| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004145851.1 THO complex subunit 4D [Cucumis sativus] | 4.6e-141 | 93.36 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGR A+S+V N FPGPSHRGGLRN RGRGRG WSRG+GLG G GGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_008457020.1 PREDICTED: THO complex subunit 4D [Cucumis melo] | 1.6e-141 | 94.06 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
PESGR A+ +V NPFPGPSHRGGLRN RGRGRG W+RG+GLG G GGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 3.4e-136 | 88.52 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPPRRMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGL----GLGLGGGG-------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
ESGRT SS+ NPFPGPSHRGGLR+GRGRGRGGWSRGL G GLGGGG GRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGL----GLGLGGGG-------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 3.4e-136 | 91.19 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPPRRMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLGLGLG---GGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRT SS+ NPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGWSRGLG G G GGGGRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLGLGLG---GGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 3.1e-145 | 96.15 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
PESGRTASS+V NPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW+RG G+G GGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L717 RRM domain-containing protein | 4.5e-102 | 96 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
|
|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 7.6e-142 | 94.06 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPP RMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
PESGR A+ +V NPFPGPSHRGGLRN RGRGRG W+RG+GLG G GGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 3.0e-130 | 90.21 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI KPPRRMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAEMPVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRT SS+V N FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G GGGRGRGRGRGRG GRKK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 2.8e-136 | 91.19 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPPRRMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLGLGLG---GGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRT SS NPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGWSRGLG G G GGGGRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLGLGLG---GGGGRGRGR----GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 1.6e-136 | 88.52 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPLGINAR SA+SI KPPRRMKNVQW+HDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGL----GLGLGGGG-------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
ESGRT SS+ NPFPGPSHRGGLR+GRGRGRGGWSRGL G GLGGGG GRGRGR GRGRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: PESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGL----GLGLGGGG-------GRGRGR--------GRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 7.3e-33 | 38.78 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPRRMKNV--QWKHDLFEDSLRASGIS
MA +DMSL+D+IK N ++ +RG R GRG GG+ GG GV G GP+ + AR + P R K + +W+HDLF+ A +
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVVIGSVRRGPL---GINARASAYSIRKPPRRMKNV--QWKHDLFEDSLRASGIS
Query: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
G+E G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I++ V+++I
Subjt: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNG
Query: RSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGG----RGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
++ R + SV +RGG+ RG LG G GGGG RG RGRGRG GR + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: RSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGG----RGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 5.2e-71 | 54.58 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP RR++++ W+ LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTPESGR----TASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G P P S R + N +G G G G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTPESGR----TASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 7.1e-44 | 44.41 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS ++ + W++D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P +
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW-SRGLGLGLGGG---GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
+ P + F G + N RGRGRGG+ R G G GGG GGRG RGRG GRG GR + S+++LD EL+ YH E
Subjt: VNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW-SRGLGLGLGGG---GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
Query: AMQT
AM+T
Subjt: AMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 2.3e-42 | 42.27 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLF----EDSLRASGISGIEIG
M+T LDMSL+D+I KN ++RG A RG G G + R P + R++ Y K P W HD+F ED +GIE G
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLF----EDSLRASGISGIEIG
Query: TKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRT
TKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N +
Subjt: TKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTGVNGRSRRT
Query: VVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
TA++ P G S+ R G+GRGG RG G G GG GG GRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: VVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 7.8e-67 | 52.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPRRMKNVQW--KHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K RR +++ W ++DL+E++LRA
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPRRMKNVQW--KHDLFEDSLRAS
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSR----------GLGLGLGGGGGRGRGRGRGR-----GQGRKKPVEKSSDEL
G+NGR +R+V F G RGG R GRGRG G R G+ G GG GRGRG G GR G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GVNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSR----------GLGLGLGGGGGRGRGRGRGR-----GQGRKKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.5e-68 | 52.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPRRMKNVQW--KHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K RR +++ W ++DL+E++LRA
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPRRMKNVQW--KHDLFEDSLRAS
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSR----------GLGLGLGGGGGRGRGRGRGR-----GQGRKKPVEKSSDEL
G+NGR +R+V F G RGG R GRGRG G R G+ G GG GRGRG G GR G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GVNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSR----------GLGLGLGGGGGRGRGRGRGR-----GQGRKKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.5e-68 | 52.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPRRMKNVQW--KHDLFEDSLRAS
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG GGRG G VRRGPL +N R +S++SI K RR +++ W ++DL+E++LRA
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLGINAR-ASAYSIRKPPRRMKNVQW--KHDLFEDSLRAS
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVT
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-MPVSARINVT
Query: GVNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSR----------GLGLGLGGGGGRGRGRGRGR-----GQGRKKPVEKSSDEL
G+NGR +R+V F G RGG R GRGRG G R G+ G GG GRGRG G GR G+G KKPVEKS+ +L
Subjt: GVNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSR----------GLGLGLGGGGGRGRGRGRGR-----GQGRKKPVEKSSDEL
Query: DKELENYHAEAM
DK+LE+YHAEAM
Subjt: DKELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 5.0e-45 | 44.41 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS ++ + W++D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P +
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEMPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW-SRGLGLGLGGG---GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
+ P + F G + N RGRGRGG+ R G G GGG GGRG RGRG GRG GR + S+++LD EL+ YH E
Subjt: VNGRSRRTVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW-SRGLGLGLGGG---GGRG-RGRGRGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
Query: AMQT
AM+T
Subjt: AMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 3.7e-72 | 54.58 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP RR++++ W+ LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTPESGR----TASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G P P S R + N +G G G G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTPESGR----TASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 2.0e-73 | 55.67 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL +NAR S+++I KP RR++++ W+ LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLGINARASAYSIRKPPRRMKNVQWKHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N +E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ GR P P S R + N +G G G G G GGRGRG GRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTPESGRTASSSVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGLGLGGGGGRGRGRGRGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
