CuGenDBv2

Gene ID	Lsi05G011210
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	protein XRI1-like
Genome location	chr05:18975609..18980551
RNA-Seq Expression	Lsi05G011210
Synteny	Lsi05G011210
Gene Ontology terms	GO:0006281 - DNA repair (biological process) GO:0007140 - male meiotic nuclear division (biological process) GO:0007143 - female meiotic nuclear division (biological process) GO:0009555 - pollen development (biological process) GO:0010165 - response to X-ray (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domains	IPR039933 - Protein XRI1

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0025348.1 protein XRI1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-136

89.13

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVS  A L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N V HHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

XP_004144384.1 protein XRI1 [Cucumis sativus]

7.6e-137

88.77

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETS+CREDLSSRFLKSHNK VS PA L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL+FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N VQHHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPS+SYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

XP_008461885.1 PREDICTED: protein XRI1 isoform X1 [Cucumis melo]

1.3e-136

89.13

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVS  A L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N V HHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

XP_008461886.1 PREDICTED: protein XRI1 isoform X2 [Cucumis melo]

1.3e-136

89.13

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVS  A L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N V HHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

XP_038887270.1 protein XRI1 [Benincasa hispida]

1.2e-134

87.68

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT  DDRN+KSEESRET SQAKRRRMLQFTAQDLE S CREDLSSRFLKSH+KDVS PA L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECS LSDNVLISCHENLDHSP+GWIAECLNDADMHCSPEDLNF GTSDIQIDVSEFCDGAPEFK NAVQHHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LBN6 Uncharacterized protein

3.7e-137

88.77

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETS+CREDLSSRFLKSHNK VS PA L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL+FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N VQHHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPS+SYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

A0A1S3CFL6 protein XRI1 isoform X2

6.2e-137

89.13

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVS  A L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N V HHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

A0A1S3CH27 protein XRI1 isoform X1

6.2e-137

89.13

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVS  A L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N V HHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

A0A5A7SGS7 Protein XRI1 isoform X1

6.2e-137

89.13

Show/hide

Query:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        +EISECLWDG VSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT SDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVS  A L E
Subjt:  MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
        VSYGIPECSGL+DNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDL FAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFK N V HHP+RAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

A0A6J1K0G1 protein XRI1-like

3.4e-127

85.29

Show/hide

Query:  ECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPEVSYG
        ECLWDG VSEN DLSYVFDETTPVKACGDLAYHVT +DD NKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLC EDLSSRFLKSHNKDVS PA LP+V Y 
Subjt:  ECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPEVSYG

Query:  IPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKLASSV
        IPECSGLS NV  SC ENLDHSPEGWIA+CLNDADMHCSPEDLNFAGTSD QIDVSEFC+ APEFK NAVQHHP+R P NIIFKGRKSYIRTPTKLASSV
Subjt:  IPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKLASSV

Query:  AYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
        AYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFS    + K K+   G+   +TI+
Subjt:  AYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q6NLW5 Protein XRI1

4.1e-53

46.74

Show/hide

Query:  EISECLWDGTVSENGDLSYVF-DETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        ++ +C          D SY+F DE TPVKAC +L YHVT ++D N+K E   ET S  KRRRMLQF  Q  ETSL   +  S  LKS  +D +   +LPE
Subjt:  EISECLWDGTVSENGDLSYVF-DETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
         S  I    G S++   S  E LD   E W A+CLNDA+    P+DLNF G+ D+Q+D+SE+ +  PE +   VQ   +R+ PN+IFKGRKS+ R  +KL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
         SS+ YPFAFIKPCG HG +TLKDINQ+IR  PP+K K   E+P+    TSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G48720.1 x-ray induced transcript 1

1.9e-53

49.04

Show/hide

Query:  DLSYVF-DETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPEVSYGIPECSGLSDNV
        D SY+F DE TPVKAC +L YHVT ++D N+K E   ET S  KRRRMLQF  Q  ETSL   +  S  LKS  +D +   +LPE S  I    G S++ 
Subjt:  DLSYVF-DETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPEVSYGIPECSGLSDNV

Query:  LISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKLASSVAYPFAFIKPCG
          S  E LD   E W A+CLNDA+    P+DLNF G+ D+Q+D+SE+ +  PE +   VQ   +R+ PN+IFKGRKS+ R  +KL SS+ YPFAFIKPCG
Subjt:  LISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKLASSVAYPFAFIKPCG

Query:  FHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
         HG +TLKDINQ+IR  PP+K K   E+P+    TSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  FHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

AT5G48720.2 x-ray induced transcript 1

2.9e-54

46.74

Show/hide

Query:  EISECLWDGTVSENGDLSYVF-DETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE
        ++ +C          D SY+F DE TPVKAC +L YHVT ++D N+K E   ET S  KRRRMLQF  Q  ETSL   +  S  LKS  +D +   +LPE
Subjt:  EISECLWDGTVSENGDLSYVF-DETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPE

Query:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL
         S  I    G S++   S  E LD   E W A+CLNDA+    P+DLNF G+ D+Q+D+SE+ +  PE +   VQ   +R+ PN+IFKGRKS+ R  +KL
Subjt:  VSYGIPECSGLSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKL

Query:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII
         SS+ YPFAFIKPCG HG +TLKDINQ+IR  PP+K K   E+P+    TSAFS    + K K+   G    +TI+
Subjt:  ASSVAYPFAFIKPCGFHGDVTLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASR-ISKMKLLQLGQFPRLTII

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGATATCAGAATGCCTGTGGGATGGTACAGTCTCTGAAAATGGCGATCTTTCGTATGTGTTTGATGAAACAACTCCTGTTAAAGCTTGTGGGGACTTGGCATATCA
TGTTACGAGTAGTGATGATAGGAATAAGAAATCAGAAGAATCCAGAGAAACTCATTCACAAGCGAAGAGACGGCGGATGTTGCAGTTTACTGCACAAGATTTGGAAACTT
CCCTCTGCCGTGAAGATTTGTCTTCTAGATTTCTAAAATCACATAATAAGGATGTTTCCCACCCAGCTGTTCTCCCTGAAGTTTCATACGGGATTCCTGAGTGTTCTGGA
CTATCAGATAATGTGCTCATTTCTTGTCATGAGAACTTGGATCACTCACCCGAAGGTTGGATTGCTGAATGCCTTAATGATGCTGATATGCATTGTAGCCCCGAGGATTT
GAACTTTGCTGGGACTTCGGACATTCAAATCGATGTATCAGAGTTTTGTGATGGTGCACCCGAGTTCAAACCCAATGCGGTCCAACATCATCCTTCCCGAGCTCCTCCGA
ACATAATTTTTAAAGGTCGGAAGTCGTATATTAGAACTCCCACTAAATTGGCTTCTTCAGTTGCCTACCCATTTGCCTTTATCAAGCCCTGTGGATTCCATGGAGATGTG
ACCTTGAAGGACATAAACCAGCGGATCCGCACACCTCCACCATCAAAATTGAAGCATCAACCCGAAGATCCATCTCAATCTTACCCAACTTCAGCTTTCTCTGCATCGAG
GATTTCCAAGATGAAATTGCTGCAACTGGGACAGTTCCCGCGGCTGACCATCATCTCCTTCGAACAGAGCCGGCAAAAAGTATGGCCGCAAGACGCCAATGGTGCGTTCT
TATGCTTCACCATACAAACGCAGCAGGTAAATTCTCCGCCAGTACCATCATCTTCATCTTCTTCGTATTCATCATCTTCATCGTCGTCGAAGAAATCTGCTCCAAATCCC
ATTCCGTCCATCAACGACATCCTCACCGGCTCCGACGTCGGCGAAGACTCCTCCTCTTCCTCTGATCCGGTTGTTGACTCTTCGTTTTCGTTTTCACTTCCGTTCTCGTT
GTTTTCATTTTGTTCTTTTGCTTCTTCTGCGGCTTCCGCCGCAGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGAAGCTGCATCTGCTGCTTCTTGTGCTGCGA
CGGCTTCTCTAGCGGACATCATTCTGTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEISECLWDGTVSENGDLSYVFDETTPVKACGDLAYHVTSSDDRNKKSEESRETHSQAKRRRMLQFTAQDLETSLCREDLSSRFLKSHNKDVSHPAVLPEVSYGIPECSG
LSDNVLISCHENLDHSPEGWIAECLNDADMHCSPEDLNFAGTSDIQIDVSEFCDGAPEFKPNAVQHHPSRAPPNIIFKGRKSYIRTPTKLASSVAYPFAFIKPCGFHGDV
TLKDINQRIRTPPPSKLKHQPEDPSQSYPTSAFSASRISKMKLLQLGQFPRLTIISFEQSRQKVWPQDANGAFLCFTIQTQQVNSPPVPSSSSSSYSSSSSSSKKSAPNP
IPSINDILTGSDVGEDSSSSSDPVVDSSFSFSLPFSLFSFCSFASSAASAAAAAAAAAAAAAAEAASAASCAATASLADIIL

Lsi05G011210 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome