; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G017450 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G017450
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionCRIB domain-containing protein
Genome locationchr05:24845470..24847117
RNA-Seq ExpressionLsi05G017450
SyntenyLsi05G017450
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR000095 - CRIB domain
IPR036936 - CRIB domain superfamily
IPR044510 - CRIB domain-containing protein RIC1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049235.1 CRIB domain-containing protein RIC7-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-9692.63Show/hide
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XP_008438496.1 PREDICTED: CRIB domain-containing protein RIC7-like [Cucumis melo]5.2e-9793.09Show/hide
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XP_038899999.1 CRIB domain-containing protein RIC7-like isoform X1 [Benincasa hispida]7.3e-9177.43Show/hide
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XP_038900006.1 CRIB domain-containing protein RIC7-like isoform X2 [Benincasa hispida]5.2e-9792.56Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9S1 CRIB domain-containing protein2.4e-9590.7Show/hide
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A0A1S3AWI0 CRIB domain-containing protein RIC7-like2.5e-9793.09Show/hide
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A0A5D3CZJ5 CRIB domain-containing protein RIC7-like7.3e-9792.63Show/hide
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A0A6J1CYH9 CRIB domain-containing protein RIC7-like3.0e-8282.57Show/hide
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        RAP+SKRQTS+ESSS LDSSS RRNSEKG+RRQR+SCP GD+ PQEGSSRSSRRRR S    ES +ENPIPKHSNRRK+KGSSDGGESTRS++S  S ++
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        SLTDIPLP LEAVDEE+G
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A0A6J1INK5 CRIB domain-containing protein RIC7-like5.9e-7876.92Show/hide
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        APRSKRQTS++SSS LDSSSARRNSEK SRRQR+SCPSGDSGPQ      EGSSR +RRRR S PG E+STENP+PKHS+RRK+KGSSDGGE   SS+S 
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        +N+SLTDI LPVLEAVDEEKG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4I5N6 CRIB domain-containing protein RIC34.4e-1437.55Show/hide
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           +   +  R K +T S++ SP   +S+   S+   +  R    S        +  S RRRR           S P ++SST +     S  RK KGS 
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         G  S + ++    N       P++E+VD
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F4IVV0 CRIB domain-containing protein RIC19.1e-2041.18Show/hide
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        SS GGE +  +SS+    NS+
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F4J424 CRIB domain-containing protein RIC59.1e-2038.73Show/hide
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        +  + +R+TS+ ++SP +S S    S + S+R        ++G Q   +  S     S       T+   +PK S ++K+KGS+ GG     S    N  
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         TDI
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Q1G3K8 CRIB domain-containing protein RIC72.3e-2343.69Show/hide
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        +T +K LLKGLRYISQ+F    EKE EMQIG PTDVKHVAHIGWDGPS N    PSWMN+FKSSP  +S    +  +GE D SS    ++  G    +  
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         + P+S R++SSE  SP    S    RR S KG+   R +     +     SSR + +   S+    S+    +PK S R+K+K + +GG S+RSSR S+
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         + ++D
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Q1PF35 CRIB domain-containing protein RIC62.9e-1838.94Show/hide
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        ++ +K LLKGLRYISQ+F+ EKE E+QIG PTDVKHVAHIGWDGPS N    PSWM EF S    +S+      +GE D SS    ++  G    +    
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         P+S R+ +SE  SP    S+ +   + S +              G+S SSRR + +    +  +  P     IPK S R+K  TK ++  G S+RS+R 
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Query:  SDNNSLTD
        SD +++++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04450.1 ROP-interactive CRIB motif-containing protein 33.1e-1537.55Show/hide
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        MAT VKGLLKGLRYI+QIFD EK+ +MQIG PTDVKHVAHIG DGP+    N PSWM +FK  P+   +  +V       N IGE       +  QE   
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           +   +  R K +T S++ SP   +S+   S+   +  R    S        +  S RRRR           S P ++SST +     S  RK KGS 
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         G  S + ++    N       P++E+VD
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AT2G20430.1 ROP-interactive CRIB motif-containing protein 62.1e-1938.94Show/hide
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        ++ +K LLKGLRYISQ+F+ EKE E+QIG PTDVKHVAHIGWDGPS N    PSWM EF S    +S+      +GE D SS    ++  G    +    
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Query:  SDNNSLTD
        SD +++++
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AT2G33460.1 ROP-interactive CRIB motif-containing protein 16.5e-2141.18Show/hide
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        E   QK  R P      +   S P  SS    +S+   K SR  R++  S DS   +    S RRRR   P  ++   N IP          S  RK KG
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AT3G23380.1 ROP-interactive CRIB motif-containing protein 56.5e-2138.73Show/hide
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        +  + +R+TS+ ++SP +S S    S + S+R        ++G Q   +  S     S       T+   +PK S ++K+KGS+ GG     S    N  
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Query:  LTDI
         TDI
Subjt:  LTDI

AT4G28556.1 PAK-box/P21-Rho-binding family protein1.7e-2443.69Show/hide
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        +T +K LLKGLRYISQ+F    EKE EMQIG PTDVKHVAHIGWDGPS N    PSWMN+FKSSP  +S    +  +GE D SS    ++  G    +  
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Query:  SRAPRSKRQTSSESSSPLDSSS---ARRNSEKGSRRQRASCPSGDSGPQEGSSRSSRRRRSSNPGAESSTENPIPKHSNRRKTKGSSDGGESTRSSRSSD
         + P+S R++SSE  SP    S    RR S KG+   R +     +     SSR + +   S+    S+    +PK S R+K+K + +GG S+RSSR S+
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Query:  NNSLTD
         + ++D
Subjt:  NNSLTD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AACCAGAAATGCAGATTGGTCTTCCCACTGATGTTAAGCATGTTGCTCATATTGGATGGGATGGTCCATCTGGGAATCAAAACAATACACCTAGTTGGATGAACGAGTTT
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AAAGGCAAGTCGAGCACCGAGGTCGAAACGCCAAACGTCGTCGGAGTCTTCGTCGCCTTTAGACTCTTCCTCTGCTCGGCGAAACTCTGAGAAGGGCTCAAGACGACAAC
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TTCCCACATGTAATCTGTATTTTTGAATTTCTACTTATTCAGCACCCCCTTTTCAATGCAGTGGTATGATCATCATAAATCACTGATATTAACAGAAGCAATTGTAGTCA
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AAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ESSSPLDSSSARRNSEKGSRRQRASCPSGDSGPQEGSSRSSRRRRSSNPGAESSTENPIPKHSNRRKTKGSSDGGESTRSSRSSDNNSLTDIPLPVLEAVDEEKG