; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi06G012290 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G012290
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HOX18-like
Genome locationchr06:22684196..22685969
RNA-Seq ExpressionLsi06G012290
SyntenyLsi06G012290
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587716.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.3e-6458.24Show/hide
Query:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQ------QLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFG
        QD++CNI   LSLG GFGEY PKKMQKIN+          LSFTL+PK+EL IN++   N++       SE +                           
Subjt:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQ------QLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFG

Query:  IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
                                               RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
Subjt:  IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT

Query:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTA---AAVDANSPP
        EVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT    AA D NSPP
Subjt:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTA---AAVDANSPP

XP_004150745.1 homeobox-leucine zipper protein HOX18 [Cucumis sativus]2.2e-10082.97Show/hide
Query:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD---QD
        MED H+DE+CNISWLSLGLGFG +Y PKK+QK   +QQQLSFTLIPKEEL I    NNNNMEI   EANSSEE DDDHHL KRIRS +NNIV+YD   QD
Subjt:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD---QD

Query:  SSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRART
        SSFG IR  SSDH       NN++ + TTNHNYKGI SSS SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRART
Subjt:  SSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRART

Query:  KLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ
        KLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT  AVDANSPPQ
Subjt:  KLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ

XP_008453538.1 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HOX18-like [Cucumis melo]2.4e-9980.85Show/hide
Query:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD----Q
        MED H+DE+CNISWLSLGLGFG +Y PKK+QK  ++QQQ+SFTLIPKEEL I    NNNNMEI   E NSSEE DDDHHL KRIRS NNNIV+YD    Q
Subjt:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD----Q

Query:  DSSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
        DSSFG IR  SSD        NNN+ + +TNHNYKGI SSS SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
Subjt:  DSSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR

Query:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITR-----TAAAVDANSPPQ
        TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITR     TAAAVDANSPPQ
Subjt:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITR-----TAAAVDANSPPQ

XP_022134791.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Momordica charantia]6.6e-6566.42Show/hide
Query:  DEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQ----QQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRT
        DE+CNI  L LGLGFG EY PKK  KINN        LSFTLIPKEE          N+EI EA+SS+ D    HL KRIRSNNN      QD    IR 
Subjt:  DEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQ----QQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRT

Query:  SSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
        SSS              I+        I+ SS     ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  SSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ
        CEFLKKCCERLNEENRR+KKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+K+TR AAA  A   PQ
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ

XP_038879995.1 homeobox-leucine zipper protein HOX17-like [Benincasa hispida]1.1e-10784.89Show/hide
Query:  MEDHQDEVCNISWLSLGLGFG--EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNN-NMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD-QDS
        M DHQDEVCNISWLSLGLGFG  +Y PKKMQKINN   QLSFTLIPKEELGINNNNN+N NMEI   EANSSEE D  HHL KR RS NNNIV+YD QDS
Subjt:  MEDHQDEVCNISWLSLGLGFG--EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNN-NMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD-QDS

Query:  SFGIRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
        SFGIR+ SS  +HHH   ++NNNIITTNHN+KGISSS ASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKL+TTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL
Subjt:  SFGIRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKL

Query:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT----AAAVDANSPPQ
        KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKEL+EL+SLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT    AAA+DANSPPQ
Subjt:  KQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT----AAAVDANSPPQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M012 Homeobox domain-containing protein1.0e-10082.97Show/hide
Query:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD---QD
        MED H+DE+CNISWLSLGLGFG +Y PKK+QK   +QQQLSFTLIPKEEL I    NNNNMEI   EANSSEE DDDHHL KRIRS +NNIV+YD   QD
Subjt:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD---QD

Query:  SSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRART
        SSFG IR  SSDH       NN++ + TTNHNYKGI SSS SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRART
Subjt:  SSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRART

Query:  KLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ
        KLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT  AVDANSPPQ
Subjt:  KLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ

A0A1S3BWH2 homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.2e-9980.85Show/hide
Query:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD----Q
        MED H+DE+CNISWLSLGLGFG +Y PKK+QK  ++QQQ+SFTLIPKEEL I    NNNNMEI   E NSSEE DDDHHL KRIRS NNNIV+YD    Q
Subjt:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD----Q

Query:  DSSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
        DSSFG IR  SSD        NNN+ + +TNHNYKGI SSS SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
Subjt:  DSSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR

Query:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITR-----TAAAVDANSPPQ
        TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITR     TAAAVDANSPPQ
Subjt:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITR-----TAAAVDANSPPQ

A0A5A7USQ4 Homeobox-leucine zipper protein HOX18-like1.2e-9980.85Show/hide
Query:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD----Q
        MED H+DE+CNISWLSLGLGFG +Y PKK+QK  ++QQQ+SFTLIPKEEL I    NNNNMEI   E NSSEE DDDHHL KRIRS NNNIV+YD    Q
Subjt:  MED-HQDEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEI--VEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYD----Q

Query:  DSSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
        DSSFG IR  SSD        NNN+ + +TNHNYKGI SSS SELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
Subjt:  DSSFG-IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRAR

Query:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITR-----TAAAVDANSPPQ
        TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCD+ITR     TAAAVDANSPPQ
Subjt:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITR-----TAAAVDANSPPQ

A0A6J1BYS3 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like3.2e-6566.42Show/hide
Query:  DEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQ----QQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRT
        DE+CNI  L LGLGFG EY PKK  KINN        LSFTLIPKEE          N+EI EA+SS+ D    HL KRIRSNNN      QD    IR 
Subjt:  DEVCNISWLSLGLGFG-EYPPKKMQKINNKQ----QQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRT

Query:  SSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
        SSS              I+        I+ SS     ERKKLRLSKEQS LLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  SSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ
        CEFLKKCCERLNEENRR+KKE+ ELRSLK+GASQLYIQLPKAATLTICPSC+K+TR AAA  A   PQ
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ

A0A6J1EUD1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like1.0e-6357.88Show/hide
Query:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQ------QLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFG
        QD++CNI   LSLG GFGEY PKKMQKIN+          LSFTL+PK+EL IN++   N++       SE +                           
Subjt:  QDEVCNIS-WLSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQ------QLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFG

Query:  IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
                                               RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT
Subjt:  IRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQT

Query:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTA---AAVDANSPP
        EVDCEFLKKCCERLNEENRR+KKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT    AA + NSPP
Subjt:  EVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTA---AAVDANSPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT38.4e-3964.84Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRR++KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSP
        +    TLT+CPSC+++  T+++     P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSP

P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT224.9e-3972.41Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRR++KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-41.1e-3866.4Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRR++KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDA
        +    TLT+CPSC++++ +AA V A
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDA

Q01I23 Homeobox-leucine zipper protein HOX171.4e-3865.38Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+QS +LE+SF+ H TLNP QK  LAQQL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRR++KE+ ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRT------AAAVD
        +    TLT+CPSC++++ T      AAA D
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRT------AAAVD

Q0JB92 Homeobox-leucine zipper protein HOX171.4e-3865.38Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+QS +LE+SF+ H TLNP QK  LAQQL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRR++KE+ ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRT------AAAVD
        +    TLT+CPSC++++ T      AAA D
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRT------AAAVD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 47.8e-4066.4Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRR++KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDA
        +    TLT+CPSC++++ +AA V A
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDA

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 36.0e-4064.84Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRLSKEQ+ +LEE+FK H+TLNP QK ALA+QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRR++KE++ELR+LKL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSP
        +    TLT+CPSC+++  T+++     P
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSP

AT4G16780.1 homeobox protein 25.4e-3343.62Show/hide
Query:  LSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNN-NNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRTSSSDHNHHHYNN
        LSLGL F    PKK  +IN K              G+   ++ N +      NS     +     + I  N     +   D   G+ + +S  +      
Subjt:  LSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNN-NNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRTSSSDHNHHHYNN

Query:  NNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLN
         +     T     +GIS     +   RKKLRLSK+QS +LEE+FK H+TLNP QKQALA+QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL++CCE L 
Subjt:  NNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLN

Query:  EENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKIT
        EENRR++KE+ ELR+LKL + Q Y+ +    TLT+CPSC+ ++
Subjt:  EENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKIT

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family3.5e-4072.41Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+QS LLE++FKLH+TLNP QKQALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRR++KEL +L++LKL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana4.9e-3445.22Show/hide
Query:  QQQLSF-TLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSA
        Q QL F   +P+   G         M +  A   EE++++      +  +  + V+      FGI++       + Y   +N   I          +S+ 
Subjt:  QQQLSF-TLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRTSSSDHNHHHYNNNNNNNIITTNHNYKGISSSSA

Query:  SELRE----RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLK
            E    RKKLRLSK+QS  LE+SFK H+TLNP QK ALA+QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRR++KE+ ELR+LK
Subjt:  SELRE----RKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKKELNELRSLK

Query:  LGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAA
          ++  Y+QLP A TLT+CPSC+++  +AA
Subjt:  LGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGATCATCAAGATGAAGTTTGCAATATCAGCTGGCTTAGCCTTGGCTTGGGATTTGGTGAATATCCCCCAAAAAAGATGCAAAAAATCAACAATAAGCAACAACA
ACTCTCTTTCACTCTCATTCCAAAAGAAGAATTGGGTATTAACAACAACAACAACAACAACAATATGGAAATTGTTGAAGCAAATTCAAGTGAAGAAGATGATGATGATC
ATCATTTGAGGAAGAGAATTAGAAGCAACAATAATAATATTGTTAGTTATGATCAAGATTCCTCCTTTGGAATTAGAACATCATCATCAGATCATAATCATCATCACTAC
AACAACAACAACAACAACAATATTATTACTACTAATCATAATTACAAGGGGATTAGTAGTAGTAGTGCATCAGAATTAAGGGAGAGAAAAAAGCTTAGGCTTTCCAAAGA
ACAATCCACTTTGCTCGAAGAAAGCTTCAAACTTCATACCACCTTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAAAACTCGACAAGTGGAAGTTT
GGTTTCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAACAAACAGAAGTAGATTGCGAGTTCTTGAAGAAATGTTGTGAAAGATTAAACGAAGAAAATCGAAGGATGAAGAAA
GAATTGAATGAATTAAGATCCCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTACATTCAGCTGCCCAAGGCGGCGACCCTCACAATTTGCCCTTCATGCGACAAAATTACCAGGAC
GGCCGCCGCCGTCGACGCCAATTCTCCGCCTCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTAACTGATTATTTCAACTTGAAACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTTACCAATTCTTTCTCGCTTAATAATCCCTCACTTACCCCTCTGTGTTCTTCTCC
AAGACTGCCATGGAAGATCATCAAGATGAAGTTTGCAATATCAGCTGGCTTAGCCTTGGCTTGGGATTTGGTGAATATCCCCCAAAAAAGATGCAAAAAATCAACAATAA
GCAACAACAACTCTCTTTCACTCTCATTCCAAAAGAAGAATTGGGTATTAACAACAACAACAACAACAACAATATGGAAATTGTTGAAGCAAATTCAAGTGAAGAAGATG
ATGATGATCATCATTTGAGGAAGAGAATTAGAAGCAACAATAATAATATTGTTAGTTATGATCAAGATTCCTCCTTTGGAATTAGAACATCATCATCAGATCATAATCAT
CATCACTACAACAACAACAACAACAACAATATTATTACTACTAATCATAATTACAAGGGGATTAGTAGTAGTAGTGCATCAGAATTAAGGGAGAGAAAAAAGCTTAGGCT
TTCCAAAGAACAATCCACTTTGCTCGAAGAAAGCTTCAAACTTCATACCACCTTGAATCCGGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAACAATTAAACCTCAAAACTCGACAAG
TGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAACAAACAGAAGTAGATTGCGAGTTCTTGAAGAAATGTTGTGAAAGATTAAACGAAGAAAATCGAAGG
ATGAAGAAAGAATTGAATGAATTAAGATCCCTTAAACTTGGAGCTTCACAATTGTACATTCAGCTGCCCAAGGCGGCGACCCTCACAATTTGCCCTTCATGCGACAAAAT
TACCAGGACGGCCGCCGCCGTCGACGCCAATTCTCCGCCTCAATAATTTAATAATGCCCTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTCCTGGCTGTGTGTTTTAGTACAGCAAAAAAG
AATAATTCAATTCAATAACAATACAGCCTTTTTTTAGATTTTATTTATATGAAATCATCTAAATTATGTTATGAAAAAAATTAGATAAAAAGGTAACTTTTTTTGGGGGG
GGTTAAATTGAAAAATTAATTAAGAACAGTTAAATTAAATTAATGTTTAGAAGGAAATTAGAGAGGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDHQDEVCNISWLSLGLGFGEYPPKKMQKINNKQQQLSFTLIPKEELGINNNNNNNNMEIVEANSSEEDDDDHHLRKRIRSNNNNIVSYDQDSSFGIRTSSSDHNHHHY
NNNNNNNIITTNHNYKGISSSSASELRERKKLRLSKEQSTLLEESFKLHTTLNPAQKQALAQQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRMKK
ELNELRSLKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTAAAVDANSPPQ