; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi06G000290 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G000290
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationchr06:305574..312587
RNA-Seq ExpressionLsi06G000290
SyntenyLsi06G000290
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
GO:0003878 - ATP citrate synthase activity (molecular function)
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InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050962.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-23289.03Show/hide
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A0A5D3CJ91 ATP citrate synthase5.3e-23389.25Show/hide
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A0A6J1HYY6 ATP citrate synthase2.6e-23289.03Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRL NIDLQICSAQVNQSTDF ELTNNEPWLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVK RLGVQVEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T EACAPLIATLPLE                           
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                       IRGKIGDFIMGVFSVFQDLDF+FLEMNPFTLVN EPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTS
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        REKE+KLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLEVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 31.7e-21782.25Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDFTELTN E WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVKARLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE                           
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                       +R KIG+FIMG F+VFQDLDFSF+EMNPFTLV+ EP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTS
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        ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
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        REKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLEV+GPEATMTGICK+AI+CIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 32.3e-21781.94Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDFTEL N EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKT+FLPTEK  T +ACAPLIATLPLE                           
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                       +R KIGDFI GV+SVFQDLDFSFLEMNPFT+VN EPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNI+FPLPFGRVL+P+ESF+H LDEKTS
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        +SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRAL
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        REKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+EV+GPEATMTGICKQAI+CIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 21.3e-22083.23Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDFTEL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKP T +ACAPLIATLPLE                           
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                        RGKIGDFI GVF+VFQDLDFSFLEMNPFT+VN EPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTS
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        ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRAL
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        REKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+EV+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 11.6e-20278.33Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDFTEL N +PWLS+ KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDKVKTIFL TEKP T +ACAPLIATLPLE                           
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Query:  ASSFVVLTAPSVFSQIRGKIGDFIMGVFSVFQDLDFSFLEMNPFTLVNEEPYPLDMRGELDDTAAFKNFK-KWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKT
                        RGKIGDFI GVF+VFQDLDFSFLEMNPFT+VN EPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGNIEFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKT
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Query:  SASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRA
        SASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRA
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Query:  LREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLEVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        LREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+EV+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 16.9e-19873.76Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLENTCDKKFHLPRNNVVKAIALQASLFPL
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLE                           
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                       I+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMNPFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTS
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        ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
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        +EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+EV+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-31.2e-21882.25Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDFTELTN E WLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVKARLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLP EK  TLE CAPLIATLPLE                           
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                       +R KIG+FIMG F+VFQDLDFSF+EMNPFTLV+ EP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG+IEFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTS
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        ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
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        REKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLEV+GPEATMTGICK+AI+CIM
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AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-14.9e-19973.76Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLE                           
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Query:  ASSFVVLTAPSVFSQIRGKIGDFIMGVFSVFQDLDFSFLEMNPFTLVNEEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTS
                       I+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMNPFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTS
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Query:  ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
        ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
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Query:  REKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLEVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        +EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+EV+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  REKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLEVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-14.9e-19973.76Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLENTCDKKFHLPRNNVVKAIALQASLFPL
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLE                           
Subjt:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLENTCDKKFHLPRNNVVKAIALQASLFPL

Query:  ASSFVVLTAPSVFSQIRGKIGDFIMGVFSVFQDLDFSFLEMNPFTLVNEEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTS
                       I+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMNPFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTS
Subjt:  ASSFVVLTAPSVFSQIRGKIGDFIMGVFSVFQDLDFSFLEMNPFTLVNEEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNIEFPLPFGRVLNPTESFVHSLDEKTS

Query:  ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
        ASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL
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Query:  REKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLEVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        +EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+EV+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  REKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLEVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA

AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-14.9e-19973.76Show/hide
Query:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFTELTNNEPWLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKARLGVQVEMGGCKA
        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
Subjt:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFTELTNNEPWLSSTKLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKARLGVQVEMGGCKA

Query:  PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLGCTISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPTEKPFTLEACAPLIATLPLENTCDKKFHLPRNNVVKAIALQASLFPL
        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDKVKTIFLPT    T E CAPL+ATLPLE                           
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                       I+ +I +FI  +F++FQDLDF+FLEMNPFTLV+  PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTS
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        +EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+EV+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-24.2e-19873.12Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS KLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGGI+IEENWDKVKTI +PT    T E CAPL+ATLPLE                           
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                       I+G++ DFI  +F++F+DLDF+FLEMNPFTLV+ +PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG+IEFP+PFGRV++ TESF+H LDEKTS
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