; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G002960 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G002960
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUBP1-associated protein 2C
Genome locationchr07:3185776..3192759
RNA-Seq ExpressionLsi07G002960
SyntenyLsi07G002960
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031060.1 UBP1-associated protein 2C [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-22093.56Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MD TKKRRM+ENGVDSS+NS  +IT +DARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAAD+SLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DGIQT GAGQGN+HGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSG+QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
         QPL HHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGP SSIYGGMGSVGGGLGGS GGLGG GG SSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPN  HQ A TSPAPRVPPGGMYP+VPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

XP_004137219.1 UBP1-associated protein 2C [Cucumis sativus]2.5e-23198.16Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS++S SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDG QTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        AQPLAHHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

XP_008451717.1 PREDICTED: UBP1-associated protein 2C [Cucumis melo]4.7e-23097.7Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS+NS SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVL+AVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDG QTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSG QYGGPGGMGSY GFSSGLQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        AQPLAHHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

XP_022142828.1 UBP1-associated protein 2C [Momordica charantia]5.8e-22093.58Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MD+TKKRRMDENGVDS ++  SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH+DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS++GELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVP+DMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQ
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DGIQ   AGQGNVHGDGM MAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY GGFSSG+Q
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQ

Query:  GAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYS
        G QPL HHP+NSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSS+YGGMGSVGGGLGGSGGGLGG GGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPD GHYS
Subjt:  GAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYS

Query:  MSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        MSS+S HPNQ HQ AGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  MSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

XP_038896596.1 UBP1-associated protein 2C-like [Benincasa hispida]1.6e-23098.16Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSSDNS SRITPEDARKIIDRF+PDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGP GMGSYGGFSSGLQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        A PL HHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVP YY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYY6 Uncharacterized protein1.2e-23198.16Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS++S SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDG QTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        AQPLAHHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

A0A1S3BT99 UBP1-associated protein 2C2.3e-23097.7Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS+NS SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVL+AVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDG QTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSG QYGGPGGMGSY GFSSGLQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        AQPLAHHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

A0A5D3D7P8 UBP1-associated protein 2C2.3e-23097.7Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MDVTKKRRMDENGVDSS+NS SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVL+AVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGA+LALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDG QTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSG QYGGPGGMGSY GFSSGLQG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
        AQPLAHHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPG SIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

A0A6J1CND4 UBP1-associated protein 2C2.8e-22093.58Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MD+TKKRRMDENGVDS ++  SRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH+DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS++GELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVP+DMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQ
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DGIQ   AGQGNVHGDGM MAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY GGFSSG+Q
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQ

Query:  GAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYS
        G QPL HHP+NSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSS+YGGMGSVGGGLGGSGGGLGG GGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPD GHYS
Subjt:  GAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYS

Query:  MSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        MSS+S HPNQ HQ AGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
Subjt:  MSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

A0A6J1J0Q9 UBP1-associated protein 2C-like1.1e-21993.33Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV
        MD TKKRRM+ENGVDSS+NS  +IT +DARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRH DVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFS+YGELEEAV
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAV

Query:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
        VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAAD+SLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG
Subjt:  VIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTG

Query:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG
        KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGG DGIQT GAGQGN+HGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSG+QG
Subjt:  KCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQG

Query:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
         QPL HHPLNSSMGPGLSSV GQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGS+IYGGMGSVGGGLGGS GGLGG  G SSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM
Subjt:  AQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSM

Query:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        SSAS HPN  HQ A TSPAPRVPPGGMYP+VPPYY
Subjt:  SSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80678 UBP1-associated protein 2B2.0e-4237.77Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAIL
        E    +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQA
        ALK+P K I  R+T  QLA++G           Q+ N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQA

Query:  ALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSM----
        AL +P KT +G  L C  ANDG K            Q     N H                  YG PGG G +  G +  +Q   P     L + +    
Subjt:  ALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSM----

Query:  -GPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPGS---SIYGGMGSVGG----------GLGGSGGGLGGAG
         G GL+   GQA   LG+ G    G  GG   GYG   +    +Y G G+  G          G GG+G G  GAG
Subjt:  -GPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPGS---SIYGGMGSVGG----------GLGGSGGGLGGAG

Q8BG05 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A36.1e-2334.33Show/hide
Query:  RKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANV
        RKLFI GLS +T+ + LR  F  +G L + VV+ D  T +S+G+GFVT+  V+    A+      +DGRV V    AV         A L+++KI+V  +
Subjt:  RKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANV

Query:  PMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPM
          D     L  +F  YG+IE   +  D+Q+GK RG+A   +   +     +V    TI+G     K A   ++ +  G   G   +G G GN  G G   
Subjt:  PMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPM

Query:  APPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGG-GPYGGGY-GGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGG
               G GG +GG GG G  GG S G  G                            G  GGY G G  GG Y GGPG S  GG G  G G G  GGG
Subjt:  APPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGG-GPYGGGY-GGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGG

Query:  LGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGG---YPDSGHYS
         GG GG    Y    +  G   GG   Y D G+YS
Subjt:  LGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGG---YPDSGHYS

Q9LES2 UBP1-associated protein 2A5.5e-4035.71Show/hide
Query:  DVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVV
        D T   R++      S N       E  + +++ F+ +Q++ +L++A  +H+DV + +R +AD D   RK+F+ GL  DT TE L   F  YGE+E+   
Subjt:  DVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVV

Query:  IIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGE
        + DK +GKSKGYGF+ +K   GA  ALK+P K I  R+T  QL              AAV    Q+SN ++ + +KIYV+NV  ++   KLL  FS +GE
Subjt:  IIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGE

Query:  IEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGG
        IEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK  E A+ AL +P KT +G  L C+ A DG   KPG            Q   H +      P         YG PGG
Subjt:  IEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGG

Query:  MGS-YGGFSSGLQGAQPLAHHP--------LNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLY
         G    G  +G+ G      +P        L +S G GL+       + LGS G   G   G G G P    YG      G + G G   G  GG    Y
Subjt:  MGS-YGGFSSGLQGAQPLAHHP--------LNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLY

Query:  RLPQSSVGMPSGGYPDSGHY
        + PQ   G  S G    G Y
Subjt:  RLPQSSVGMPSGGYPDSGHY

Q9LJ04 RNA-binding protein P8.8e-4638.31Show/hide
Query:  DENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGK
        D  G    +   +    +  + +++ F  DQL+++L  A   H DVL AV   AD D + RK+F+ GL  D + E L   FS+YGE+E+  V+ D+ATGK
Subjt:  DENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGK

Query:  SKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG---ISGQNSNAA----------------DLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEE
         KGYGF+ F    GA  AL+EP K I  R T  QLA+VG     G  +N A                + + RKI+V+NV  D+   KLL  FS YGEIEE
Subjt:  SKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG---ISGQNSNAA----------------DLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEE

Query:  GPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGS
        GPLG DK TGK +G+ALFVYK  + A+ AL +P K  +G  L C+ A DG K   GGG  G+   GAG                        GG  G G 
Subjt:  GPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGS

Query:  YGGFSSGLQGAQPLAH---HPLNS-------SMGPGLSSVSGQAPSS-LGSSGG-------YGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVG-GGLGGSGGGLGGA
        YG  S  L GA    H    P++S       + GPG++   GQA ++ L S GG        G G  G G   PG+S   G+GS G  G+ G+GG LGG 
Subjt:  YGGFSSGLQGAQPLAH---HPLNS-------SMGPGLSSVSGQAPSS-LGSSGG-------YGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVG-GGLGGSGGGLGGA

Query:  GGASSLYRLPQSSVG
        GG       P    G
Subjt:  GGASSLYRLPQSSVG

Q9LKA4 UBP1-associated protein 2C1.3e-12660.5Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDN-----SLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGE
        MD+ KKR++DENG   + N       +R++P+DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFSSYG+
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDN-----SLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGE

Query:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DK TGKSKGYGFVTF HVDGA+LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFS
        DK TGK RG+ALFVYK  EGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKKG   G P   Q  G+G G+VHG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+S
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFS

Query:  SGLQGAQPLAHH--PLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMP-SGGY
         G     P AHH    +SSMG G              S GYGG  + GGYGGPG +         G  GG GGG GG G  S  YR+P SS  MP  GGY
Subjt:  SGLQGAQPLAHH--PLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMP-SGGY

Query:  PDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        P+SGHY +SS++ +P QHHQ  GTSP PRVP GGMYPN PP Y
Subjt:  PDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41060.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.4e-4337.77Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAIL
        E    +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQA
        ALK+P K I  R+T  QLA++G           Q+ N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQA

Query:  ALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSM----
        AL +P KT +G  L C  ANDG K            Q     N H                  YG PGG G +  G +  +Q   P     L + +    
Subjt:  ALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSM----

Query:  -GPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPGS---SIYGGMGSVGG----------GLGGSGGGLGGAG
         G GL+   GQA   LG+ G    G  GG   GYG   +    +Y G G+  G          G GG+G G  GAG
Subjt:  -GPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPGS---SIYGGMGSVGG----------GLGGSGGGLGGAG

AT2G41060.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.4e-4337.77Show/hide
Query:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAIL
        E    +++ F+ DQL+ +L++A  RH DV + +R +AD D+  RK+F+ GL  DT  + L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  
Subjt:  EDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAIL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQA
        ALK+P K I  R+T  QLA++G           Q+ N  ++  RKIYV+NV  D+   KLL  FS +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ 
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVG--------ISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQA

Query:  ALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSM----
        AL +P KT +G  L C  ANDG K            Q     N H                  YG PGG G +  G +  +Q   P     L + +    
Subjt:  ALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSY-GGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSM----

Query:  -GPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPGS---SIYGGMGSVGG----------GLGGSGGGLGGAG
         G GL+   GQA   LG+ G    G  GG   GYG   +    +Y G G+  G          G GG+G G  GAG
Subjt:  -GPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGG---GYGGPGS---SIYGGMGSVGG----------GLGGSGGGLGGAG

AT3G15010.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein9.4e-12860.5Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDN-----SLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGE
        MD+ KKR++DENG   + N       +R++P+DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFSSYG+
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDN-----SLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGE

Query:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DK TGKSKGYGFVTF HVDGA+LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFS
        DK TGK RG+ALFVYK  EGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKKG   G P   Q  G+G G+VHG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+S
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFS

Query:  SGLQGAQPLAHH--PLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMP-SGGY
         G     P AHH    +SSMG G              S GYGG  + GGYGGPG +         G  GG GGG GG G  S  YR+P SS  MP  GGY
Subjt:  SGLQGAQPLAHH--PLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMP-SGGY

Query:  PDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        P+SGHY +SS++ +P QHHQ  GTSP PRVP GGMYPN PP Y
Subjt:  PDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

AT3G15010.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein9.4e-12860.5Show/hide
Query:  MDVTKKRRMDENGVDSSDN-----SLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGE
        MD+ KKR++DENG   + N       +R++P+DARKII+RFT DQL+D+LQ+A+ RH DVL++VR  AD D+SQRKLFIRGL+ DT+TEGLRSLFSSYG+
Subjt:  MDVTKKRRMDENGVDSSDN-----SLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGE

Query:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VI+DK TGKSKGYGFVTF HVDGA+LALKEPSK IDGRVTVTQLAA G  G  S  AD+S+RKIYVANVP DMPAD+LL HF  YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVIIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFS
        DK TGK RG+ALFVYK  EGAQAAL DP+K IDG+ L+CK A DGKKG   G P   Q  G+G G+VHG+GM M  P+      G YG  GG+ +YGG+S
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFS

Query:  SGLQGAQPLAHH--PLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMP-SGGY
         G     P AHH    +SSMG G              S GYGG  + GGYGGPG +         G  GG GGG GG G  S  YR+P SS  MP  GGY
Subjt:  SGLQGAQPLAHH--PLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMP-SGGY

Query:  PDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY
        P+SGHY +SS++ +P QHHQ  GTSP PRVP GGMYPN PP Y
Subjt:  PDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY

AT3G56860.3 UBP1-associated protein 2A3.9e-4135.71Show/hide
Query:  DVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVV
        D T   R++      S N       E  + +++ F+ +Q++ +L++A  +H+DV + +R +AD D   RK+F+ GL  DT TE L   F  YGE+E+   
Subjt:  DVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVV

Query:  IIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGE
        + DK +GKSKGYGF+ +K   GA  ALK+P K I  R+T  QL              AAV    Q+SN ++ + +KIYV+NV  ++   KLL  FS +GE
Subjt:  IIDKATGKSKGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQL--------------AAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGE

Query:  IEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGG
        IEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK  E A+ AL +P KT +G  L C+ A DG   KPG            Q   H +      P         YG PGG
Subjt:  IEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAALVDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGG

Query:  MGS-YGGFSSGLQGAQPLAHHP--------LNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLY
         G    G  +G+ G      +P        L +S G GL+       + LGS G   G   G G G P    YG      G + G G   G  GG    Y
Subjt:  MGS-YGGFSSGLQGAQPLAHHP--------LNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGSSGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLY

Query:  RLPQSSVGMPSGGYPDSGHY
        + PQ   G  S G    G Y
Subjt:  RLPQSSVGMPSGGYPDSGHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGTCACCAAGAAGCGGAGGATGGACGAAAATGGCGTCGACTCCTCCGACAATTCTTTATCAAGAATTACCCCCGAAGACGCCCGCAAGATCATTGATCGTTTCAC
TCCCGACCAGCTTATCGATATTCTACAAGATGCGGTTTCGCGTCACTTGGATGTTCTTGATGCGGTACGGTCGATTGCCGACCGTGATGTCTCCCAGCGGAAGCTGTTTA
TTCGGGGACTTAGTTGCGATACAAGTACAGAAGGTTTGCGTTCTCTTTTTTCCTCTTATGGCGAGCTTGAAGAAGCTGTTGTTATTATTGACAAGGCAACTGGGAAATCG
AAAGGTTATGGCTTTGTGACTTTTAAGCATGTTGATGGTGCTATACTGGCTTTGAAGGAACCGAGCAAGACTATCGATGGCCGCGTTACGGTGACGCAATTGGCTGCGGT
GGGAATTTCTGGACAGAATTCCAACGCTGCGGACTTGTCGTTGAGGAAAATTTATGTGGCGAATGTTCCGATGGATATGCCGGCTGATAAATTGTTGGCACACTTTTCGC
TGTATGGAGAAATTGAGGAGGGACCGCTAGGGTTTGATAAGCAGACGGGTAAATGTAGAGGTTATGCTTTGTTCGTGTACAAAAAGCCAGAGGGTGCTCAGGCAGCTCTG
GTGGATCCTATCAAGACGATTGACGGAAGGCAGTTGAGTTGTAAATTCGCTAACGATGGGAAAAAGGGGAAACCTGGTGGTGGGCCGGATGGAATTCAAACGCAGGGGGC
AGGTCAGGGAAACGTGCATGGTGATGGTATGCCAATGGCTCCTCCGTCGGCAATGCCCGGTTCAGGCGGACAATATGGTGGGCCGGGAGGCATGGGGTCATATGGAGGCT
TTTCTAGTGGGCTTCAAGGGGCGCAGCCACTGGCTCATCATCCGCTCAACTCGTCAATGGGGCCGGGACTATCTTCTGTCAGTGGTCAGGCTCCATCTTCGTTGGGAAGC
TCCGGTGGGTATGGTGGCGGACCATATGGTGGTGGGTACGGCGGGCCTGGGTCCTCAATTTATGGTGGTATGGGAAGTGTAGGTGGGGGTTTGGGTGGTTCTGGAGGTGG
ATTGGGCGGAGCTGGGGGTGCTTCATCTCTGTATAGATTGCCACAGAGTTCAGTTGGAATGCCTTCTGGTGGTTATCCGGATAGTGGGCATTATAGCATGTCATCAGCAT
CCGTGCACCCCAATCAGCACCATCAACCGGCGGGAACATCACCAGCACCGCGTGTTCCACCTGGAGGAATGTATCCCAATGTGCCACCATATTACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTGACATCGTTCCAAGCCTTCGATTAGGGTTTAGCTTCACCCTCTTCTTCTTCCTCAACTTCTACTCTACACTTTCAGGGACCGCCTTCTTCCTCTTCTATACGCCAT
GGACGTCACCAAGAAGCGGAGGATGGACGAAAATGGCGTCGACTCCTCCGACAATTCTTTATCAAGAATTACCCCCGAAGACGCCCGCAAGATCATTGATCGTTTCACTC
CCGACCAGCTTATCGATATTCTACAAGATGCGGTTTCGCGTCACTTGGATGTTCTTGATGCGGTACGGTCGATTGCCGACCGTGATGTCTCCCAGCGGAAGCTGTTTATT
CGGGGACTTAGTTGCGATACAAGTACAGAAGGTTTGCGTTCTCTTTTTTCCTCTTATGGCGAGCTTGAAGAAGCTGTTGTTATTATTGACAAGGCAACTGGGAAATCGAA
AGGTTATGGCTTTGTGACTTTTAAGCATGTTGATGGTGCTATACTGGCTTTGAAGGAACCGAGCAAGACTATCGATGGCCGCGTTACGGTGACGCAATTGGCTGCGGTGG
GAATTTCTGGACAGAATTCCAACGCTGCGGACTTGTCGTTGAGGAAAATTTATGTGGCGAATGTTCCGATGGATATGCCGGCTGATAAATTGTTGGCACACTTTTCGCTG
TATGGAGAAATTGAGGAGGGACCGCTAGGGTTTGATAAGCAGACGGGTAAATGTAGAGGTTATGCTTTGTTCGTGTACAAAAAGCCAGAGGGTGCTCAGGCAGCTCTGGT
GGATCCTATCAAGACGATTGACGGAAGGCAGTTGAGTTGTAAATTCGCTAACGATGGGAAAAAGGGGAAACCTGGTGGTGGGCCGGATGGAATTCAAACGCAGGGGGCAG
GTCAGGGAAACGTGCATGGTGATGGTATGCCAATGGCTCCTCCGTCGGCAATGCCCGGTTCAGGCGGACAATATGGTGGGCCGGGAGGCATGGGGTCATATGGAGGCTTT
TCTAGTGGGCTTCAAGGGGCGCAGCCACTGGCTCATCATCCGCTCAACTCGTCAATGGGGCCGGGACTATCTTCTGTCAGTGGTCAGGCTCCATCTTCGTTGGGAAGCTC
CGGTGGGTATGGTGGCGGACCATATGGTGGTGGGTACGGCGGGCCTGGGTCCTCAATTTATGGTGGTATGGGAAGTGTAGGTGGGGGTTTGGGTGGTTCTGGAGGTGGAT
TGGGCGGAGCTGGGGGTGCTTCATCTCTGTATAGATTGCCACAGAGTTCAGTTGGAATGCCTTCTGGTGGTTATCCGGATAGTGGGCATTATAGCATGTCATCAGCATCC
GTGCACCCCAATCAGCACCATCAACCGGCGGGAACATCACCAGCACCGCGTGTTCCACCTGGAGGAATGTATCCCAATGTGCCACCATATTACTGAGTTATGATGCTTGT
TGGGCGCAGATGCTTTATGTGCTCTGGTGATTGCGTTGATTGCAGACTGTAACTCTGGTTTGATGAATGCATTAGCTTTGCTTGTGGCCTCTGCTGTTTAACTGCACCTT
TGAGTTGTTCATTGATAATTACTGGTAGTCAAAGAGACAGTTAGAAAGTTAGATAATTTTTGTACTGTACCCAATCACTTATTTGTGCTATTTGACTTTTCTACTAGTAG
TAAGTTTAGTATTTTATGAGTACTATTATTTGCTCTTGTTATTTTAGTTTTGTCTGCTTTCTGTTGCTTTTCAAAATATGTGGACGATCTTTTCTTCTATCTCTTTCATT
TACTGAGCTTGTCCTTTTCCCCTAAGCACTTATTGCTTAAAAATTGGTGTTTTGATATTTTCAATTTGGATAGTTACTTGGCTCCGACATCTTGATTTGAGTGTATCAAC
CTGCTTGAAGAATATTATGTTTTCTTTGTCGGTTCTCTTCTGCTAGGAAGTTTGAATCCTTGGCAGTTGTCTAAAAGTGGTTTTACTTCTCTTCCATTTTTATTGTCATA
CTTTTGGAAAGTTCTTTTTTTAATTGCTACTCTTCATTATTTGTGAATGATTGATGAAAGAAGTAAGAAAAAATCCATGGTGATTCTGTTTACTGAACTTGGTAGTGGTT
TGTATGTCAACTTCTATTGCTGCTCTGCTATGTGTATCTATTTCGAAGAAAGTTGTTGGAGCAACAAACTTTTGGTCAGGCTTGAATTTGAATGTTAGTTGAAGCACTTT
GTGCATCTTATCTTTGATGGTTTGGTTTCTTGAGCTATGGATTGTACAGTTGATTTTTTTACTTTTGAGCTGTGACTTTAGTTGTATTCGTTGATTCAAGTGCATAATTG
AGTTGGATGGTTGGACCAAATACATGTGTGCACAGTGATAGAGACCCGGTTCATTTCTTGCATGTTTATTTCTCTGTCGTGTAGTGATTAGCCCGAAGTTGGCTTGGTTG
ATGGTGGGTGGTGTGTTTTATGGATGACCATAAGATTTGTTCTCTCATTTCCCCTTTTGTACCCTATTTTGTTCTTGTGTTGAAAGAAAGTTAATACAAGCCTTTTTTGG
ATCTTGGCTTGTTTCCCTACATTTTGTTGGTCTGTGTTTTGTACCTAGACTGAGCATTTTGATGGAGTTTTAGGTGTTAAATGAAATTTTTTTTTTAAAGATTTTTGGAG
GTCTAGAATTTGTAGAATGATTGTTAAAAACTAGCGTTATTATGAGTTTGGCGAACTTGTTGTCTTAAATGTTGTGGGTTGGTTTGGAATGACTTTTTACGAACTTGTTG
TCTTAGATGTTGTGGGTCGATTTGGAATGACTTTTTACGAACTTGTTGTCTTAGATGTTATGGGTCGGTTTGGAATGACTTTTTACGAACTTGTTGCTTGGATGTTGTGG
GTCGGTTTGGAATTACTTTTTATGAACTTCTTGTCTTAGATTTAGTAGGTCGGTTTGGAATGACTTTTTACGAACTTGTCTTAGATTTGGTGGATCGGTTTGGAATGACT
TTTTAAGTTTGTAAAAAGGTTATCTTGTCCTAAATGCCCCTGATGATGAATGTTTATTAAATTATGTTTCTCTCACATAATATTTGGACTTTGTCTTTTGTGTTTGGTGG
AATATGAAATGAGATGACAAATGGACATCCTCATCCCACTGGCACCTGTTTGGAGGACTTAATATCACATCACTCAAGAAGACTTCACATTAAAATTGCAGCTGAAATTT
GACAAATCCCTTTCTAAGGCAACCCATTGATACCTATTGAAAGCTCATTCGGTTGGCCGGGCCAACCTCTCTGTAATCTTTCTTTTGGGGTGAAATTATGGATTATATAA
TTATTTGTTTTGTTTCTTAGAAAGCTTTTGCTATTTAATAAAAAATGTCCTTTTTTTTGTGGCTTGTGAAAGATATAAAAGTATTGTTAGTTGAATGTCAATATTACATA
AACTTATGAATCAAAGGTACTTCAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDVTKKRRMDENGVDSSDNSLSRITPEDARKIIDRFTPDQLIDILQDAVSRHLDVLDAVRSIADRDVSQRKLFIRGLSCDTSTEGLRSLFSSYGELEEAVVIIDKATGKS
KGYGFVTFKHVDGAILALKEPSKTIDGRVTVTQLAAVGISGQNSNAADLSLRKIYVANVPMDMPADKLLAHFSLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKPEGAQAAL
VDPIKTIDGRQLSCKFANDGKKGKPGGGPDGIQTQGAGQGNVHGDGMPMAPPSAMPGSGGQYGGPGGMGSYGGFSSGLQGAQPLAHHPLNSSMGPGLSSVSGQAPSSLGS
SGGYGGGPYGGGYGGPGSSIYGGMGSVGGGLGGSGGGLGGAGGASSLYRLPQSSVGMPSGGYPDSGHYSMSSASVHPNQHHQPAGTSPAPRVPPGGMYPNVPPYY