; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi06G002740 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G002740
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionGATA transcription factor 21
Genome locationchr06:3088314..3090359
RNA-Seq ExpressionLsi06G002740
SyntenyLsi06G002740
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588037.1 GATA transcription factor 21, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-7359.94Show/hide
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          ETSS   N    HND VKW   SSSSSSKIR +I N NQTET T+T D  RNFQDL P+SPS SP PS  DQTNK   + L+D GGAIIRTCSDCNTT
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        KTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAA   N T        TNK +      KPAATMKRK K+VV          S   GGGR+ LC E++K
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           RLSEISS+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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XP_004135818.1 putative GATA transcription factor 22 [Cucumis sativus]8.4e-11274.26Show/hide
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        MAPPYRDSFPSDH+DLDL YSSSHHLFFPI TPQ SSSSSSSLSF  LDHS  S+DP  R  ELK+EGG IM CNNDQSIG NHEDH+ E GLRFTIWKQ
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        IDKRETSSCCEN    +THND VKW SSSSSSKI+F+I NSNQTE T+TRT ++GRN QDL     ++SP PSS +QTNK TS + LHDGGAIIRTCSDC
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        NTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAAAAA      GG     TNK VQHKI TKPA T+KRK KD VV  GG     GGGRK LCFEEI
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        K  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
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XP_008450852.1 PREDICTED: GATA transcription factor 21 [Cucumis melo]6.0e-11073.28Show/hide
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        MAPPYRDSFPSDH+DLD L YSSS HHLFFPI TP Q SSSSSSSLSF  LDHS  S+DPR  ELK+EGGGIM CNNDQSIG NHEDH+ E GLRFTIWK
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        QIDKRETSSCCEN     THND VKW  SSSSSSKI+F+IN++ QTET  TRT D+GRN QDL P SPS    PSS++QTNK TS + LH+GGAIIRTCS
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Query:  DCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGG--KPTNKGVQHKIMTKPAATM------KRKCKD-VVVGGGGGSGGNGGG
        DCNTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAAAAA      GG     TNK VQHKI TKPA TM      KRK KD VVV  G G G  GGG
Subjt:  DCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGG--KPTNKGVQHKIMTKPAATM------KRKCKD-VVVGGGGGSGGNGGG

Query:  RK-NLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        RK  LCFEEIK  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  RK-NLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

XP_022967871.1 GATA transcription factor 21-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.5e-7659.05Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRY---SSSHHLFFPITPQPSSSSS--SSLSFPPLDHSNSNDPRPFELKN-EGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWK
        MAPPYRDSFPS+H++L +RY   SS  HLFFP TP  SS SS  S   FP L  SN + P      + E GG M C NDQ    N E  VE GL FTIWK
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Query:  QIDKRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDC
             ETSS   N    HND VKW   SSSSSSKIR +I N NQTET+ +T D  RNFQDL P+SPS SP PS  DQTNK   +AL+D GGAIIRTCSDC
Subjt:  QIDKRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDC

Query:  NTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQ-HKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIK
        NTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAA          GG PT   ++ +K + KPAATMKRK K+VV      +   GGGR+ LC E++K
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Query:  FRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
           RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  FRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

XP_038878562.1 GATA transcription factor 21 [Benincasa hispida]1.1e-12777.91Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPLDHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWKQIDKRE
        MAPPYRDSFPSDH+DLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFP LDH  S+DPR  ELK+EGGGIM CNNDQ IG NHED VE GLRFTIWKQIDKRE
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Query:  TSSCCE--NTTTTHNDLVKW-SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCNTTKTPL
        +SSCCE  N   THNDLVKW SSSSSSKI+FLI NSNQTET TRT D+GRNFQDL   SP  +P PSS DQTNK TS+AL DGGAIIRTCSDCNTTKTPL
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Query:  WRSGPRGPK----------RKARRAMAE-AAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPA-----ATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFR
        WRSGPRGPK          RKARRAMAE AAAAANG  P      +NK VQHKIMTK A      T+KRKCKD VV G GG G +GGGRKNLCFEEIK  
Subjt:  WRSGPRGPK----------RKARRAMAE-AAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPA-----ATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFR

Query:  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
         RLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZE4 GATA-type domain-containing protein4.1e-11274.26Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRYSSSHHLFFPI-TPQPSSSSSSSLSFPPLDHSN-SNDP--RPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV-ENGLRFTIWKQ
        MAPPYRDSFPSDH+DLDL YSSSHHLFFPI TPQ SSSSSSSLSF  LDHS  S+DP  R  ELK+EGG IM CNNDQSIG NHEDH+ E GLRFTIWKQ
Subjt:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRYSSSHHLFFPI-TPQPSSSSSSSLSFPPLDHSN-SNDP--RPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV-ENGLRFTIWKQ

Query:  IDKRETSSCCENTT--TTHNDLVKW-SSSSSSKIRFLINNSNQTE-TVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTS-SALHDGGAIIRTCSDC
        IDKRETSSCCEN    +THND VKW SSSSSSKI+F+I NSNQTE T+TRT ++GRN QDL     ++SP PSS +QTNK TS + LHDGGAIIRTCSDC
Subjt:  IDKRETSSCCENTT--TTHNDLVKW-SSSSSSKIRFLINNSNQTE-TVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTS-SALHDGGAIIRTCSDC

Query:  NTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGG--KPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEI
        NTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAAAAA      GG     TNK VQHKI TKPA T+KRK KD VV  GG     GGGRK LCFEEI
Subjt:  NTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGG--KPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEI

Query:  KFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        K  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  KFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

A0A1S3BPL1 GATA transcription factor 212.9e-11073.28Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLD-LRYSSS-HHLFFPI-TP-QPSSSSSSSLSFPPLDHSN-SNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV-ENGLRFTIWK
        MAPPYRDSFPSDH+DLD L YSSS HHLFFPI TP Q SSSSSSSLSF  LDHS  S+DPR  ELK+EGGGIM CNNDQSIG NHEDH+ E GLRFTIWK
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Query:  QIDKRETSSCCENTT--TTHNDLVKW--SSSSSSKIRFLINNSNQTETV-TRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTS-SALHDGGAIIRTCS
        QIDKRETSSCCEN     THND VKW  SSSSSSKI+F+IN++ QTET  TRT D+GRN QDL P SPS    PSS++QTNK TS + LH+GGAIIRTCS
Subjt:  QIDKRETSSCCENTT--TTHNDLVKW--SSSSSSKIRFLINNSNQTETV-TRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTS-SALHDGGAIIRTCS

Query:  DCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGG--KPTNKGVQHKIMTKPAATM------KRKCKD-VVVGGGGGSGGNGGG
        DCNTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAAAAA      GG     TNK VQHKI TKPA TM      KRK KD VVV  G G G  GGG
Subjt:  DCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGG--KPTNKGVQHKIMTKPAATM------KRKCKD-VVVGGGGGSGGNGGG

Query:  RK-NLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        RK  LCFEEIK  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  RK-NLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

A0A6J1ELP1 GATA transcription factor 21-like1.7e-7359.59Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRYSSS--HHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWKQID
        MAPPYRDSFPS+H+DL LRYSSS   HLFFP TP   SS SS LSFP   D   SN   P  L     G     +DQ    N E  VE GL FTIWK   
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Query:  KRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDCNTT
          ETSS   N    HND VKW   SSSSSSKIR +I N NQTET T+T D  RNFQDL P+SPS SP PS  DQTNK   + L+D GGAIIRTCSDCNTT
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Query:  KTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCKDVV------VGGGGGSGGNGGGRKNLCFEE
        KTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAA   N T        TNK +      KPAATMKRK K+VV            S   GGGR+ LC E+
Subjt:  KTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCKDVV------VGGGGGSGGNGGGRKNLCFEE

Query:  IKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
        +K   RLSEISS+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  IKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

A0A6J1HT96 GATA transcription factor 21-like isoform X17.3e-7759.05Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRY---SSSHHLFFPITPQPSSSSS--SSLSFPPLDHSNSNDPRPFELKN-EGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWK
        MAPPYRDSFPS+H++L +RY   SS  HLFFP TP  SS SS  S   FP L  SN + P      + E GG M C NDQ    N E  VE GL FTIWK
Subjt:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRY---SSSHHLFFPITPQPSSSSS--SSLSFPPLDHSNSNDPRPFELKN-EGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWK

Query:  QIDKRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDC
             ETSS   N    HND VKW   SSSSSSKIR +I N NQTET+ +T D  RNFQDL P+SPS SP PS  DQTNK   +AL+D GGAIIRTCSDC
Subjt:  QIDKRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDC

Query:  NTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQ-HKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIK
        NTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAA          GG PT   ++ +K + KPAATMKRK K+VV      +   GGGR+ LC E++K
Subjt:  NTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQ-HKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIK

Query:  FRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
           RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  FRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

A0A6J1HXZ7 GATA transcription factor 21-like isoform X21.7e-7358.81Show/hide
Query:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRY---SSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWKQI
        MAPPYRDSFPS+H++L +RY   SS  HLFFP TP   SS SS LSFP   D   SN   P  L     G     NDQ    N E  VE GL FTIWK  
Subjt:  MAPPYRDSFPSDHNDLDLRY---SSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWKQI

Query:  DKRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDCNT
           ETSS   N    HND VKW   SSSSSSKIR +I N NQTET+ +T D  RNFQDL P+SPS SP PS  DQTNK   +AL+D GGAIIRTCSDCNT
Subjt:  DKRETSSCCENTTTTHNDLVKW---SSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHD-GGAIIRTCSDCNT

Query:  TKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQ-HKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFR
        TKTPLWRSGPRGPK          RKARRAMAEAA          GG PT   ++ +K + KPAATMKRK K+VV      +   GGGR+ LC E++K  
Subjt:  TKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQ-HKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFR

Query:  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
         RL+EI+S+YQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
Subjt:  GRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5HZ36 GATA transcription factor 212.1e-2028.99Show/hide
Query:  HHLFFPITPQPSSSSSSSLS--FPPL-----------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV----ENGLRFTIWKQIDKRE
        HH   P     SSSS SSLS   P L                 DH + + P   ++    GG   C           DH+    E  L+ TI K+  + +
Subjt:  HHLFFPITPQPSSSSSSSLS--FPPL-----------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV----ENGLRFTIWKQIDKRE

Query:  TSSCCENTTTTHNDLVKWSSSSSSK-IRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSS-------------------SPLPSSLDQTNKGTSSALHDG
             +N T   +D  KW  S   + I+  I N+ Q   + +T +N     D  P++  +                   +   ++ ++ N    +   + 
Subjt:  TSSCCENTTTTHNDLVKWSSSSSSK-IRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSS-------------------SPLPSSLDQTNKGTSSALHDG

Query:  GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAAN----GTIPYGGGKPTNKGVQHKIM----------TKPAATMKRKCK---
          +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRA   AAAAA        P     P  K +Q+K            + P     +KCK   
Subjt:  GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAAN----GTIPYGGGKPTNKGVQHKIM----------TKPAATMKRKCK---

Query:  -------------DVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
                     D  +     S  +       CF+++     +   SS+YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  -------------DVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Q6L5E5 GATA transcription factor 153.6e-0435.51Show/hide
Query:  KGTSSALHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPA---ATMKRKCKDVVV
        K  + A HD   + R C++C T  TPLWR+GPRGPK          +K  R  A     A+G    G G  T +  +     K A    T   +    VV
Subjt:  KGTSSALHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPA---ATMKRKCKDVVV

Query:  GGGGGSG
        GGGGG G
Subjt:  GGGGGSG

Q6YW48 Protein CYTOKININ-RESPONSIVE GATA TRANSCRIPTION FACTOR 12.2e-0931.67Show/hide
Query:  IIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYG-------GGKPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCK------------
        ++R CSDCNTTKTPLWRSGP GPK          RKARRAMA AA       P           KP  K  +       +   K++CK            
Subjt:  IIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAANGTIPYG-------GGKPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCK------------

Query:  -----------------DVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH
                          V+V GG  +       +N    +       +  S ++    P+DE  +AA+LLMTLS GL+H
Subjt:  -----------------DVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDE-REAAILLMTLSYGLLH

Q9SZI6 Putative GATA transcription factor 222.1e-1730.4Show/hide
Query:  HNDLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-------------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIW
        H+ L  +     H     +  PSS  S SLS+ P                    D  +++  +P E KN      + ++DQ +        E  L+ TI 
Subjt:  HNDLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-------------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIW

Query:  KQIDKRETSSCCEN--TTTTHNDLVKWSSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCN
        K+ + ++ +   ++     T  + +KW    SSK+R +     + + +  T+D+ +   +    +  SS L +S  Q         ++   +IR CSDCN
Subjt:  KQIDKRETSSCCEN--TTTTHNDLVKWSSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCN

Query:  TTKTPLWRSGPRGPK----------RKARR-AMAEAAAAANGTI--PYGGGKPTNK-----GVQHKIMTKPAATMKRKCK------DVVVGGGGGSGGNG
        TTKTPLWRSGPRGPK          RKARR AMA A A A   +  P    K  NK     GV +KI++ P       CK      +  +     +  N 
Subjt:  TTKTPLWRSGPRGPK----------RKARR-AMAEAAAAANGTI--PYGGGKPTNK-----GVQHKIMTKPAATMKRKCK------DVVVGGGGGSGGNG

Query:  ---GGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
               N+ F+++     L   SS+YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  ---GGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G50870.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein5.6e-0536.26Show/hide
Query:  QTETVTRTTDNG-----RNFQDLIPVSPSSSP------LPS-SLDQTNKGTSSALHDGGA-------IIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK
        + E   R+T +G      NF DLI    ++S       +PS S ++ ++G S     GG        + R C++C+TT TPLWR+GPRGPK
Subjt:  QTETVTRTTDNG-----RNFQDLIPVSPSSSP------LPS-SLDQTNKGTSSALHDGGA-------IIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK

AT4G26150.1 cytokinin-responsive gata factor 11.5e-1830.4Show/hide
Query:  HNDLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-------------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIW
        H+ L  +     H     +  PSS  S SLS+ P                    D  +++  +P E KN      + ++DQ +        E  L+ TI 
Subjt:  HNDLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPL-------------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIW

Query:  KQIDKRETSSCCEN--TTTTHNDLVKWSSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCN
        K+ + ++ +   ++     T  + +KW    SSK+R +     + + +  T+D+ +   +    +  SS L +S  Q         ++   +IR CSDCN
Subjt:  KQIDKRETSSCCEN--TTTTHNDLVKWSSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCN

Query:  TTKTPLWRSGPRGPK----------RKARR-AMAEAAAAANGTI--PYGGGKPTNK-----GVQHKIMTKPAATMKRKCK------DVVVGGGGGSGGNG
        TTKTPLWRSGPRGPK          RKARR AMA A A A   +  P    K  NK     GV +KI++ P       CK      +  +     +  N 
Subjt:  TTKTPLWRSGPRGPK----------RKARR-AMAEAAAAANGTI--PYGGGKPTNK-----GVQHKIMTKPAATMKRKCK------DVVVGGGGGSGGNG

Query:  ---GGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
               N+ F+++     L   SS+YQ+VFPQDE+EAAILLM LS+G++HG
Subjt:  ---GGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG

AT4G36620.1 GATA transcription factor 191.3e-0437.18Show/hide
Query:  LDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKR-------KARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGV
        L+ + KG     H+   + R C++C+TT TPLWR+GPRGPK        + ++    A+ A N T    GG  T  GV
Subjt:  LDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKR-------KARRAMAEAAAAANGTIPYGGGKPTNKGV

AT5G26930.1 GATA transcription factor 231.3e-0473.91Show/hide
Query:  IRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK
        IR CS+C TTKTP+WR GP GPK
Subjt:  IRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK

AT5G56860.1 GATA type zinc finger transcription factor family protein1.5e-2128.99Show/hide
Query:  HHLFFPITPQPSSSSSSSLS--FPPL-----------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV----ENGLRFTIWKQIDKRE
        HH   P     SSSS SSLS   P L                 DH + + P   ++    GG   C           DH+    E  L+ TI K+  + +
Subjt:  HHLFFPITPQPSSSSSSSLS--FPPL-----------------DHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHV----ENGLRFTIWKQIDKRE

Query:  TSSCCENTTTTHNDLVKWSSSSSSK-IRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSS-------------------SPLPSSLDQTNKGTSSALHDG
             +N T   +D  KW  S   + I+  I N+ Q   + +T +N     D  P++  +                   +   ++ ++ N    +   + 
Subjt:  TSSCCENTTTTHNDLVKWSSSSSSK-IRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSS-------------------SPLPSSLDQTNKGTSSALHDG

Query:  GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAAN----GTIPYGGGKPTNKGVQHKIM----------TKPAATMKRKCK---
          +IR CSDCNTTKTPLWRSGPRGPK          RKARRA   AAAAA        P     P  K +Q+K            + P     +KCK   
Subjt:  GAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPK----------RKARRAMAEAAAAAN----GTIPYGGGKPTNKGVQHKIM----------TKPAATMKRKCK---

Query:  -------------DVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG
                     D  +     S  +       CF+++     +   SS+YQ+VFPQDE+EAA+LLM LSYG++HG
Subjt:  -------------DVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCTCCTTATCGGGACTCGTTTCCCTCCGATCACAACGATCTCGATCTTCGTTACTCTTCTTCTCATCACCTCTTCTTCCCGATCACCCCTCAACCTTCGTCTTC
TTCTTCCTCCTCTCTTTCTTTCCCTCCCCTCGATCATTCCAACTCCAACGATCCCCGCCCGTTCGAGCTCAAAAACGAGGGTGGTGGGATTATGACTTGTAATAATGATC
AAAGTATTGGGATTAATCATGAAGATCATGTAGAAAATGGCCTAAGGTTTACAATTTGGAAGCAGATTGATAAGAGAGAAACTTCGAGTTGTTGTGAGAATACTACTACT
ACTCATAATGATTTGGTGAAGTGGTCTTCTTCCTCCTCCTCCAAGATTAGATTCCTGATAAATAATTCTAATCAAACGGAGACCGTCACTCGAACAACTGATAACGGTCG
TAATTTCCAAGATCTTATTCCGGTATCGCCGTCGTCGTCGCCGTTGCCGTCGTCGTTAGATCAAACGAACAAAGGAACAAGTAGTGCGCTACACGACGGTGGCGCCATAA
TCAGAACCTGTTCCGATTGTAACACCACAAAAACTCCCCTTTGGAGGAGCGGCCCTAGAGGTCCTAAGAGAAAAGCAAGGCGAGCAATGGCGGAAGCGGCAGCGGCAGCA
AACGGCACCATTCCATACGGCGGAGGAAAGCCAACCAACAAGGGAGTGCAACACAAGATAATGACGAAGCCGGCGGCGACAATGAAGAGAAAATGCAAAGACGTGGTAGT
AGGTGGTGGAGGCGGCAGCGGCGGCAACGGCGGAGGAAGAAAGAATCTTTGTTTTGAAGAGATAAAATTCCGGGGGCGATTAAGCGAGATTTCTTCATCTTACCAACGAG
TTTTCCCACAAGATGAAAGAGAAGCTGCCATTTTGCTCATGACTCTATCTTATGGCCTTCTTCATGGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACTAATTTCTTTCTTTTTGTCCTTCTTCTTCTCCTTCTCTGCCATGGCTCCTCCTTATCGGGACTCGTTTCCCTCCGATCACAACGATCTCGATCTTCGTTACTCTTCT
TCTCATCACCTCTTCTTCCCGATCACCCCTCAACCTTCGTCTTCTTCTTCCTCCTCTCTTTCTTTCCCTCCCCTCGATCATTCCAACTCCAACGATCCCCGCCCGTTCGA
GCTCAAAAACGAGGGTGGTGGGATTATGACTTGTAATAATGATCAAAGTATTGGGATTAATCATGAAGATCATGTAGAAAATGGCCTAAGGTTTACAATTTGGAAGCAGA
TTGATAAGAGAGAAACTTCGAGTTGTTGTGAGAATACTACTACTACTCATAATGATTTGGTGAAGTGGTCTTCTTCCTCCTCCTCCAAGATTAGATTCCTGATAAATAAT
TCTAATCAAACGGAGACCGTCACTCGAACAACTGATAACGGTCGTAATTTCCAAGATCTTATTCCGGTATCGCCGTCGTCGTCGCCGTTGCCGTCGTCGTTAGATCAAAC
GAACAAAGGAACAAGTAGTGCGCTACACGACGGTGGCGCCATAATCAGAACCTGTTCCGATTGTAACACCACAAAAACTCCCCTTTGGAGGAGCGGCCCTAGAGGTCCTA
AGAGAAAAGCAAGGCGAGCAATGGCGGAAGCGGCAGCGGCAGCAAACGGCACCATTCCATACGGCGGAGGAAAGCCAACCAACAAGGGAGTGCAACACAAGATAATGACG
AAGCCGGCGGCGACAATGAAGAGAAAATGCAAAGACGTGGTAGTAGGTGGTGGAGGCGGCAGCGGCGGCAACGGCGGAGGAAGAAAGAATCTTTGTTTTGAAGAGATAAA
ATTCCGGGGGCGATTAAGCGAGATTTCTTCATCTTACCAACGAGTTTTCCCACAAGATGAAAGAGAAGCTGCCATTTTGCTCATGACTCTATCTTATGGCCTTCTTCATG
GTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPPYRDSFPSDHNDLDLRYSSSHHLFFPITPQPSSSSSSSLSFPPLDHSNSNDPRPFELKNEGGGIMTCNNDQSIGINHEDHVENGLRFTIWKQIDKRETSSCCENTTT
THNDLVKWSSSSSSKIRFLINNSNQTETVTRTTDNGRNFQDLIPVSPSSSPLPSSLDQTNKGTSSALHDGGAIIRTCSDCNTTKTPLWRSGPRGPKRKARRAMAEAAAAA
NGTIPYGGGKPTNKGVQHKIMTKPAATMKRKCKDVVVGGGGGSGGNGGGRKNLCFEEIKFRGRLSEISSSYQRVFPQDEREAAILLMTLSYGLLHG