; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G005400 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G005400
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description50S ribosomal protein L2, chloroplastic
Genome locationchr07:5710215..5711057
RNA-Seq ExpressionLsi07G005400
SyntenyLsi07G005400
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0015934 - large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002171 - Ribosomal protein L2
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR022669 - Ribosomal protein L2, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB4284020.1 unnamed protein product [Prunus armeniaca]1.0e-4989.92Show/hide
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KAF8050894.1 hypothetical protein N665_1859s0021 [Sinapis alba]7.8e-5092.24Show/hide
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QHE65617.1 ribosomal protein L2 [Nitraria roborowskii]1.0e-4993.04Show/hide
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QJS51892.1 ribosomal protein L2 [Sycopsis sinensis]1.0e-4993.04Show/hide
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WP_131792711.1 50S ribosomal protein L2 [Candidatus Frankia datiscae]7.8e-5093.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6B9QGD4 50S ribosomal protein L2, chloroplastic4.9e-5093.04Show/hide
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A0A6B9QGQ4 50S ribosomal protein L2, chloroplastic4.9e-5093.04Show/hide
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A0A6J5V4U4 Ribosomal_L2_C domain-containing protein4.9e-5089.92Show/hide
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A0A6M4SPT6 50S ribosomal protein L2, chloroplastic4.9e-5093.04Show/hide
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A0A7T7D7D8 Ribosomal protein L24.9e-5093.04Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4GYV2 50S ribosomal protein L2, chloroplastic7.3e-3592.77Show/hide
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Q0G9F5 50S ribosomal protein L2-A, chloroplastic7.3e-3591.67Show/hide
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Q14F95 50S ribosomal protein L2-A, chloroplastic2.5e-3592.86Show/hide
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Q14FB6 50S ribosomal protein L2-B, chloroplastic7.3e-3592.77Show/hide
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Q4VZK5 50S ribosomal protein L2, chloroplastic3.3e-3593.98Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44065.1 Ribosomal protein L2 family2.4e-0941.46Show/hide
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AT2G44065.2 Ribosomal protein L2 family2.4e-0941.46Show/hide
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AT3G51190.1 Ribosomal protein L2 family2.3e-0741.03Show/hide
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ATCG00830.1 ribosomal protein L21.5e-3591.57Show/hide
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ATCG01310.1 ribosomal protein L21.5e-3591.57Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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