; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G009710 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G009710
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationchr05:16929828..16936206
RNA-Seq ExpressionLsi05G009710
SyntenyLsi05G009710
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057418.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.8e-11882.41Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK++                            
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

KGN61718.2 hypothetical protein Csa_006801 [Cucumis sativus]6.3e-11882.13Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSL SALP
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP

XP_008449352.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]6.3e-11882.41Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

XP_038888258.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.8e-11882.76Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST+GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMM IKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGAR SV+DKVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTK+LKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

XP_038888259.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.8e-11882.76Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST+GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMM IKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGAR SV+DKVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTK+LKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKV4 Tryptophan synthase3.0e-11882.13Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSL SALP
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP

A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase3.0e-11882.41Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

A0A1S3BMR7 Tryptophan synthase3.0e-11882.41Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

A0A5A7UQL8 Tryptophan synthase1.4e-11882.41Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK++                            
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase3.0e-11882.41Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLA+GTNFSAIISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+TIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIEL             VLLTTPTTP+DRMKAIVEASEGFVY
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTGARASVS+KVQTLLE+IKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+SWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain1.9e-6950.17Show/hide
Query:  AFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKV
        A IP+ITAGDPDL TTA+AL++L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L +G     ++ ++K                             +V
Subjt:  AFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKV

Query:  IPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYL
         PE+  PI LF+YYNPI  RG+  F+  +K AGV+GLVVPD+PLEE E L K A  H + +            V LL  PT+P +R++AI   S+GF+YL
Subjt:  IPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYL

Query:  VSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        VS  GVTG R+ V+ +V+ LL  ++  T+KP+ VGFGISKPEH  QV +WGAD +IVGSAMVK L E  +PEEGLKA+  F + LK AL
Subjt:  VSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain2.9e-10269.66Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL KGTNF++IISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIP+LSCPIALF+YYNPIL+RG+ N+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IEL             VLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+Y
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTG R SV++KVQ+LL+ IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic1.2e-7652.41Show/hide
Query:  AFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKV
        AFIPYITAGDPDL+TTAEAL++L   G+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA GT   A++ ML+                             +V
Subjt:  AFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKV

Query:  IPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYL
         PELSCP+ L SYY PI+ R +      +K+AGV GL+VPD+P      L  EA  +N+EL             VLLTTP  P+DRMK I +ASEGFVYL
Subjt:  IPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYL

Query:  VSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP
        VS  GVTG RA+V+ +V++L++++K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+ALP
Subjt:  VSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain3.0e-7050.87Show/hide
Query:  AFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKV
        A IP+ITAGDPDL TTA+AL+VL   G+++IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL +GT   +++ +++                              V
Subjt:  AFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKV

Query:  IPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYL
         P+L  PI LF+YYNPIL RG+ NF+  I D G RGLVVPD+PLEE +IL + A    IEL              LL  PT+PK+R+KAI   S+GF+YL
Subjt:  IPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYL

Query:  VSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        VS  GVTG RA +  +V+ LL  ++EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV  WG+D +IVGSA+VK L E  SP+EGLKA+  F ++LK+A+
Subjt:  VSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic1.5e-10168.28Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL +GTN  +I+ ML                              K
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+G FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IEL             VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+Y
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSS+GVTGAR+SVS KVQ+LL+DIKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain1.0e-10268.28Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL +GTN  +I+ ML                              K
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+G FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IEL             VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+Y
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSS+GVTGAR+SVS KVQ+LL+DIKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein2.1e-10369.66Show/hide
Query:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK
        VA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL KGTNF++IISMLK                             +
Subjt:  VAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKIISISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELK

Query:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY
        VIP+LSCPIALF+YYNPIL+RG+ N+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IEL             VLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+Y
Subjt:  VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVY

Query:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        LVSSVGVTG R SV++KVQ+LL+ IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  LVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGAAAAATGAGAATAGATGATTCCAAGGCGAGGATAATTGTGGAACGTGATTCCGTTGAGGAGTTCACCGGAGAAGCAGCAGCCAAAGTGGCAATAGCTCCACCAGCGTG
GGTCGCATTTATCCCTTACATCACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCCACCACTGCTGAAGCACTGAAGGTGCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTC
CGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTTATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAAGGGTACAAACTTTAGTGCAATCATTTCCATGCTGAAGAAGATAATA
TCAATATCTTTTCCTCTTCCACTTTTGGTCCTGTCTGTATATGCTTCACTGCCCTTTAGTTTCTCAGTAATGGAATTGAAAGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGC
CCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGGGAACTTCATGATGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCGGATGTTCCTCTTGAGG
AGACTGAAATTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTGAATTCCTTTTCTCATATGGCTATATTGAACATAGTGGTACTCTTAACTACACCAACCACG
CCTAAAGATAGGATGAAAGCCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTATATCTTGTGAGTTCTGTTGGAGTTACCGGCGCCCGTGCATCAGTGAGTGATAAAGTTCAAAC
TCTCCTGGAAGATATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGTAGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCATGTGAAACAGGTGGCTAGCTGGGGGGCTGATGGTATCA
TAGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAAAGCTTAAAATCTGCACTCCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAAATGAGAATAGATGATTCCAAGGCGAGGATAATTGTGGAACGTGATTCCGTTGAGGAGTTCACCGGAGAAGCAGCAGCCAAAGTGGCAATAGCTCCACCAGCGTG
GGTCGCATTTATCCCTTACATCACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCCACCACTGCTGAAGCACTGAAGGTGCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTC
CGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCTGTTATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAAGGGTACAAACTTTAGTGCAATCATTTCCATGCTGAAGAAGATAATA
TCAATATCTTTTCCTCTTCCACTTTTGGTCCTGTCTGTATATGCTTCACTGCCCTTTAGTTTCTCAGTAATGGAATTGAAAGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGC
CCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGGGAACTTCATGATGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCGGATGTTCCTCTTGAGG
AGACTGAAATTTTGAGAAAAGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTGAATTCCTTTTCTCATATGGCTATATTGAACATAGTGGTACTCTTAACTACACCAACCACG
CCTAAAGATAGGATGAAAGCCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTATATCTTGTGAGTTCTGTTGGAGTTACCGGCGCCCGTGCATCAGTGAGTGATAAAGTTCAAAC
TCTCCTGGAAGATATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGTAGGTTTTGGTATATCGAAACCCGAGCATGTGAAACAGGTGGCTAGCTGGGGGGCTGATGGTATCA
TAGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAAAGCTTAAAATCTGCACTCCCCTAATAA
ATTTTGATGGTATAACTTAGGCTGTTCCTTTCATTTGTAATCAAGAGATCAACTAGCTCTGTTACTGAAGCCTGCTAGTGGCTAACAGCCATCTTGAAGTTATACTTGAA
AGATTTCTTTTTTTCCCTTCTAAAAGAATAAGACTGTTAGTTTATATTATCATGAGAATATTTTCTAGATTTTTTTTGGTAATCACTGGATGATGATTAAGAGAATAATA
TTTCAAATCCTTACTCCTTAATCATTGTCAATGAGGCCTAACTGCCTGATCTTTAAGCTTCATCTCAGGACCAATTAAACATGGTAATCTCCATTAAGGTGGAATGAATT
CTGTTTAAGGGTGTTTTTTCTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
RKMRIDDSKARIIVERDSVEEFTGEAAAKVAIAPPAWVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLAKGTNFSAIISMLKKII
SISFPLPLLVLSVYASLPFSFSVMELKVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMMTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVNSFSHMAILNIVVLLTTPTT
PKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSDKVQTLLEDIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVASWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALP