; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G008480 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G008480
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description40S ribosomal protein S5-like
Genome locationchr05:13914379..13915589
RNA-Seq ExpressionLsi05G008480
SyntenyLsi05G008480
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000235 - Ribosomal protein S5/S7
IPR005716 - Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal
IPR020606 - Ribosomal protein S7, conserved site
IPR023798 - Ribosomal protein S7 domain
IPR036823 - Ribosomal protein S7 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151715.3 40S ribosomal protein S5 [Cucumis sativus]6.8e-10986.29Show/hide
Query:  FLILSPHLWSTSV---IRFEFPDV--------------AGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRY
        FL+++PHL S+     +R   P                +G MAVEVDVVNQELT PHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRY
Subjt:  FLILSPHLWSTSV---IRFEFPDV--------------AGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRY

Query:  SVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTT
        SVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNP+QVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTT
Subjt:  SVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTT

Query:  GAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        GAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  GAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

XP_008447164.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5-like isoform X1 [Cucumis melo]8.1e-11099.04Show/hide
Query:  GIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
        GIMAVE+DVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
Subjt:  GIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH

Query:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
        AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
Subjt:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE

Query:  IERVAKANR
        IERVAKANR
Subjt:  IERVAKANR

XP_008456864.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S5-like [Cucumis melo]1.8e-10998.57Show/hide
Query:  AGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        +G MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  AGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

XP_038888890.1 40S ribosomal protein S5-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.7e-11098.58Show/hide
Query:  VAGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRII
        + GIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRII
Subjt:  VAGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRII

Query:  KHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKK
        KHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKK
Subjt:  KHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKK

Query:  DEIERVAKANR
        DEIERVAKANR
Subjt:  DEIERVAKANR

XP_038888891.1 40S ribosomal protein S5-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.2e-10899.52Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BGS8 40S ribosomal protein S5-like isoform X27.4e-10999.03Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A1S3BGS9 40S ribosomal protein S5-like isoform X13.9e-11099.04Show/hide
Query:  GIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
        GIMAVE+DVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH
Subjt:  GIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKH

Query:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
        AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE
Subjt:  AMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE

Query:  IERVAKANR
        IERVAKANR
Subjt:  IERVAKANR

A0A1S3C3S7 40S ribosomal protein S5-like8.7e-11098.57Show/hide
Query:  AGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        +G MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  AGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

A0A5A7SN17 40S ribosomal protein S5-like isoform X15.6e-10999.52Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

A0A5D3D3Q1 40S ribosomal protein S5-like isoform X27.4e-10999.03Show/hide
Query:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        MAVE+DVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDY+GVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
Subjt:  MAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65731 40S ribosomal protein S5 (Fragment)3.7e-9794.21Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        +VKLFNRW+FDDVQ++D+SL+DY+GV P+KHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTD NPIQVIVD
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIK+IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P46782 40S ribosomal protein S53.9e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P51427 40S ribosomal protein S5-22.4e-9687.92Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        A +VD  + Q LT   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Q5E988 40S ribosomal protein S53.9e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

Q9ZUT9 40S ribosomal protein S5-12.1e-9787.92Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        + E+D  + Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37270.1 ribosomal protein 5B1.5e-9887.92Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        + E+D  + Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT2G37270.2 ribosomal protein 5B1.5e-9887.92Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        + E+D  + Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.1 ribosomal protein 5A1.7e-9787.92Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        A +VD  + Q LT   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

AT3G11940.2 ribosomal protein 5A1.7e-9787.92Show/hide
Query:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM
        A +VD  + Q LT   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAM
Subjt:  AVEVDV-VNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAM

Query:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
        EIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE
Subjt:  EIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIE

Query:  RVAKANR
        RVAKANR
Subjt:  RVAKANR

ATCG01240.1 ribosomal protein S75.5e-0835.29Show/hide
Query:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT
        RL N L+     +GKK +A +II  A++ I   T+ NP+ V+  A+    P     A R+G  G   +  ++I   +    AI  L   +R+   RN   
Subjt:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT

Query:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        +A  L+ EL++AAKGS +  AI+KK+E  R+A+ANR
Subjt:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAGAATGTGGAGTTGTTTATCGGAAATGGTCCTATTCTTATGATTTTCTCATTTTATCACCACATCTATGGTCTACTTCTGTTATTCGTTTTGAATTTCCAGATGT
TGCCGGAATAATGGCTGTTGAAGTTGATGTGGTAAACCAGGAACTGACGCAGCCTCATCACGATGTAAAGCTGTTCAACCGGTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTGAATG
ACATCTCTCTGGTTGATTACGTTGGTGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCTGGGAGGTACTCCGTCAAGCGCTTCCGAAAAGCTCAGTGCCCA
ATTGTGGAGAGGCTCACAAATTCACTTATGATGCACGGTAGGAACAATGGGAAGAAACTTATGGCTGTCAGGATTATCAAGCACGCAATGGAGATTATTCATCTTCTAAC
TGATCTCAACCCAATTCAAGTCATTGTTGACGCTGTTGTTAACAGTGGGCCACGTGAAGATGCTACTCGAATTGGTTCAGCCGGTGTTGTTAGGCGTCAGGCTGTGGATA
TATCCCCTCTGCGCCGGGTTAACCAAGCAATCTATCTTCTTACAACTGGTGCTCGTGAGGCTGCCTTCAGGAATATCAAGACAATCGCAGAATGCTTGGCTGATGAACTT
ATTAATGCAGCAAAGGGTTCTTCAAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCGAATCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAGAATGTGGAGTTGTTTATCGGAAATGGTCCTATTCTTATGATTTTCTCATTTTATCACCACATCTATGGTCTACTTCTGTTATTCGTTTTGAATTTCCAGATGT
TGCCGGAATAATGGCTGTTGAAGTTGATGTGGTAAACCAGGAACTGACGCAGCCTCATCACGATGTAAAGCTGTTCAACCGGTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTGAATG
ACATCTCTCTGGTTGATTACGTTGGTGTTGCACCTGCCAAGCATGCCACCTATGTCCCCCACACTGCTGGGAGGTACTCCGTCAAGCGCTTCCGAAAAGCTCAGTGCCCA
ATTGTGGAGAGGCTCACAAATTCACTTATGATGCACGGTAGGAACAATGGGAAGAAACTTATGGCTGTCAGGATTATCAAGCACGCAATGGAGATTATTCATCTTCTAAC
TGATCTCAACCCAATTCAAGTCATTGTTGACGCTGTTGTTAACAGTGGGCCACGTGAAGATGCTACTCGAATTGGTTCAGCCGGTGTTGTTAGGCGTCAGGCTGTGGATA
TATCCCCTCTGCGCCGGGTTAACCAAGCAATCTATCTTCTTACAACTGGTGCTCGTGAGGCTGCCTTCAGGAATATCAAGACAATCGCAGAATGCTTGGCTGATGAACTT
ATTAATGCAGCAAAGGGTTCTTCAAACAGTTATGCAATCAAGAAAAAGGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCGAATCGTTGAGGTTATGTTTCAGGTTTGTTTTATGT
TGCACAACAAGAGTTTTATGTCCTTTTTCTTGTGTCTGGCTACATTCTTCTAATGAACACTATGGTCTAAGGTTCCATTTTAGTTTCCTTGTAACGAACGATTCATATCT
ACTTGTTTTAGGCTTTTTGAAGTTTTGGTATCATTATGTTTTCCATCAGAACAGAGCTAATGCATGATGTTGTTTCTTAAAGTTTCAAATATGTTTTCTAGTATCATTTG
GTTTCTAGATAAATATTTTGCTAAATGTATGTTTTGGGTCTATATTGTTAGGGTTTTTTTTTTTCTCTAATAATAGTTCAAGGTTTTTTTCCCTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGECGVVYRKWSYSYDFLILSPHLWSTSVIRFEFPDVAGIMAVEVDVVNQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCP
IVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADEL
INAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR