; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi04G008360 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi04G008360
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionSerine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1
Genome locationchr04:8056907..8059743
RNA-Seq ExpressionLsi04G008360
SyntenyLsi04G008360
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0034024.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-12177.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_008445806.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 [Cucumis melo]1.1e-12177.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_008445810.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor RS2Z33-like isoform X3 [Cucumis melo]1.1e-12177.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_038892927.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Benincasa hispida]3.9e-12478.09Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPL
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP K MKRSPTPDERSPEEARRSLSP NRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPL
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPL

Query:  PREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        PREERSPVNDED NGSPRGGSESA
Subjt:  PREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

XP_038892929.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z33-like isoform X2 [Benincasa hispida]3.9e-12478.09Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPL
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP K MKRSPTPDERSPEEARRSLSP NRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPL
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPL

Query:  PREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        PREERSPVNDED NGSPRGGSESA
Subjt:  PREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS31 Uncharacterized protein1.5e-12177.3Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSES
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSES
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSES

A0A1S3BD24 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X15.2e-12277.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A1S3BDJ7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X25.2e-12277.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A1S3BEE4 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z33-like isoform X35.2e-12277.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

A0A5A7SS39 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X15.2e-12277.37Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKG                                                                 VP
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER
        RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKR+R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP
        SLERSDKRSRSPRGR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEE ARRSLSP NRD  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDF+GGGSRNYRREENGYSRSP
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSLSPENRD--SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYSRSP

Query:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
        SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA
Subjt:  SPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q23121 Probable splicing factor, arginine/serine-rich 11.1e-0446.28Show/hide
Query:  QNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD
        Q    + +  S SRS S  R R RSRS S  RS SRSRSP KR R   +S  RSRS R R +  R S SP       RSP   +RSP   R S SP  + 
Subjt:  QNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRD

Query:  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGE
        SPR      R RS SPMD G+
Subjt:  SPRGRSRSPRGRSRSPMDEGE

Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z332.7e-4343.36Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                                   
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS
          P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR RSYSRSRS
Subjt:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS

Query:  PV-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGY
        PV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP  D+                SP+    SP    +   + G D  GG       ++NG 
Subjt:  PV-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGY

Query:  SRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES
        +   SP+        +E+RSPV+D  E N  SPR GSES
Subjt:  SRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES

Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z321.8e-4243.11Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G                                                                   
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYS
          P GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SPRR R  SRSRSYSRGRSYS
Subjt:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYS

Query:  RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREE
        RSRSPV+RE+S+E    RSRSP                KAM+RS +P  R      +SLSP+ +        SP+   R    +G     G  RN     
Subjt:  RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREE

Query:  NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES
         G   SP  L  ++RSP++DE     P   GSES
Subjt:  NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 331.9e-4443.36Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                                   
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS
          P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR RSYSRSRS
Subjt:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS

Query:  PV-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGY
        PV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP  D+                SP+    SP    +   + G D  GG       ++NG 
Subjt:  PV-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGY

Query:  SRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES
        +   SP+        +E+RSPV+D  E N  SPR GSES
Subjt:  SRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES

AT2G37340.2 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 332.5e-4443.49Show/hide
Query:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVPR
        EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                                    
Subjt:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVPR

Query:  GPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSP
         P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR RSYSRSRSP
Subjt:  GPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSP

Query:  V-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYS
        V +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP  D+                SP+    SP    +   + G D  GG       ++NG +
Subjt:  V-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGYS

Query:  RSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES
           SP+        +E+RSPV+D  E N  SPR GSES
Subjt:  RSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES

AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 331.9e-4443.36Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                                   
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS
          P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR RSYSRSRS
Subjt:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRS

Query:  PV-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGY
        PV +RERS+E   +RSRSP+        SLSP   +A  RSP  D+                SP+    SP    +   + G D  GG       ++NG 
Subjt:  PV-KRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREENGY

Query:  SRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES
        +   SP+        +E+RSPV+D  E N  SPR GSES
Subjt:  SRSPSPL-------PREERSPVND--EDNNGSPRGGSES

AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain1.2e-4343.11Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G                                                                   
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYS
          P GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SPRR R  SRSRSYSRGRSYS
Subjt:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYS

Query:  RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREE
        RSRSPV+RE+S+E    RSRSP                KAM+RS +P  R      +SLSP+ +        SP+   R    +G     G  RN     
Subjt:  RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREE

Query:  NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES
         G   SP  L  ++RSP++DE     P   GSES
Subjt:  NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES

AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain1.2e-4343.11Show/hide
Query:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP
        +EFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G                                                                   
Subjt:  LEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQLPPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVP

Query:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYS
          P GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SPRR R  SRSRSYSRGRSYS
Subjt:  RGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYS

Query:  RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREE
        RSRSPV+RE+S+E    RSRSP                KAM+RS +P  R      +SLSP+ +        SP+   R    +G     G  RN     
Subjt:  RSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDEGEDFSGGGSRNYRREE

Query:  NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES
         G   SP  L  ++RSP++DE     P   GSES
Subjt:  NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPR-GGSES


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCGGGTGCGTCTCGCCTCCTCCTTCAAATTTTCTAGGTTTTCTCTCCTCGAAACCTCTATTGAATTTTTTTTTGCTCAATCAAGGTTTTGTGTCATAAAATGCCT
CGCTATGACGATCGTTACGGTGGTACTCGGCTCTATGTTGGGCGCCTGTCTTCACGGACGAGGTCCCGTGATCTGGATGACCTGTTCAGTCGTTATGGAAGGTATGGAGA
TTCTTGCTGGGTGTACTATTCAACCATGGTCGAAATTGTGTGCTAACATTGATTTGATGGATTCGGAAAGTTCATGTGTGTTTAGTTATGCCGTATGTTCTTTCTATTGT
CCTTTCTATTGTCCCGGTTTTTCTATTGCCAACATCCTTGTCAGAGTTTCTTGGCTTATGCCAAACCTGGAGGTCTATGGTGAGAGGGTTCCCTTGGTGGATTTGGCGAG
TCTTTCTATTATGTTATTGCCTGTTTTTATGGAAATGCCAAGAATCTCAGAATGGTGTTTAGAATTTAGTGATCCCCGTGATGCGGATGATGCAAGATATAGTTTAAATG
GGAGAGATGTTCATGGAAGTCGAATCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTATGTTTCATAATCTTTCCTCACAAACCTTTCATAAACTGTAAAATTTCTTTCAGACAGTTG
CCTCCTCTATTCCATGCTAGCTATCATTTTTATCCTTTTAAGCGGTTAACTATTTCTCCTATATCATTCATCATGTTCATGGACAGCTTTACTCTTTTCATAGTCACATT
TGTTCAATTTTATAAAGCCTGTGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCTCGTGAATATCTTGGTCGAGGCCCTCCAGGAACTGGCCGTTGCTTCAATTGTGGGATTGATGGCC
ACTGGGCTAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAATGTTATCGATGTGGCGAACGTGGACATATAGAGAAGAATTGCCAAAACAGTCCTAAGAAATTGAAGCGT
GGAAGTTACTCACGTTCACCAAGCCCTCGCCGTGGTAGAAGCCGCAGTCGTAGTTACAGCAGAGGACGTAGCTACAGTCGATCTAGATCGCCTGTAAAAAGAGAAAGAAG
CCTTGAACGATCAGATAAAAGATCAAGGAGCCCGAGAGGCAGACCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGTCACCTCCTCCTTCAAAAGCTATGAAACGTAGCCCCACTCCTG
ATGAGAGGAGTCCCGAAGAAGCAAGACGTAGTCTGTCCCCTGAAAATCGCGACAGTCCTAGAGGTAGAAGCAGAAGCCCAAGGGGAAGGAGCAGGAGTCCAATGGACGAA
GGCGAGGACTTCAGCGGTGGTGGAAGTAGAAATTACAGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTCGCAGCCCCAGTCCGTTGCCTAGAGAAGAAAGAAGTCCTGTAAACGACGA
AGATAACAACGGTTCTCCAAGGGGTGGCAGCGAGTCTGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCGGGTGCGTCTCGCCTCCTCCTTCAAATTTTCTAGGTTTTCTCTCCTCGAAACCTCTATTGAATTTTTTTTTGCTCAATCAAGGTTTTGTGTCATAAAATGCCT
CGCTATGACGATCGTTACGGTGGTACTCGGCTCTATGTTGGGCGCCTGTCTTCACGGACGAGGTCCCGTGATCTGGATGACCTGTTCAGTCGTTATGGAAGGTATGGAGA
TTCTTGCTGGGTGTACTATTCAACCATGGTCGAAATTGTGTGCTAACATTGATTTGATGGATTCGGAAAGTTCATGTGTGTTTAGTTATGCCGTATGTTCTTTCTATTGT
CCTTTCTATTGTCCCGGTTTTTCTATTGCCAACATCCTTGTCAGAGTTTCTTGGCTTATGCCAAACCTGGAGGTCTATGGTGAGAGGGTTCCCTTGGTGGATTTGGCGAG
TCTTTCTATTATGTTATTGCCTGTTTTTATGGAAATGCCAAGAATCTCAGAATGGTGTTTAGAATTTAGTGATCCCCGTGATGCGGATGATGCAAGATATAGTTTAAATG
GGAGAGATGTTCATGGAAGTCGAATCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTATGTTTCATAATCTTTCCTCACAAACCTTTCATAAACTGTAAAATTTCTTTCAGACAGTTG
CCTCCTCTATTCCATGCTAGCTATCATTTTTATCCTTTTAAGCGGTTAACTATTTCTCCTATATCATTCATCATGTTCATGGACAGCTTTACTCTTTTCATAGTCACATT
TGTTCAATTTTATAAAGCCTGTGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCTCGTGAATATCTTGGTCGAGGCCCTCCAGGAACTGGCCGTTGCTTCAATTGTGGGATTGATGGCC
ACTGGGCTAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAATGTTATCGATGTGGCGAACGTGGACATATAGAGAAGAATTGCCAAAACAGTCCTAAGAAATTGAAGCGT
GGAAGTTACTCACGTTCACCAAGCCCTCGCCGTGGTAGAAGCCGCAGTCGTAGTTACAGCAGAGGACGTAGCTACAGTCGATCTAGATCGCCTGTAAAAAGAGAAAGAAG
CCTTGAACGATCAGATAAAAGATCAAGGAGCCCGAGAGGCAGACCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGTCACCTCCTCCTTCAAAAGCTATGAAACGTAGCCCCACTCCTG
ATGAGAGGAGTCCCGAAGAAGCAAGACGTAGTCTGTCCCCTGAAAATCGCGACAGTCCTAGAGGTAGAAGCAGAAGCCCAAGGGGAAGGAGCAGGAGTCCAATGGACGAA
GGCGAGGACTTCAGCGGTGGTGGAAGTAGAAATTACAGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTCGCAGCCCCAGTCCGTTGCCTAGAGAAGAAAGAAGTCCTGTAAACGACGA
AGATAACAACGGTTCTCCAAGGGGTGGCAGCGAGTCTGCATAATAGACAGTTCCTTATTTTGCTTCTGCTTAAACACATGAGTTTGCGTTGGAATTTTATAAGCGACTTC
TGCCTCAAGAGAGACTTCTAAAATAGATCTGTATTGTGATTGAATCCCGCCTCAAATGTTCATCAGCACCGTATTTTGTCTATTTATCTTCCAGCTTAATTATGATAAAT
TATATATAATAATCTGTTTCTTATTAGCTGTTATCCTATTTTTGTTTGGTCACTTGATTTGATTATGGTGTTTTCTCGATCTAACTAGGATTTGTGAGTTCTGTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MERVRLASSFKFSRFSLLETSIEFFFAQSRFCVIKCLAMTIVTVVLGSMLGACLHGRGPVIWMTCSVVMEGMEILAGCTIQPWSKLCANIDLMDSESSCVFSYAVCSFYC
PFYCPGFSIANILVRVSWLMPNLEVYGERVPLVDLASLSIMLLPVFMEMPRISEWCLEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVCFIIFPHKPFINCKISFRQL
PPLFHASYHFYPFKRLTISPISFIMFMDSFTLFIVTFVQFYKACVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR
GSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDERSPEEARRSLSPENRDSPRGRSRSPRGRSRSPMDE
GEDFSGGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDNNGSPRGGSESA