; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G001260 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G001260
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationchr07:1410758..1413829
RNA-Seq ExpressionLsi07G001260
SyntenyLsi07G001260
Gene Ontology termsGO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044679.1 Ras-related protein RABD2c [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-8193.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNR VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

XP_004146899.1 ras-related protein RABD2a [Cucumis sativus]1.9e-8493.1Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNR VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

XP_022141232.1 ras-related protein RABD2c-like [Momordica charantia]1.5e-8493.1Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

XP_022943181.1 ras-related protein RABD2c-like [Cucurbita moschata]6.6e-8593.14Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISL
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  SL
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISL

XP_038906428.1 ras-related protein RABD2c-like [Benincasa hispida]8.6e-8593.68Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUE5 Uncharacterized protein9.3e-8593.1Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNR VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

A0A1S3BWQ8 ras-related protein RABD2a-like9.3e-8593.1Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNR VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

A0A6J1CJB0 ras-related protein RABD2c-like7.1e-8593.1Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

A0A6J1FR03 ras-related protein RABD2c-like3.2e-8593.14Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISL
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  SL
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISL

A0A6J1JJU9 ras-related protein RABD2c-like3.2e-8593.14Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESFENVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISL
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKD+TNVEQAFMAMTADIKNR  SL
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a8.1e-7883.43Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  +ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNK DL  NR + YE+AKAFADE+GIPFMETSAKD+TNVEQAFMAM+A IK R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

P40392 Ras-related protein RIC13.9e-8086.29Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYL+SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV + +  QESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL  NRVVSYE+ KA ADE+GIPF+ETSAKD+TNVE+AFM M  +IKNR  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

Q05737 GTP-binding protein YPTM23.6e-7885.14Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  QESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYAS+NVNKLLVGNK DL  N+VV+ E+AKAFADE+GIPFMETSAK++TNV+QAFMAM A IK+R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b1.4e-7785.71Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV++ +   ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DL + +VVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK++TNVE+AFMAMTA IK R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c5.6e-7986.29Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV++ +   ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL + +VVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK++TNVE+AFMAMTA IK R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 55.7e-7983.43Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ + +  +ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNK DL  NR + YE+AKAFADE+GIPFMETSAKD+TNVEQAFMAM+A IK R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein4.9e-7076.16Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        MS EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+EQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ +     ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNR
        QWL+EIDRYA+E+V KLL+GNK D+  ++VVS E+ +A ADE+GIPF+ETSAKDS NVEQAF+ +  +IK +
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNR

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C4.0e-8086.29Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV++ +   ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDL + +VVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK++TNVE+AFMAMTA IK R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS

AT5G03520.1 RAB GTPase homolog 8C4.0e-5662.94Show/hide
Query:  EYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSFMYYQE-SFENVKQWL
        +YDYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVE DGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++ +    E SF N++ W+
Subjt:  EYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSFMYYQE-SFENVKQWL

Query:  NEIDRYASENVNKLLVGNKCDL--PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNR
          I+++AS+NVNK+LVGNK D+    R V     +A ADE GI F ETSAK + NVE  FM++  DIK R
Subjt:  NEIDRYASENVNKLLVGNKCDL--PNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNR

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A9.8e-7985.71Show/hide
Query:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK
        M+PEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV++ +   ESF NVK
Subjt:  MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSF-MYYQESFENVK

Query:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS
        QWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DL + +VVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK++TNVE+AFMAMTA IK R  S
Subjt:  QWLNEIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-RVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYIS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTCCTGAGTATGACTATTTGTTCAAGCTCTTGCTTATTGGAGATTCTGGCGTTGGGAAATCATGTCTTCTGTTGAGATTTGCTGATGACTCATACCTGGATAGTTA
TATTAGCACCATTGGAGTTGATTTTAAAATACGCACTGTGGAACAGGATGGAAAGACCATTAAACTTCAAATTTGGGATACTGCAGGACAGGAGCGTTTTAGGACCATCA
CTAGTAGCTACTACCGTGGGGCACATGGCATAATAGTAAGTTTTATGTACTACCAGGAGAGTTTTGAAAATGTCAAGCAATGGTTAAACGAAATTGACCGTTACGCAAGT
GAAAACGTAAACAAGCTTCTAGTTGGCAATAAGTGTGACCTCCCTAATAGAGTAGTGTCCTACGAATCAGCTAAGGCTTTTGCTGATGAGGTTGGGATCCCATTTATGGA
GACAAGCGCAAAAGATTCCACCAATGTAGAGCAGGCATTTATGGCCATGACTGCTGACATTAAAAATAGGTACATCTCCCTTCTCATCCGTGTGCTAATGTGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATAAACTTCTCTCGTTCTTCAGTTCTCTTTATTTCATCTTTCTTCTGCGTGCATTCGACTTCTTTACTCTCTTCCTCCTTCGTCTCTCTCGTCTCTCCCCTGTGGATCG
CAGGCCGGTCTGAATTATCTGGACCGGTTCAACTCCGGTTGAGCTTTTTCCCCATTCTAGATCAGCATTCCGCCAGCAATCATGAGTCCTGAGTATGACTATTTGTTCAA
GCTCTTGCTTATTGGAGATTCTGGCGTTGGGAAATCATGTCTTCTGTTGAGATTTGCTGATGACTCATACCTGGATAGTTATATTAGCACCATTGGAGTTGATTTTAAAA
TACGCACTGTGGAACAGGATGGAAAGACCATTAAACTTCAAATTTGGGATACTGCAGGACAGGAGCGTTTTAGGACCATCACTAGTAGCTACTACCGTGGGGCACATGGC
ATAATAGTAAGTTTTATGTACTACCAGGAGAGTTTTGAAAATGTCAAGCAATGGTTAAACGAAATTGACCGTTACGCAAGTGAAAACGTAAACAAGCTTCTAGTTGGCAA
TAAGTGTGACCTCCCTAATAGAGTAGTGTCCTACGAATCAGCTAAGGCTTTTGCTGATGAGGTTGGGATCCCATTTATGGAGACAAGCGCAAAAGATTCCACCAATGTAG
AGCAGGCATTTATGGCCATGACTGCTGACATTAAAAATAGGTACATCTCCCTTCTCATCCGTGTGCTAATGTGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVSFMYYQESFENVKQWLNEIDRYAS
ENVNKLLVGNKCDLPNRVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDSTNVEQAFMAMTADIKNRYISLLIRVLMC