; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi06G001760 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G001760
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionNon-specific serine/threonine protein kinase
Genome locationchr06:1901579..1905301
RNA-Seq ExpressionLsi06G001760
SyntenyLsi06G001760
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0008033 - tRNA processing (biological process)
GO:0070525 - tRNA threonylcarbamoyladenosine metabolic process (biological process)
GO:0000408 - EKC/KEOPS complex (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0004674 - protein serine/threonine kinase activity (molecular function)
GO:0004712 - protein serine/threonine/tyrosine kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0106310 - protein serine kinase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000719 - Protein kinase domain
IPR008266 - Tyrosine-protein kinase, active site
IPR011009 - Protein kinase-like domain superfamily
IPR022495 - Serine/threonine-protein kinase Bud32


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008450724.1 PREDICTED: EKC/KEOPS complex subunit bud32 isoform X1 [Cucumis melo]4.9e-11496.02Show/hide
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XP_022154600.1 EKC/KEOPS complex subunit bud32 [Momordica charantia]7.4e-11094.25Show/hide
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XP_023529406.1 EKC/KEOPS complex subunit bud32 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-10993.81Show/hide
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XP_038880661.1 EKC/KEOPS complex subunit bud32 isoform X1 [Benincasa hispida]1.7e-11496.9Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LW55 Non-specific serine/threonine protein kinase6.5e-11295.09Show/hide
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A0A1S3BPU1 Non-specific serine/threonine protein kinase2.4e-11496.02Show/hide
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A0A5D3CF78 Non-specific serine/threonine protein kinase2.4e-11496.02Show/hide
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A0A6J1DK25 Non-specific serine/threonine protein kinase3.6e-11094.25Show/hide
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A0A6J1I5M0 Non-specific serine/threonine protein kinase3.0e-10993.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2HGY8 EKC/KEOPS complex subunit BUD323.9e-3740.74Show/hide
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        LI QGAE R++++T +   R   +K R  K YRHP+LD++LT  RL++EA+ + +  R GV  P ++A+DP    +  E++EG  V+    + L +    
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        G +  Q++      D+  +IG AIG LH  G++HGDLTTSNM++R                  S   ++VLIDFGL+  S   ED+AVDLYVLERA  S 
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        H     L   +L SY+ T K+ SS   KL  VR RGRKR+M+G
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Q54W07 EKC/KEOPS complex subunit bud325.4e-4747.42Show/hide
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        LI QGAEA+ +E+   G + I+KERFSK YRHP+LD K++ KR+  E R + K ++ G+  P L+ VD     +  E+++G +VK  L +   +     Q
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        +  I  ++G  IG +H+  +IHGDLTTSNML+R  TNELV IDFGLS+TS   EDKAVDLYVLERA +S H +   L + IL++Y  TS        KL 
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        QVR RGRK+T  G
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Q96S44 EKC/KEOPS complex subunit TP53RK9.2e-4749.08Show/hide
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        L L+KQGAEARVF   F GR ++IK RF K YRHP L+++L  +R   EAR + + RR G+S PV+F VD     L  E +EG  +V+D +         
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         + LS++A  IG  + ++HD  LIHGDLTTSNML++    +L  VLIDFGLSF S +PEDK VDLYVLE+A LS H +   + E  L SY  +SK+    
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          KL +VR RGRKR+MVG
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Q99PW4 EKC/KEOPS complex subunit Tp53rk3.9e-4548.17Show/hide
Query:  LNLIKQGAEARVFESTFVGRRSIIKERFSKKYRHPLLDSKLTLKRLNAEARCMTKARRLGVSTPVLFAVDPILYTLTFEYVE-GCSVKDILLEIGSNGGD
        L L++QGAEARVF   F GR +++K RF K YRHP L+++L  +R   EAR + + RR G++ PV+F VD     L  E +E   +V+D +        D
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         + L D+A ++G  +  +HD  LIHGDLTTSNML+R    +L  VLIDFGLSF S +PEDK VDLYVLE+A LS H       E  L SY  +SK+ S  
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          KL +VR RGRKR+MVG
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Q9P7N1 EKC/KEOPS complex subunit SPAP27G11.07c1.5e-3639.65Show/hide
Query:  EIKTDSNDGSLNLIKQGAEARVFESTFV-GRRSIIKERFSKKYRHPLLDSKLTLKRLNAEARCMTKARRLGVSTPVLFAVDPILYTLTFEYVEGCSVKDI
        +I  +  +  L ++KQGAEA   ++ F  G   ++K R +K++RHP+LD KL+ KR   EAR + K   +G+  P+L+ +D     +  E+++G  V+D 
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        + EI       K+L  +  +IG  + K+H   ++HGDLTTSNM++ S  N + + IDFGL   S   EDKAVD+YVLERAL S      +L   +L SY 
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Query:  KTSKQWSSTSNKLAQVRQRGRKRTMVG
        ++ KQ  +T  +  +VR RGRKRTM+G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08120.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G26110.1)3.0e-1665.71Show/hide
Query:  MEIKTDSNDGSLNLIKQGAEARVFESTFVGRRSIIKERFSKKYRHPLLDSKLTLKRLNAEARCMTKARRL
        M+ + +  + SL LIKQGAEARV ESTF GRRSI+KERFSKKYRHP+LD+KLTLKRL  + +   KAR L
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AT3G50720.1 Protein kinase superfamily protein4.4e-0431.4Show/hide
Query:  VDPILYTLTFEYVEGCSVKDILLEIGSNGGDSKQLSDIAMQIGVAIGKLHDGGLIHGDLTTSNMLIRSGTNELVLIDFGLSFTSTI
        ++P L  +T E V G +++  +L    +  D K     A+ I  A+  LH  G+IH DL   N+L+      + L DFGL+   T+
Subjt:  VDPILYTLTFEYVEGCSVKDILLEIGSNGGDSKQLSDIAMQIGVAIGKLHDGGLIHGDLTTSNMLIRSGTNELVLIDFGLSFTSTI

AT5G01850.1 Protein kinase superfamily protein5.3e-0525.64Show/hide
Query:  IKQGAEARVFESTFVGRRSI---IKERFSKKYRHPLLDSKLTLKRLNAEARCMTKARRLGVSTPVLFAVDPILYTLTFEYVEGCSVKDILLEIGSNGGDS
        I +GA  +V++  + GR+ +   +  R SK  +   L+S     R   E   M++ +   +   +    DP++  +T E + G S++  L  I       
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Query:  KQLSDIAMQIGVAIGKLHDGGLIHGDLTTSNMLIRSGTNELVLIDFGLSFTSTIPE
              A+ I  A+  LH  G+IH DL   N+L+      + L DFGL+   ++ E
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AT5G26110.1 Protein kinase superfamily protein1.3e-9677.88Show/hide
Query:  MEIKTDSNDGSLNLIKQGAEARVFESTFVGRRSIIKERFSKKYRHPLLDSKLTLKRLNAEARCMTKARRLGVSTPVLFAVDPILYTLTFEYVEGCSVKDI
        M+ + +  D SL LIKQGAEARVFESTF GRRSI+KERFSKKYRHP+LD+KLTLKRLNAEARCMTKAR+LGV TPVL+AVD +L++LT EY+EG SVKDI
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Query:  LLEIGSNGGDSKQLSDIAMQIGVAIGKLHDGGLIHGDLTTSNMLIRSGTNELVLIDFGLSFTSTIPEDKAVDLYVLERALLSMHSSCGNLMELILASYRK
         LE G+NG   ++L D+A QIG AI KLHDGGL HGDLTTSNML+RSGTN+LVLIDFGLS TST+PEDKAVDLYVLERALLSMHSSCGN+M+ IL +YRK
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Query:  TSKQWSSTSNKLAQVRQRGRKRTMVG
        +SKQWS+T NKLAQVRQRGRKRTM+G
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AT5G26110.2 Protein kinase superfamily protein9.7e-6877.3Show/hide
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        MTKAR+LGV TPVL+AVD +L++LT EY+EG SVKDI LE G+NG   ++L D+A QIG AI KLHDGGL HGDLTTSNML+RSGTN+LVLIDFGLS TS
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Query:  TIPEDKAVDLYVLERALLSMHSSCGNLMELILASYRKTSKQWSSTSNKLAQVRQRGRKRTMVG
        T+PEDKAVDLYVLERALLSMHSSCGN+M+ IL +YRK+SKQWS+T NKLAQVRQRGRKRTM+G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACGGTTCTCAAAGAAATATAGACATCCATTACTGGATTCCAAGCTTACACTCAAGCGATTGAATGCAGAAGCAAGGTGCATGACAAAAGCTAGGCGGCTCGGAGTTTCTA
CTCCAGTGCTGTTTGCTGTTGACCCCATATTATACACTCTGACATTTGAGTATGTGGAAGGTTGTTCTGTGAAAGACATATTGCTTGAAATTGGGTCAAATGGTGGTGAT
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TGGTACCAATGAACTCGTTCTTATTGATTTTGGTCTGAGCTTCACTTCAACTATTCCAGAAGATAAAGCAGTTGATCTATATGTGTTGGAACGAGCGCTGCTATCAATGC
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AAACGCACCATGGTTGGTTAA
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CTACTCTCAAATCTTTGTTTTCTTTCTCACTTCTTCTTTTGTACTTTGGTTTCATATCGATTCTAAGTGTCCGAGGCGTTTTTTTCCGCCATACCTGAAGGCCAATATAG
TTGTAATTCATCAATTTGAGGTGACCCAGTTTTTCTCTCCAAAAATTGGATTATGGAGATAAAGACGGATAGTAACGATGGCTCACTCAATTTAATTAAGCAAGGAGCTG
AAGCTAGAGTGTTTGAGTCTACTTTCGTTGGAAGGAGATCAATTATAAAGGAACGGTTCTCAAAGAAATATAGACATCCATTACTGGATTCCAAGCTTACACTCAAGCGA
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AGGTTGTTCTGTGAAAGACATATTGCTTGAAATTGGGTCAAATGGTGGTGATTCAAAACAGTTGAGTGACATTGCAATGCAGATTGGTGTTGCAATTGGGAAGTTGCATG
ATGGTGGTTTAATTCATGGTGACCTGACCACATCAAACATGTTGATCAGGAGTGGTACCAATGAACTCGTTCTTATTGATTTTGGTCTGAGCTTCACTTCAACTATTCCA
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GTGACTCCTTGTAGTAGACTCATTGAACTTCTTGAACAATGTATTTAATTAATCTTAACCTTACAACAAATCAACAATTATGTTTTTGTGATTACAATTTTGCGGGAAAA
AACCATTCCAATGTCTTGTATTTAGTTATAATATAAAGTCCAATTTAATTCTTAACTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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KRTMVG