; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi04G012450 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi04G012450
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionBasic helix-loop-helix transcription factor
Genome locationchr04:19399132..19402542
RNA-Seq ExpressionLsi04G012450
SyntenyLsi04G012450
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0055072 - iron ion homeostasis (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily
IPR044818 - Transcription factor ILR3-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151959.3 LOW QUALITY PROTEIN: transcription factor ILR3 [Cucumis sativus]1.4e-11285.6Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPV SSSFSW IQP NG  D+GVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLR DRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKS+PAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTF AQGQA GNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_004151962.3 transcription factor ILR3 [Cucumis sativus]1.9e-11485.6Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSFSW IQP NG  D+GVEIDGSLADLDG LESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLR ET+KLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTF AQGQAPGNKL PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_008454558.1 PREDICTED: transcription factor ILR3 isoform X1 [Cucumis melo]1.6e-11385.6Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSF+WAIQP NG  DTGVEIDGSLAD+DGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSET KLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFL PPIPTF AQGQAPGNKL PF+GYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_008454561.1 PREDICTED: transcription factor ILR3-like [Cucumis melo]7.8e-11686.77Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSFSWAIQ  NG  DTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTF AQGQAPGNKL PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

XP_038900262.1 transcription factor ILR3-like [Benincasa hispida]1.6e-11687.16Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LIDDIPVPDANFPVTSSSFSW+IQP NG PD GVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLEL S
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTFAAQ QAPG+KLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L7N8 BHLH domain-containing protein1.4e-11586.38Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSFSW IQP NG  D+GVEIDGSLADLDG LESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTF AQGQAPGNKL PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A1S3BYW4 transcription factor ILR3-like3.8e-11686.77Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSFSWAIQ  NG  DTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTF AQGQAPGNKL PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A1S3C042 transcription factor ILR3 isoform X17.9e-11485.6Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSF+WAIQP NG  DTGVEIDGSLAD+DGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSET KLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFL PPIPTF AQGQAPGNKL PF+GYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A5A7TUD2 Transcription factor ILR3 isoform X17.9e-11485.6Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSF+WAIQP NG  DTGVEIDGSLAD+DGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSET KLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFL PPIPTF AQGQAPGNKL PF+GYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

A0A5D3BHU4 Transcription factor ILR3-like3.8e-11686.77Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPENPNWLFDY LI+DIPVPD NFPVTSSSFSWAIQ  NG  DTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
        ILDPGRPPKTDKAAILVDA RMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELK                      AEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQ

Query:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        QPGFLPPPIPTF AQGQAPGNKL PFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDH+LRPPVA
Subjt:  QPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L467 Transcription factor bHLH1042.4e-3548.45Show/hide
Query:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQY
        S+KR R+ SCS    +KACRE+LRR++LN++F++L S+L+PGR PKTDK AIL DA R++NQLR E  KL+E+N  L E+IK LK               
Subjt:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQY

Query:  IRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
               AEKNELR+EK  LKADKE+ EQQ+KSM A   GF+P     F     A    + P  GY P   MW +MP +  DTS+D  LRPP A
Subjt:  IRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Q9C682 Transcription factor bHLH1151.7e-6556.54Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPEN NWL DY LI      +  F   + +F W I   +G     VE+DG L D D   E  S+KR++++SC+ S+SKACREK RRDRLNDKF EL S
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQ---VKSM
        +L+PGR PKTDK AI+ DA RMVNQ R E QKLK+ NSSLQEKIKELK                       EKNELRDEKQ+LK +KER++QQ   +K+ 
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQ---VKSM

Query:  PAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        P  QP FLP   P   +Q QAPG+KLVPF  Y P  AMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  PAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Q9FH37 Transcription factor ILR32.1e-7159.92Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAI-QPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG
        M SPEN NW+ D  LID       +F +    FSW + QP+    ++   +DGS  + +   E GSKKR R +S SA+SSKACREK RRDRLNDKF+ELG
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAI-QPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG

Query:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPA
        +IL+PG PPKTDKAAILVDA RMV QLR E QKLK+SNSSLQ+KIKELK                       EKNELRDEKQRLK +KE+LEQQ+K+M A
Subjt:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPA

Query:  QQPGFLPPP--IPT--FAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
         QP F P P  +PT   +AQGQAPGNK+VP I Y P VAMWQFMPPA+VDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QQPGFLPPP--IPT--FAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Q9LT23 Transcription factor bHLH1214.0e-1433.18Show/hide
Query:  DSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFA
        D  +  S KA REKLRR++LN+ F+ELG++LDP R PK DKA IL D  +++ +L SE  KLK   ++L ++ +EL                        
Subjt:  DSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFA

Query:  EKNELRDEKQRLKADKERL----EQQVKSMP------------AQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYH----------PSVAMWQFMPPAAVD
        EKN+LR+EK  LK+D E L    +Q+++SM             A  P F P P+P     G  P +  +P   Y           P      +MPP  V 
Subjt:  EKNELRDEKQRLKADKERL----EQQVKSMP------------AQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYH----------PSVAMWQFMPPAAVD

Query:  TSQD-HVLRPP
          Q  H+ + P
Subjt:  TSQD-HVLRPP

Q9LTC7 Transcription factor bHLH341.7e-3648.98Show/hide
Query:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMC
        E  S KR R+ SCS   +KACREKLRR++LNDKF++L S+L+PGR PKTDK+AIL DA R+VNQLR E  +L+E+N  L E+IK LK             
Subjt:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMC

Query:  QYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
                 A+KNELR+EK  LKA+KE++EQQ+KSM    PGF+P   P  AA          P+  Y P++ MW  +PPA  DTS+D    PPVA
Subjt:  QYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51070.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-6656.54Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS
        M SPEN NWL DY LI      +  F   + +F W I   +G     VE+DG L D D   E  S+KR++++SC+ S+SKACREK RRDRLNDKF EL S
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGS

Query:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQ---VKSM
        +L+PGR PKTDK AI+ DA RMVNQ R E QKLK+ NSSLQEKIKELK                       EKNELRDEKQ+LK +KER++QQ   +K+ 
Subjt:  ILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQ---VKSM

Query:  PAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
        P  QP FLP   P   +Q QAPG+KLVPF  Y P  AMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  PAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT1G51070.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.9e-5961.03Show/hide
Query:  VEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKEL
        VE+DG L D D   E  S+KR++++SC+ S+SKACREK RRDRLNDKF EL S+L+PGR PKTDK AI+ DA RMVNQ R E QKLK+ NSSLQEKIKEL
Subjt:  VEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKEL

Query:  KASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQ---VKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAV
        K                       EKNELRDEKQ+LK +KER++QQ   +K+ P  QP FLP   P   +Q QAPG+KLVPF  Y P  AMWQFMPPAAV
Subjt:  KASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQ---VKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAV

Query:  DTSQDHVLRPPVA
        DTSQDHVLRPPVA
Subjt:  DTSQDHVLRPPVA

AT3G23210.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-3748.98Show/hide
Query:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMC
        E  S KR R+ SCS   +KACREKLRR++LNDKF++L S+L+PGR PKTDK+AIL DA R+VNQLR E  +L+E+N  L E+IK LK             
Subjt:  ESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMC

Query:  QYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
                 A+KNELR+EK  LKA+KE++EQQ+KSM    PGF+P   P  AA          P+  Y P++ MW  +PPA  DTS+D    PPVA
Subjt:  QYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT4G14410.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.7e-3648.45Show/hide
Query:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQY
        S+KR R+ SCS    +KACRE+LRR++LN++F++L S+L+PGR PKTDK AIL DA R++NQLR E  KL+E+N  L E+IK LK               
Subjt:  SKKRVRSDSCS-ASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQY

Query:  IRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
               AEKNELR+EK  LKADKE+ EQQ+KSM A   GF+P     F     A    + P  GY P   MW +MP +  DTS+D  LRPP A
Subjt:  IRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA

AT5G54680.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.5e-7259.92Show/hide
Query:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAI-QPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG
        M SPEN NW+ D  LID       +F +    FSW + QP+    ++   +DGS  + +   E GSKKR R +S SA+SSKACREK RRDRLNDKF+ELG
Subjt:  MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAI-QPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELG

Query:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPA
        +IL+PG PPKTDKAAILVDA RMV QLR E QKLK+SNSSLQ+KIKELK                       EKNELRDEKQRLK +KE+LEQQ+K+M A
Subjt:  SILDPGRPPKTDKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPA

Query:  QQPGFLPPP--IPT--FAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA
         QP F P P  +PT   +AQGQAPGNK+VP I Y P VAMWQFMPPA+VDTSQDHVLRPPVA
Subjt:  QQPGFLPPP--IPT--FAAQGQAPGNKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCCCCGAAAATCCCAATTGGTTGTTTGATTATGCTTTGATCGACGATATCCCTGTACCGGATGCGAATTTTCCGGTCACGAGTTCAAGCTTTTCCTGGGCTAT
TCAGCCCTTAAACGGCCCCCCTGATACCGGTGTGGAAATTGATGGATCGTTGGCAGATCTGGATGGCCGTCTAGAATCTGGCTCGAAGAAGAGGGTCAGATCTGATTCAT
GTAGTGCATCAAGCTCCAAAGCATGTAGGGAGAAACTGCGGAGGGATAGGCTCAATGACAAGTTTCTGGAACTGGGCTCCATTTTGGATCCTGGAAGACCACCCAAAACT
GACAAGGCTGCAATTTTAGTTGATGCGGCTCGAATGGTGAATCAGTTGCGTAGCGAAACCCAGAAACTAAAGGAATCGAATTCAAGTCTCCAGGAGAAGATTAAAGAGTT
GAAGGCAAGTCTTCATGGATTTCTTTGCCAACTATACATGTGCCAATATATAAGATCGTCCATTCAATTTGCTGAGAAGAACGAGCTTCGCGACGAGAAGCAGAGGCTCA
AGGCAGATAAGGAGAGGCTAGAGCAGCAAGTGAAGTCCATGCCTGCTCAACAACCTGGCTTCTTACCTCCACCAATCCCCACATTTGCTGCTCAGGGTCAAGCTCCTGGC
AATAAGTTAGTTCCTTTCATTGGTTACCACCCGAGTGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCACCTGCTGCGGTGGACACGTCACAGGACCATGTACTCCGGCCACCGGTCGC
TTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCATTTTGTCTCCCCCTTGAAATGGGGATTGAAAGCCGATAACCAAAATATAACTACGCGTTTGGATGACGTGTTTCTCCCACTCGATCCCAATATGGCCGATCATCTG
CCAACACTACCCCCAAATCCCTAATCTTCTACAAATTTTTATCGTCCCCTAAATATTCGTCTCCTTCAATTTTCTCTCTCTTCAATCGCCCGAGCCCTAACCCTAACTCT
CCTCCTGTAATTTCTTTTCAATTATCATTCCGTGTTTCTTCCAATTATTCTTGCCGGAAATTTTGAATATTTTCCGGCAATCCCACGGTTTTTTTTCAATAATTGTTTGA
GAAATGGCGTCCCCCGAAAATCCCAATTGGTTGTTTGATTATGCTTTGATCGACGATATCCCTGTACCGGATGCGAATTTTCCGGTCACGAGTTCAAGCTTTTCCTGGGC
TATTCAGCCCTTAAACGGCCCCCCTGATACCGGTGTGGAAATTGATGGATCGTTGGCAGATCTGGATGGCCGTCTAGAATCTGGCTCGAAGAAGAGGGTCAGATCTGATT
CATGTAGTGCATCAAGCTCCAAAGCATGTAGGGAGAAACTGCGGAGGGATAGGCTCAATGACAAGTTTCTGGAACTGGGCTCCATTTTGGATCCTGGAAGACCACCCAAA
ACTGACAAGGCTGCAATTTTAGTTGATGCGGCTCGAATGGTGAATCAGTTGCGTAGCGAAACCCAGAAACTAAAGGAATCGAATTCAAGTCTCCAGGAGAAGATTAAAGA
GTTGAAGGCAAGTCTTCATGGATTTCTTTGCCAACTATACATGTGCCAATATATAAGATCGTCCATTCAATTTGCTGAGAAGAACGAGCTTCGCGACGAGAAGCAGAGGC
TCAAGGCAGATAAGGAGAGGCTAGAGCAGCAAGTGAAGTCCATGCCTGCTCAACAACCTGGCTTCTTACCTCCACCAATCCCCACATTTGCTGCTCAGGGTCAAGCTCCT
GGCAATAAGTTAGTTCCTTTCATTGGTTACCACCCGAGTGTTGCCATGTGGCAGTTCATGCCACCTGCTGCGGTGGACACGTCACAGGACCATGTACTCCGGCCACCGGT
CGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASPENPNWLFDYALIDDIPVPDANFPVTSSSFSWAIQPLNGPPDTGVEIDGSLADLDGRLESGSKKRVRSDSCSASSSKACREKLRRDRLNDKFLELGSILDPGRPPKT
DKAAILVDAARMVNQLRSETQKLKESNSSLQEKIKELKASLHGFLCQLYMCQYIRSSIQFAEKNELRDEKQRLKADKERLEQQVKSMPAQQPGFLPPPIPTFAAQGQAPG
NKLVPFIGYHPSVAMWQFMPPAAVDTSQDHVLRPPVA