; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi04G004380 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi04G004380
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1A
Genome locationchr04:4162059..4162550
RNA-Seq ExpressionLsi04G004380
SyntenyLsi04G004380
Gene Ontology termsGO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601423.1 hypothetical protein SDJN03_06656, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-4264.84Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS-----------PI--------IQTEAEAAITDSASLQDYSSS
        MASKRQR+E + EE+ EGEELKRQKSY+QILSLLEEEEEE +EDLSSII++LQQEISS           PI         + E  AA  +  S++DY+S 
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS-----------PI--------IQTEAEAAITDSASLQDYSSS

Query:  SSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
           SSS  N          EE GERERVMRHLLEASDDELGIPN EF+VGEGVDGVAL DALWELEDEAANYYTLF SQLFM
Subjt:  SSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

XP_008446332.1 PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Cucumis melo]4.1e-5478.53Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEE---IEDLSSIITTLQQEISSPIIQ----TEAEAAITDSASLQD-----YSSSSSSSSSV
        MASKRQR++ ETE++REGEELKRQKSYNQILSLLEE+EE+E   I+DLSSIITTLQQEISSPIIQ    T+   A + S SLQD      SSSSSSSSSV
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEE---IEDLSSIITTLQQEISSPIIQ----TEAEAAITDSASLQD-----YSSSSSSSSSV

Query:  ANSPNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        ANSP C +NKEELEE+GERE+VMRHLLEASDDELGIPNGEF VG+ GVDGVAL DALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
Subjt:  ANSPNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

XP_011655674.1 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A [Cucumis sativus]3.1e-5783.33Show/hide
Query:  MASKRQRNEGE-TEELREGEELKRQKSYNQILSLLE--EEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTE-AEAAITDSASLQDY-----SSSSSSSSSVANS
        MASKRQR++ E TEELREGEELKRQKSYNQILSLLE  EE+EEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQT+  +  +T S SLQDY     SSSSSSSSSVANS
Subjt:  MASKRQRNEGE-TEELREGEELKRQKSYNQILSLLE--EEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTE-AEAAITDSASLQDY-----SSSSSSSSSVANS

Query:  PNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        P C +NKEELEEEGERE+VMRHLLEASDDELGIPNGEF VG+ GVDGVAL DALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
Subjt:  PNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

XP_022987613.1 uncharacterized protein LOC111485117 [Cucurbita maxima]9.6e-4361.98Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS---------------------PI--------IQTEAEAAITD
        MASKRQR+E + EE+ EGEE+KRQKSYNQILSLLEEEEEE +EDLSSII++LQQEISS                     PI         + E EAA  +
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS---------------------PI--------IQTEAEAAITD

Query:  SASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
          S++DY+S    SSS  N          EE GERERVMRHLLEASDDELGIPN EF+VGEGVDGVAL DALWELEDEAANYYTLF SQLFM
Subjt:  SASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

XP_038891727.1 uncharacterized protein LOC120081124 [Benincasa hispida]2.4e-7094.48Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEEL
        MASKRQRNEGETEELR+GEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEA+  I DS SLQDYSSSSSSSSSVANSP CMNKEEL
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEEL

Query:  EEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        EEEGERE+VMRHLLEASDDELGIPNGEF VGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
Subjt:  EEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BFM2 histone-lysine N-methyltransferase SETD1A2.0e-5478.53Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEE---IEDLSSIITTLQQEISSPIIQ----TEAEAAITDSASLQD-----YSSSSSSSSSV
        MASKRQR++ ETE++REGEELKRQKSYNQILSLLEE+EE+E   I+DLSSIITTLQQEISSPIIQ    T+   A + S SLQD      SSSSSSSSSV
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEE---IEDLSSIITTLQQEISSPIIQ----TEAEAAITDSASLQD-----YSSSSSSSSSV

Query:  ANSPNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        ANSP C +NKEELEE+GERE+VMRHLLEASDDELGIPNGEF VG+ GVDGVAL DALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
Subjt:  ANSPNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

A0A5D3D3N5 Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A2.0e-5478.53Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEE---IEDLSSIITTLQQEISSPIIQ----TEAEAAITDSASLQD-----YSSSSSSSSSV
        MASKRQR++ ETE++REGEELKRQKSYNQILSLLEE+EE+E   I+DLSSIITTLQQEISSPIIQ    T+   A + S SLQD      SSSSSSSSSV
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEE---IEDLSSIITTLQQEISSPIIQ----TEAEAAITDSASLQD-----YSSSSSSSSSV

Query:  ANSPNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        ANSP C +NKEELEE+GERE+VMRHLLEASDDELGIPNGEF VG+ GVDGVAL DALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
Subjt:  ANSPNC-MNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGE-GVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

A0A6J1FZL9 uncharacterized protein LOC1114493403.2e-3665.85Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEEL
        MASKR R+E    +  E  ELKRQKSY QILSLL+E+EEE I DLSSIITTLQQEISSP        A+T +     + S S+SSSSV +S +    +E 
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEEL

Query:  EEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGV-ALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        EEEGE ERVMRHLL+ASDDELGIP GEFLVG+GV+GV    DA WELEDEAANYYTLFQSQLFM
Subjt:  EEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGV-ALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

A0A6J1H1H5 uncharacterized protein LOC1114587173.9e-4262.57Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS----------------PI--------IQTEAEAAITDSASLQ
        MASKRQR+E + EE+ EGEELKRQKSY+QILSLLEEEEEE +EDLSSII++LQQEISS                PI         + E  AA  +  S++
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS----------------PI--------IQTEAEAAITDSASLQ

Query:  DYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        DY+S   SSSS  N          EE GERERVMRHLLEASDDELGIPN EF+VGEG+DGVAL DALWELEDEAANYYTLF SQLF+
Subjt:  DYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

A0A6J1JJY7 uncharacterized protein LOC1114851174.6e-4361.98Show/hide
Query:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS---------------------PI--------IQTEAEAAITD
        MASKRQR+E + EE+ EGEE+KRQKSYNQILSLLEEEEEE +EDLSSII++LQQEISS                     PI         + E EAA  +
Subjt:  MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISS---------------------PI--------IQTEAEAAITD

Query:  SASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
          S++DY+S    SSS  N          EE GERERVMRHLLEASDDELGIPN EF+VGEGVDGVAL DALWELEDEAANYYTLF SQLFM
Subjt:  SASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26920.1 unknown protein5.4e-2045.98Show/hide
Query:  ETEELREGEELKRQK--------SYNQILSLL--EEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEEL
        E E L E E  KRQK        SYNQIL LL   +E+ +   DL+S I  LQQEISS     +  A ++++++++D  SS  SS           KEE 
Subjt:  ETEELREGEELKRQK--------SYNQILSLL--EEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEEL

Query:  EEEGERERVMRHLLEASDDELGIPN---GEFLVGEGVDGV--------ALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
         E+  +E+VM+HLLEASDDELGIPN   GE    +  DG            DA WELEDEAANYYTL QS+LFM
Subjt:  EEEGERERVMRHLLEASDDELGIPN---GEFLVGEGVDGV--------ALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM

AT1G69760.1 unknown protein5.6e-2549.72Show/hide
Query:  KRQRNEGETEELREGEELKRQK------SYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNK
        KRQR+E E E ++  EE KRQK      SYNQ+L+LL++E E    D++S+ITTLQQEIS+   + +  A   ++ SL   SSS SSSSS     +C +K
Subjt:  KRQRNEGETEELREGEELKRQK------SYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNK

Query:  EELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEF-----------LVGEGVDGVALSD----ALWELEDEAANYYTLFQSQLFM
        E+ E +G++E+VM+HLLEA+DDELGIPN EF              + V+G +L D     LWELEDEAANYYTL QS+LFM
Subjt:  EELEEEGERERVMRHLLEASDDELGIPNGEF-----------LVGEGVDGVALSD----ALWELEDEAANYYTLFQSQLFM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCAAAACGCCAGAGGAACGAAGGAGAAACAGAGGAACTGAGGGAAGGGGAAGAGCTTAAACGCCAAAAATCATACAACCAAATCCTATCCCTTTTAGAAGAAGA
AGAAGAGGAAGAAATTGAAGATTTATCCTCAATCATCACCACACTCCAACAAGAAATCTCTTCTCCAATCATTCAAACAGAGGCAGAGGCCGCCATTACAGACTCTGCTT
CTCTACAAGATTATTCTTCCTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTGTTGCTAATTCCCCTAACTGTATGAACAAGGAGGAATTAGAGGAAGAGGGTGAAAGAGAAAGGGTTATG
AGACACCTTCTGGAAGCTTCGGATGATGAACTTGGAATTCCAAACGGAGAGTTTTTGGTCGGAGAAGGAGTGGATGGAGTGGCGTTAAGTGATGCGTTGTGGGAGTTGGA
AGATGAAGCTGCTAATTACTATACCTTGTTTCAGTCCCAGCTTTTTATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCATCAAAACGCCAGAGGAACGAAGGAGAAACAGAGGAACTGAGGGAAGGGGAAGAGCTTAAACGCCAAAAATCATACAACCAAATCCTATCCCTTTTAGAAGAAGA
AGAAGAGGAAGAAATTGAAGATTTATCCTCAATCATCACCACACTCCAACAAGAAATCTCTTCTCCAATCATTCAAACAGAGGCAGAGGCCGCCATTACAGACTCTGCTT
CTCTACAAGATTATTCTTCCTCTTCTTCTTCATCTTCTTCTGTTGCTAATTCCCCTAACTGTATGAACAAGGAGGAATTAGAGGAAGAGGGTGAAAGAGAAAGGGTTATG
AGACACCTTCTGGAAGCTTCGGATGATGAACTTGGAATTCCAAACGGAGAGTTTTTGGTCGGAGAAGGAGTGGATGGAGTGGCGTTAAGTGATGCGTTGTGGGAGTTGGA
AGATGAAGCTGCTAATTACTATACCTTGTTTCAGTCCCAGCTTTTTATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASKRQRNEGETEELREGEELKRQKSYNQILSLLEEEEEEEIEDLSSIITTLQQEISSPIIQTEAEAAITDSASLQDYSSSSSSSSSVANSPNCMNKEELEEEGERERVM
RHLLEASDDELGIPNGEFLVGEGVDGVALSDALWELEDEAANYYTLFQSQLFM