; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G004730 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G004730
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2
Genome locationchr05:6054091..6057994
RNA-Seq ExpressionLsi05G004730
SyntenyLsi05G004730
Gene Ontology termsGO:0033615 - mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR011419 - ATP12, ATP synthase F1-assembly protein
IPR023335 - ATP12 orthogonal Bundle domain superfamily
IPR042272 - ATP12, ATP synthase F1-assembly protein, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022934998.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 [Cucurbita moschata]2.3e-16892.51Show/hide
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XP_038878128.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X2 [Benincasa hispida]2.8e-17495.81Show/hide
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XP_038878129.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X3 [Benincasa hispida]9.4e-17096Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BNE3 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X11.1e-16088.92Show/hide
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A0A6J1DKX6 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 29.2e-16391.37Show/hide
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A0A6J1F9A4 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 21.1e-16892.51Show/hide
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A0A6J1J577 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 25.0e-16992.22Show/hide
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E5GCD8 ATP12-like protein1.1e-16088.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P22135 Protein ATP12, mitochondrial6.8e-0621.43Show/hide
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        PT     S   ++F+++V+     ++    + LD RT+KTP    + +      LA  +  EW    +  I+  ++PL  L    ++      P     L
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        + K   N D               LVF    E +  L +   E  +  +  + +++R   SE   +  +  +      G +Q D +  A +  +      
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Query:  ELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRG-----------KLQIEEAIELIRLEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATV
        +LA ++       S I  + +              K  ++  +    LE   QV+KWG VE  HDVD  D+R +I +A +
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Q1LZ96 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 21.1e-2431.22Show/hide
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        KRFYQ V+  + +   G+ + LD+R L+TP  +   +P+  LA AVA EW+ Q+ D I+ +TM L  L  T+L+  P  R K  +I   +K  + D V  
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        R  E   L     E Q  + DP++ W    +G +    +S  G        + +   L   +   L  I+ + +   SL++ +G+   +L +E+A+ L R
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        LEE+ Q+ KWG +E  HD ++ +LR + ++ T+F+ L
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Q8N5M1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 22.7e-2631.22Show/hide
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        KRFYQ V+  + +   G+ + LD+R LKTP  +   +P+  LA AVA EW+ Q+ D I+ +TM L  L  T+L+  P  R K  +I   +K  + D +  
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        R  E   L     E Q  + DP+++W    +G +    +S  G        + +   L   +   L  I+ +A+   S+++ +G+   +L +E+A+ L R
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        LEE+ Q+ KWG +E  HD ++ +LR + ++ T+F+ L
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Q91YY4 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 21.3e-2530.8Show/hide
Query:  KRFYQQVTTREADDRNGWTVMLDYRTLKTPSKRPLKLPTLGLAKAVAAEWEYQETDGIRPFTMPLMKLACTALERVPLTRPK--IIEHLMKKFNQDLVFC
        KRFYQ V+  + +   G+ + LD+R LKTP  +   +P+  LA AVA EW+ Q+ D I+ +TM L  L  T+L+  P  R K  +I   +K  + D +  
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Query:  RAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIR
        R  E   L     E Q  + DP+++W    +G +    +S  G        + +   L   +   L  I+ + +   S+++ +G+   +L +E+A+ L R
Subjt:  RAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIR

Query:  LEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATVFLAL
        LEE+ Q+ KWG +E  HD ++ +LR + ++ T+F+ L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40660.1 ATP12 protein-related2.5e-12068.14Show/hide
Query:  MASSILSKMAKSIRITNPTLIPFHSFRCRMLSTSVATAAEQAQSD------AASFTFSEDNAREDPIFVKAPVSNSRADSSSPSSSSVTMPTSFMTGSVV
        MA+ ++ +  KS R +N  +      R R L T+  +AA Q  SD      ++SFTF ++N  E PI VKAP  NSR  +    S SVTMPTSFMTGS+V
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Query:  GKRFYQQVTTREADDRNGWTVMLDYRTLKTPSKRPLKLPTLGLAKAVAAEWEYQETDGIRPFTMPLMKLACTALERVPLTRPKIIEHLMKKFNQDLVFCR
        GKRFY++VTTREADD NGWTVMLDYRTLKTPSKRPLKL +L LAKA+AAEWEYQ T+GIRPFTMPLM+LACTALERVPLTR KIIEHL +K +QDLVF R
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Query:  APEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIRL
        APEDN LTS V++ QVE +DPLL+W+ SEF  KP VYSS FGGKQ+D L+KAVE+LL+KT+D ELASIDA+ ++AHS++IA+GIF GKLQI++AI+LIRL
Subjt:  APEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWVRSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIRL

Query:  EEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATVFLALSRK
        EEDLQVDKWGLVEGGHD+D+ADL+VQISSATVFLALSR+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAGCTCAATTTTATCAAAAATGGCGAAATCAATCAGAATCACCAATCCCACGCTAATTCCATTTCATTCATTCCGCTGCCGTATGCTTTCTACCAGTGTCGCCAC
CGCTGCCGAACAAGCTCAATCCGACGCTGCCTCCTTCACCTTCTCCGAGGACAACGCTAGAGAAGATCCTATTTTCGTCAAGGCTCCAGTTTCGAATTCCAGAGCCGATT
CTTCATCCCCTTCCAGCTCCTCGGTGACGATGCCGACCTCGTTCATGACCGGTTCCGTCGTAGGCAAGCGATTTTACCAGCAAGTGACTACGAGGGAAGCGGATGATCGG
AATGGATGGACGGTGATGCTTGATTACCGGACGCTGAAGACTCCTTCGAAGAGGCCGCTAAAGCTACCGACTCTCGGTCTCGCCAAGGCCGTTGCGGCTGAGTGGGAATA
TCAGGAAACAGATGGGATTAGACCCTTCACAATGCCTCTAATGAAACTGGCCTGTACCGCATTGGAAAGAGTGCCTCTTACCCGGCCCAAGATTATCGAACATTTGATGA
AGAAATTCAATCAGGATTTGGTTTTCTGTCGTGCTCCGGAGGACAATGTTCTAACAAGTGGAGTTTATGAACGACAAGTGGAGAAAGTTGATCCTTTACTTGACTGGGTG
CGCTCAGAATTTGGCTTTAAGCCTGTTGTATATTCCAGTTTTTTTGGTGGGAAGCAGGAGGACGGTCTTATAAAAGCTGTTGAAGATCTTCTAAGAAAAACAGATGACTG
TGAATTGGCATCAATCGATGCCATTGCGTCAGCTGCACACTCTTTAATAATTGCTATTGGAATTTTTCGTGGAAAGTTGCAGATCGAAGAAGCAATTGAGTTGATTAGAC
TCGAAGAAGATCTGCAGGTGGATAAATGGGGTCTGGTTGAAGGTGGTCACGATGTCGATATTGCTGATCTACGGGTTCAGATCTCATCTGCCACGGTATTTCTCGCTCTT
TCAAGGAAATTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTTTCAAGTGTTGGAGTGCTTCTTGCTTCTTCTAAGAGCACCACACATTCCCTTTTTGATCCACTTGTAAATGTCATTGCTTCACCTTGTTCTTTTTCTTCTTCATT
CAAAGTTTGTATGTTGTTGAGTAAGGTATCTTGTGGGTAATTTCCACTTCATTTGTACATTCTTCCATCTGGATCTCCAAAATTTGTTGAGATGTCGTTTCACTTTCAAT
GTTGACACCCAATGTAGATCTCGATCAAGTTGGATCGAAAAAAATTAGTCTAAGGAATTAAAAAAAAATATGCTAATTTTGAGAAGTGAAATTTAGAGGAAGGTACGTAT
AACCATTTCAGAGTATTATAGATTATTTCGTGTGAAATTTTGCAGACCATTTGTAAATCAACCCGTCCGAGTCCGAGTCGAGTCCGAAAACATGTAAACCGATCCGTGTA
TTTGCAATCCCTCTTCTTCCTCAATTTCTAAAACCCTAGCGCAGTTCACTCAGAAACACAAACATTAGGGGGAAAGCAAGAAAATGGCGAGCTCAATTTTATCAAAAATG
GCGAAATCAATCAGAATCACCAATCCCACGCTAATTCCATTTCATTCATTCCGCTGCCGTATGCTTTCTACCAGTGTCGCCACCGCTGCCGAACAAGCTCAATCCGACGC
TGCCTCCTTCACCTTCTCCGAGGACAACGCTAGAGAAGATCCTATTTTCGTCAAGGCTCCAGTTTCGAATTCCAGAGCCGATTCTTCATCCCCTTCCAGCTCCTCGGTGA
CGATGCCGACCTCGTTCATGACCGGTTCCGTCGTAGGCAAGCGATTTTACCAGCAAGTGACTACGAGGGAAGCGGATGATCGGAATGGATGGACGGTGATGCTTGATTAC
CGGACGCTGAAGACTCCTTCGAAGAGGCCGCTAAAGCTACCGACTCTCGGTCTCGCCAAGGCCGTTGCGGCTGAGTGGGAATATCAGGAAACAGATGGGATTAGACCCTT
CACAATGCCTCTAATGAAACTGGCCTGTACCGCATTGGAAAGAGTGCCTCTTACCCGGCCCAAGATTATCGAACATTTGATGAAGAAATTCAATCAGGATTTGGTTTTCT
GTCGTGCTCCGGAGGACAATGTTCTAACAAGTGGAGTTTATGAACGACAAGTGGAGAAAGTTGATCCTTTACTTGACTGGGTGCGCTCAGAATTTGGCTTTAAGCCTGTT
GTATATTCCAGTTTTTTTGGTGGGAAGCAGGAGGACGGTCTTATAAAAGCTGTTGAAGATCTTCTAAGAAAAACAGATGACTGTGAATTGGCATCAATCGATGCCATTGC
GTCAGCTGCACACTCTTTAATAATTGCTATTGGAATTTTTCGTGGAAAGTTGCAGATCGAAGAAGCAATTGAGTTGATTAGACTCGAAGAAGATCTGCAGGTGGATAAAT
GGGGTCTGGTTGAAGGTGGTCACGATGTCGATATTGCTGATCTACGGGTTCAGATCTCATCTGCCACGGTATTTCTCGCTCTTTCAAGGAAATTTTGAAACCATTACTTT
CTTATTGTACCCTGAGAGCTAGGATGGTGTCTTTTTTTTAGTTTTTAGTTTTTTGTATCTTGTTGTAGATCCAAAGGGCCTTTCTAAATTATGTTCTAAGACTGTTTATA
GGCATACAATAGCTATGAGCAGTTGAGAAAATAATTATATTTACTGGAAAATAATGGATAGATTATTTTTGTAAACATTTCCCTCTGGCCAAGAAAGAACTTAGATGCCA
CTGTCTTTAATCTTTGGCTTTGTGAGAGTAAATCAAAATCACATACAAAATAATGCATAGAAGAAGGCTTTTAGAAGAGTTTATATTCAATCCAAGTGAAGTAATAGCTG
AGCATGTTTAGTAGTGTAGACATTGTCAAAGCTCTTGGCAGCATTGCACACAGAGAGGTGGCTGTTTCCAGATATCACAGTTACAACAGGCAGTGTCACAGTCATTATTG
CACCCTACATTAGACATTTTCCAATATGAGAGTTCTTTTGGTTAAGATTTCATAAATGTTAACAAGGATATGCTTTTTGCAAGTGCTAGGTGAATTTGGCTATCTCAATT
CTTGGTAAGTCAAGATTCTCATCTATGCTCTTCTTTTAATTTACTACCCATTGTTTCTATGTTTAATGAGAATTGACAAATGGTTTCATAAGAACAAAAAGAAGTTTTTG
TTTTTTAAAAGATACCATTTCTTTTAGTACAAAAGTCCTGATCATAGTTATTATTAAGAGTTTGTTGACATCAAATGTCTAATCTCAAATTTATGAAAAATGTTCATGTC
ATTGATATTGTGAAGGAAACCTTAAAGTCAAATTCATGTAAATTTATCAATATGTTGTAGATTATGGCCGTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSILSKMAKSIRITNPTLIPFHSFRCRMLSTSVATAAEQAQSDAASFTFSEDNAREDPIFVKAPVSNSRADSSSPSSSSVTMPTSFMTGSVVGKRFYQQVTTREADDR
NGWTVMLDYRTLKTPSKRPLKLPTLGLAKAVAAEWEYQETDGIRPFTMPLMKLACTALERVPLTRPKIIEHLMKKFNQDLVFCRAPEDNVLTSGVYERQVEKVDPLLDWV
RSEFGFKPVVYSSFFGGKQEDGLIKAVEDLLRKTDDCELASIDAIASAAHSLIIAIGIFRGKLQIEEAIELIRLEEDLQVDKWGLVEGGHDVDIADLRVQISSATVFLAL
SRKF