; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi04G018300 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi04G018300
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL80
Genome locationchr04:25437672..25439076
RNA-Seq ExpressionLsi04G018300
SyntenyLsi04G018300
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608649.1 RING-H2 finger protein ATL80, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.1e-9393.41Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLA  NSS+ISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILV SQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+K+EG+DK N
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

XP_004145558.1 RING-H2 finger protein ATL8 [Cucumis sativus]1.7e-9496.7Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGA STRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+KEEGDDKTN
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

XP_008453009.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL80 [Cucumis melo]2.4e-9395.6Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDG GA STRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+KEEGDDKTN
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

XP_022941514.1 RING-H2 finger protein ATL80-like [Cucurbita moschata]9.2e-9393.41Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MR FRYLA  NSS+ISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+K+EG+DK N
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

XP_038898612.1 RING-H2 finger protein ATL8 [Benincasa hispida]4.6e-10095.85Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLAGVNSSAISDT EPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTR PPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTNSRDGITLQYRR
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFHMSCID WFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+KEEGDDKTNS DGIT QYRR
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTNSRDGITLQYRR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5Y2 RING-type domain-containing protein8.2e-9596.7Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGA STRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+KEEGDDKTN
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

A0A1S3BWC1 RING-H2 finger protein ATL801.2e-9395.6Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDG GA STRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+KEEGDDKTN
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

A0A5A7VGL3 RING-H2 finger protein ATL801.2e-9395.6Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDG GA STRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+KEEGDDKTN
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

A0A6J1FNK0 RING-H2 finger protein ATL80-like4.5e-9393.41Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MR FRYLA  NSS+ISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+K+EG+DK N
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

A0A6J1IVW2 RING-H2 finger protein ATL803.8e-9293.41Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF
        MRPFRYLA  NSS+ISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTE R+K +G+DK N
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22755 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ATL441.4e-3555.32Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFS--------AQFSDCAICLAEFAVGDEI
        +SD V+IL+ALLCALICV GL AV RCAWLR     G           P+ NKGLKKK L+SLP+ TFTA  S           ++CAICL +FA G+EI
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFS--------AQFSDCAICLAEFAVGDEI

Query:  RVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG
        RVLP CGH FH+ CID W  S SSCPSCR+IL   +C +CG
Subjt:  RVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG

Q8LC69 RING-H2 finger protein ATL81.7e-5257.46Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--SAQFS
        FR L   NS++ ++   P  ++SD V+ILA LLCAL C++GL+AV+RCAWLR +A     +  T PPP  A+NKGLKKK+LRSLPK T++ +   + +  
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--SAQFS

Query:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        +CAICL EFA GDE+RVLPQCGHGFH+SCIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS    + R+K+  D   N
Subjt:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

Q9LM69 RING-H2 finger protein ATL802.8e-5257.14Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD----GGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--S
        FR L   N+ + +        +SD V+ILAALLCALICVLGL+AV+RC WLR LA       G    +  PP  A+NKGLKKK+L+SLPK TF+ E   S
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD----GGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--S

Query:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMK---EEGDDKTNS
         +F++CAICLAEF+ GDE+RVLPQCGHGFH++CIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS   +E  ++   ++G+D  NS
Subjt:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMK---EEGDDKTNS

Q9LZV8 RING-H2 finger protein ATL746.6e-2549.61Show/hide
Query:  YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTF-TAEFSAQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQC
        +D++ VIILAALLCALI  LGL ++ RCA        G G +S+      A   GLKK+ L+  P   + + E     ++CAICL EFA G+ +RVLP C
Subjt:  YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTF-TAEFSAQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQC

Query:  GHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILV
         H FHMSCIDTW  SHSSCP+CR  L+
Subjt:  GHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILV

Q9ZT49 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ATL457.5e-3752.35Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSA----------------QFSDCAICLA
        ++D V+IL+ALLCAL+CV GL AVARCAWLR L G    A    PPP    NKGLKKK L++LPK T+TA  S                   ++CAIC+ 
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSA----------------QFSDCAICLA

Query:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG
        EF+ G+EIR+LP C H FH++CID W  S SSCPSCR+ILV  +C +CG
Subjt:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G20823.1 RING/U-box superfamily protein2.0e-5357.14Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD----GGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--S
        FR L   N+ + +        +SD V+ILAALLCALICVLGL+AV+RC WLR LA       G    +  PP  A+NKGLKKK+L+SLPK TF+ E   S
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD----GGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--S

Query:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMK---EEGDDKTNS
         +F++CAICLAEF+ GDE+RVLPQCGHGFH++CIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS   +E  ++   ++G+D  NS
Subjt:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMK---EEGDDKTNS

AT1G76410.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-5357.46Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--SAQFS
        FR L   NS++ ++   P  ++SD V+ILA LLCAL C++GL+AV+RCAWLR +A     +  T PPP  A+NKGLKKK+LRSLPK T++ +   + +  
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--SAQFS

Query:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN
        +CAICL EFA GDE+RVLPQCGHGFH+SCIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS    + R+K+  D   N
Subjt:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTN

AT2G17450.1 RING-H2 finger A3A1.0e-3655.32Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFS--------AQFSDCAICLAEFAVGDEI
        +SD V+IL+ALLCALICV GL AV RCAWLR     G           P+ NKGLKKK L+SLP+ TFTA  S           ++CAICL +FA G+EI
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFS--------AQFSDCAICLAEFAVGDEI

Query:  RVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG
        RVLP CGH FH+ CID W  S SSCPSCR+IL   +C +CG
Subjt:  RVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG

AT4G35480.1 RING-H2 finger A3B5.3e-3852.35Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSA----------------QFSDCAICLA
        ++D V+IL+ALLCAL+CV GL AVARCAWLR L G    A    PPP    NKGLKKK L++LPK T+TA  S                   ++CAIC+ 
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSA----------------QFSDCAICLA

Query:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG
        EF+ G+EIR+LP C H FH++CID W  S SSCPSCR+ILV  +C +CG
Subjt:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG

AT5G01880.1 RING/U-box superfamily protein4.7e-2649.61Show/hide
Query:  YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTF-TAEFSAQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQC
        +D++ VIILAALLCALI  LGL ++ RCA        G G +S+      A   GLKK+ L+  P   + + E     ++CAICL EFA G+ +RVLP C
Subjt:  YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTF-TAEFSAQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQC

Query:  GHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILV
         H FHMSCIDTW  SHSSCP+CR  L+
Subjt:  GHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGTCCCTTCAGATATCTTGCCGGCGTCAACTCCTCCGCCATCTCCGACACCGTCGAGCCTGAAAGGTATGACTCTGACTTCGTCATAATCCTTGCCGCCCTCCTCTG
CGCTTTGATTTGCGTTCTCGGTCTTGTTGCTGTTGCTCGCTGCGCCTGGCTACGACACCTCGCCGGCGATGGCGGCGGCGCTGCTTCCACTCGTCCTCCTCCACCTCCTG
CCTCCAACAAAGGTCTCAAGAAGAAGATCCTGAGGTCTCTTCCGAAGTACACCTTCACCGCTGAGTTTTCTGCTCAGTTCTCAGATTGCGCGATCTGCCTCGCGGAGTTC
GCTGTCGGTGATGAAATCCGTGTGTTGCCGCAGTGTGGCCATGGATTTCACATGTCCTGCATCGATACGTGGTTCCGATCTCACTCTTCCTGTCCTTCCTGCCGTCAGAT
TCTGGTGGTAAGTCAGTGCCAGAAGTGCGGCGGTTTTCCGGCAAGCTCGAGTTCGAACGGTGGAACGGAATACAGAATGAAAGAGGAAGGAGATGATAAGACGAATAGCC
GAGATGGCATAACTTTACAGTACAGGCGATTAATTCGAAAAGGGGAACAGTATCAGTATCAGTATCATCAGTATCATGTGGATGATGAACATTGCAACTGCCAATGTGAT
TTGTTTATTTCCATTTTGGATCGCATTTTTCAGCAGCAAATGGCTCCTCCTCTCTTCATCTCTCTTCACATTGCCAATTTTTCTCTCTCCTCCGCCCTGAAGATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACGCCGTTAGAATTGAGGTGGGTGAGGCTAATGAGAAGAAGCTCCGAAAGCGGAAAAACGCAAGCCCGATTCTCGTGTTCAGTATAAAATCCCTTCGAAACGACAAAC
GTTACGCCCACGGTTGATTCAAAACGACTATCCTTCTCATCTCTTCTTTTATCTTTATAGACTCTTCCTTTCCTCTCGCCGCTTCAAATGCGTCCCTTCAGATATCTTGC
CGGCGTCAACTCCTCCGCCATCTCCGACACCGTCGAGCCTGAAAGGTATGACTCTGACTTCGTCATAATCCTTGCCGCCCTCCTCTGCGCTTTGATTTGCGTTCTCGGTC
TTGTTGCTGTTGCTCGCTGCGCCTGGCTACGACACCTCGCCGGCGATGGCGGCGGCGCTGCTTCCACTCGTCCTCCTCCACCTCCTGCCTCCAACAAAGGTCTCAAGAAG
AAGATCCTGAGGTCTCTTCCGAAGTACACCTTCACCGCTGAGTTTTCTGCTCAGTTCTCAGATTGCGCGATCTGCCTCGCGGAGTTCGCTGTCGGTGATGAAATCCGTGT
GTTGCCGCAGTGTGGCCATGGATTTCACATGTCCTGCATCGATACGTGGTTCCGATCTCACTCTTCCTGTCCTTCCTGCCGTCAGATTCTGGTGGTAAGTCAGTGCCAGA
AGTGCGGCGGTTTTCCGGCAAGCTCGAGTTCGAACGGTGGAACGGAATACAGAATGAAAGAGGAAGGAGATGATAAGACGAATAGCCGAGATGGCATAACTTTACAGTAC
AGGCGATTAATTCGAAAAGGGGAACAGTATCAGTATCAGTATCATCAGTATCATGTGGATGATGAACATTGCAACTGCCAATGTGATTTGTTTATTTCCATTTTGGATCG
CATTTTTCAGCAGCAAATGGCTCCTCCTCTCTTCATCTCTCTTCACATTGCCAATTTTTCTCTCTCCTCCGCCCTGAAGATTTAAGAGGTCAGATCCATAAAGTTCTGAA
AATGGAATAATTCTGCAACTGCAACTGCTCCATTTTCTAATTAAAAATTAGCAAAATCCCTAATCCAAATTTCACCATCCATAGCCATGTCTGCTCTCTCTCCTTTTCAC
TTTCACTTATCTTCTCACCATGATAATCACTATCAAATTTTTTAGGTTTAAAATTAATTTTCATCTCTAAACTTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPERYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDGGGAASTRPPPPPASNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFSAQFSDCAICLAEF
AVGDEIRVLPQCGHGFHMSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSNGGTEYRMKEEGDDKTNSRDGITLQYRRLIRKGEQYQYQYHQYHVDDEHCNCQCD
LFISILDRIFQQQMAPPLFISLHIANFSLSSALKI