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AT3G11210.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein9.7e-4851.06Show/hide
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        MVGPARP  VLFGSSIVQ+SFG GGWG+IL+ +YAR                          KD+A+QPSLVIVYFGGND++ P  +    +VPL EYV+
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        NMKKIALHL+SLS+ TR+IFL++PPV  A +++  S  L+E  RT + C+ Y++AC+ELC+ + ++ +D++S  QK DDW T CFT G
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AT5G45920.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein1.3e-2034.02Show/hide
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        LFG SI + SF DGGWG+ LA+L  RK                             D    P+ V V+FG NDA LP   S   +VPL EY +N++ I  
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Query:  HLKSLSEKTRVIFLTAPPVS------YALIKEKLSEELAECRTLESCRKYAEACIELCEMIDVKCIDVWSAIQKRDDWLTSCFTLGWDSFNSRR
         LK+   +T +I +T PP+       Y  I+   +  L E RT E    YA+ACI + E   +   D+WS +Q+  +W T C    WD  +  R
Subjt:  HLKSLSEKTRVIFLTAPPVS------YALIKEKLSEELAECRTLESCRKYAEACIELCEMIDVKCIDVWSAIQKRDDWLTSCFTLGWDSFNSRR

AT5G62930.1 SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein2.2e-2335.16Show/hide
Query:  RPLFVLFGSSIVQLSFGDGGWGSILANLYARK--------------------------DSAIQPSLVIVYFGGNDAVLPFPTSQVSYVPLPEYVENMKKI
        RP  VLFG SI   SF  GGWGS LA+ Y+RK                           S+  P    ++FG NDA L   TS   +VP+ EY +N++KI
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Query:  ALHLKSLSEKTRVIFLTAPPV------SYA--LIKEKLSEELAECRTLESCRKYAEACIELCEMIDVKCIDVWSAIQKRDDW
          HLK  S    ++ +T PP+      SYA  +  EK  +E    RT E+   YA+ C+ L E + ++C+++WS +Q+ +DW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAGGGCCGGCGAGACCTCTTTTTGTGCTATTTGGTTCTTCCATAGTTCAATTGAGCTTTGGCGATGGCGGATGGGGTTCTATTCTTGCCAATTTGTACGCCCGTAA
GGACAGTGCCATTCAACCTTCATTGGTGATAGTTTACTTTGGTGGCAATGATGCTGTGCTTCCTTTCCCTACTTCTCAGGTCTCTTATGTACCACTTCCTGAATATGTTG
AGAACATGAAGAAGATAGCTCTTCATCTCAAGAGCCTCTCGGAGAAAACCCGAGTCATCTTCCTCACAGCTCCGCCCGTGAGCTATGCCTTAATTAAAGAAAAACTGAGC
GAGGAGCTCGCTGAATGTCGAACATTGGAGTCCTGTCGCAAATACGCCGAGGCTTGTATAGAACTTTGCGAGATGATCGACGTGAAATGCATAGATGTTTGGTCTGCTAT
TCAGAAGAGAGATGACTGGCTCACTTCTTGCTTCACGTTAGGATGGGATTCATTTAACAGCAGAAGGAAGCCAGATAGTTGCAGAGGAAATTTTGAAGGTTTTAGAAGAG
GCAGACTGGGAGCCAAGTTTGCACTGGAAAGCATTGCCAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCCCTAACATCATACTCATCCACTACAAAGAAGCAAAAAAATGTTGGAATCCAATCCAACGGCTGTTAAGAAGCCGTCATAACGTTTGGTTGGAAATTTTTCCTATAAA
TTGGGGAGTGGATGGATCTACTTCTTCTGTGGAAGTGGATAAAGCCGTATCTTTGGAGTCAGATCAATTCAATAGTACTGGATTCTGGAAAATGGTAGGGCCGGCGAGAC
CTCTTTTTGTGCTATTTGGTTCTTCCATAGTTCAATTGAGCTTTGGCGATGGCGGATGGGGTTCTATTCTTGCCAATTTGTACGCCCGTAAGGACAGTGCCATTCAACCT
TCATTGGTGATAGTTTACTTTGGTGGCAATGATGCTGTGCTTCCTTTCCCTACTTCTCAGGTCTCTTATGTACCACTTCCTGAATATGTTGAGAACATGAAGAAGATAGC
TCTTCATCTCAAGAGCCTCTCGGAGAAAACCCGAGTCATCTTCCTCACAGCTCCGCCCGTGAGCTATGCCTTAATTAAAGAAAAACTGAGCGAGGAGCTCGCTGAATGTC
GAACATTGGAGTCCTGTCGCAAATACGCCGAGGCTTGTATAGAACTTTGCGAGATGATCGACGTGAAATGCATAGATGTTTGGTCTGCTATTCAGAAGAGAGATGACTGG
CTCACTTCTTGCTTCACGTTAGGATGGGATTCATTTAACAGCAGAAGGAAGCCAGATAGTTGCAGAGGAAATTTTGAAGGTTTTAGAAGAGGCAGACTGGGAGCCAAGTT
TGCACTGGAAAGCATTGCCAATTGAATTTGGTAGTCCAGCTAAACTATCCCCTGAAAGGCAATGGTGGGGTAAGAGATCGAACCTCTGACGTCGAGATTGAGGTTGATAG
TACATACTCGATGTAAATTGAGTTATACTCTTTTTGGCAAACCACCCTTACTTTTGTACTAAATTTTTGTTGATAAATTGATAGATTGTAGGGAGGGATTACAATTTAAC
CTTCGATTTTTTTTTTATTACCAAGAAAATTCAAACATTTCATATCTTGATCATCTTTTAAGGGGACACATGGCCTATCATTTTGTTTCTACCTTGTAAGCCAACGTCTT
CTCTCTATTTCACTTAGTTGAATGTATTTTTAAAATATAAATTGAAATTTTAAATCGACTAGAAAGAAAATTAATGTTTGCAGTTAAATCAGCTCCTTAGATTTTTTTAA
ACCTTTTATTATATATATTTGAAAGGTTAAACTACAGATTTAGTTATGAATTTTATGTGTCGATTTGGTCACTAGGTCGACCTACTTGATAGCTTTTTTTTTAATAATGA
CATAAGCTCGAAAATTGTTGTACTAAATTTGTAATTTAACCCATTACAAATTTAAAATTTAAAACTCAATCAATCAATTGAAAAAAATAATTGTGCATCTTAAACGATTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EELAECRTLESCRKYAEACIELCEMIDVKCIDVWSAIQKRDDWLTSCFTLGWDSFNSRRKPDSCRGNFEGFRRGRLGAKFALESIAN