; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi04G020680 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi04G020680
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4
Genome locationchr04:27825538..27827797
RNA-Seq ExpressionLsi04G020680
SyntenyLsi04G020680
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039828 - VQ motif-containing protein 33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK20262.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-11493.15Show/hide
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XP_038896819.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]8.2e-11493.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L3E4 VQ domain-containing protein3.6e-11593.93Show/hide
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A0A1S3BTW1 VQ motif-containing protein 44.7e-11593.55Show/hide
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A0A5A7VAR6 VQ motif-containing protein 44.7e-11593.55Show/hide
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A0A5D3D9L9 VQ motif-containing protein 41.4e-11493.15Show/hide
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A0A6J1IMJ9 VQ motif-containing protein 4-like3.2e-10388.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 131.3e-2141.07Show/hide
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        R R+ + N  P+ ++  + P           + Y TTF++ D S+FK VVQ+LTG       P  PT  P P          PF S     IPPIK    
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        L PSP  TPR  + P+LLSLFP T
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Q5M750 VQ motif-containing protein 42.1e-4354.47Show/hide
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        S N+   S++  SN PP      +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E  RP H  +  P P+   P    +P  +  +F IPPIK  P 
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        K+QS      F+LYERRN +KN L IN L P F+   +   FSPR  EILSPSILDFPSL LSPVTPL  DP     SS+ S    + EE+A+ E+GFYL
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        HPSP  TP   DP P+LL LFP TSPRVSGSSS+S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 332.8e-3249.21Show/hide
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        STS+  S  E+ +NP P  S          P      +  SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS         T +        PSP        +F
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Query:  PIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPNFSGSGAVGG---------FSPRNLE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL--NDDPL
         IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N       GG         FSPRN       +LSPS+LDFP L L SPVTPL  NDDP 
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Query:  FDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP
        F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 312.3e-1033.51Show/hide
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        TTFVQ DT+ F+ +VQ LTG          PT +   ++ P  +               IKTA +K+ + KL+ERR  ++  L I     +F  +G    
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Query:  FSPRNLEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVSG
            N  +L+ S +  PS   S ++ +  +P  D  ++     +  EEE+AI E+ FYLHPSP + P   + P+LL+LFP TSP  SG
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 194.8e-4053.54Show/hide
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        PS ++S  S++I +      ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS SPR P  P P   PS               NF IPPIKTA PKK  
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Query:  SFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHP
          KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER IA+KG+YLH 
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Query:  SPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVS
        SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.5e-4454.47Show/hide
Query:  SPNTSPNSTTINSNPPPP----KLLPRSDS-NPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNFPIPPIKTAPK
        S N+   S++  SN PP      +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E  RP H  +  P P+   P    +P  +  +F IPPIK  P 
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Query:  KQQS------FKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYL
        K+QS      F+LYERRN +KN L IN L P F+   +   FSPR  EILSPSILDFPSL LSPVTPL  DP     SS+ S    + EE+A+ E+GFYL
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        HPSP  TP   DP P+LL LFP TSPRVSGSSS+S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.8e-4253.71Show/hide
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        S N+   S++  SN PP      +  RS+S NPYPTTFVQADTS+FK VVQMLTGS+E  RP H  +  P P+   P    +P  +  +F IPPIK  P 
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Query:  HPSPMNTPRAADP-PQLLSLFPETSPRVS
        HPSP  TP   DP P+LL LFP TSPRVS
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein9.3e-2341.07Show/hide
Query:  RERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNFPIPPIKTAPK
        R R+ + N  P+ ++  + P           + Y TTF++ D S+FK VVQ+LTG       P  PT  P P          PF S     IPPIK    
Subjt:  RERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNFPIPPIKTAPK

Query:  KQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFY
        K+Q  SF+L ERRN +K+ L IN   P  SG            EIL+P+IL+FP+L LSP TPL  DP +   S S S   S      ++ER+I EKGFY
Subjt:  KQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFY

Query:  LHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPET
        L PSP  TPR  + P+LLSLFP T
Subjt:  LHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPET

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein3.4e-4153.54Show/hide
Query:  PSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNFPIPPIKTA-PKKQQ
        PS ++S  S++I +      ++ RSD   YPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGSS SPR P  P P   PS               NF IPPIKTA PKK  
Subjt:  PSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNFPIPPIKTA-PKKQQ

Query:  SFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHP
          KLYERR+H      LKNSLMINTL+    G+G+   FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL      ++      +   SEEER IA+KG+YLH 
Subjt:  SFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHP

Query:  SPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVS
        SP++TPR ++ PQLL LFP TSPR+S
Subjt:  SPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVS

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein2.0e-3349.21Show/hide
Query:  STSTTRSSHERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNF
        STS+  S  E+ +NP P  S          P      +  SNPYPTTFVQADTS FK VVQMLTGSS         T +        PSP        +F
Subjt:  STSTTRSSHERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHVVQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNF

Query:  PIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPNFSGSGAVGG---------FSPRNLE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL--NDDPL
         IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL + N       GG         FSPRN       +LSPS+LDFP L L SPVTPL  NDDP 
Subjt:  PIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-IPNFSGSGAVGG---------FSPRNLE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL--NDDPL

Query:  FDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP
        F+KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR +  P LL LFP  SP
Subjt:  FDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCAACGCAATGGGGCAGACACTCAGACAAATAAGTCCTAAGCTCAGCTCAGGGCCTCTCAACCTTCTTTCTCACTCCTCCCCTTTCTCTCTCATTCCATCCAATCA
AAACCCACCCTCAAATTCTCAAACTCTCANAATCACTTCTTCTTCAACCTCAACAACAAGATCATCTCATGAAAGAGAAAGAAACCCTTCTCCAAATACTTCCCCAAACA
GTACCACCATCAACTCCAATCCTCCTCCTCCTAAGCTCCTCCCCAGATCTGATTCCAATCCTTATCCCACCACTTTCGTTCAAGCTGATACCTCCAATTTCAAGCACGTC
GTTCAAATGCTCACTGGCTCATCCGAATCTCCCCGGCCACCGCATCCACCAACGCCATCCCCTAAGCCCTCTTCTATTCCTCCTCCTTCTCCTCAAGAACCCTTTCAATC
CTCCAAAAACTTCCCGATTCCTCCCATCAAAACAGCCCCCAAGAAACAGCAGAGTTTCAAGCTCTATGAAAGAAGAAATCACCTCAAGAATAGCCTCATGATCAATACCC
TAATCCCCAATTTCTCCGGTTCCGGTGCGGTGGGGGGATTTTCTCCTCGTAACCTTGAGATTCTCTCTCCGAGTATCCTCGATTTTCCTTCGCTTGCTCTCAGCCCTGTT
ACGCCTTTGAACGATGACCCGTTGTTCGACAAATCGTCGTCATCGCCGTCGCTTGGGAGCTCGTCGGAGGAGGAGAGAGCGATTGCCGAGAAGGGGTTTTACTTGCATCC
ATCGCCGATGAATACCCCCAGAGCCGCCGACCCGCCGCAGCTTCTTTCTCTGTTCCCGGAAACGTCGCCTAGGGTTTCTGGATCCTCGTCTTCTTCG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGTGTAATAAATTGACGCGTGAAAGCCACGACGTTAAAATGTCCAACGCAATGGGGCAGACACTCAGACAAATAAGTCCTAAGCTCAGCTCAGGGCCTCTCAACCTTCTT
TCTCACTCCTCCCCTTTCTCTCTCATTCCATCCAATCAAAACCCACCCTCAAATTCTCAAACTCTCANAATCACTTCTTCTTCAACCTCAACAACAAGATCATCTCATGA
AAGAGAAAGAAACCCTTCTCCAAATACTTCCCCAAACAGTACCACCATCAACTCCAATCCTCCTCCTCCTAAGCTCCTCCCCAGATCTGATTCCAATCCTTATCCCACCA
CTTTCGTTCAAGCTGATACCTCCAATTTCAAGCACGTCGTTCAAATGCTCACTGGCTCATCCGAATCTCCCCGGCCACCGCATCCACCAACGCCATCCCCTAAGCCCTCT
TCTATTCCTCCTCCTTCTCCTCAAGAACCCTTTCAATCCTCCAAAAACTTCCCGATTCCTCCCATCAAAACAGCCCCCAAGAAACAGCAGAGTTTCAAGCTCTATGAAAG
AAGAAATCACCTCAAGAATAGCCTCATGATCAATACCCTAATCCCCAATTTCTCCGGTTCCGGTGCGGTGGGGGGATTTTCTCCTCGTAACCTTGAGATTCTCTCTCCGA
GTATCCTCGATTTTCCTTCGCTTGCTCTCAGCCCTGTTACGCCTTTGAACGATGACCCGTTGTTCGACAAATCGTCGTCATCGCCGTCGCTTGGGAGCTCGTCGGAGGAG
GAGAGAGCGATTGCCGAGAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGATGAATACCCCCAGAGCCGCCGACCCGCCGCAGCTTCTTTCTCTGTTCCCGGAAACGTCGCCTAG
GGTTTCTGGATCCTCGTCTTCTTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNAMGQTLRQISPKLSSGPLNLLSHSSPFSLIPSNQNPPSNSQTLXITSSSTSTTRSSHERERNPSPNTSPNSTTINSNPPPPKLLPRSDSNPYPTTFVQADTSNFKHV
VQMLTGSSESPRPPHPPTPSPKPSSIPPPSPQEPFQSSKNFPIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFSGSGAVGGFSPRNLEILSPSILDFPSLALSPV
TPLNDDPLFDKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAADPPQLLSLFPETSPRVSGSSSSS