CuGenDBv2

Gene ID	Lsi06G000360
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Cytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome location	chr06:353692..354551
RNA-Seq Expression	Lsi06G000360
Synteny	Lsi06G000360
Gene Ontology terms	GO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002541 - Cytochrome c assembly protein IPR017562 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

QZL38644.1 cytochrome c biogenesis protein [Citrullus naudinianus]

2.8e-148

99.26

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSII+LFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNF+RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

YP_009326039.1 cytochrome c biogenesis protein [Citrullus lanatus]

1.3e-148

99.63

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSII+LFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

YP_009431692.1 cytochrome c biogenesis protein [Citrullus rehmii]

6.3e-148

99.26

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSII+LFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTL SN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

YP_009456196.1 cytochrome c biogenesis protein [Lagenaria siceraria]

2.6e-149

100

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

YP_009752714.1 cytochrome c biogenesis protein [Ampelosycios humblotii]

3.1e-147

98.51

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIH+FTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYA+LLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNN LNALFSFDEIQYMNEGNN LRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1P8LE41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

6.1e-149

99.63

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSII+LFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

A0A1P8LFA2 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

6.1e-149

99.63

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSII+LFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

A0A2I6C0D7 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

1.2e-149

100

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

A0A343A8G1 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

6.1e-149

99.63

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSII+LFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

A0A7G9IT87 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

1.2e-149

100

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

B1NWJ8 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

1.7e-119

80.9

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWI+L HLPLSDLYESL+FLSW FSIIH+  YFKK+KN L  SAITAPST FTQGFATSG LT+MHQS +LVPALQS WLMMHVSMM+LGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVA +VITF+K IRIF K+NN LN  F F EIQYM E  N LRN SF SS+NYY+ QLIQQLD W YRIIS+GFIFL+IGILSGAVWANE WGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLT
        NWDPKETWAFITWTIFAIY H RTNK  EG +SAIVAS+GFL+IWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLT
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLT

Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

3.5e-125

83.64

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LL+TRWIYLR+LPLS+LYESL+FLSW FSIIH+  YFKKYKN+L   AITAPS IFTQGFATSG LTEMHQS +LVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSL S+AL+VITF+K I IF K+NNF+N  FS  EIQY+ E NN L NTSF SS+NYY+ QLIQQLD WSYRIISLGFIFL+IGILSGAVWANE WGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWT+F+IYLHTRTNKNFE VNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

4.1e-126

83.27

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYL H PLSDLYESL+FLSW FSIIH+  YFKK+KNHL  SA+TAPS IFTQGFATSG LTEMHQS +LVPALQS WLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSL SVAL+VITF++ IRI  KNN+FLN  FSFDEIQYMN+GNN L+NTSF S +NYY++Q IQQLDHWSYR+ISLGF+FL+IGILSGAVWANE WGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKN +  NSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT +SN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

1.9e-147

97.4

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSW FSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSLFSVALIVITFQKAIRIF KNNN LNALFSF+EIQY+NEGN F+RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
        NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Q49KU9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

8.9e-121

81.2

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LLVTRWIY  H PLSDLYESL+FLSW FS+IH+  YFKK+KN+L  S ITAPSTIFTQGFATSG LTEMHQS ++VPALQS WLMMHVSMM+LGYAALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW
        GSL SVAL+VIT +KAIR+F K NNFLN  FSF EIQYMNE +N L  TSF SS+NYY++QLIQQLD WSYRIISLGF+FL+IGILSGAVWANE WGSYW
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYW

Query:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTL
        NWDPKETWAFITWT+FAIYLHTRTNKN+E  N AIVAS+GFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSF L
Subjt:  NWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTL

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein

8.3e-106

71.96

Show/hide

Query:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC
        LL+TRWIY  H PLS+LYESL+FLSW FSIIH+ +YF K K    ++ ITAPS IF QGFATSG L +M QS +LVPALQS WLMMHVSMM+LGY ALLC
Subjt:  LLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLC

Query:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNN---NF-LNALFSFDEIQYMNEGNNFL--RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANE
        GSL S+AL+VITF+K    F K N   NF LN LFSFD + Y+NE N+ L  +N +F  S+NYY+ QLIQQLD WS+RIISLGFIFL++GILSGAVWANE
Subjt:  GSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNN---NF-LNALFSFDEIQYMNEGNNFL--RNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANE

Query:  TWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
        TWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLH +TN+N  G+NSAIVA +GF++IWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT
Subjt:  TWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTTCGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCTTTAAGTGATTTATATGAATCATTACTATTTCTTTCATGGGGTTTCTCCATTATTCATCTATT
TACGTATTTTAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTTACCCAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTGAAATGCATC
AATCCCCACTATTAGTTCCCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATTGGGTTATGCAGCTCTTTTATGTGGATCATTATTTTCAGTAGCT
CTTATAGTGATTACATTTCAAAAAGCTATAAGAATTTTTGGTAAAAACAATAATTTCTTAAATGCGTTATTTTCCTTTGATGAGATCCAATACATGAATGAAGGGAACAA
TTTTTTAAGAAACACTTCCTTTTTTTCTTCGAAGAATTATTATAAGTCTCAACTGATTCAACAATTAGATCATTGGAGTTATCGTATTATTAGTCTAGGGTTTATCTTTT
TAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGACCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACCATATTCGCA
ATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAAATTTTGAAGGTGTAAATTCTGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATT
AGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFRLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWGFSIIHLFTYFKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVA
LIVITFQKAIRIFGKNNNFLNALFSFDEIQYMNEGNNFLRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFA
IYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN

Lsi06G000360 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome