; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi05G019960 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi05G019960
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr05:27020694..27021639
RNA-Seq ExpressionLsi05G019960
SyntenyLsi05G019960
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACR34668.1 unknown [Zea mays]1.2e-0446.99Show/hide
Query:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCT
        I +S+SG  GS S TSSP PP  P    + I+ SS   PRPTLI TP  P+A+ITS L + RV + +    T+ S   ASS T
Subjt:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCT
CDP20565.1 unnamed protein product [Coffea canephora]1.6e-0462.5Show/hide
Query:  SSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLI
        SSSG  GS SKTS+P P I P  K+   AFSSM+APR  LIITP  P+A  TSLLI
Subjt:  SSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLI
XP_039850005.1 putative protein TPRXL [Panicum virgatum]2.1e-0446.25Show/hide
Query:  SSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCT
        S+SG  GS S TSSP PP  P    +  + SS   PRP L+ TP  P A+ITS   +CRV++ + Q  T  S L ASS T
Subjt:  SSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCT
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A068VIC6 Uncharacterized protein7.7e-0562.5Show/hide
Query:  SSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLI
        SSSG  GS SKTS+P P I P  K+   AFSSM+APR  LIITP  P+A  TSLLI
Subjt:  SSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLI
A0A0A9GWD8 Uncharacterized protein5.3e-0648.81Show/hide
Query:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCTL
        I  SS G SGSFS TSSP P ++P  +H   + SS   PRPTL  TP FP+A+ITS     RVSSV+    T+ S   A S T+
Subjt:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCTL
A0A0A9HD69 Uncharacterized protein1.3e-0751.19Show/hide
Query:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCTL
        I  SS G SGSFS TSSP PP++P  +H   + SS   PRPTL  TPSFP+A+ITS   + RVSSV+    T  S   A S T+
Subjt:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCTL
C4J0G8 Uncharacterized protein5.9e-0546.99Show/hide
Query:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCT
        I +S+SG  GS S TSSP PP  P    + I+ SS   PRPTLI TP  P+A+ITS L + RV + +    T+ S   ASS T
Subjt:  ILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCT
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATATTAAAGAGCTCTTCAGGAATTTCAGGTTCATTCTCAAAAACATCTAGTCCAACTCCTCCAATCTCCCCTTTAATCAAACATTCAATCATCGCCTTCTCGTCGAT
GATCGCCCCTCGACCAACATTGATTATCACTCCATCTTTTCCTAACGCAACCATCACCTCCCTGTTGATCATATGCCGGGTTTCTTCCGTTAACCCACAACAAATTACGA
CGCCGTCACAGTTGCTTGCAAGTTCATGTACATTGGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATATTAAAGAGCTCTTCAGGAATTTCAGGTTCATTCTCAAAAACATCTAGTCCAACTCCTCCAATCTCCCCTTTAATCAAACATTCAATCATCGCCTTCTCGTCGAT
GATCGCCCCTCGACCAACATTGATTATCACTCCATCTTTTCCTAACGCAACCATCACCTCCCTGTTGATCATATGCCGGGTTTCTTCCGTTAACCCACAACAAATTACGA
CGCCGTCACAGTTGCTTGCAAGTTCATGTACATTGGAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MILKSSSGISGSFSKTSSPTPPISPLIKHSIIAFSSMIAPRPTLIITPSFPNATITSLLIICRVSSVNPQQITTPSQLLASSCTLE