; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G012110 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G012110
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionsec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic
Genome locationchr05:19943298..19948720
RNA-Seq ExpressionLsi05G012110
SyntenyLsi05G012110
Gene Ontology termsGO:0009409 - response to cold (biological process)
GO:0043953 - protein transport by the Tat complex (biological process)
GO:0045038 - protein import into chloroplast thylakoid membrane (biological process)
GO:1902458 - positive regulation of stomatal opening (biological process)
GO:1903426 - regulation of reactive oxygen species biosynthetic process (biological process)
GO:2000070 - regulation of response to water deprivation (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0033281 - TAT protein transport complex (cellular component)
GO:0009977 - proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003369 - Sec-independent protein translocase protein TatA/B/E
IPR006312 - Sec-independent protein translocase protein TatA/E


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022141178.1 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]1.8e-10187.14Show/hide
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XP_038891753.1 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]6.0e-11093.36Show/hide
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XP_038891762.1 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]3.9e-10992.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AYD4 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X29.1e-9686.92Show/hide
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A0A5A7SWY3 Sec-independent protein translocase protein TATB6.6e-9486.13Show/hide
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A0A6J1CHV3 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X31.2e-10086.78Show/hide
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A0A6J1CJ51 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X11.2e-10086.78Show/hide
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A0A6J1CJQ6 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X28.5e-10287.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48950 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic1.4e-3253.63Show/hide
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         S N  Y  +  N    P            A+PN    E   YTSEE +KVTEEQ+ A      N   +  + SQ Q E
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Q2R237 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic1.7e-3557.56Show/hide
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        RL+L      LGL S  SG  H  +  R +  E  KR  +G  V+ASLFGVGAPEALVIGVVALLVFGPKGLAEVAR LGKTLRAFQPTI+ELQDVSREF
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        ++TLEREIGLDE+  S+N             PP++  +++  A+ + +D   E+  YTSEE +KVTEEQL A
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Q31RR1 Sec-independent protein translocase protein TatA4.8e-0954.84Show/hide
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        + FG+G PE LVI  +ALLVFGPK L E+ R+LGK LR F       QD SREF++ ++REI
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Q94G16 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic1.2e-4953.88Show/hide
Query:  LAASTSSSSSILYPT--TPKIRLSLCN------------FPLGLGLFSPWSGLKHLGISTRGKFP----ERRKRIPKGKAVFASLFGVGAPEALVIGVVA
        LA ++S+S+ +L P   T  + LS C             + LG  LF+PW+G K LG ST+ K P      +K   KGK V+ASLFGVGAPEALVIGVVA
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        LLVFGPKGLAEVAR LGKTLR FQPTI+E+QDVSREFK+TLEREIG+D+I++ + S+Y+S+  NT   P +      S    +PN    ESKAY+SEEYL
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        K+TEEQLK   AQ Q QT+   E +   Q+QP
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Q9XH75 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic1.2e-4454.55Show/hide
Query:  RLAASTSSSSSIL------YP------TTPKIRLSLCNFPLGLGLFSPWSGLKHLGISTRGKF--PERRKRIPKGKAVFASLFGVGAPEALVIGVVALLV
        ++ AS+SSS +I       YP         K  LS     LG   FSP+ GLKHLGIS   K   PE+++R  K   + ASLFGVGAPEALVIGVVALLV
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Query:  FGPKGLAEVARTLGKTLRAFQPTIKELQDVSREFKTTLEREIGLDEISSSVNSSYNSSKSNTYS-----DPPSVPKAEESVAVAEPNDSSSESKAYTSEE
        FGPKGLAEVAR LGKTLR FQPTI+ELQDVSR+FK+TLEREIGLD+IS+   + YN +++N         PPSVP  E  V   +PNDS S  KAYTSE+
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        YLK TEEQLKA    ++    ++Q+    QP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G28750.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1061.0e-0640.24Show/hide
Query:  SLFGVGAPEALVIGVVALLVFGPKGLAEVARTLGKTLRAFQPTIKELQDVSREFKTTLEREIGLDEISSSVNSSYNSSKSNT
        +LFG+G PE  VI  VA L+FGPK L E+ +++GKT+++FQ   KE +    E KT  E  +     SS V +S    +  T
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AT5G52440.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1068.6e-4654.55Show/hide
Query:  RLAASTSSSSSIL------YP------TTPKIRLSLCNFPLGLGLFSPWSGLKHLGISTRGKF--PERRKRIPKGKAVFASLFGVGAPEALVIGVVALLV
        ++ AS+SSS +I       YP         K  LS     LG   FSP+ GLKHLGIS   K   PE+++R  K   + ASLFGVGAPEALVIGVVALLV
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Query:  FGPKGLAEVARTLGKTLRAFQPTIKELQDVSREFKTTLEREIGLDEISSSVNSSYNSSKSNTYS-----DPPSVPKAEESVAVAEPNDSSSESKAYTSEE
        FGPKGLAEVAR LGKTLR FQPTI+ELQDVSR+FK+TLEREIGLD+IS+   + YN +++N         PPSVP  E  V   +PNDS S  KAYTSE+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCGTTCTCCAAATCATGGCCTCCAAATTTTCAGTTTCCACATTCCCATTTTCCCCTTCTTCCTCATCTGCTTGCTCAAGACTTGCAGCTTCCACTTCCTCTTCCTC
TTCCATCTTATACCCCACAACCCCCAAAATTCGTCTCTCCTTGTGTAATTTCCCACTGGGTCTCGGCCTTTTCTCTCCATGGAGTGGTTTAAAGCATTTGGGTATTTCTA
CCAGAGGAAAGTTTCCCGAGAGAAGAAAGAGAATTCCTAAGGGGAAAGCAGTTTTTGCATCTTTGTTTGGGGTTGGAGCTCCCGAGGCACTGGTTATTGGGGTAGTGGCT
CTGTTAGTTTTTGGTCCCAAGGGTCTTGCTGAGGTTGCTCGGACTCTGGGGAAGACCTTACGTGCATTTCAACCCACTATAAAAGAACTTCAGGACGTTTCTAGAGAATT
CAAGACCACGCTTGAGCGAGAAATTGGTCTCGATGAAATCTCGAGTTCAGTCAACAGCTCATACAATTCAAGCAAATCAAATACCTACTCAGACCCACCTTCTGTTCCTA
AAGCAGAAGAGTCTGTTGCAGTAGCTGAACCAAATGATTCTTCATCAGAAAGCAAAGCATATACCTCTGAAGAGTACCTAAAGGTTACAGAAGAGCAGCTGAAAGCTCAA
GATCAGCTCCAAACCAATTTTGCAGCAGAAAGCCAGAGTGGATCCCAAGTACAGCCTGAAGGTTGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAAACCCTGAAGGCTATGCCGAATCAGAAGTGCTGAAGCTTTGTCCAAATTAGCGACTATCTGTTTGCTGGGTCTCCCCCGGTTCATGGTCGTTCTCCAAATCA
TGGCCTCCAAATTTTCAGTTTCCACATTCCCATTTTCCCCTTCTTCCTCATCTGCTTGCTCAAGACTTGCAGCTTCCACTTCCTCTTCCTCTTCCATCTTATACCCCACA
ACCCCCAAAATTCGTCTCTCCTTGTGTAATTTCCCACTGGGTCTCGGCCTTTTCTCTCCATGGAGTGGTTTAAAGCATTTGGGTATTTCTACCAGAGGAAAGTTTCCCGA
GAGAAGAAAGAGAATTCCTAAGGGGAAAGCAGTTTTTGCATCTTTGTTTGGGGTTGGAGCTCCCGAGGCACTGGTTATTGGGGTAGTGGCTCTGTTAGTTTTTGGTCCCA
AGGGTCTTGCTGAGGTTGCTCGGACTCTGGGGAAGACCTTACGTGCATTTCAACCCACTATAAAAGAACTTCAGGACGTTTCTAGAGAATTCAAGACCACGCTTGAGCGA
GAAATTGGTCTCGATGAAATCTCGAGTTCAGTCAACAGCTCATACAATTCAAGCAAATCAAATACCTACTCAGACCCACCTTCTGTTCCTAAAGCAGAAGAGTCTGTTGC
AGTAGCTGAACCAAATGATTCTTCATCAGAAAGCAAAGCATATACCTCTGAAGAGTACCTAAAGGTTACAGAAGAGCAGCTGAAAGCTCAAGATCAGCTCCAAACCAATT
TTGCAGCAGAAAGCCAGAGTGGATCCCAAGTACAGCCTGAAGGTTGCTAAAACCAAATCTCTAAGGAAACTTAGTTTTTAAAAATAAAAAAACCAAATGGTTATGAGCGG
GATCTTCACTCTCTCCCCTTATCACTCTGACACATATGACCTTGTAACAGGAACTGTCGAAGAACCTACCACGGCAGCTCCTGGACTCCAAAATCTTGGAACAGGTAAAG
TTGAGGAATCAACTGCCTCAGCTCCCGGACCTCCTGGAACTGAGACGTAAAGTTATTAGAATCAATTTTGGATCGAGAATTATTTGTTGTTTCATCTATTGATTGGATGT
GATACAACATGTTCTTTAGGTGGCCAATTTAGAAAATATGTGTTTAGTGTTTGAACCTCATGTGAGAGAAGTGATTTTATCAGTGTCTTGGAACGTAATCAGTTTATAGG
CATTGGGTAAGATGATTTTGTTGGATTACTAATTAGAATTCCTTCCACATTTCATATAATATCTTCCATGGATTTTGATTAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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