CuGenDBv2

Gene ID	Lsi06G011740
Organism	Lagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr06:22028579..22029382
RNA-Seq Expression	Lsi06G011740
Synteny	Lsi06G011740
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7023388.1 hypothetical protein SDJN02_14413 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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TYK11828.1 uncharacterized protein E5676_scaffold152G00430 [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_008453606.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494265 [Cucumis melo]

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XP_022921809.1 uncharacterized protein LOC111429953 [Cucurbita moschata]

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XP_038879756.1 uncharacterized protein LOC120071507 [Benincasa hispida]

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e value

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A0A1S3BW36 uncharacterized protein LOC103494265

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A0A5A7UVS6 Uncharacterized protein

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A0A5D3CL04 Uncharacterized protein

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A0A6J1E1L2 uncharacterized protein LOC111429953

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A0A6J1JAL3 uncharacterized protein LOC111485063

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G30230.1 unknown protein

2.0e-27

36.23

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        +TN  NP  L        ++E +++LS  DLPL               KNP  +++E       +LFEF ++   + +++PAE++IF G+L+PLN  +  
Subjt:  DTNETNP--LTSQRNQDEDDESDESLSFSDLPLDRQKSDGHAHPESFRKNPRRSSSE-----PLDLFEFFSTGFITSEMSPAEDLIFCGRLLPLNDHSPL

Query:  TTRTTEKCFWKEEISRKQTVFRKRSESLSGLQS-SVSRSNSAKFNLRRN------SRSLDYRKLYRQTNSIFSPTAEIDRNCSIKSGLKPDSLNKKA--S
         +         E ISR+    R RSESLS +Q   ++R  S     R N      SRSLDYRKL R   ++ SP    + + S K+  KP++ +  +  S
Subjt:  TTRTTEKCFWKEEISRKQTVFRKRSESLSGLQS-SVSRSNSAKFNLRRN------SRSLDYRKLYRQTNSIFSPTAEIDRNCSIKSGLKPDSLNKKA--S

Query:  SKPRWYLLMFGMVKFPAEMDLSDIKSRQVRRS-SSTLFPANESKGKFHCNRSSGEATWRILRALSCKNHASVDVTA
         +PRWY++MFGMVKFP E++L DIKSRQ+RR+    +FP+  ++        S   +WR L ALSCK   SV  TA
Subjt:  SKPRWYLLMFGMVKFPAEMDLSDIKSRQVRRS-SSTLFPANESKGKFHCNRSSGEATWRILRALSCKNHASVDVTA

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTCATGGACGACACCAACGAAACCAATCCCCTAACGTCTCAACGCAATCAAGATGAAGACGACGAATCAGACGAATCACTCTCCTTCTCCGATCTTCCGCTCGACAG
ACAAAAATCCGACGGCCACGCTCATCCGGAAAGCTTCCGCAAGAATCCACGTAGGTCCTCCTCCGAGCCTCTTGATCTCTTCGAATTCTTCAGCACTGGATTCATCACCT
CCGAGATGTCTCCGGCAGAGGATTTGATCTTCTGCGGCAGATTGCTTCCTCTCAACGATCATTCTCCGCTTACTACGCGTACTACCGAGAAGTGTTTCTGGAAGGAAGAG
ATCAGCCGAAAACAGACTGTCTTTCGAAAACGATCCGAGTCATTGTCTGGATTGCAGAGCTCTGTTTCTCGATCCAACAGCGCGAAATTCAATCTCAGGCGGAATAGCCG
ATCGCTCGATTACCGCAAGCTCTATCGCCAAACGAATTCGATTTTCTCGCCGACGGCTGAAATCGATCGTAATTGTTCGATCAAGAGCGGATTGAAGCCTGATTCACTGA
ACAAAAAGGCCTCGTCGAAGCCGAGGTGGTACTTGCTAATGTTCGGAATGGTGAAGTTTCCAGCGGAGATGGACCTCAGCGACATTAAGAGCAGACAAGTCCGCCGAAGT
TCGTCGACACTTTTTCCGGCGAATGAGAGTAAAGGTAAATTTCACTGCAACCGGAGCTCCGGCGAGGCGACTTGGAGGATCCTTCGAGCGCTCAGCTGCAAGAATCACGC
TAGTGTAGATGTAACGGCGTCGTTAACTGCCTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFMDDTNETNPLTSQRNQDEDDESDESLSFSDLPLDRQKSDGHAHPESFRKNPRRSSSEPLDLFEFFSTGFITSEMSPAEDLIFCGRLLPLNDHSPLTTRTTEKCFWKEE
ISRKQTVFRKRSESLSGLQSSVSRSNSAKFNLRRNSRSLDYRKLYRQTNSIFSPTAEIDRNCSIKSGLKPDSLNKKASSKPRWYLLMFGMVKFPAEMDLSDIKSRQVRRS
SSTLFPANESKGKFHCNRSSGEATWRILRALSCKNHASVDVTASLTA

Lsi06G011740 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome