; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G010980 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G010980
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationchr05:18760021..18760887
RNA-Seq ExpressionLsi05G010980
SyntenyLsi05G010980
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004672 - protein kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066257.1 putative carbohydrate esterase [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-14184.01Show/hide
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KAE8646868.1 hypothetical protein Csa_020851 [Cucumis sativus]5.3e-13782.99Show/hide
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        FAH+LLAKV PNAG VGL+PCARGGTLI QW+KNPSNP ATFYQNFIERIKASDK+GGVVRALFWFQGESDAAM+DTA RYKDNLK FFTDIRNDIKPRF
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        LPIIVVKIA+YDF M+HDTH+LPAVR A+DAVSKEL DVV ID+LELPIN TTN G N DHGHFNTTTEI LGKWLA+TYLSHYGHLL
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XP_031736508.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucumis sativus]2.9e-13581.6Show/hide
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        M LL LS++LC ML+ PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVE +  G L WDGLVPPECQP+PSILR NP  QWE AREPLH GIDIN+T GIGPG+ 
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        FAH+LL K  PNAG VGL+PCARGGTLIEQWIKNPSNP ATFYQNFIERIKASDK+GGVVRALFWFQGESDAAM+DTA RYKDNLK FFTDIR+DIKPRF
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        LPIIVVKIA+YDFF +HDTH+LPAVR A++AVSKEL DVV ID+L+LPIN+TTN GIN DHGHFNTTTEI LGKWLA+TYLSH+G LL
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XP_038886442.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Benincasa hispida]7.1e-14285.42Show/hide
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        MALL LS++LCTMLF  SLS AASP NIFILAGQSNMAGRGGVE +Q  EL WDGL+PPECQ +PSILR NP  QWE AREPLH+GIDINKTVGIGPGMP
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        FAHQLL KV P AG VGL+PCARGGT+IEQWIKNPSNPDATFY+NFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTA RYKDNLKNFFTDIRNDIKPRF
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        LPII+VKIA+YDF MKHDTHDLPAVRAA+DAVSKEL D+VTIDAL+LPIN  T+ G NQDHGHFNTTT+I LGKWLADTYLSHYGHLL
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XP_038886575.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Benincasa hispida]5.7e-13983.68Show/hide
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        MALL L ++LCT+LF  SLS AASPKNIFILAGQSNMAGRGGVE +Q G+L W+ L+PPECQ + SILR NP  QWE AREPLH+GIDINKTVGIGPGMP
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        FAHQLLAKV P AG+VGL+PCA+GGT+IEQWIKNPSNPDATFY++FIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAM+DTA RYKDNLKNFFTDIRNDIKPRF
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        LPII+VKIA+YDF MKHDTHDLP VRAA+DAVSKEL DVVTIDAL+LPIN  T+ G NQDHGHFNTTTEI LGKWLADTYLSHYGHLL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNC5 SASA domain-containing protein9.1e-13581.25Show/hide
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        M LL LS++LC ML+ PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVE +  G L WDGLVPPECQP+PSILR NP  QWE AREPLH GIDI +T GIGPG+ 
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        FAH+LL K  PNAG VGL+PCARGGTLIEQWIKNPSNP ATFYQNFIERIKASDK+GGVVRALFWFQGESDAAM+DTA RYKDNLK FFTDIR+DIKPRF
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        LPIIVVKIA+YDFF +HDTH+LPAVR A++AVSKEL DVV ID+L+LPIN+TTN GIN DHGHFNTTTEI LGKWLA+TYLSH+G LL
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A0A5A7VGP3 Putative carbohydrate esterase1.7e-14184.01Show/hide
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        MALL LS+MLCTMLFS       SLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKDQSG LVWD LVPPEC+P+PSILR NP R+WETAREPLH GIDIN+T G
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Query:  IGPGMPFAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRN
        IGPGMPFAH LLAK  PNAGVVGL+PCARGGTLIEQWIKNPSNP+ATFY+NFIERIKASDK+GGVVRALFWFQGESDAAMSDTA RYKDNLK FFTDIRN
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        DIKPRFLPII+ KIA+YD FMKHDTHDL AVRAA++ VSKEL D++TIDAL+LPINFTTNAG N DH HFNT TEI++GKW ADTYLSHYGHLL
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A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342154.0e-13078.12Show/hide
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        M LL LSV+LC +LFSPSLSGA SP NIFILAGQSNMAGRGGVEK Q+G+LVWDG VP EC   PSILR NP RQWE A EPLH GIDI+ T GIGPG+P
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Query:  FAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRF
        FAHQ   K    AG+VGL+PCARGGTLIEQW+KNPSNP ATFYQNFIERIK S+KEGGVVRALFW+QGESDAAM+DTA+RYKDNLK F TDIRNDIKPRF
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Query:  LPIIVVKIAIYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHYGHLL
        LP+I+VKI++YDFFMKHDTH+LPAVRAAEDAV KEL D++TID+ ELP+NFTT  G + D GHFNT TEI+LGKWLADTYL+HYGHLL
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342154.7e-13178.12Show/hide
Query:  MALLGLSVMLCTMLFSPSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKDQSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMP
        M LL LS++LC +LF+PSLSGA SP NIFILAGQSNMAGRGGVEK Q+G+LVWDG VP ECQ +PSILR NP RQWE A EPLH GIDI+ T GIGPG+P
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Query:  FAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRF
        FAHQ   K    AG+VGL+PCARGGTLIEQWIKNPSNP ATFYQNFIERIK S+KEGGVVRALFW+QGESDAAM+DTA+RYKDNLK F TDIRNDIKPRF
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Query:  LPIIVVKIAIYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHYGHLL
        LP+I+VKI++YDFFMKHDTH+LPAVRAAEDAV KEL D++TID+ ELP+NFTT  G + DHGHFNT TEI+LGKWLA+TYL+HYGHLL
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342151.6e-13178.62Show/hide
Query:  MALLGLSVMLCTMLFSPSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKDQSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDI--NKTVGIGPG
        M LL LS+++CT+L SPSLSGA SP NIFILAGQSNMAGRGGVEK  +GELVWDG VP ECQ +PSILRFNP RQWE A EPLH GID+   KT GIGPG
Subjt:  MALLGLSVMLCTMLFSPSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKDQSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDI--NKTVGIGPG

Query:  MPFAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKP
        +PFAHQL  K    AG+VGL+PCARGGTLIEQWIKNPSNP ATFYQNFIERIK S+KEGGVVRALFW+QGESDAAM+DTA+RYKDNLK F TDIRNDIKP
Subjt:  MPFAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKP

Query:  RFLPIIVVKIAIYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHYGHLL
        RFLP+I+VKIA+YDFFMKHDTH+LPAVRAAEDAV KEL D++TID+ ELP+N TT  G + DHGHFNT TEI LGKWLADTYL+HYGHLL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.1e-4738.29Show/hide
Query:  PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGV
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD  +   VWD ++PPEC P  SILR +   +WE A EPLH  ID  K  G+GPGM FA+ +  ++  ++ V
Subjt:  PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGV

Query:  VGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFM
        +GL+PCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ W+QGESD      A+ Y +N+     ++R+D+    LPII V IA    ++
Subjt:  VGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFM

Query:  KHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHY
                  +  E  +  +LS+VV +DA  LP        +  D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
Subjt:  KHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)2.2e-4842.47Show/hide
Query:  NIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGG
        +IFILAGQSNMAGRGGV  D  +   VWDG++PPEC+  PSILR     +W+ A+EPLH  IDINKT G+GPGMPFA++++ +     G VGL+PC+ GG
Subjt:  NIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGVVGLIPCARGG

Query:  TLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKA--SDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFMKHDTHDLP
        T + QW K         Y+  ++R KA  +   GG  RA+ W+QGESD      A  YK  L  FF+D+RND++   LPII V +A            L 
Subjt:  TLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKA--SDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFMKHDTHDLP

Query:  AVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLS
        AVR A+  +  +L +V  +DA  LP        +  D  H  T++++ LG  +A+++L+
Subjt:  AVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLS

AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)7.6e-4938.29Show/hide
Query:  PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGV
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD  +   VWD ++PPEC P  SILR +   +WE A EPLH  ID  K  G+GPGM FA+ +  ++  ++ V
Subjt:  PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGV

Query:  VGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFM
        +GL+PCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ W+QGESD      A+ Y +N+     ++R+D+    LPII V IA    ++
Subjt:  VGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFM

Query:  KHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHY
                  +  E  +  +LS+VV +DA  LP        +  D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
Subjt:  KHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHY

AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)7.6e-4938.29Show/hide
Query:  PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGV
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV KD  +   VWD ++PPEC P  SILR +   +WE A EPLH  ID  K  G+GPGM FA+ +  ++  ++ V
Subjt:  PSLSGAASPKNIFILAGQSNMAGRGGVEKD-QSGELVWDGLVPPECQPEPSILRFNPTRQWETAREPLHDGIDINKTVGIGPGMPFAHQLLAKVRPNAGV

Query:  VGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFM
        +GL+PCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ W+QGESD      A+ Y +N+     ++R+D+    LPII V IA    ++
Subjt:  VGLIPCARGGTLIEQWIKNPSNPDATFYQNFIERIKASDKEGGVVRALFWFQGESDAAMSDTAKRYKDNLKNFFTDIRNDIKPRFLPIIVVKIAIYDFFM

Query:  KHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHY
                  +  E  +  +LS+VV +DA  LP        +  D+ H  T  ++ LG  LA  YLS++
Subjt:  KHDTHDLPAVRAAEDAVSKELSDVVTIDALELPINFTTNAGINQDHGHFNTTTEIILGKWLADTYLSHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTTGTTGGGACTATCGGTCATGTTATGTACGATGCTATTTAGCCCTTCCCTTTCAGGGGCTGCTTCTCCTAAGAACATATTCATCCTCGCCGGTCAAAGCAACAT
GGCCGGTCGAGGTGGGGTTGAGAAAGATCAATCGGGAGAACTCGTGTGGGATGGGTTGGTCCCACCAGAATGTCAACCTGAACCATCCATCCTACGATTTAACCCCACGC
GCCAATGGGAGACAGCTCGAGAGCCTCTCCACGACGGAATTGACATCAACAAGACAGTTGGGATTGGACCAGGTATGCCATTTGCTCACCAACTGCTAGCCAAAGTCAGG
CCAAATGCTGGCGTTGTGGGTTTAATCCCTTGTGCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGATTAAAAATCCTAGCAATCCTGATGCAACTTTTTACCAAAATTTTAT
TGAACGAATCAAAGCATCAGATAAAGAAGGTGGGGTTGTGCGTGCTCTTTTTTGGTTTCAAGGGGAAAGTGATGCAGCTATGAGCGACACTGCTAAGAGATACAAGGACA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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