; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G017740 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G017740
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic
Genome locationchr05:25057286..25060950
RNA-Seq ExpressionLsi05G017740
SyntenyLsi05G017740
Gene Ontology termsGO:1901259 - chloroplast rRNA processing (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049207.1 putative G3BP-like protein [Cucumis melo var. makuwa]9.1e-12693.08Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        MAAAAAA GASFFTTPLRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IES PLRA SERWRPVL ISAAVVQGE AVTVGVEE   E+    AV+GGSPV
Subjt:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
        GNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV

XP_004134038.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis sativus]7.2e-13189.96Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        MAAAAAA GASFF T LRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIES  LRA SE+WRPV+ ISAAVVQGE AVTVGVEE   E+     V+GGSPV
Subjt:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYG+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        GNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIY+GETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE +NE+ELEGRVIRVSLAEGKQA G
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

XP_016898952.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein [Cucumis melo]7.9e-13092.94Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        MAAAAAA GASFFTTPLRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IES PLRA SERWRPVL ISAAVVQGE AV VGVEE   E+    AV+GGSPV
Subjt:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
        GNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

XP_022157973.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Momordica charantia]1.5e-12586.17Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASF--FTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETA-EKGGGEAVDGG
        MAAAAA  G+SF   T   +G RSKHWLSDSLLA PSTQ+LP+LSR LA+ES  LRAFSE+WRPVL ISAAVVQGE AVT   EE  A EKGGGEAV GG
Subjt:  MAAAAAAAGASF--FTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETA-EKGGGEAVDGG

Query:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
        SPVE+GSTKLYFGNLPYSVDSSQLA IVQ++GV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
Subjt:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK

Query:  LFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        LFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTK EME ALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
Subjt:  LFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

XP_022979333.1 putative G3BP-like protein [Cucurbita maxima]5.5e-12386.99Show/hide
Query:  AAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTV----GVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        AAA G SFFTTP+RGSRSKHWLSDS LATPSTQVLPILSR LA++S PLRAFSERWRP   ISAA VQGEAA+TV    GVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
Subjt:  AAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTV----GVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDS QLAAIVQDYGVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SIEDCNKVIENL+G  YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
         NL+WSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL ALN+   EGRV+ V
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L496 Uncharacterized protein3.5e-13189.96Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        MAAAAAA GASFF T LRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIES  LRA SE+WRPV+ ISAAVVQGE AVTVGVEE   E+     V+GGSPV
Subjt:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYG+AELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG+AYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        GNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIY+GETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALE +NE+ELEGRVIRVSLAEGKQA G
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

A0A1S4DSH7 LOW QUALITY PROTEIN: putative G3BP-like protein3.8e-13092.94Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        MAAAAAA GASFFTTPLRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IES PLRA SERWRPVL ISAAVVQGE AV VGVEE   E+    AV+GGSPV
Subjt:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
        GNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

A0A5D3CZH4 Putative G3BP-like protein4.4e-12693.08Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        MAAAAAA GASFFTTPLRGSRSKHW SDSLLATPSTQVLPILSRSL IES PLRA SERWRPVL ISAAVVQGE AVTVGVEE   E+    AV+GGSPV
Subjt:  MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQD+GVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
        GNLSWSVTSE LTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEV

A0A6J1DUT6 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic7.5e-12686.17Show/hide
Query:  MAAAAAAAGASF--FTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETA-EKGGGEAVDGG
        MAAAAA  G+SF   T   +G RSKHWLSDSLLA PSTQ+LP+LSR LA+ES  LRAFSE+WRPVL ISAAVVQGE AVT   EE  A EKGGGEAV GG
Subjt:  MAAAAAAAGASF--FTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETA-EKGGGEAVDGG

Query:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
        SPVE+GSTKLYFGNLPYSVDSSQLA IVQ++GV ELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCN+VIENLDG+AYMGR+LRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK
Subjt:  SPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYK

Query:  LFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
        LFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTK EME ALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG
Subjt:  LFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG

A0A6J1IVW4 putative G3BP-like protein2.7e-12386.99Show/hide
Query:  AAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTV----GVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
        AAA G SFFTTP+RGSRSKHWLSDS LATPSTQVLPILSR LA++S PLRAFSERWRP   ISAA VQGEAA+TV    GVEEETAEKGGGEAVDGGSPV
Subjt:  AAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTV----GVEEETAEKGGGEAVDGGSPV

Query:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV
        ESGSTKLYFGNLPYSVDS QLAAIVQDYGVAELIEVLYDR+TGKSRGFAFVTM+SIEDCNKVIENL+G  YMGRILRVNFSDKPKPKE L+PETEYKLFV
Subjt:  ESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFV

Query:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
         NL+WSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETG+SRGYGFVSYSTKSEMETAL ALN+   EGRV+ V
Subjt:  GNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19683 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic1.8e-3641.71Show/hide
Query:  EETAEKGGGEAV-DGGSPVE-------------SGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG
        EET E+G  EAV D G   E                 KL+ GNLPY VDS  LA + +  GV E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS++E+  K +E  + 
Subjt:  EETAEKGGGEAV-DGGSPVE-------------SGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDG

Query:  TAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEG
            GR+L VN +    ++P+ + P   E  Y+++VGN+ W +    L Q F E+G VV ARV+Y+ ETG+SRG+GFV+ ++++EM  A+  L+   L+G
Subjt:  TAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEG

Query:  RVIRVSLAEGK
        R IRV++AE +
Subjt:  RVIRVSLAEGK

P19684 33 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic3.7e-3738.74Show/hide
Query:  IESVPLRA---FSERWRPVLFIS--AAVVQG--------EAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELI
        I S  L+A    S  +R  +F+S  A+V  G        E  V +  EEE   +   E V+  S VE G  +LY GNLP+S+ SSQL+ I  + G    +
Subjt:  IESVPLRA---FSERWRPVLFIS--AAVVQG--------EAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELI

Query:  EVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNV
        E++YDR T +SRGFAFVTM S+E+  + I   DG+   GR ++VNF + P+  E              + ++ +KL+V NLSW++TS+ L  AF +    
Subjt:  EVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNV

Query:  VGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGK
        + A+VIY+  +G+SRG+GF+++S+   M +AL+ +NEVELEGR +R+++A  K
Subjt:  VGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGK

P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic1.9e-3844.39Show/hide
Query:  AVVQGEA----AVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGS-PVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVI
        AV++GE+    AV+ G E + +++GG E   G S P E    KL+ GNLPY VDS +LA I    GV E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMS++E+  K +
Subjt:  AVVQGEA----AVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGS-PVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVI

Query:  ENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY----KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNE
        E L+G    GR L VN    P+      P  ++    +++VGNL W V +  L Q F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV+ S++SE+  A+ AL+ 
Subjt:  ENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEY----KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNE

Query:  VELEGRVIRVSLAE
          L+GR +RV++AE
Subjt:  VELEGRVIRVSLAE

P82277 30S ribosomal protein 2, chloroplastic6.9e-3640.3Show/hide
Query:  VEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNF
        V EET+      +   G     G+ +LY GN+P ++++ +L  IV+++G  E+ EV+YD+ +G+SR F FVTM ++ED N VIE L+ T   GR ++VN 
Subjt:  VEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNF

Query:  SDKP---------KPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSL
        ++KP         + ++  + E+ YK+++GNL+ +VT+E L   F E G V+GA+V     T KS G+GFVS+S++ E+E A++ALN   LEG+ IRV+ 
Subjt:  SDKP---------KPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSL

Query:  A
        A
Subjt:  A

Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic2.0e-3540.81Show/hide
Query:  SAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKG--GG---------EAVDG-GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMS
        S+ VV   +  +   EEE  E G  GG         E+ DG G P      KL+ GNLPY VDS  LA + +  G  E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS
Subjt:  SAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKG--GG---------EAVDG-GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMS

Query:  SIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEM
        ++E+  K +E  +     GR L VN +     +P+ ++P   +  ++++VGNL W V S  L + F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV  S ++E+
Subjt:  SIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEM

Query:  ETALEALNEVELEGRVIRVSLAE
          A+ AL+   LEGR I+V++AE
Subjt:  ETALEALNEVELEGRVIRVSLAE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G60000.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein4.3e-7366.67Show/hide
Query:  VTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL
        +TV +EEE  + G    +D   P  + +TKLYFGNLPY+VDS+ LA I+QD+   EL+EVLY+R+TG+SRGFAFVTMS++EDCN +I+NLDGT Y+GR L
Subjt:  VTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL

Query:  RVNFSDKPKP-KEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGK
        +VNF+DKPKP KEPLYPETE+KLFVGNLSW+VTSESL  AF+E G+VVGARV+++G+TG+SRGYGFV YS+K+EMETALE+L+  ELEGR IRV+LA+GK
Subjt:  RVNFSDKPKP-KEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGK

Query:  Q
        +
Subjt:  Q

AT2G37220.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein7.1e-3637.56Show/hide
Query:  VTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL
        V +  E E  E G  +         S   KL+ GNLP++VDS+QLA + +  G  E++EV+YD+ TG+SRGF FVTMSS+ +     +  +G    GR L
Subjt:  VTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRIL

Query:  RVNFSDKPKPKEPLY---PETEY-------------------KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL
        RVN    P  +E  +   P + +                   +++VGNLSW V   +L   F E G VV ARVIY+ ++G+S+G+GFV+Y +  E++ A+
Subjt:  RVNFSDKPKPKEPLY---PETEY-------------------KLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETAL

Query:  EALNEVELEGRVIRVSLAEGK
        ++L+  +L+GR IRVS AE +
Subjt:  EALNEVELEGRVIRVSLAEGK

AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 331.2e-3535.84Show/hide
Query:  AAVVQGEAAVTVGVEEETAEKG--GGEAVDGGSPVESGS---TKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKV
        A+    E   +V  EEE  E+G  G E V+        S    +LY GNLPY++ SS+L+ I  + G    ++++YD+ T +SRGF FVTM SIE+  + 
Subjt:  AAVVQGEAAVTVGVEEETAEKG--GGEAVDGGSPVESGS---TKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKV

Query:  IENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEM
        ++  + +   GR ++VNF + P+  E              Y ++ +K++ GNL W++TS+ L  AF +   V+GA+VIY   TG+SRG+GF+S+ +   +
Subjt:  IENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKE------------PLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEM

Query:  ETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ
        ++AL  +N VE+EGR +R++LA  ++
Subjt:  ETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQ

AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein1.2e-3541.18Show/hide
Query:  EAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMG
        E  V+ G E E     G  +     P  S   KL+ GNL Y V+S  LA + +  G  E+ EV+Y+R T +SRGF FVTMSS+++    +E  +     G
Subjt:  EAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMG

Query:  RILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV
        R+L VN +     +P+ + P   E  ++++VGNL W V +  L Q F E+G VV ARV+Y+ ETG+SRG+GFV+ S   E+  A+ AL+   LEGR IRV
Subjt:  RILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRV

Query:  SLAE
        ++AE
Subjt:  SLAE

AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B1.4e-3640.81Show/hide
Query:  SAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKG--GG---------EAVDG-GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMS
        S+ VV   +  +   EEE  E G  GG         E+ DG G P      KL+ GNLPY VDS  LA + +  G  E+ EV+Y+R+T +SRGF FVTMS
Subjt:  SAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKG--GG---------EAVDG-GSPVESGSTKLYFGNLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMS

Query:  SIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEM
        ++E+  K +E  +     GR L VN +     +P+ ++P   +  ++++VGNL W V S  L + F E+G VV ARV+ + ETG+SRG+GFV  S ++E+
Subjt:  SIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFS----DKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYGNVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEM

Query:  ETALEALNEVELEGRVIRVSLAE
          A+ AL+   LEGR I+V++AE
Subjt:  ETALEALNEVELEGRVIRVSLAE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGAGCCTCCTTCTTCACCACTCCCTTAAGGGGTTCACGGTCCAAGCACTGGCTCTCTGATTCTCTCCTCGCAACCCCATCCACGCA
AGTGTTGCCCATATTGTCCCGCTCTCTGGCCATTGAATCAGTTCCACTCAGAGCTTTCTCGGAGAGGTGGCGGCCGGTTCTTTTCATCTCGGCCGCCGTTGTGCAAGGAG
AGGCGGCTGTGACGGTGGGGGTTGAAGAGGAGACGGCGGAGAAGGGAGGAGGGGAGGCGGTGGATGGTGGTTCTCCAGTGGAGTCCGGGAGTACTAAGCTGTATTTTGGG
AATTTGCCTTACAGTGTTGATAGTTCCCAGCTCGCCGCCATTGTTCAGGATTATGGGGTCGCCGAGCTTATTGAGGTTCTGTATGACAGGAATACTGGAAAAAGCAGAGG
ATTCGCATTTGTAACCATGAGCAGTATTGAAGATTGCAATAAAGTCATTGAAAATCTAGATGGAACTGCTTACATGGGCAGAATTTTGAGAGTTAATTTCTCAGACAAAC
CTAAGCCCAAGGAACCTTTATATCCAGAAACTGAGTATAAACTTTTTGTCGGAAACTTATCCTGGTCAGTAACATCTGAAAGTTTGACACAAGCATTTCAAGAATATGGA
AATGTGGTAGGAGCAAGGGTTATTTATAACGGGGAGACTGGAAAGTCACGTGGTTATGGCTTTGTTTCTTACTCAACAAAATCAGAGATGGAAACAGCTCTTGAAGCTCT
TAATGAAGTGGAACTTGAAGGCAGGGTAATACGTGTAAGCTTGGCTGAAGGAAAACAGGCACAGGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAACCATTCTCTTATTTCATTTAGCAATATAAAAATTTAGTTAACAATAAAATATTGGCAAATAAAAATGGATATTACTAATCCAAATGAGAATTTAACATTATCTCTCA
CCATTGGCCACCAAGCGCCCACGTCTGCATGGACTACTAACTTGAGGCTGTGAAAAAGGCACCGATCACTTTTCAACTCTCCACCGCTGCTAACCATCATCTCCTCCCTA
TCAAATTCCACCACCATGGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGAGCCTCCTTCTTCACCACTCCCTTAAGGGGTTCACGGTCCAAGCACTGGCTCTCTGATTCTCTCCTCGC
AACCCCATCCACGCAAGTGTTGCCCATATTGTCCCGCTCTCTGGCCATTGAATCAGTTCCACTCAGAGCTTTCTCGGAGAGGTGGCGGCCGGTTCTTTTCATCTCGGCCG
CCGTTGTGCAAGGAGAGGCGGCTGTGACGGTGGGGGTTGAAGAGGAGACGGCGGAGAAGGGAGGAGGGGAGGCGGTGGATGGTGGTTCTCCAGTGGAGTCCGGGAGTACT
AAGCTGTATTTTGGGAATTTGCCTTACAGTGTTGATAGTTCCCAGCTCGCCGCCATTGTTCAGGATTATGGGGTCGCCGAGCTTATTGAGGTTCTGTATGACAGGAATAC
TGGAAAAAGCAGAGGATTCGCATTTGTAACCATGAGCAGTATTGAAGATTGCAATAAAGTCATTGAAAATCTAGATGGAACTGCTTACATGGGCAGAATTTTGAGAGTTA
ATTTCTCAGACAAACCTAAGCCCAAGGAACCTTTATATCCAGAAACTGAGTATAAACTTTTTGTCGGAAACTTATCCTGGTCAGTAACATCTGAAAGTTTGACACAAGCA
TTTCAAGAATATGGAAATGTGGTAGGAGCAAGGGTTATTTATAACGGGGAGACTGGAAAGTCACGTGGTTATGGCTTTGTTTCTTACTCAACAAAATCAGAGATGGAAAC
AGCTCTTGAAGCTCTTAATGAAGTGGAACTTGAAGGCAGGGTAATACGTGTAAGCTTGGCTGAAGGAAAACAGGCACAGGGGTAAATGTAGAAATGATTTAAACATGTCA
AGCATACAATGACTAAACAAGAAACAGGAAAGAATTTCTACCTAGCTGTTACTGCACAAACCGCAAGTGACTGAATCTTCTCTCTTCTTTCTTCTTGTATATACCCCATT
TCCCACTTTTGTACCTTACAAGCTAAATTCAGCGGGAAAAACTTTTTGGTCTCCGGCAAATGTGGTAGAGATATCCTATCATTTCTGATTCAGACTGATGATCACAACAC
TGAATGGTTGTACCATGAAATGTAATAGGAAAGAATTCCTACCTTACTATTGCTGCAAATGACTGAAATTTCTCATTTCTTCACTTCTATACCTTACAAGTGAGAATCAT
TTGATGGTCTCTCGTTGACTGTGGTAGAGATTGTTGTTGTATTAATCTTGATTCAGGTTGACGATTAGACACTAAATCTTACAACCAGCTGTAGCAGGGACTAAGAAGTG
ATGTCTGAACCAGATGGACTCCACACTGCTTAAAGAGAATGGAAGTCTGTCACCACGATCTCTTTGAAGATTTGCTCCTCAAAGACACTTTTCACAAGACTGCTCTATTT
GCTCAGGTATGAAAGGATCACCTTAGTGTTTATACAACTAACAATCTGATTGAACAACAAGAAGTCAAGAACTACTACCCTGTATTTGAAACTGATCTCAAAGTACCCAC
ATGCTTCAAATTCAAAAACTCATCTTTGGGGACTTTCAGCAAACACTTGGTGTGCACCCCACAAAACAAACCTAATCTTCAAGGGATTTCTCACCTCAAAAGGTAGAAAA
TGAAAAGTTAGGCTGCAGGGCAGTGTTAGGCACTGATGAGCTTAAGAAATACCAACATAAGCACTAGATTGTGCTGTTCCATGTCTCCCAAAACTCAAACAGAGCCGTAT
AGGCATAAAAGCGCGGTGCTAATTGTGTCAGCAGACAAGGAGATCAATGTGCCCTTCTCTTTATGGGCGAAATTATTGTGCATTTATGTGCTTTGAGATTTAGGGTCGCT
GCCTAGAACGAGTGAAATGGCGGCTGCTTCACACTAAACTTTCTTTTCTTTCTTTTCTTATAGTTCATGTTCGTTAAATTAAAAAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAAAAAAGASFFTTPLRGSRSKHWLSDSLLATPSTQVLPILSRSLAIESVPLRAFSERWRPVLFISAAVVQGEAAVTVGVEEETAEKGGGEAVDGGSPVESGSTKLYFG
NLPYSVDSSQLAAIVQDYGVAELIEVLYDRNTGKSRGFAFVTMSSIEDCNKVIENLDGTAYMGRILRVNFSDKPKPKEPLYPETEYKLFVGNLSWSVTSESLTQAFQEYG
NVVGARVIYNGETGKSRGYGFVSYSTKSEMETALEALNEVELEGRVIRVSLAEGKQAQG