; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi04G020510 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi04G020510
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein yippee-like
Genome locationchr04:27610731..27614557
RNA-Seq ExpressionLsi04G020510
SyntenyLsi04G020510
Gene Ontology termsGO:0000151 - ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR034751 - Yippee domain
IPR039058 - Yippee family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649834.1 hypothetical protein Csa_012456 [Cucumis sativus]5.4e-4170.37Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNA----INISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYK
        C +    F  L  ++FHCRRGKAYLFNNA    INI FGALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYK
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNA----INISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYK

Query:  EGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        EGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSS+SDSE+N
Subjt:  EGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

KAG7024814.1 Protein yippee-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.6e-4772.79Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKE---------------IAFGYQYEAAHEKSQKY
        L  ++FHCRRGKAYLFNNAIN   GALE+R+MLSG HTVADIFCC CGQIVGWKYV+S YYPPHT KE               I   +  EAAHEKSQKY
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKE---------------IAFGYQYEAAHEKSQKY

Query:  KEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        KEGKYVLERGRIVDDIEFSTGF++DSRSSISDSEDN
Subjt:  KEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

XP_004146051.1 protein yippee-like At5g53940 [Cucumis sativus]9.9e-4372.52Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +    F  L  ++FHCRRGKAYLFNNAINI FGALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKY
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSS+SDSE+N
Subjt:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

XP_016903088.1 PREDICTED: protein yippee-like At5g53940 [Cucumis melo]6.8e-4474.05Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +    F  L  ++FHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKY
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSS+SDSE+N
Subjt:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

XP_038899427.1 protein yippee-like At5g53940 [Benincasa hispida]1.8e-4475.57Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +    F  L  ++FHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKY
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
Subjt:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L050 Protein yippee-like4.8e-4372.52Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +    F  L  ++FHCRRGKAYLFNNAINI FGALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKY
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSS+SDSE+N
Subjt:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

A0A1S4E4C9 Protein yippee-like3.3e-4474.05Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +    F  L  ++FHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKY
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSS+SDSE+N
Subjt:  VLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

A0A6J1CDY9 Protein yippee-like2.9e-4072.73Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        L  ++FHCRRGKAYLFN AINIS GALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGK+VLERGRI+DD
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        IEFSTGF+ID+RS +SDSEDN
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

A0A6J1F692 Protein yippee-like6.5e-4072.73Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        L  ++FHCRRGKAYLFNNAIN   GALE+R+MLSG HTVADIFCC CGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        IEFSTGF++DSRSSISDSEDN
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

A0A6J1IP05 Protein yippee-like1.3e-4073.55Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        L  ++FHCRRGKAYLFNNAIN   GALE+R+MLSG HTVADIFCCTCGQIVGWK                    YEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        IEFSTGF++DSRSSISDSEDN
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P59234 Protein yippee-like2.6e-2252.58Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRI
        +  +SFHC+ GKAYLF+  +N++ G +E RMM++G+HTVADIFC  CG IVGWK                    YE AHEKSQKYKEGK VLER +I
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRI

Q9C777 Protein yippee-like At3g112309.7e-1746.81Show/hide
Query:  QSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRI
        +SF  R GKAYLF+  +N+  G  E+RMM++G+HTV DI+C  CG  VGWK                    YE A EK+QKYKEGK VLER ++
Subjt:  QSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRI

Q9FN32 Protein yippee-like At5g539402.7e-3561.16Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        L  +SFHCRRGKAYLFN ++NIS G LEER+MLSG+HTVADIFCC CGQ VGWK                    YE+AHEK+QKYKEGK+VLERGRIVD+
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        I+ ST  +ID+  S SD+ED+
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN

Q9LY56 Protein yippee-like At3g558901.6e-1945Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        +  +SF C+ G+AYLFNN +N+S G  E+RMM++GLH V DIFC  CG  VGWK                    YE AHEKSQKYKEGK VLE  +I   
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED
                 DS   +SD +D
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED

Q9SR97 Protein yippee-like At3g089908.5e-2140Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        +  +SFHC+ G+AYLF+N +N++ G  E R+M++G HTVADIFC +CG +VGWK                    YE A++KSQKYKEGK++LER +++  
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED
          +  G+ ++    ++ S+D
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40110.1 Yippee family putative zinc-binding protein2.9e-2450.47Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +   T+  +  +SFHC+ GKAYLFN   N+S G  EER+M++G HTVADIFC +CG IVGWK                    YE AHEK+QKYKEGK 
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLERGRI
        VLER +I
Subjt:  VLERGRI

AT2G40110.2 Yippee family putative zinc-binding protein8.4e-2450.96Show/hide
Query:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY
        C +   T+  +  +SFHC+ GKAYLFN   N+S G  EER+M++G HTVADIFC +CG IVGWK                    YE AHEK+QKYKEGK 
Subjt:  CISGRLTFSLLFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKY

Query:  VLER
        VLER
Subjt:  VLER

AT3G08990.1 Yippee family putative zinc-binding protein6.0e-2240Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        +  +SFHC+ G+AYLF+N +N++ G  E R+M++G HTVADIFC +CG +VGWK                    YE A++KSQKYKEGK++LER +++  
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED
          +  G+ ++    ++ S+D
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED

AT3G08990.2 Yippee family putative zinc-binding protein6.0e-2240Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        +  +SFHC+ G+AYLF+N +N++ G  E R+M++G HTVADIFC +CG +VGWK                    YE A++KSQKYKEGK++LER +++  
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED
          +  G+ ++    ++ S+D
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSED

AT5G53940.1 Yippee family putative zinc-binding protein1.9e-3661.16Show/hide
Query:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD
        L  +SFHCRRGKAYLFN ++NIS G LEER+MLSG+HTVADIFCC CGQ VGWK                    YE+AHEK+QKYKEGK+VLERGRIVD+
Subjt:  LFDQSFHCRRGKAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDD

Query:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN
        I+ ST  +ID+  S SD+ED+
Subjt:  IEFSTGFFIDSRSSISDSEDN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CTTAGAGCTTCTTCTCACGTCAACAATGGCAGTGATCGTGTCCTTCCCGTACTGGACGATGGACGAATTTATGGGCAAAAGGCGGTTCCCATTTTTCTCAATTCAACCTA
CTTCAACTGTGGCGGAATCCTTTCCCCGTTGAAGCTGAGGCGGAGGACGGGAGCTAAGGAGCGTGGAAGCGATGGGACGGATGTTTGTTGTGGAAAGGGAAGGCAGGTCC
TACAGATGCAAGTACTGCAATACGCAGTTAGCTCTCTTCGACGACCTTGCATCTCGGGTCGTCTAACTTTTTCGCTCTTATTTGATCAGTCCTTTCATTGCCGCCGTGGA
AAAGCCTACCTTTTCAATAACGCGATAAACATTTCTTTTGGAGCATTGGAAGAGAGGATGATGCTCTCAGGATTGCACACTGTAGCAGACATATTTTGTTGCACATGTGG
ACAAATCGTCGGGTGGAAATATGTAAACTCTCCCTATTATCCTCCGCACACTGCAAAAGAAATTGCATTTGGTTACCAATATGAGGCAGCACATGAGAAGAGCCAAAAGT
ACAAGGAGGGGAAGTATGTTCTTGAAAGGGGGAGGATAGTCGATGACATTGAATTCTCGACGGGCTTCTTTATAGACTCTCGGTCCAGTATCAGTGATAGCGAAGATAAT
TAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTAGAGCTTCTTCTCACGTCAACAATGGCAGTGATCGTGTCCTTCCCGTACTGGACGATGGACGAATTTATGGGCAAAAGGCGGTTCCCATTTTTCTCAATTCAACCTA
CTTCAACTGTGGCGGAATCCTTTCCCCGTTGAAGCTGAGGCGGAGGACGGGAGCTAAGGAGCGTGGAAGCGATGGGACGGATGTTTGTTGTGGAAAGGGAAGGCAGGTCC
TACAGATGCAAGTACTGCAATACGCAGTTAGCTCTCTTCGACGACCTTGCATCTCGGGTCGTCTAACTTTTTCGCTCTTATTTGATCAGTCCTTTCATTGCCGCCGTGGA
AAAGCCTACCTTTTCAATAACGCGATAAACATTTCTTTTGGAGCATTGGAAGAGAGGATGATGCTCTCAGGATTGCACACTGTAGCAGACATATTTTGTTGCACATGTGG
ACAAATCGTCGGGTGGAAATATGTAAACTCTCCCTATTATCCTCCGCACACTGCAAAAGAAATTGCATTTGGTTACCAATATGAGGCAGCACATGAGAAGAGCCAAAAGT
ACAAGGAGGGGAAGTATGTTCTTGAAAGGGGGAGGATAGTCGATGACATTGAATTCTCGACGGGCTTCTTTATAGACTCTCGGTCCAGTATCAGTGATAGCGAAGATAAT
TAGAGAGCGGTATTATCATGTAGTATACCGTAACATAATAATTACCAAATGACGATGTTCGGGTTTGCATATAATCTAATAATGTCTGAACTATGAAAATGCAGAGTTAT
CTAGATGGCATGCCTTTGTTTCTTAATTCTTCCACCCTTCTAGTTCATCACTCCACTTTGTTATTTAGCAACAATTTCACTAACTTTCCATTGCTGGCTGATTCTCCCTT
TCTAACTATTTCGACCCATTTGACTCTGTAGTTGAGTGAATACCTCTGTAGTCATATAAAGCTGCTGCAGGCACCCGAATTGTGCTGTAAGTTTTTGGTCATTTATGTTG
TTGTTGAGACTGAACTTTCAGAATGATCAGTAAGTGTATTTTTTCGTTTCACATGTAGAGGTGGAAATTTGAACTTTGAACCTTTTAGTCGATTATATATTCTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
LRASSHVNNGSDRVLPVLDDGRIYGQKAVPIFLNSTYFNCGGILSPLKLRRRTGAKERGSDGTDVCCGKGRQVLQMQVLQYAVSSLRRPCISGRLTFSLLFDQSFHCRRG
KAYLFNNAINISFGALEERMMLSGLHTVADIFCCTCGQIVGWKYVNSPYYPPHTAKEIAFGYQYEAAHEKSQKYKEGKYVLERGRIVDDIEFSTGFFIDSRSSISDSEDN