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Lsi06G000370 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G000370
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionProtein TIC 214
Genome locationchr06:355529..363197
RNA-Seq ExpressionLsi06G000370
SyntenyLsi06G000370
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0009706 - chloroplast inner membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008896 - Protein TIC214


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QJD26342.1 Ycf1 [Trichosanthes kirilowii]4.3e-4096.74Show/hide
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YP_009430686.1 photosystem I assembly protein Ycf1 [Gynostemma cardiospermum]4.3e-4096.74Show/hide
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YP_009440204.1 hypothetical chloroplast RF19-like protein [Gynostemma longipes]4.3e-4096.74Show/hide
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YP_009738261.1 Ycf1 [Siraitia siamensis]4.3e-4096.74Show/hide
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YP_009753666.1 Ycf1 protein [Trichosanthes wallichiana]4.3e-4096.74Show/hide
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A0A1S4EU51 Protein TIC 2142.1e-4096.74Show/hide
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A0A1S4EU70 Protein TIC 2142.1e-4096.74Show/hide
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A0A249RZD8 Protein TIC 2142.1e-4096.74Show/hide
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A0A6M3RWE9 Protein TIC 2142.1e-4096.74Show/hide
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A0A6M3S424 Protein TIC 2142.1e-4096.74Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A393 Protein TIC 2145.7e-4396.74Show/hide
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A6MM95 Protein TIC 2141.3e-4295.65Show/hide
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Q2MIC9 Protein TIC 2143.7e-4295.65Show/hide
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Q33BW4 Protein TIC 2143.7e-4295.65Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07739.1 Ycf1 protein1.6e-4090.53Show/hide
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ATCG01000.1 Ycf1 protein6.4e-4292.63Show/hide
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ATCG01130.1 Ycf1 protein6.4e-4292.63Show/hide
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ATMG00370.1 Ycf1 protein3.2e-4191.58Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTCTACCGTTTAAATGTCCATCAAAAGGTATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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