CuGenDBv2

Gene ID	Lsi05G003490
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Photosystem II CP47 reaction center protein
Genome location	chr05:4448260..4455477
RNA-Seq Expression	Lsi05G003490
Synteny	Lsi05G003490
Gene Ontology terms	GO:0009772 - photosynthetic electron transport in photosystem II (biological process) GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process) GO:0009523 - photosystem II (cellular component) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function) GO:0045156 - electron transporter, transferring electrons within the cyclic electron transport pathway of photosynthesis activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000932 - Photosystem antenna protein-like IPR036001 - Photosystem antenna protein-like superfamily

Homology

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Q0G9T6 Photosystem II CP47 reaction center protein

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Q2QD63 Photosystem II CP47 reaction center protein

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Q68RY1 Photosystem II CP47 reaction center protein

1.0e-171

98.98

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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00680.1 photosystem II reaction center protein B

8.0e-172

98.64

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ATGGCTTTAGAGCTCATGATAATTTGCTTTCTGTTTTTCATATAATGATGAGATTTGGTTCATATACCGTTTGTGTGGAGATATTGGTGAGTGAGAATATCACATAA

mRNA sequence

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Protein sequence

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GVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGFRAHDNLLSVFHIMMRFGSYTVCVEILVSENIT

Lsi05G003490 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome