; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G004810 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G004810
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionCell wall protein DAN4-like
Genome locationchr05:6122757..6123209
RNA-Seq ExpressionLsi05G004810
SyntenyLsi05G004810
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056279.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]4.6e-0745.33Show/hide
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        MAYQSLA LALII       AQAP+TSPT++PA                 T++SS+S +SS D      S++I T + SS D+S                
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              SISVAP  S DS   +AQSPT  T+PTGSPS ETSRLF NGFFG
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KAA0056285.1 cell wall protein DAN4-like [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-0844.67Show/hide
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        MAYQSLALLALI+       AQAPSTSPT+SP   TSS DS++S ++S+D+ +++++ TSS D      +SSIS   A SPDSS                
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                              AQSPT  T+PTGSPS ETSR F NGFFG
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KGN58213.1 hypothetical protein Csa_017497 [Cucumis sativus]5.0e-0648Show/hide
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        MAYQSLA LALII       AQ P++S   +PAPTTS   ST +P  S    SSSSS      SS+D+++++ +T S SS DS                 
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             PSIS AP  S DS   +AQSPT  T+P+GSPSIETSRLF NGFFG
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XP_038887448.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]1.5e-2158.94Show/hide
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        MAYQSLALLA+II   +   AQAPSTS TTSPAP TSSFDSTSSP  S +T    SS TSS DSS                               TSPD
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        LS YAPSISVAP  S DST+ N AQSPTPE APTGSPS+ETSRLF N FFG
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XP_038887469.1 classical arabinogalactan protein 6-like [Benincasa hispida]3.4e-1854.97Show/hide
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        MAYQSLALL +II   +   AQAPSTSPTTS AP TSSFDSTSS   S +T S  SSQ SS                                    SPD
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        LS YAPSISVAP  S DST+ N AQSPTPE APTGSP+  TSRLF NGFFG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8Q5 Uncharacterized protein2.4e-0648Show/hide
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        MAYQSLA LALII       AQ P++S   +PAPTTS   ST +P  S    SSSSS      SS+D+++++ +T S SS DS                 
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             PSIS AP  S DS   +AQSPT  T+P+GSPSIETSRLF NGFFG
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A0A0A0LB81 Uncharacterized protein6.0e-0544Show/hide
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        MAYQSLA LALII       AQ P++S   +PAPTTSSFDS+                T S  SS+D+++++ +T ++SS  SS+ S             
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             PSISVAP  + DS    AQSPT   +PTGS S ETSR F NGFFG
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A0A1S3BPQ2 cell wall protein DAN4-like2.4e-0644.59Show/hide
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        MAYQSLA L LII       AQAPSTSPT++PA  TSSFDS++S ++S+D   S+++ T++  SS D   SSIS   A SPDSS                
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                              AQSPT  T+PTGS S ETSRLF NGF
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A0A5D3C1H7 Cell wall protein DAN4-like9.0e-0944.67Show/hide
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        MAYQSLALLALI+       AQAPSTSPT+SP   TSS DS++S ++S+D+ +++++ TSS D      +SSIS   A SPDSS                
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                              AQSPT  T+PTGSPS ETSR F NGFFG
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A0A5D3C1I1 Cell wall protein DAN4-like2.2e-0745.33Show/hide
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        MAYQSLA LALII       AQAP+TSPT++PA                 T++SS+S +SS D      S++I T + SS D+S                
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              SISVAP  S DS   +AQSPT  T+PTGSPS ETSRLF NGFFG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTATCAATCTCTTGCTCTTCTTGCTCTCATAATCGCTACCACCATCAGTACTAATGCTCAGGCTCCTTCTACCTCCCCCACAACCTCTCCGGCTCCAACGACCTC
TTCGTTTGATTCCACCTCGTCCCCAACGGCCTCTATCGATACTTTGTCGTCTTCATCGTCCCAAACAAGCTCACCGGATTCCTCTGTCGATGCTTCGTCGTCTTCAATTT
CAACCGTTTCGGCAAGTTCGCCGGATTCCTCTTCGTCGTCTCCGTCTTCCCTCGATGCAACACACACCACCTCACCAGATCTCTCTGCCTATGCTCCATCAATCTCTGTG
GCTCCGGAATCCTCATTGGATTCCACCAATTTCAATGCTCAGTCACCAACGCCTGAGACAGCTCCAACTGGATCTCCCTCTATTGAGACTTCTCGCTTGTTTGGAAATGG
TTTTTTTGGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTATCAATCTCTTGCTCTTCTTGCTCTCATAATCGCTACCACCATCAGTACTAATGCTCAGGCTCCTTCTACCTCCCCCACAACCTCTCCGGCTCCAACGACCTC
TTCGTTTGATTCCACCTCGTCCCCAACGGCCTCTATCGATACTTTGTCGTCTTCATCGTCCCAAACAAGCTCACCGGATTCCTCTGTCGATGCTTCGTCGTCTTCAATTT
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TTTTTTTGGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYQSLALLALIIATTISTNAQAPSTSPTTSPAPTTSSFDSTSSPTASIDTLSSSSSQTSSPDSSVDASSSSISTVSASSPDSSSSSPSSLDATHTTSPDLSAYAPSISV
APESSLDSTNFNAQSPTPETAPTGSPSIETSRLFGNGFFG