; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi06G011750 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G011750
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description(DL)-glycerol-3-phosphatase 2
Genome locationchr06:22037001..22041498
RNA-Seq ExpressionLsi06G011750
SyntenyLsi06G011750
Gene Ontology termsGO:0006114 - glycerol biosynthetic process (biological process)
GO:0016311 - dephosphorylation (biological process)
GO:0043136 - glycerol-3-phosphatase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006439 - HAD hydrolase, subfamily IA
IPR023198 - Phosphoglycolate phosphatase-like, domain 2
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily
IPR041492 - Haloacid dehalogenase-like hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023529419.1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-13284.43Show/hide
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XP_038878592.1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 2 [Benincasa hispida]1.0e-14391Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZT1 Uncharacterized protein3.7e-14490.66Show/hide
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A0A1S3BXU4 (DL)-glycerol-3-phosphatase 23.8e-14993.08Show/hide
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A0A5D3CIR5 (DL)-glycerol-3-phosphatase 21.2e-12995.85Show/hide
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A0A6J1C159 (DL)-glycerol-3-phosphatase 24.2e-13284.27Show/hide
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A0A6J1F0H8 (DL)-glycerol-3-phosphatase 28.9e-13083.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JTE7 (DL)-glycerol-3-phosphatase 1, mitochondrial1.8e-10370.11Show/hide
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        F R P  ++  S +F      P   A  V+      DA  RGSITH+IFDMDGLLLDTE FYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMG KAIEAAR+FV+E
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        +GISDSLS EDF+VERE ML++LFP S+LMPGASRL++HLH KG+P  +ATG+H RHF+LKTQRH ELF LMHH+V GDDPEVK+GKP+PD FLAA++RF
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        ED PVDP + LVFEDAPSGV AAKNAGM VIMVPD RLD SY   A+QVL+SLLDF P+EWGLP F+DS +
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Q08623 Pseudouridine-5'-phosphatase7.9e-5951.79Show/hide
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        +TH+IFDMDGLLLDTE  Y+ V ++I  RY+K + W +K+ +MG KA+EAA++ ++   +   +S E+ + E +  L+ +FP + LMPGA +LI HL   
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Query:  GVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYH
        G+PF LAT S    F++KT RH E F L  HIVLGDDPEV+ GKP PDIFLA AKRF   P   E+ LVFEDAP+GV AA  AGM+V+MVPD  L     
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          A  VL+SL DF P+ +GLP +E
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Q8VZP1 (DL)-glycerol-3-phosphatase 25.2e-10378.17Show/hide
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        RGSITH+IFDMDGLLLDTE FYTEVQE ILAR+NK FDWSLKAKMMG KAIEAAR+FVEE+GISDSLS EDFLVERE ML++LFP SELMPGASRLIKHL
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Query:  HAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDS
        H K +P  +ATG+H RH++LKTQRH ELF LMHH+V GDDPEVKQGKP+PD FLAAA+RF+D PVD ++ LVFEDAPSGVLAAKNAGM V+MVPDPRLD 
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Query:  SYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDS
        S+   A+Q+++SL+DF P+EWGLPPFEDS
Subjt:  SYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDS

Q94529 Probable pseudouridine-5'-phosphatase1.1e-5250Show/hide
Query:  ITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAK
        +TH +FDMDGLLLDTE  YT   E IL  Y KT+ + +K ++MG++    AR  VE   +   +S E++  ++      L   ++LMPGA RL++HLHA 
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Query:  GVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLG-DDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSY
         VPF LAT S     ELKT +H ELF L +H V G  D EV  GKP+PDIFL AA RF   P  P   LVFED+P+GV AA +AGM+V+MVPDPRL    
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Query:  HGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED
          +A QVL+SL DF P+++GLP F D
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Q9D5U5 Pseudouridine-5'-phosphatase1.1e-5248.89Show/hide
Query:  ITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAK
        +T +IFD+DGL+L+TE  YT+V E+I  RY K ++W +K+ +MG KA+E A+  VE   +   +S E+ L E ++ L+ +   +  MPGA  LI HL   
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Query:  GVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYH
         +PF LAT S    F+ KT RH   F L HHIVLGDDPEVK GKP  DIFL  AKRF   P DP+  LVFED+P+GV AA + GM+V+MVP   L +   
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Query:  GNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED
          A  VLSSL DF P+ +GLP F +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56500.1 haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein3.1e-1028.7Show/hide
Query:  RTATTVSMAYLSPDAT----SRGSITHIIFDMDGLLLDTEGF--------YTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPED
        +++T +S+A  SP AT      G ++ ++FDMDG+L ++E          +TE+  ++       F  + +AK +G           E  G     + E 
Subjt:  RTATTVSMAYLSPDAT----SRGSITHIIFDMDGLLLDTEGF--------YTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPED

Query:  FLVEREDMLRNLFPQSEL-MPGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERT
        F     D      P+S +  PGA  L+     KG+   +A+ + R   +   +  G    +   IV  D    +  KP+PDIFLAAAK      V     
Subjt:  FLVEREDMLRNLFPQSEL-MPGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERT

Query:  LVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMV
        +V EDA +GV AA+ A M+ I V
Subjt:  LVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMV

AT2G38740.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein1.9e-0724.88Show/hide
Query:  PDATSRGSITHIIFDMDGLLLDTEGF----YTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQS-ELM
        P  +    +  I+FD+DG L D++      + E+ ++I        D     + +  K      + +    +S  L    F  E+E + R +  +  + +
Subjt:  PDATSRGSITHIIFDMDGLLLDTEGF----YTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQS-ELM

Query:  PGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKV
         G  +L K +  +G+     T + + + EL   + G L      ++LG + E  +  P P +     K  E   V  E TLVFED+ SG+ A   AGM V
Subjt:  PGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKV

Query:  I
        I
Subjt:  I

AT4G21470.1 riboflavin kinase/FMN hydrolase3.0e-3739.19Show/hide
Query:  IIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAKGVP
        ++ D+DG L++T+G   ++  K L +Y K +D     K++G   +EAA   VE+  +   +  ++F  E   +      + + +PGA+RLI+HL   GVP
Subjt:  IIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAKGVP

Query:  FGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYHGNA
          LA+ S R + E K   H E +K    +++G D EV +GKPSPDIFL AAKR +  P D    LV ED+  GV+A K AG KVI VP     +  + +A
Subjt:  FGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYHGNA

Query:  NQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED
        ++V++SLLD   ++WGLPPF+D
Subjt:  NQVLSSLLDFNPKEWGLPPFED

AT4G25840.1 glycerol-3-phosphatase 11.3e-10470.11Show/hide
Query:  FIRFPKSKILHSSQFQFQFQFPNRTATTVSMAYLSPDATSRGSITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEE
        F R P  ++  S +F      P   A  V+      DA  RGSITH+IFDMDGLLLDTE FYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMG KAIEAAR+FV+E
Subjt:  FIRFPKSKILHSSQFQFQFQFPNRTATTVSMAYLSPDATSRGSITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEE

Query:  TGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRF
        +GISDSLS EDF+VERE ML++LFP S+LMPGASRL++HLH KG+P  +ATG+H RHF+LKTQRH ELF LMHH+V GDDPEVK+GKP+PD FLAA++RF
Subjt:  TGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRF

Query:  EDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDSES
        ED PVDP + LVFEDAPSGV AAKNAGM VIMVPD RLD SY   A+QVL+SLLDF P+EWGLP F+DS +
Subjt:  EDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDSES

AT5G57440.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein3.7e-10478.17Show/hide
Query:  RGSITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHL
        RGSITH+IFDMDGLLLDTE FYTEVQE ILAR+NK FDWSLKAKMMG KAIEAAR+FVEE+GISDSLS EDFLVERE ML++LFP SELMPGASRLIKHL
Subjt:  RGSITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIEAARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHL

Query:  HAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDS
        H K +P  +ATG+H RH++LKTQRH ELF LMHH+V GDDPEVKQGKP+PD FLAAA+RF+D PVD ++ LVFEDAPSGVLAAKNAGM V+MVPDPRLD 
Subjt:  HAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFEDAPVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDS

Query:  SYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDS
        S+   A+Q+++SL+DF P+EWGLPPFEDS
Subjt:  SYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTTCAACTTTTGCAAAACCCCTCTTCCACTCACACTAGACTCTTTCAAAACTTTATACGCTTTCCCAAATCCAAAATTCTCCATTCTTCTCAATTCCAATTCCAATT
CCAATTCCCAAATCGCACTGCAACCACAGTTTCAATGGCGTATCTCTCCCCCGACGCTACTTCCAGAGGATCCATCACTCACATTATCTTTGATATGGACGGACTCTTAT
TGGATACTGAGGGGTTTTACACTGAAGTACAAGAGAAAATACTTGCTAGGTATAATAAAACTTTTGATTGGTCACTTAAGGCAAAGATGATGGGTATGAAAGCTATAGAA
GCTGCTCGGGTCTTTGTTGAAGAGACTGGGATTAGTGATTCTCTTAGTCCGGAGGACTTTCTTGTGGAAAGAGAGGACATGCTACGAAATTTGTTTCCGCAAAGTGAGCT
TATGCCAGGAGCTAGCCGGTTGATCAAACATCTTCATGCAAAAGGAGTACCATTTGGCTTGGCCACTGGATCTCATAGACGTCATTTTGAATTAAAAACACAAAGACATG
GTGAACTTTTTAAGTTGATGCATCACATTGTTCTTGGTGATGATCCAGAGGTTAAACAAGGAAAACCATCTCCGGATATATTTCTTGCAGCTGCTAAAAGATTTGAGGAT
GCTCCTGTGGATCCAGAAAGAACCCTTGTTTTTGAAGATGCACCCTCAGGTGTTCTTGCAGCTAAAAATGCCGGAATGAAGGTAATTATGGTTCCAGATCCAAGGTTGGA
TAGTTCTTATCATGGGAATGCAAATCAGGTATTGAGTTCCCTCTTGGATTTCAACCCCAAGGAATGGGGTCTGCCTCCTTTTGAAGATTCAGAAAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAAAATACGTGGAATAGCTATGATCTTGACTACCATCTCATTCCCGCTATTAAATTGCTAAAGCCTCCACTTAGCGATGCTTCAACTTTTGCAAAACCCCTCTTCCACTC
ACACTAGACTCTTTCAAAACTTTATACGCTTTCCCAAATCCAAAATTCTCCATTCTTCTCAATTCCAATTCCAATTCCAATTCCCAAATCGCACTGCAACCACAGTTTCA
ATGGCGTATCTCTCCCCCGACGCTACTTCCAGAGGATCCATCACTCACATTATCTTTGATATGGACGGACTCTTATTGGATACTGAGGGGTTTTACACTGAAGTACAAGA
GAAAATACTTGCTAGGTATAATAAAACTTTTGATTGGTCACTTAAGGCAAAGATGATGGGTATGAAAGCTATAGAAGCTGCTCGGGTCTTTGTTGAAGAGACTGGGATTA
GTGATTCTCTTAGTCCGGAGGACTTTCTTGTGGAAAGAGAGGACATGCTACGAAATTTGTTTCCGCAAAGTGAGCTTATGCCAGGAGCTAGCCGGTTGATCAAACATCTT
CATGCAAAAGGAGTACCATTTGGCTTGGCCACTGGATCTCATAGACGTCATTTTGAATTAAAAACACAAAGACATGGTGAACTTTTTAAGTTGATGCATCACATTGTTCT
TGGTGATGATCCAGAGGTTAAACAAGGAAAACCATCTCCGGATATATTTCTTGCAGCTGCTAAAAGATTTGAGGATGCTCCTGTGGATCCAGAAAGAACCCTTGTTTTTG
AAGATGCACCCTCAGGTGTTCTTGCAGCTAAAAATGCCGGAATGAAGGTAATTATGGTTCCAGATCCAAGGTTGGATAGTTCTTATCATGGGAATGCAAATCAGGTATTG
AGTTCCCTCTTGGATTTCAACCCCAAGGAATGGGGTCTGCCTCCTTTTGAAGATTCAGAAAGTTAGGGCCTCACATTGGATTCATGCTGCTGAGATATAAAACTTATCAT
TTTAATGGAATGTTTAGATTCTTTCATTCCACATTTCAAGAGAAAGGTTCCCATCAAGTTATTTATTAGTTTGCTTGGCCTTTCTTGCCAAAATATGAACTTTGATTACC
AATTGCTATTATGGAAATGGAACTAGAATATTATGTTCCAGTTTCTCATTTACGACTTGTTTAGCTATTGATCTCAACCGAGACGGTTAGATCTTGAAATTGTTGTCATT
GTTTATCAGAATCTCTGTTGTATCTTAAATAAATCAAGGAACCATCTCACACTTATGATTATTATTATTTTGGTCTAGTCGTTCATGTACTAAAAATAACTCTATTAACT
GAGCCCTTTTGAAGAGTGCAAGTTTCTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLQLLQNPSSTHTRLFQNFIRFPKSKILHSSQFQFQFQFPNRTATTVSMAYLSPDATSRGSITHIIFDMDGLLLDTEGFYTEVQEKILARYNKTFDWSLKAKMMGMKAIE
AARVFVEETGISDSLSPEDFLVEREDMLRNLFPQSELMPGASRLIKHLHAKGVPFGLATGSHRRHFELKTQRHGELFKLMHHIVLGDDPEVKQGKPSPDIFLAAAKRFED
APVDPERTLVFEDAPSGVLAAKNAGMKVIMVPDPRLDSSYHGNANQVLSSLLDFNPKEWGLPPFEDSES