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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
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| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 5.0e-19 | 42.64 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RR+R+ P KR ++ SP
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+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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++ RRS SGS SSSRSR S S S SSS S S S+S S S + SRS SSSSS S S SS S SP P R+ + RR+R+ KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPARKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ +DR +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P P R +P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDR-TVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRAREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P + P M R P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDAEKDDMKRAREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q4R5N1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 5.0e-19 | 42.64 | Show/hide |
Query: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPARKPSPVR
+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S SS S SP P R+ + RR+R+ P KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSASVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPARKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVATVPKR
Query: DGPKPENVGPDAEKDDMKRAREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGPDAEKDDMKRAREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 2.6e-108 | 67.52 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP+K +S P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
Query: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
++K V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+
Subjt: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
Query: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRAREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSP
V+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG
Subjt: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRAREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSP
Query: SPLGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVAR
SP RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS SPSPR++ R
Subjt: SPLGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVAR
Query: RV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP
Subjt: RV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 1.8e-109 | 67.52 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP+K +S P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
Query: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
++K V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+
Subjt: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
Query: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRAREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSP
V+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG
Subjt: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRAREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSP
Query: SPLGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVAR
SP RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS SPSPR++ R
Subjt: SPLGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVAR
Query: RV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP
Subjt: RV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
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|
| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 5.0e-107 | 66.67 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP+K +S P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
Query: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
++K V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+
Subjt: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
Query: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRAREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSP
V+ PKRD PK +N DAEKD P R+ SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG SP
Subjt: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKDDMKRAREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSP
Query: LGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS SPSPR++ R++
Subjt: LGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSGSPSPRKVARRV
Query: --SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP
Subjt: --SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
|
|
| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 2.9e-107 | 65.75 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
MAKPSRGRRSP S+SGS SRSSSRSRS S+ S+SRSRSRSRS+SSSSS SRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP+K +S P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSLSGSDSRSSSRSRSRSA---SVSRSRSRSRSISSSSSLSRSGSSRSRSPPPQRKSPTETARRTRA-SPPPAKRSSPP
Query: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
++K V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+
Subjt: ARKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRT
Query: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRAREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSP
V+ PKRD PK +N DAEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG
Subjt: VATVPKRDGPKPENVGPDAEKD-DMKRAREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRIESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSP
Query: SPLGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPAAAGRRGRSSSYS
SP RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRR+ PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+ G AGRRGRSSSYS
Subjt: SPLGRRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRT-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPAAAGRRGRSSSYS
Query: GSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP
Subjt: GSPSPRKVARRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPP
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