; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G015500 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G015500
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionBidirectional sugar transporter SWEET
Genome locationchr05:23270650..23275779
RNA-Seq ExpressionLsi05G015500
SyntenyLsi05G015500
Gene Ontology termsGO:0034219 - carbohydrate transmembrane transport (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051119 - sugar transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004316 - SWEET sugar transporter


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049507.1 SWEET sugar transporter [Cucumis melo var. makuwa]9.9e-11389.02Show/hide
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XP_004134220.1 bidirectional sugar transporter SWEET17 [Cucumis sativus]1.8e-11490.98Show/hide
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XP_023522068.1 bidirectional sugar transporter SWEET17-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.1e-10381.07Show/hide
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Query:  QLSLYAIYRNAKKQLLPLNTSIIT-----SQKQPLISSSDPQP
        Q+++Y +YRNAK   LPL TSI T     SQ QPLISSS+P+P
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XP_023539111.1 bidirectional sugar transporter SWEET16-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-10280.66Show/hide
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        VGILDIG    AI VS+L+L+GE RIG LGFVCAGLNI+MY SPLSVMKTVIK+RSVEYMPFMLS FF LNGGIWTFYAFL+ DWFLAVPNG+GLGLGLA
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Query:  QLSLYAIYRNAKKQLLPLNTSIIT-----SQKQPLISSSDPQP
        Q+++Y +YRNAK   LPL TSI T     SQ QPLISSS+P+P
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XP_038881463.1 bidirectional sugar transporter SWEET16 isoform X1 [Benincasa hispida]7.8e-11086.64Show/hide
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        MA+LSFFVG+IGN+ISVLMFLSP GTF+RI+RNKSTE+FESFPYVCTWLNS+LWTYYGIIKPGAYLVATIN+FGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMK +TGIL
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        VGILDIGMLTA IAVSEL LEG KRIG LGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFF LNGGIWTFYAFLV DWFLAVPNGMGLGLGL 
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        QL LYAIYRNAK+   PLNTSIIT       SQ QPLISSS P PQP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L599 Bidirectional sugar transporter SWEET8.7e-11590.98Show/hide
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        QL LYAIYRNA+K LLPLNTSIITSQ+      QPLISS  PQP
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A0A5D3CWA5 Bidirectional sugar transporter SWEET4.8e-11389.02Show/hide
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        QL LYAIYRNA+K LLPLNTSIITSQ+       QPLISSS PQPQ
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A0A6J1CA77 Bidirectional sugar transporter SWEET1.1e-9879.51Show/hide
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        VGILDIG LT AI VS+  L  E RIG LGFVCAGLNI+MYASPLSVMKTV++SRSVEYMPFMLSLFF +NGGIWTFYAFL  DWFLAVPNGMGLGLGLA
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        +L LY IYRNA K LLPL +S  +S+K    QPLI   S+SDPQ
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A0A6J1FI87 Bidirectional sugar transporter SWEET1.0e-10280.25Show/hide
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        MAELSFFVG+IGN+ISVLMFLSP GTF RI++ KSTEEFESFPYVCTWLNS+LWTYYG+IKPGAYLVAT+NSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMK KTGI+
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        VGILDIG L  AI VS+L+L+GE RIG LGFVCAGLNI+MY SPLS+MKTVIK+RSVEYMPFMLS FF LNGGIWTFYAFL+ DWFLAVPNG+GLGLGLA
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        Q+++Y +YRNAK   LPL TSI T     SQ QPLISSS+P+P
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A0A6J1I9M2 Bidirectional sugar transporter SWEET7.2e-10179.42Show/hide
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        VGILDIG    AI VS+L+L GE RIG LG VCAGLNI+MY SPLSVMKTVIK+RSVEYMPFMLS FF LNGGIWTFYAFL+ DWFLAVPNG+GLGLGLA
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        Q+++Y +YRNAK   LPL TSI T     SQ QPLISS +P+P
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10LN5 Bidirectional sugar transporter SWEET162.5e-5851.17Show/hide
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        MA+ SFFVGI+GN+IS+L+F SP  TFRRI+R+KSTEEF   PYV T L+++LWT+YG+ KPG  L+ T+N  G  +++ ++ ++L YAP   KAK   +
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        V  +++G L A +AV+ + L G  R+  +G +CA L I MYA+P++ M+TV+K+RSVEYMPF LS F  LNGG+W+ Y+ LV+D+F+ +PN +G  LG A
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Query:  QLSLYAIYRNAKK
        QL+LY  YR  KK
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Q6K602 Bidirectional sugar transporter SWEET152.7e-4441.63Show/hide
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        +F  GI+GN+IS+++FLSP  TF R+ R KSTE F+S PYV T  +  LW YY  +K GA L+ TIN  G V+++ +L ++L YAP + +  T  ++  L
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Query:  DIGMLTAAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQLSL
        +IG+      V+ L+  GE R+  LG++C  +++ ++A+PLS+++ VI+++SVE+MPF LS F  L+  IW  Y  L +D F+A+PN +G   G+AQ++L
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Query:  YAIYRNAKKQLLPLNTSIITS
        Y  YR +KK L+  ++S + +
Subjt:  YAIYRNAKKQLLPLNTSIITS

Q84WN3 Bidirectional sugar transporter SWEET172.7e-6051.87Show/hide
Query:  MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGIL
        MAE SF++G+IGN+ISVL+FLSP  TF +I++ +STEE++S PY+CT L S+LWTYYGI+ PG YLV+T+N FG +V++ ++ +FL YAP  +K KT  +
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Query:  VGILDIGMLTAAIAVSELVLEGEK-RIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGL
          +L++    AAI  +    E EK R   +GF+ AGLNI+MY SPLS MKTV+ ++SV+YMPF LS F  LNG IW  YA L  D FL VPNG+G   G 
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Query:  AQLSLYAIYRNAKKQLLPLNTSII--------TSQKQPLIS
         QL LY IYRNAK   L    S I        TS+ +PL+S
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Q9LUR4 Bidirectional sugar transporter SWEET163.8e-5953.05Show/hide
Query:  MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGIL
        MA+LSF+VG+IGN+ISVL+FLSP  TF RI++ +STEE+E FPY+CT ++S+LWTYYGI+ PG YLV+T+N FG + +S ++ +FL + P +   KT ++
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Query:  VGILDIGMLTAAIAVSELVL-EGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGL
        V  L++     AIA +  +  +   R   +GF+CA LNI+MY SPLS +KTV+ +RSV++MPF LS F  LNG IW  YA L+ D FL VPNGMG  LG+
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Query:  AQLSLYAIYRNAK
         QL +YA YRNA+
Subjt:  AQLSLYAIYRNAK

Q9ZV02 Bidirectional sugar transporter SWEET91.8e-4542.27Show/hide
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        E++F  G++GNI+S  +FLSP  TF  I + KS++ F+S PY+C   ++ L  YYGI+K  AYL+ +IN+FG  ++  +L ++++YAP   K  T  L+ 
Subjt:  ELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVG

Query:  ILDIGMLTAAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQL
        I +IG L   I +  L++  + R+  +G+VCA  ++ ++ASPLSVM+ VIK++SVEYMPF+LSL  +LN  +W FY  L++D F+A+PN +G   G+AQ+
Subjt:  ILDIGMLTAAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQL

Query:  SLYAIYRNAKKQLLPLNTSI
         LY +Y+ + K  LP    +
Subjt:  SLYAIYRNAKKQLLPLNTSI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39060.1 Nodulin MtN3 family protein1.3e-4642.27Show/hide
Query:  ELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVG
        E++F  G++GNI+S  +FLSP  TF  I + KS++ F+S PY+C   ++ L  YYGI+K  AYL+ +IN+FG  ++  +L ++++YAP   K  T  L+ 
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Query:  ILDIGMLTAAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQL
        I +IG L   I +  L++  + R+  +G+VCA  ++ ++ASPLSVM+ VIK++SVEYMPF+LSL  +LN  +W FY  L++D F+A+PN +G   G+AQ+
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Query:  SLYAIYRNAKKQLLPLNTSI
         LY +Y+ + K  LP    +
Subjt:  SLYAIYRNAKKQLLPLNTSI

AT3G16690.1 Nodulin MtN3 family protein2.7e-6053.05Show/hide
Query:  MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGIL
        MA+LSF+VG+IGN+ISVL+FLSP  TF RI++ +STEE+E FPY+CT ++S+LWTYYGI+ PG YLV+T+N FG + +S ++ +FL + P +   KT ++
Subjt:  MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGIL

Query:  VGILDIGMLTAAIAVSELVL-EGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGL
        V  L++     AIA +  +  +   R   +GF+CA LNI+MY SPLS +KTV+ +RSV++MPF LS F  LNG IW  YA L+ D FL VPNGMG  LG+
Subjt:  VGILDIGMLTAAIAVSELVL-EGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGL

Query:  AQLSLYAIYRNAK
         QL +YA YRNA+
Subjt:  AQLSLYAIYRNAK

AT4G10850.1 Nodulin MtN3 family protein2.0e-4245.54Show/hide
Query:  VGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGI--IKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVGILD
        VGIIGN I++ +FLSP  TF RI++ KS EE+   PY+ T +N  +W  YG+  + P + LV TIN  G++++  FL +F +Y     K +  I   I  
Subjt:  VGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGI--IKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVGILD

Query:  IGMLTAAIAVSELVLE--GEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQLS
             A +AV  L L+   EKR   +G VC   N+MMYASPLSVMK VIK++SVE+MPF LS+   LN G+WT YA +  D F+A+PNG+G   GLAQL 
Subjt:  IGMLTAAIAVSELVLE--GEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQLS

Query:  LYAIYRNAKKQLL
        LY  Y  + K+++
Subjt:  LYAIYRNAKKQLL

AT4G15920.1 Nodulin MtN3 family protein1.4e-6151.87Show/hide
Query:  MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGIL
        MAE SF++G+IGN+ISVL+FLSP  TF +I++ +STEE++S PY+CT L S+LWTYYGI+ PG YLV+T+N FG +V++ ++ +FL YAP  +K KT  +
Subjt:  MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGIL

Query:  VGILDIGMLTAAIAVSELVLEGEK-RIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGL
          +L++    AAI  +    E EK R   +GF+ AGLNI+MY SPLS MKTV+ ++SV+YMPF LS F  LNG IW  YA L  D FL VPNG+G   G 
Subjt:  VGILDIGMLTAAIAVSELVLEGEK-RIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGL

Query:  AQLSLYAIYRNAKKQLLPLNTSII--------TSQKQPLIS
         QL LY IYRNAK   L    S I        TS+ +PL+S
Subjt:  AQLSLYAIYRNAKKQLLPLNTSII--------TSQKQPLIS

AT5G50800.1 Nodulin MtN3 family protein8.8e-4341.15Show/hide
Query:  SFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPG-AYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVGI
        +F  GI+GNIIS ++FL+P  TF RI + KSTE F+S PYV    ++ LW YY + K G A+L+ TIN+FG V+++ ++ +F+ YA    +  T  ++G+
Subjt:  SFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPG-AYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVGI

Query:  LDIGMLTAAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQLS
        L+     A + V EL+ +G  R   LG +C G ++ ++A+PLS+M+ V+++RSVE+MPF LSLF +++   W FY   ++D+++A+PN +G  LG  Q+ 
Subjt:  LDIGMLTAAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQLS

Query:  LYAIYRNAK
        LY I++  K
Subjt:  LYAIYRNAK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGAACTCAGCTTCTTCGTCGGCATAATAGGAAACATTATCTCCGTCCTCATGTTCCTTTCTCCGGCGGGAACATTCCGGCGGATTATGAGGAATAAATCGACGGA
GGAGTTCGAGAGTTTTCCGTATGTATGCACATGGCTGAACTCCGCTCTCTGGACTTACTACGGAATTATCAAGCCTGGCGCCTACCTCGTCGCCACTATCAATTCCTTTG
GCGTGGTTGTACAGTCATTTTTCCTCGGTGTTTTCCTCATCTACGCACCTTCCGCAATGAAGGCGAAGACAGGGATTCTGGTAGGGATTTTGGATATCGGAATGTTGACG
GCGGCGATTGCAGTGAGTGAATTGGTATTGGAAGGCGAAAAGCGTATTGGACCTCTAGGGTTTGTTTGTGCCGGACTGAATATCATGATGTACGCCTCGCCGCTGTCTGT
CATGAAAACGGTGATAAAGAGTAGGAGTGTGGAGTACATGCCTTTTATGCTATCACTTTTCTTTTCTCTAAATGGAGGAATCTGGACTTTCTATGCTTTTCTCGTGCGTG
ACTGGTTTCTTGCGGTACCAAATGGAATGGGTTTAGGGTTGGGATTGGCACAACTTTCGCTATATGCAATTTACAGAAATGCCAAAAAGCAATTATTGCCATTAAACACT
TCAATAATCACATCACAAAAACAACCCCTTATTTCTTCTTCAGATCCACAACCACAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAAAATAAGAAAAGGCCCGGAAAAGTACAACTTATTAAAGGCAGCTTTAAACGTTCTCACCTGCAAAGCAACCACTTCATTTCTTCTTTCTCCAGCCAACAATGGCGG
AACTCAGCTTCTTCGTCGGCATAATAGGAAACATTATCTCCGTCCTCATGTTCCTTTCTCCGGCGGGAACATTCCGGCGGATTATGAGGAATAAATCGACGGAGGAGTTC
GAGAGTTTTCCGTATGTATGCACATGGCTGAACTCCGCTCTCTGGACTTACTACGGAATTATCAAGCCTGGCGCCTACCTCGTCGCCACTATCAATTCCTTTGGCGTGGT
TGTACAGTCATTTTTCCTCGGTGTTTTCCTCATCTACGCACCTTCCGCAATGAAGGCGAAGACAGGGATTCTGGTAGGGATTTTGGATATCGGAATGTTGACGGCGGCGA
TTGCAGTGAGTGAATTGGTATTGGAAGGCGAAAAGCGTATTGGACCTCTAGGGTTTGTTTGTGCCGGACTGAATATCATGATGTACGCCTCGCCGCTGTCTGTCATGAAA
ACGGTGATAAAGAGTAGGAGTGTGGAGTACATGCCTTTTATGCTATCACTTTTCTTTTCTCTAAATGGAGGAATCTGGACTTTCTATGCTTTTCTCGTGCGTGACTGGTT
TCTTGCGGTACCAAATGGAATGGGTTTAGGGTTGGGATTGGCACAACTTTCGCTATATGCAATTTACAGAAATGCCAAAAAGCAATTATTGCCATTAAACACTTCAATAA
TCACATCACAAAAACAACCCCTTATTTCTTCTTCAGATCCACAACCACAACCCTAATTTTTCAAACATGCCTTATAAATAATTTATATATATTTTAGTTTTATTTTGTAT
TTTGTATCAATTTTTTCTTTATTATTTTTTAAAGAATTTGAGTGTGCTTTACTTTTATACATAATGTAAGAGTTTGAAGGATACGACATCATCAAATTGAGTTGTGATTT
TGGAGTTAATTAATTTATTTAATATCTTTTCTCTTTATTTTTTAAGGAGTGTTTGGCTTAAAAATGAGTGTTTTGTATTTTAGAGTTCAAAATAAATCACAATCTATGTG
TTCATATAATCAATCAATCACATGAACTATGTGTACTAGTCGAGTGAGTTATATATAAAACTCACATTCTATATATAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAELSFFVGIIGNIISVLMFLSPAGTFRRIMRNKSTEEFESFPYVCTWLNSALWTYYGIIKPGAYLVATINSFGVVVQSFFLGVFLIYAPSAMKAKTGILVGILDIGMLT
AAIAVSELVLEGEKRIGPLGFVCAGLNIMMYASPLSVMKTVIKSRSVEYMPFMLSLFFSLNGGIWTFYAFLVRDWFLAVPNGMGLGLGLAQLSLYAIYRNAKKQLLPLNT
SIITSQKQPLISSSDPQPQP