; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G000910 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G000910
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptiontranscription factor bHLH128-like
Genome locationchr07:1009081..1013892
RNA-Seq ExpressionLsi07G000910
SyntenyLsi07G000910
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649128.1 hypothetical protein Csa_014981 [Cucumis sativus]3.8e-10688.58Show/hide
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        M+SAH G+     GGLTRYGSAPGS LTTAVDSVIG+RQPDSAATLR PPSFG HYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSS+T  AAAL RSYG N
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        DLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTM  GGGGNG GRLKSQMSFNGQDNSLSQ ISE+SESFVEAANSCSNGL
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        Q+NTNSTHSF P SAFAMDSSWDTS+NSIVFAAPH+KRSKHHSD+DFFTGLESQ
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XP_004152076.1 transcription factor bHLH128 isoform X2 [Cucumis sativus]1.3e-11188.81Show/hide
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        MYQSTSSSSSS KSM+SAH G+     GGLTRYGSAPGS LTTAVDSVIG+RQPDSAATLR PPSFG HYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSS+
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Query:  TAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTM--GGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEMS
        T  AAAL RSYG NDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTM  GGGGNG GRLKSQMSFNGQDNSLSQ ISE+S
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Query:  ESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGP-SAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQ
        ESFVEAANSCSNGLQ+NTNSTHSF P SAFAMDSSWDTS+NSIVFAAPH+KRSKHHSD+DFFTGLESQ
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XP_031739984.1 transcription factor bHLH128 isoform X1 [Cucumis sativus]3.3e-11088.48Show/hide
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        MYQSTSSSSSS KSM+SAH G+     GGLTRYGSAPGS LTTAVDSVIG+RQPDSAATLR PPSFG HYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSS+
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Query:  TAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPN-GGFSLTM--GGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEM
        T  AAAL RSYG NDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPN GGFSLTM  GGGGNG GRLKSQMSFNGQDNSLSQ ISE+
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        SESFVEAANSCSNGLQ+NTNSTHSF P SAFAMDSSWDTS+NSIVFAAPH+KRSKHHSD+DFFTGLESQ
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XP_038899818.1 transcription factor bHLH128-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.7e-12290.97Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGL-----GGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDL
        MYQSTSSSSSS KSM SAHAG+GL     GGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSS DSSVVESSRKVVQSSSTSNDL
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Query:  KSSSST----AAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLS
        KSSSST    AAAAAL RSYG NDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNG+GRLKSQMSFNGQDNSLS
Subjt:  KSSSST----AAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLS

Query:  QIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQVRM
        Q ISEMSESFVEAANSCSNGLQ+NTNSTHSFGPSAFAMDSSW+TSNNSIVF APH+KRSKHHSD+DFFT LESQVR+
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XP_038899826.1 transcription factor bHLH128-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.4e-12191.24Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGL-----GGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDL
        MYQSTSSSSSS KSM SAHAG+GL     GGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSS DSSVVESSRKVVQSSSTSNDL
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Query:  KSSSST----AAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLS
        KSSSST    AAAAAL RSYG NDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNG+GRLKSQMSFNGQDNSLS
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Query:  QIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQ
        Q ISEMSESFVEAANSCSNGLQ+NTNSTHSFGPSAFAMDSSW+TSNNSIVF APH+KRSKHHSD+DFFT LESQ
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KZ44 BHLH domain-containing protein6.5e-11288.81Show/hide
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        MYQSTSSSSSS KSM+SAH G+     GGLTRYGSAPGS LTTAVDSVIG+RQPDSAATLR PPSFG HYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSS+
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Query:  TAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTM--GGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEMS
        T  AAAL RSYG NDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTM  GGGGNG GRLKSQMSFNGQDNSLSQ ISE+S
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Query:  ESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGP-SAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQ
        ESFVEAANSCSNGLQ+NTNSTHSF P SAFAMDSSWDTS+NSIVFAAPH+KRSKHHSD+DFFTGLESQ
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A0A1S4DZV8 LOW QUALITY PROTEIN: transcription factor bHLH1283.5e-10584.06Show/hide
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        MYQSTSSSSSS KSM+SAHA +    GGGLTRYGSAPGS LTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFG HYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSS+
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Query:  TAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNF--NSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGV-------GRLKSQMSFNGQDNSLS
        T    AL RSYG NDLALG F  G NF  NSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGG+G        GRLK+QMSFNGQDNSLS
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Query:  QIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGP-SAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSK-HHSDSDFFTGLESQ
        Q ISE+SESFVEAANSCSNGLQ+NTNSTHSF P SAFAMDSSWDTS+NSIVFAAPH+KRSK HHSD+DFF+GLESQ
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A0A6J1EWR4 transcription factor bHLH128-like3.4e-8475.19Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGLGGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSSS
        MYQSTSSSSSSH SM S+HA     GGGGLTRYGSAPGSLL +AVDSVIG R PDS A LR PPSFGGH+FSSA+SSVVESSRKVVQSSSTS+DLKSS++
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Query:  TAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEMSES
         AAAAALQRSYGI+DLAL DFST R+FNSNGGQSSSS PLVRQRSSPAGFLGHLSVAE  GGFSLT GGGG G+GRLKSQ+SF+G  +S+SQ +S MSES
Subjt:  TAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEMSES

Query:  FVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSK-HHSDSDFFTGLESQ
         VE             +S+HSF P+AFAMD SWDTS NSI FAAPH KRSK  HSD DFFTGL+SQ
Subjt:  FVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSK-HHSDSDFFTGLESQ

A0A6J1GTJ6 transcription factor bHLH128-like isoform X31.7e-8371.43Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGLGG-----GGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDL
        MYQS SSSSSS K MASA+AG G GG     GGGLTRYGSAPGSLLT+AVDSVIGSR PDS ++LR PPSF GHYFSSADSS                 L
Subjt:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGLGG-----GGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDL

Query:  KSSSSTAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIIS
        K+SSSTAAAA   RSYGI+DLALGDFST RNFNSNGGQSS S PLVRQ+SSPAGFLGHLSVAE NGGFSLTMGGGGNG+GRLKSQ+  NGQD SLSQ IS
Subjt:  KSSSSTAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIIS

Query:  EMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQVRM
        EM+ESF+EAANS +NGL           PS F MDSSWDTSNNSIVF APH+K S+HH D++FFT LESQ  M
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A0A6J1IUI2 transcription factor bHLH128-like isoform X28.3e-8371.59Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAG---SGLGGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKS
        MYQS SSSSSS K MASA+AG    G GGGGGLTRYGSAPGSLLT+AVDSVIGSR PDS ++LR PPSF GHYFSSADSS                 LKS
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Query:  SSSTAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEM
        SSSTAAA    RSYGI+DLALGDFST RNFNSNGGQSSSS PLVRQ+SSPAGFLGHLSVAE NGGFSLTMGGGGN +GRLKSQ+  NGQD SLSQ ISEM
Subjt:  SSSTAAAAALQRSYGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEM

Query:  SESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQVRM
        SE F+EAANS +NGL           PS F MDS WDTSNNSIVF APH+K S+HH D++FFT LESQ  M
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8H102 Transcription factor bHLH1288.4e-1637.06Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGLGGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIG---SRQPDSAATLRGPPSFGGHYFS-SADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLK
        MYQS+SS+SSS +        S L GGGGL RYGSAPGS L + VD VIG   S   D         +F G++F+ +ADSS + S       +++S+  K
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Query:  -----SSSSTAAAAALQRSY-GINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHL-------SVAEPNGGFSLTMG-GGGNGVGRLKSQMS
             +++++     L RSY G N+++       ++ +  GG SS S  L RQRSSPA F  +L       S+ +P   +S   G  GG G  RLKSQ+S
Subjt:  -----SSSSTAAAAALQRSY-GINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHL-------SVAEPNGGFSLTMG-GGGNGVGRLKSQMS

Query:  FNGQDNSLSQIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAF--AMDSSWDTSNNSIVFAAPH-SKRSKHHSDSDFFTGLESQ
        F   D SL++ I+E++E+ V            +  S HSF  ++F  A   SWD  + SI F     SKRSK     D  +GL SQ
Subjt:  FNGQDNSLSQIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAF--AMDSSWDTSNNSIVFAAPH-SKRSKHHSDSDFFTGLESQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05805.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.0e-1737.06Show/hide
Query:  MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGLGGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIG---SRQPDSAATLRGPPSFGGHYFS-SADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLK
        MYQS+SS+SSS +        S L GGGGL RYGSAPGS L + VD VIG   S   D         +F G++F+ +ADSS + S       +++S+  K
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Query:  -----SSSSTAAAAALQRSY-GINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHL-------SVAEPNGGFSLTMG-GGGNGVGRLKSQMS
             +++++     L RSY G N+++       ++ +  GG SS S  L RQRSSPA F  +L       S+ +P   +S   G  GG G  RLKSQ+S
Subjt:  -----SSSSTAAAAALQRSY-GINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHL-------SVAEPNGGFSLTMG-GGGNGVGRLKSQMS

Query:  FNGQDNSLSQIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAF--AMDSSWDTSNNSIVFAAPH-SKRSKHHSDSDFFTGLESQ
        F   D SL++ I+E++E+ V            +  S HSF  ++F  A   SWD  + SI F     SKRSK     D  +GL SQ
Subjt:  FNGQDNSLSQIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTHSFGPSAF--AMDSSWDTSNNSIVFAAPH-SKRSKHHSDSDFFTGLESQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACCAATCAACTTCTTCCTCTTCTTCCTCTCACAAATCCATGGCCTCCGCCCATGCCGGCTCCGGTCTCGGCGGCGGCGGCGGTCTCACTCGGTACGGTTCCGCCCC
TGGATCTCTCCTAACCACGGCGGTCGATTCCGTGATTGGAAGTCGGCAACCGGACTCCGCCGCCACGCTCCGTGGCCCGCCGTCGTTCGGCGGCCATTACTTCTCCTCCG
CTGATTCCTCTGTCGTGGAGTCCTCAAGGAAGGTTGTTCAGTCATCGTCTACTTCCAACGATCTGAAATCGTCGTCGTCCACCGCCGCTGCCGCCGCCTTGCAGAGGTCG
TACGGAATCAACGATTTGGCGTTAGGGGATTTCTCGACGGGTAGAAATTTCAATAGCAATGGTGGTCAATCCTCTTCCTCTTTGCCGTTGGTTCGCCAAAGAAGCTCGCC
GGCTGGATTTCTCGGCCATCTCTCCGTCGCCGAACCAAACGGAGGGTTTTCATTGACAATGGGAGGTGGTGGAAATGGAGTAGGAAGACTAAAGTCCCAAATGAGCTTCA
ATGGTCAAGATAATTCACTTTCTCAAATAATCTCTGAAATGAGTGAAAGTTTTGTGGAGGCAGCCAATTCTTGTAGTAATGGCCTTCAAACCAACACTAATTCTACACAT
TCCTTTGGCCCCTCTGCCTTTGCTATGGACTCTTCTTGGGATACCTCCAATAATTCCATTGTCTTTGCTGCCCCTCATTCTAAAAGATCCAAGCACCATTCCGATTCCGA
CTTCTTCACCGGCCTCGAGTCTCAAGTACGTATGTGTGTTCGAGTATTCGTATACTTAAATTTAAGTATTATCGTAGCTCATCAGCTTAAGCAAAAGACTCTTTTATCGG
GCGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTTATCAAAGCCCTTAGGTGTTGCCTGAAGAAGAAAAAGCATCAATTTTTAATATATATTTAATTCCATTTATTTTATTTATGCCTATATAAAGTACTTTGTTATTGGT
GTGTTTTTTTTAATTTATTTTTTCTTTCCATTTGCTTTTCTTTCCCCAATCTCTCTCTCTCCTTCCATTTCATTTTGTTCAAACCCAAAACACACAGATCCAAATTCAAA
TCCCCCATATGTACCAATCAACTTCTTCCTCTTCTTCCTCTCACAAATCCATGGCCTCCGCCCATGCCGGCTCCGGTCTCGGCGGCGGCGGCGGTCTCACTCGGTACGGT
TCCGCCCCTGGATCTCTCCTAACCACGGCGGTCGATTCCGTGATTGGAAGTCGGCAACCGGACTCCGCCGCCACGCTCCGTGGCCCGCCGTCGTTCGGCGGCCATTACTT
CTCCTCCGCTGATTCCTCTGTCGTGGAGTCCTCAAGGAAGGTTGTTCAGTCATCGTCTACTTCCAACGATCTGAAATCGTCGTCGTCCACCGCCGCTGCCGCCGCCTTGC
AGAGGTCGTACGGAATCAACGATTTGGCGTTAGGGGATTTCTCGACGGGTAGAAATTTCAATAGCAATGGTGGTCAATCCTCTTCCTCTTTGCCGTTGGTTCGCCAAAGA
AGCTCGCCGGCTGGATTTCTCGGCCATCTCTCCGTCGCCGAACCAAACGGAGGGTTTTCATTGACAATGGGAGGTGGTGGAAATGGAGTAGGAAGACTAAAGTCCCAAAT
GAGCTTCAATGGTCAAGATAATTCACTTTCTCAAATAATCTCTGAAATGAGTGAAAGTTTTGTGGAGGCAGCCAATTCTTGTAGTAATGGCCTTCAAACCAACACTAATT
CTACACATTCCTTTGGCCCCTCTGCCTTTGCTATGGACTCTTCTTGGGATACCTCCAATAATTCCATTGTCTTTGCTGCCCCTCATTCTAAAAGATCCAAGCACCATTCC
GATTCCGACTTCTTCACCGGCCTCGAGTCTCAAGTACGTATGTGTGTTCGAGTATTCGTATACTTAAATTTAAGTATTATCGTAGCTCATCAGCTTAAGCAAAAGACTCT
TTTATCGGGCGAGTAGTGTTCGATCTCATCTCTTGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYQSTSSSSSSHKSMASAHAGSGLGGGGGLTRYGSAPGSLLTTAVDSVIGSRQPDSAATLRGPPSFGGHYFSSADSSVVESSRKVVQSSSTSNDLKSSSSTAAAAALQRS
YGINDLALGDFSTGRNFNSNGGQSSSSLPLVRQRSSPAGFLGHLSVAEPNGGFSLTMGGGGNGVGRLKSQMSFNGQDNSLSQIISEMSESFVEAANSCSNGLQTNTNSTH
SFGPSAFAMDSSWDTSNNSIVFAAPHSKRSKHHSDSDFFTGLESQVRMCVRVFVYLNLSIIVAHQLKQKTLLSGE