; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G007280 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G007280
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationchr05:9928126..9932338
RNA-Seq ExpressionLsi05G007280
SyntenyLsi05G007280
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022136911.1 ras-related protein RABD1 [Momordica charantia]1.2e-10396.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein6.2e-10698.51Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X16.2e-10698.01Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD15.8e-10496.52Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like1.5e-10496.52Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like1.5e-10496.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM16.2e-8779.71Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC16.2e-8778.22Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM21.4e-8678.71Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c7.3e-8878.61Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD11.5e-9385.15Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 51.4e-8677.23Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.1e-6257.97Show/hide
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +  ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T ++  G    K            
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        +KS CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.1e-9485.15Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C5.2e-8978.61Show/hide
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        S
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A1.7e-8778.11Show/hide
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        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
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        QWLNEIDRYA+++V KLLVGNK DL   KVV T+TAK FADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQ++GQP+ Q+SGCC
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        S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TATAAGTACAATTGGAGTTGATTTCAAAATCAGAACTGTGGAACTGGATGGAAAGACTATTAAACTCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAGGAGAGATTCAGGACTATAA
CAAGCAGCTATTACAGAGGTGCACATGGAATAATTATTGTTTATGATGTCACTGAGATGGAGAGCTTTAACAACGTCAAGCAGTGGCTGAATGAGATTGATAGATATGCT
AATGATAGTGTATGCAAGCTTTTAGTTGGAAATAAGTGTGATTTAGTTGAGAACAAGGTTGTTGACACACAAACAGCAAAGGTATTTGCAGACGAGCTTGGAATCCCTTT
TCTAGAGACGAGTGCCAAAGACTCGATCAACGTAGAGCAAGCTTTCTTAACTATGGCTGCTGAAATAAAGAAAAAAATGGGGAGCCAGCCAACTTCGTCCAAGTCGTCAG
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AAAAACTACACCGGGAAAACAAACACAAATTTAAAAAAAATAGAAGACTAAAAATGAAATCAACTAAAACTTGTTCTATTTTATAATTTTTGAAAGTTTATAAAAAATTT
ATTAAACACAAACAAAAACGTGTAATTTATGTCCCATAAAAAGCAAGTTAACATCTAATAATAAGCATGATTTAAGGGAGGGAGGGAGAGAAAGAAAAAGACAAACTTTA
ATTAATAATTTAGAAGTTCTCTTTCTAGAAAAAAAAAATTTAAAAATAAAATCATCAAACGGGTCTCCTACTTCACTCCCACTTTCTCTCCGCTTTCGGTCCGAAGACTC
CGTGAGAAAACCAAGGACACAGATTTCTCCATTTCGATTCAAGCCATGAGCAACGAATATGATTATTTGTTCAAGCTCTTGCTAATCGGCGACTCTTCCGTTGGAAAATC
GTGCCTTCTTCTCAGATTTGCGGATGATTCCTATGTGGATAGCTATATAAGTACAATTGGAGTTGATTTCAAAATCAGAACTGTGGAACTGGATGGAAAGACTATTAAAC
TCCAGATTTGGGACACTGCTGGTCAGGAGAGATTCAGGACTATAACAAGCAGCTATTACAGAGGTGCACATGGAATAATTATTGTTTATGATGTCACTGAGATGGAGAGC
TTTAACAACGTCAAGCAGTGGCTGAATGAGATTGATAGATATGCTAATGATAGTGTATGCAAGCTTTTAGTTGGAAATAAGTGTGATTTAGTTGAGAACAAGGTTGTTGA
CACACAAACAGCAAAGGTATTTGCAGACGAGCTTGGAATCCCTTTTCTAGAGACGAGTGCCAAAGACTCGATCAACGTAGAGCAAGCTTTCTTAACTATGGCTGCTGAAA
TAAAGAAAAAAATGGGGAGCCAGCCAACTTCGTCCAAGTCGTCAGGGAATGTGCAAATGAAGGGGCAGCCAATTCAGCAAAAGAGCGGCTGTTGCAGTTGAGCACTTTCT
CACGCCTAATTATATAATGGTAAAATCTAAGTTAACAAGTTTCCTAAGAAGATGAAATTGTCTTTACTTTGTTGTTGGGTCAAGGATCTCTATGTAATTGTGAATTATTC
CCTGTTTGAATCCTTCTGTGTATAAATGCTTTGTGACAGTCACCTTTGGATACTCTCTCTCCCTCTCCTAATCATCACTATATACTAAAGTTTGGAGAGAATTATATCAG
TGTAGCTTGGAGTAAAGAAAATCATCCTGACATTCATTGACTATAGTCGTTTTGTGGGCTTTATGTGTTAGTACGGATGCAGAACACAAGTAAACAAAACCAAAGGTAAT
TAAATGAGGCATATTTTTCACATTACTATTGATTTATTACGATGTTTAGTAAACGAGGCCTTATATCTTTATAACTATTTCAATTGGAGGTAAGAGCATGTATATAATGT
TTAAAATATCCATCTTTGTAATGTGTTTTTATCAAATTAATATGTTAACAACATAATAGGCTTAAAGAAAGGCTCTATATTTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NDSVCKLLVGNKCDLVENKVVDTQTAKVFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMKGQPIQQKSGCCS