; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi03G022320 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi03G022320
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionmitochondrial succinate-fumarate transporter 1
Genome locationchr03:33340374..33345111
RNA-Seq ExpressionLsi03G022320
SyntenyLsi03G022320
Gene Ontology termsGO:0015741 - fumarate transport (biological process)
GO:0015744 - succinate transport (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR018108 - Mitochondrial substrate/solute carrier
IPR023395 - Mitochondrial carrier domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7027886.1 Mitochondrial succinate-fumarate transporter 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-5685.71Show/hide
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XP_004137702.1 mitochondrial succinate-fumarate transporter 1 [Cucumis sativus]1.7e-5685.61Show/hide
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XP_022145724.1 mitochondrial succinate-fumarate transporter 1 [Momordica charantia]2.6e-5784.62Show/hide
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XP_022971508.1 mitochondrial succinate-fumarate transporter 1-like [Cucurbita maxima]1.0e-5686.33Show/hide
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XP_038906113.1 mitochondrial succinate-fumarate transporter 1 [Benincasa hispida]2.0e-5786.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LA59 Uncharacterized protein8.2e-5785.61Show/hide
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A0A1S3B5K9 mitochondrial succinate-fumarate transporter 18.2e-5785.61Show/hide
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A0A5A7TQQ9 Mitochondrial succinate-fumarate transporter 18.2e-5785.61Show/hide
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A0A6J1CW40 mitochondrial succinate-fumarate transporter 11.3e-5784.62Show/hide
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A0A6J1I723 mitochondrial succinate-fumarate transporter 1-like4.8e-5786.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F1R4U0 Tricarboxylate transport protein B, mitochondrial8.0e-0935.54Show/hide
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        P    ++G + G +E C   P + +KT+LQLD       YKGI+ C        G  GL    + L      K A+R G    L    ++ E+GKL +  
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         LI G GAGV EA+V+V P E
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P33303 Succinate/fumarate mitochondrial transporter4.0e-0830.23Show/hide
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        KK+  P +  ++G   G+ EA C  P+D IK R+Q+ R  A        G I  G T            GL      +  K A+R  S    +T     E
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        +G +S     ++G GAG+ EA+++V P E
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P38152 Tricarboxylate transport protein7.3e-1034.38Show/hide
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        ++TK  + P    ++GSL G  EAC   P +  KTRLQL D++           YK     G      G   F    T K  +R      ++   ++SET
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        G+LS    +I+G GAG+LE++  VTPFE
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Q6PGY3 Tricarboxylate transport protein A, mitochondrial1.0e-0832.54Show/hide
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        +K   P+    +G + G +E C   P + +KT+LQLD       Y+GI  C        G  GL    + L      K A+R G+  +L    +++ TG+
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Query:  LSNHARLISGFGAGVLEALVIVTPFE
        L N A L+ G GAG+ EA+++V P E
Subjt:  LSNHARLISGFGAGVLEALVIVTPFE

Q9M038 Mitochondrial succinate-fumarate transporter 12.0e-4776.61Show/hide
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        +KK IPPYMKA+SGSLGGV+EACCLQPIDVIKTRLQLDR GAYKGI HCG+             GLTPFATHLTLKY LRMGSNAM QTAFK+SETGK+S
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Query:  NHARLISGFGAGVLEALVIVTPFE
        N  R +SGFGAGVLEAL IVTPFE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G01340.1 Mitochondrial substrate carrier family protein1.4e-4876.61Show/hide
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        +KK IPPYMKA+SGSLGGV+EACCLQPIDVIKTRLQLDR GAYKGI HCG+             GLTPFATHLTLKY LRMGSNAM QTAFK+SETGK+S
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Query:  NHARLISGFGAGVLEALVIVTPFE
        N  R +SGFGAGVLEAL IVTPFE
Subjt:  NHARLISGFGAGVLEALVIVTPFE

AT5G19760.1 Mitochondrial substrate carrier family protein5.5e-0531.25Show/hide
Query:  ISGSLGGVMEACCLQPIDVIKTRLQLDRSGA----------------YKGIIHCGATGLTPFATHLTLKYALRMGSNAMLQTAFKESETGK-LSNHARLI
        ++G   G++  C +QPID+IK R+QL +  A                YKG+    + GL   AT+ T     R+GS  +L     ES  GK L  + + +
Subjt:  ISGSLGGVMEACCLQPIDVIKTRLQLDRSGA----------------YKGIIHCGATGLTPFATHLTLKYALRMGSNAMLQTAFKESETGK-LSNHARLI

Query:  SGFGAGVLEALV
         G  AG + A V
Subjt:  SGFGAGVLEALV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAATAATAATACAACGCGAGAGGAAGGTGGACGAGGAAAGAGCGACGATTAAGGGTTTTGGAGACCGGAAAAATGGAGAATTAGGAAGCTCGTCGGGTGAATACGG
AACAGAGATCGACGAAGAAATCGATTCCTCCATATATGAAGGCGATGGAAGGTGGACGAGGAAAGAGCTACGACTAAGGGTTTTGGAGACCGGAAAAATGGAGAATCAGG
AAGCTCGTCGGGTGAATACGGAACAGAGATCGACGAAGAAATCGATTCCTCCATATATGAAGGCGATCTCCGGTTCTCTCGGAGGGGTAATGGAGGCCTGTTGTCTACAG
CCGATTGATGTTATCAAGACTAGGTTACAGCTCGATCGGAGCGGGGCGTACAAGGGGATCATTCACTGTGGAGCTACGGGATTGACTCCGTTTGCTACGCATCTGACCTT
GAAATATGCGCTTCGCATGGGGTCCAATGCAATGCTTCAGACCGCGTTTAAGGAATCTGAGACTGGAAAACTCAGCAATCATGCTCGTCTGATTTCTGGATTCGGTGCCG
GGGTTTTGGAGGCTCTCGTCATTGTTACTCCATTTGAGAATGAGATTCCAATTAAAGCCCTGGCATTGCCTTTTCCGGATGAGCAGTATATTACTTTTTGGTTGGGACTG
GTGTTCCTTAATACCGCCATTCTCCGTCTTCCTATCTACTTACTATCCTCCTTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAATAATAATACAACGCGAGAGGAAGGTGGACGAGGAAAGAGCGACGATTAAGGGTTTTGGAGACCGGAAAAATGGAGAATTAGGAAGCTCGTCGGGTGAATACGG
AACAGAGATCGACGAAGAAATCGATTCCTCCATATATGAAGGCGATGGAAGGTGGACGAGGAAAGAGCTACGACTAAGGGTTTTGGAGACCGGAAAAATGGAGAATCAGG
AAGCTCGTCGGGTGAATACGGAACAGAGATCGACGAAGAAATCGATTCCTCCATATATGAAGGCGATCTCCGGTTCTCTCGGAGGGGTAATGGAGGCCTGTTGTCTACAG
CCGATTGATGTTATCAAGACTAGGTTACAGCTCGATCGGAGCGGGGCGTACAAGGGGATCATTCACTGTGGAGCTACGGGATTGACTCCGTTTGCTACGCATCTGACCTT
GAAATATGCGCTTCGCATGGGGTCCAATGCAATGCTTCAGACCGCGTTTAAGGAATCTGAGACTGGAAAACTCAGCAATCATGCTCGTCTGATTTCTGGATTCGGTGCCG
GGGTTTTGGAGGCTCTCGTCATTGTTACTCCATTTGAGAATGAGATTCCAATTAAAGCCCTGGCATTGCCTTTTCCGGATGAGCAGTATATTACTTTTTGGTTGGGACTG
GTGTTCCTTAATACCGCCATTCTCCGTCTTCCTATCTACTTACTATCCTCCTTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQIIIQRERKVDEERATIKGFGDRKNGELGSSSGEYGTEIDEEIDSSIYEGDGRWTRKELRLRVLETGKMENQEARRVNTEQRSTKKSIPPYMKAISGSLGGVMEACCLQ
PIDVIKTRLQLDRSGAYKGIIHCGATGLTPFATHLTLKYALRMGSNAMLQTAFKESETGKLSNHARLISGFGAGVLEALVIVTPFENEIPIKALALPFPDEQYITFWLGL
VFLNTAILRLPIYLLSSL