; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G011960 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G011960
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionBeta-carotene hydroxylase 2
Genome locationchr05:19829087..19832862
RNA-Seq ExpressionLsi05G011960
SyntenyLsi05G011960
Gene Ontology termsGO:0008610 - lipid biosynthetic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005506 - iron ion binding (molecular function)
GO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR045019 - Beta-carotene hydroxylase-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033696.1 beta-carotene hydroxylase 2 [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-13380.72Show/hide
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KAG7014750.1 Beta-carotene 3-hydroxylase 1, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.9e-13280Show/hide
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NP_001315399.1 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic [Cucumis melo]1.5e-13381.05Show/hide
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XP_004140758.1 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic [Cucumis sativus]3.6e-13580.97Show/hide
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XP_038877448.1 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic [Benincasa hispida]1.0e-13782.58Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A088CIY4 Beta-carotene hydroxylase7.3e-13481.05Show/hide
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A0A0A0L606 Fatty acid hydroxylase domain-containing protein1.7e-13580.97Show/hide
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A0A1S3AZ37 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic7.3e-13481.05Show/hide
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A0A5A7SUR5 Beta-carotene hydroxylase 21.6e-13380.72Show/hide
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A0A6J1E4L5 beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic-like3.1e-13279.68Show/hide
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        MAA +S AL P+PLHLFL SSHLSPKPRTPFLFPPSVFRNSR Q K+RRK LFTVCVLVEDQNSSGEVE+LSDEE PIVVPQIPSP+V++RLARK+SERF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3SGL0 Beta-carotene 3-hydroxylase, chloroplastic9.4e-8657.14Show/hide
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        S++L PK       SS +S    T  +FPP  F+      + R K   TVC ++E             D + +GEV    ++E+        +  ++++L
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         NAVPAIALLSYGFFHKGL+PGLCFGA                                          LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGL+ LE
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Query:  KEINRRIK
         EINRR K
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O49814 Beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic2.3e-9263.18Show/hide
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        P P TP ++P + F  N     + RR+  FTVC ++ED     + E   ++    +  QI +  ++E+LARKKSERFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYY
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        RFYWQMEGGE+PFSEMFGTF+LSVGAAVGMEFWARWAH+ALWH+SLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAI NAVPAIALL YGFFHKGL+PGLCFGA    
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Query:  --------------------------------------LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRRIK
                                              LHHS+KFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKE+NRR +
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O49815 Beta-carotene hydroxylase 1, chloroplastic5.9e-8056.99Show/hide
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        P LF   +  N     + RRK     C +++D            + E + DE E+     +  +  ++E+ ARKKSERFTYLVAAVMSS GITSMAV++V
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Query:  YYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAVPAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGA--
        YYRF WQMEGGE+PFSEMF TF+L+ GAA+GME+WARWAHRALWH+SLWHMHESHH+PREGPFELND+FAI NAVPAIALLS+GF HKGL+PGLCFGA  
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Query:  ----------------------------------------LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRRIK
                                                LHHSDKF+GVPYGLFLGPKELEEVG LEELEKE+NRRIK
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Q9LTG0 Beta-carotene 3-hydroxylase 2, chloroplastic9.7e-8356.77Show/hide
Query:  MAAGLSA-ALVPKPLHLFLTSSHLSPKPRTPFLFPPSVFRNSRFQWKMRRKALFTVCVLVEDQNSSGEVENLSDEELPIVVPQI-PSPHVSERLARKKSE
        MAAGLS  A+  KPL+    SS  +  P +  +FPPS+  N       RR+ + TVC +VE++  S  +++ +  E      +I  +  + ++  +KKSE
Subjt:  MAAGLSA-ALVPKPLHLFLTSSHLSPKPRTPFLFPPSVFRNSRFQWKMRRKALFTVCVLVEDQNSSGEVENLSDEELPIVVPQI-PSPHVSERLARKKSE

Query:  RFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAVPA
        RFTYL+AAVMSSFGITSMA+MAVYYRF WQM+GGE+   EMFGTF+LSVGAAVGMEFWARWAHRALWH SLW+MHESHHKPREG FELNDVFAITNAVPA
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Query:  IALLSYGFFHKGLVPGLCFGA------------------------------------------LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRR
        I LL YGF +KGLVPGLCFGA                                          LHH+DKF GVPYGLFLGPKE+EEVGG EELEKEI+RR
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Query:  IKL
        IKL
Subjt:  IKL

Q9SZZ8 Beta-carotene 3-hydroxylase 1, chloroplastic1.8e-8456.6Show/hide
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        MAAGLS A+  KPLH   +SS    + R P          S F   +R K  F+VC +VE++  +  +EN    E       I + +    ++E+L RKK
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Query:  SERFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAV
        SER TYL+AA++SSFGITSMAVMAVYYRF WQMEGGEI   EMFGTF+LSVGAAVGMEFWARWAHRALWH+SLW+MHESHHKPREGPFELNDVFAI NA 
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Query:  PAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGA------------------------------------------LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEIN
        PAI LLSYGFF+KGLVPGLCFGA                                          LHH+DKFNGVPYGLFLGPKELEEVGG EEL+KEI+
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Query:  RRIKLTAPKSIDCSSSTN
        RRIK     S   SSS++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25700.1 beta-hydroxylase 11.3e-8556.6Show/hide
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        MAAGLS A+  KPLH   +SS    + R P          S F   +R K  F+VC +VE++  +  +EN    E       I + +    ++E+L RKK
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        SER TYL+AA++SSFGITSMAVMAVYYRF WQMEGGEI   EMFGTF+LSVGAAVGMEFWARWAHRALWH+SLW+MHESHHKPREGPFELNDVFAI NA 
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        PAI LLSYGFF+KGLVPGLCFGA                                          LHH+DKFNGVPYGLFLGPKELEEVGG EEL+KEI+
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Query:  RRIKLTAPKSIDCSSSTN
        RRIK     S   SSS++
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AT4G25700.2 beta-hydroxylase 19.6e-7062.56Show/hide
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        MAAGLS A+  KPLH   +SS    + R P          S F   +R K  F+VC +VE++  +  +EN    E       I + +    ++E+L RKK
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        SER TYL+AA++SSFGITSMAVMAVYYRF WQMEGGEI   EMFGTF+LSVGAAVGMEFWARWAHRALWH+SLW+MHESHHKPREGPFELNDVFAI NA 
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        PAI LLSYGFF+KGLVPGLCFGA+  S
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AT5G52570.1 beta-carotene hydroxylase 26.9e-8456.77Show/hide
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        MAAGLS  A+  KPL+    SS  +  P +  +FPPS+  N       RR+ + TVC +VE++  S  +++ +  E      +I  +  + ++  +KKSE
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Query:  RFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAVPA
        RFTYL+AAVMSSFGITSMA+MAVYYRF WQM+GGE+   EMFGTF+LSVGAAVGMEFWARWAHRALWH SLW+MHESHHKPREG FELNDVFAITNAVPA
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Query:  IALLSYGFFHKGLVPGLCFGA------------------------------------------LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRR
        I LL YGF +KGLVPGLCFGA                                          LHH+DKF GVPYGLFLGPKE+EEVGG EELEKEI+RR
Subjt:  IALLSYGFFHKGLVPGLCFGA------------------------------------------LHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRR

Query:  IKL
        IKL
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AT5G52570.2 beta-carotene hydroxylase 22.0e-4345.25Show/hide
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        MAAGLS  A+  KPL+    SS  +  P +  +FPPS+  N       RR+ + TVC +VE++  S  +++ +  E      +I  +  + ++  +KKSE
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Query:  RFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHES--HHKPREGPFELNDVFAITNAV
        RFTYL+AAVMSSFGITSMA+MAVYYRF WQM+GGE+   EMFGTF+LSVGAA G+          ++  +   +H+   H +   GP        I N V
Subjt:  RFTYLVAAVMSSFGITSMAVMAVYYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHES--HHKPREGPFELNDVFAITNAV

Query:  PAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGALHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRRIKL
        P +  ++                LHH+DKF GVPYGLFLGPKE+EEVGG EELEKEI+RRIKL
Subjt:  PAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGALHHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRRIKL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCGGCCTCTCCGCCGCCTTAGTGCCCAAACCACTCCATCTCTTCCTTACTTCCTCCCATCTCTCCCCTAAACCTCGAACTCCGTTTCTGTTTCCACCTTCAGT
CTTCCGGAACAGTAGATTCCAATGGAAGATGCGGAGAAAAGCTCTGTTCACTGTCTGTGTACTCGTTGAGGATCAAAATAGTTCCGGCGAGGTGGAGAATCTCTCCGATG
AAGAATTGCCGATTGTAGTCCCTCAGATCCCATCGCCTCATGTTTCAGAAAGATTGGCGAGGAAAAAATCGGAGCGCTTCACTTATCTTGTTGCTGCGGTTATGTCTAGT
TTCGGAATTACCTCCATGGCTGTCATGGCGGTTTACTACCGATTTTACTGGCAAATGGAGGGCGGAGAGATTCCTTTCTCTGAAATGTTTGGTACATTTTCTCTCTCTGT
TGGTGCCGCTGTCGGCATGGAGTTCTGGGCGAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCACTCTTCCTTATGGCATATGCACGAGTCGCACCATAAACCAAGAGAAGGACCGT
TCGAATTAAACGATGTTTTCGCCATTACCAACGCTGTGCCCGCCATAGCACTCCTTTCTTACGGCTTCTTCCATAAAGGCCTTGTCCCTGGTCTCTGCTTCGGCGCTCTT
CATCATTCAGACAAGTTCAACGGTGTGCCATACGGGCTATTTTTGGGTCCGAAGGAATTAGAGGAAGTGGGAGGTCTAGAAGAATTGGAGAAGGAAATCAACAGAAGAAT
AAAATTGACGGCCCCAAAATCAATCGACTGTTCTTCTTCAACCAATATTATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGAGAGAGAGTTATTTTAGAAAAAAATATGGCAATTTTGTATATAAAGGAAGGAAGGGCGGCAGATGCTCCAACAAAGCTCCCCATTTTTCCTAGTCAGTAATTTTACT
CCAACGCTTCAACTGACAAAAAAAACTTGTGGTCTCTGTTCCTTCAACCTCCAACTTTAAGCCCTCTCTCCGCCGTCTCTCTCTCCGAGAAGCTTCCCCTTTTTCCACCG
TCTTTTCACTTTTCATCTTCATCCCTCCCATGGCGGCCGGCCTCTCCGCCGCCTTAGTGCCCAAACCACTCCATCTCTTCCTTACTTCCTCCCATCTCTCCCCTAAACCT
CGAACTCCGTTTCTGTTTCCACCTTCAGTCTTCCGGAACAGTAGATTCCAATGGAAGATGCGGAGAAAAGCTCTGTTCACTGTCTGTGTACTCGTTGAGGATCAAAATAG
TTCCGGCGAGGTGGAGAATCTCTCCGATGAAGAATTGCCGATTGTAGTCCCTCAGATCCCATCGCCTCATGTTTCAGAAAGATTGGCGAGGAAAAAATCGGAGCGCTTCA
CTTATCTTGTTGCTGCGGTTATGTCTAGTTTCGGAATTACCTCCATGGCTGTCATGGCGGTTTACTACCGATTTTACTGGCAAATGGAGGGCGGAGAGATTCCTTTCTCT
GAAATGTTTGGTACATTTTCTCTCTCTGTTGGTGCCGCTGTCGGCATGGAGTTCTGGGCGAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCACTCTTCCTTATGGCATATGCACGA
GTCGCACCATAAACCAAGAGAAGGACCGTTCGAATTAAACGATGTTTTCGCCATTACCAACGCTGTGCCCGCCATAGCACTCCTTTCTTACGGCTTCTTCCATAAAGGCC
TTGTCCCTGGTCTCTGCTTCGGCGCTCTTCATCATTCAGACAAGTTCAACGGTGTGCCATACGGGCTATTTTTGGGTCCGAAGGAATTAGAGGAAGTGGGAGGTCTAGAA
GAATTGGAGAAGGAAATCAACAGAAGAATAAAATTGACGGCCCCAAAATCAATCGACTGTTCTTCTTCAACCAATATTATGTGAAAATGAGAAAAAAAAAGAAAAAGAAA
AAAAAAGCTTTCCCTGAGCAGTAACTTTTCTTTTTCTAATATTGAAAGGTGAAATATTATTTAGTTCAGAGCCCTTTTTTTTGTTCCATTTTTTCTCTTTTACTGTATGA
GGTAAAGGGGTAGAAGAATGAGATAGTGAATTCGGTAGAAAGGTTTCACTCTACTTTTTCATAATTTCTCAGTGCGAAAAAAAAAAAAAAATACACGTCGGACGAAAGTA
AATAACACACTCAAATTTTGTGTACTTTTGGATATTTTACAATTTAATAAAATATGTAATTATTTGAGCAACTAGCGTGAAACATGTATATTCGAGAAAATTTTTAGTAG
TAATATTTAAAAATTTTCATATTTACATTTACAAAATAAATAAATAATAAATAAATAAATCCTTTAATACCGTGTTAAATAATGTATAAAAAGAATATGTATTATGGTAG
TATTATTTTTTCTAAGTATACAAATAATTTTTCCATTCGACATGTAAATTTGGTTGGGTATCGTGCAATTGTGTATTAAAAAATAAAAATAAAAATAAAAAGAAACAAGA
GACAATCTCTTGTTATAGAATTGTATTTGGAATTACTCTAAAATGATGTATTGGGAATTGATTTCATTGAAAGATGGTGAAGATTCATGAATATACGGTTAGGATAAATC
TATTAAGGGTACACCTACAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAGLSAALVPKPLHLFLTSSHLSPKPRTPFLFPPSVFRNSRFQWKMRRKALFTVCVLVEDQNSSGEVENLSDEELPIVVPQIPSPHVSERLARKKSERFTYLVAAVMSS
FGITSMAVMAVYYRFYWQMEGGEIPFSEMFGTFSLSVGAAVGMEFWARWAHRALWHSSLWHMHESHHKPREGPFELNDVFAITNAVPAIALLSYGFFHKGLVPGLCFGAL
HHSDKFNGVPYGLFLGPKELEEVGGLEELEKEINRRIKLTAPKSIDCSSSTNIM