; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi06G016500 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi06G016500
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptiongamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial
Genome locationchr06:26780995..26786859
RNA-Seq ExpressionLsi06G016500
SyntenyLsi06G016500
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR011004 - Trimeric LpxA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7021390.1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.3e-13097.13Show/hide
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XP_023531879.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-13097.13Show/hide
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XP_038879378.1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial [Benincasa hispida]3.1e-13097.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BZX1 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial6.3e-12996.31Show/hide
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A0A6J1E3V9 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial2.6e-13096.72Show/hide
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A0A6J1EZA5 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial3.4e-13097.13Show/hide
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A0A6J1JI10 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial2.6e-13096.72Show/hide
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A0A6J1L3J3 gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.2e-13097.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q94AU7 Gamma carbonic anhydrase 3, mitochondrial1.8e-3239.89Show/hide
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Q9C6B3 Gamma carbonic anhydrase 2, mitochondrial2.6e-3140Show/hide
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Q9FMV1 Gamma carbonic anhydrase-like 1, mitochondrial2.0e-10878.26Show/hide
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Q9FWR5 Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial5.3e-3240.44Show/hide
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Q9SMN1 Gamma carbonic anhydrase-like 2, mitochondrial1.3e-11078.26Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19580.1 gamma carbonic anhydrase 13.8e-3340.44Show/hide
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AT3G48680.1 gamma carbonic anhydrase-like 29.1e-11278.26Show/hide
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AT5G63510.1 gamma carbonic anhydrase like 11.4e-10978.26Show/hide
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        GDLNKI VGFCSNVQERCV+HAAWSSPTGLPA T I+R+VT+GAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET SILEAGSVVPPGRRIPSGELW GNPA
Subjt:  GDLNKIIVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPA

Query:  RFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI
        RF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI +
Subjt:  RFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI

AT5G63510.2 gamma carbonic anhydrase like 13.1e-10470.36Show/hide
Query:  AVARFSRKAIASAVATNQLYRAFA--------TEVSK---TIAPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLR
        ++AR SR+ + S    N + R FA        TE+ K   T++PS DRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPK+AVDAYVAPNVVLAGQV V DG+SVW G+VLR
Subjt:  AVARFSRKAIASAVATNQLYRAFA--------TEVSK---TIAPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLR

Query:  GDLNKIIVGFCSNVQERCVLHAAWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET
        GDLNKI VGFCSNVQERCV+HAAWSSPT                            LPA T I+R+VT+GAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET
Subjt:  GDLNKIIVGFCSNVQERCVLHAAWSSPT---------------------------GLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVET

Query:  HSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI
         SILEAGSVVPPGRRIPSGELW GNPARF+RTLT+EETLEIPKLAVAIN LS ++FSEFLPYST YLEVEKFKKSLGI +
Subjt:  HSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI

AT5G66510.1 gamma carbonic anhydrase 31.3e-3339.89Show/hide
Query:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLRGDLNKIIVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM
        P +   A+VAPN  L+G V+V  G+S+W G VLRGD N I VG  +N+Q+  ++H A ++ +G    T I   VTIG  ++L  CT+E E  IG  + ++
Subjt:  PKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLRGDLNKIIVGFCSNVQERCVLHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILM

Query:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSL
        +G+ VE H+++ +G++V    RIPSGE+W GNPA+F+R +T EE +     AV  ++L++ H +E    +   L+  +FKK L
Subjt:  EGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHFSEFLPYSTAYLEVEKFKKSL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCTGTAGCTCGTTTTTCCAGGAAGGCAATTGCCTCAGCGGTTGCGACCAATCAACTCTACCGTGCTTTCGCGACGGAAGTGTCGAAGACGATCGCGCCCTCACC
GGATCGAGTCAAGTGGGACTATAGAGGTCAAAGACAGATAATCCCGCTCGGCCAGTGGCTCCCCAAAATCGCCGTCGACGCCTATGTTGCGCCTAATGTGGTCCTTGCCG
GACAGGTTAACGTCTGCGACGGGGCCTCCGTTTGGGCGGGTTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAACAAGATTATAGTCGGGTTTTGCTCTAACGTGCAGGAACGATGCGTC
CTCCATGCCGCTTGGTCCTCCCCAACAGGATTGCCGGCAGAGACATCTATAGAGAGATTCGTCACCATCGGTGCATATAGTCTGTTGCGGTCCTGCACAATTGAGCCAGA
GTGCATTATCGGGCAGCATTCCATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACCCACTCTATTCTTGAAGCTGGGTCCGTGGTTCCCCCAGGAAGGAGAATTCCCAGCGGTG
AACTTTGGGCAGGAAACCCAGCAAGGTTTGTCAGAACGTTGACCCACGAGGAGACATTGGAAATTCCTAAACTTGCTGTTGCAATTAATGACTTAAGCAAGGAACACTTC
TCAGAGTTTCTTCCTTACTCAACAGCATACTTGGAGGTTGAGAAATTCAAGAAGTCCTTGGGTATAACCATATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTTCGTTTAGTGTAGCCCTTAATAGTCTAAAGCCCATAACTTTGGCCCATTGAAACAGCAAAGCCAGGTGATTGTATCGCCTTCTCCGACTTGCCATCAGCTGAATC
ACAGACCACGCTCGCTTCTGCTCTAGAAATGGCAGCTGTAGCTCGTTTTTCCAGGAAGGCAATTGCCTCAGCGGTTGCGACCAATCAACTCTACCGTGCTTTCGCGACGG
AAGTGTCGAAGACGATCGCGCCCTCACCGGATCGAGTCAAGTGGGACTATAGAGGTCAAAGACAGATAATCCCGCTCGGCCAGTGGCTCCCCAAAATCGCCGTCGACGCC
TATGTTGCGCCTAATGTGGTCCTTGCCGGACAGGTTAACGTCTGCGACGGGGCCTCCGTTTGGGCGGGTTCCGTTCTCCGCGGCGATCTCAACAAGATTATAGTCGGGTT
TTGCTCTAACGTGCAGGAACGATGCGTCCTCCATGCCGCTTGGTCCTCCCCAACAGGATTGCCGGCAGAGACATCTATAGAGAGATTCGTCACCATCGGTGCATATAGTC
TGTTGCGGTCCTGCACAATTGAGCCAGAGTGCATTATCGGGCAGCATTCCATCCTCATGGAAGGTTCCCTGGTTGAGACCCACTCTATTCTTGAAGCTGGGTCCGTGGTT
CCCCCAGGAAGGAGAATTCCCAGCGGTGAACTTTGGGCAGGAAACCCAGCAAGGTTTGTCAGAACGTTGACCCACGAGGAGACATTGGAAATTCCTAAACTTGCTGTTGC
AATTAATGACTTAAGCAAGGAACACTTCTCAGAGTTTCTTCCTTACTCAACAGCATACTTGGAGGTTGAGAAATTCAAGAAGTCCTTGGGTATAACCATATGATTCAACC
TGTCTTCTTATCTTTGCATTTTGTTTGTTGAGGAAAATAAATATCTCCAAATGATAAACCAGCTTTCAGGTTCCTTCATTTGACGTTGGTTTTGCTGTCATCAAGTTAGG
ATTAAATGAATTTTCTTCGATTTTAAGATTGATGTTTATGTTATCATCTGGATTAGTTCTGCGTGGGTAGTAAAAATCCACCAATGACTCGTTATCTCCCGTTGTATGTT
TTACATATAACATTTATATGGTTGTTCCCAATATGGGTTTTACATTTGCCATTTCCCAGGTACTATTCAAACTTGGTTAAGAGGTTGGCTCTGTAAATGTTTCAAGGAAT
GTCTGATGAGACACCTTTCCTTCCTTCCATTGCCTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAVARFSRKAIASAVATNQLYRAFATEVSKTIAPSPDRVKWDYRGQRQIIPLGQWLPKIAVDAYVAPNVVLAGQVNVCDGASVWAGSVLRGDLNKIIVGFCSNVQERCV
LHAAWSSPTGLPAETSIERFVTIGAYSLLRSCTIEPECIIGQHSILMEGSLVETHSILEAGSVVPPGRRIPSGELWAGNPARFVRTLTHEETLEIPKLAVAINDLSKEHF
SEFLPYSTAYLEVEKFKKSLGITI