; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G009860 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G009860
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description50S ribosomal protein L7/L12
Genome locationchr07:13471360..13471941
RNA-Seq ExpressionLsi07G009860
SyntenyLsi07G009860
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000206 - Ribosomal protein L7/L12
IPR013823 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal
IPR014719 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008450561.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L7/L12 [Cucumis melo]1.1e-8590.16Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKLTVVARSLQARSTL KIIGLSQVRFFQ DFTPRDPKAKPK+YKYP FYDPYGPRPPPSDKII LAERI AL   ER QIGPTL E+L++PKLQ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

XP_011651634.1 uncharacterized protein LOC101206962 [Cucumis sativus]1.7e-8690.16Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKLTVVA+SLQ RST AKIIGLSQVRFFQ DFTPRDP AKPK+YKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVAL   ERCQIGPTL E+L++PKLQ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMG EGGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

XP_022155073.1 uncharacterized protein LOC111022207 [Momordica charantia]2.0e-8487.56Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKL  VARSLQ  STL K+IG  QVRFFQ DF PRD  AKPKRYKYP FYDPYGPRPPPSDKII+LAE+IVAL  DERCQIGP L ERL++PKLQPISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGA  GSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAA+KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

XP_022949504.1 uncharacterized protein LOC111452831 [Cucurbita moschata]1.3e-8386.53Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIGL QVRFFQ DFTPRDP AKPKRYKYP FYDPYGPRPPPS+KII+LAERI AL  DERCQIGP L ERL++PKL+ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

XP_038905834.1 50S ribosomal protein L7/L12 [Benincasa hispida]1.0e-8891.71Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKLTVVARSLQ RST AKIIGLSQVRFFQ DF  RDP AKPKRYKYP FYDPYGPRPPPSDKIIELAERI AL  ++RCQIGPTLRERL++PKLQPISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGA  GSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L907 Ribosomal_L12 domain-containing protein8.1e-8790.16Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKLTVVA+SLQ RST AKIIGLSQVRFFQ DFTPRDP AKPK+YKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVAL   ERCQIGPTL E+L++PKLQ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMG EGGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

A0A1S3BPI3 50S ribosomal protein L7/L125.2e-8690.16Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKLTVVARSLQARSTL KIIGLSQVRFFQ DFTPRDPKAKPK+YKYP FYDPYGPRPPPSDKII LAERI AL   ER QIGPTL E+L++PKLQ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

A0A5A7U2A3 50S ribosomal protein L7/L125.2e-8690.16Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKLTVVARSLQARSTL KIIGLSQVRFFQ DFTPRDPKAKPK+YKYP FYDPYGPRPPPSDKII LAERI AL   ER QIGPTL E+L++PKLQ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1DM08 uncharacterized protein LOC1110222079.9e-8587.56Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKL  VARSLQ  STL K+IG  QVRFFQ DF PRD  AKPKRYKYP FYDPYGPRPPPSDKII+LAE+IVAL  DERCQIGP L ERL++PKLQPISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGA  GSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAA+KIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1GD07 uncharacterized protein LOC1114528316.4e-8486.53Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIGL QVRFFQ DFTPRDP AKPKRYKYP FYDPYGPRPPPS+KII+LAERI AL  DERCQIGP L ERL++PKL+ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A9BDG4 50S ribosomal protein L7/L121.8e-1438.06Show/hide
Query:  SDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDL
        S K  E+ + + +LS  E  ++   + E      +   +  G+ M + G     S+  E  +EKT FDV LE FDAA+KIKV+KEVR+ T LGL EAK +
Subjt:  SDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDL

Query:  VEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        VE  P  +K+G +KE+A  + + I+A GG   ++
Subjt:  VEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

B1X073 50S ribosomal protein L7/L123.0e-1439.02Show/hide
Query:  ELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVP
        E+ E++ +L+  E  ++   + E        P    G+ M + G AA G++  E ++EKT FDV LE+     KI ++K VR  T LGLKEAKD+VE  P
Subjt:  ELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVP

Query:  AILKQGVTKEEANDIIEKIKAAG
          +K+G  KE+A DI +K++ AG
Subjt:  AILKQGVTKEEANDIIEKIKAAG

P41189 50S ribosomal protein L7/L126.1e-1538.46Show/hide
Query:  IIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK
        I  + E++ +L+  +  ++   L E        P++V     G    A           EKT F+V LE FDA  KI VIKEVR+ T LGLKEAKD VE 
Subjt:  IIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK

Query:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVM
         P  LK GV+K+EA ++ +K++AAG   ++
Subjt:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVM

Q2JM48 50S ribosomal protein L7/L124.7e-1539.53Show/hide
Query:  PSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKD
        PS+++ ++ E + ALS  E  ++   + E        P     +       AA  ++  E  +E+TAFDV LE   A  KI ++K VR  T LGLK+AKD
Subjt:  PSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKD

Query:  LVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAG
        LVE  P  +K+GV KEEANDI +K++ AG
Subjt:  LVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAG

Q2S1Q4 50S ribosomal protein L7/L121.8e-1442.86Show/hide
Query:  IIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK
        I ELAE++V L+  E  ++   L E      +QP S  G+ + ++GG   G+    E++E+TAFDV L      +KI+VIKEVRS T +GLKEAK LV++
Subjt:  IIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEK

Query:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGG
         P  + +GV++EEA+D+  +I+ AGG
Subjt:  VPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70190.1 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like6.4e-2844.24Show/hide
Query:  DPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISV------DGLDMGSEGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV
        D +  P  Y  PA +DP   R PP+D++  L + I +L+  E  ++G  + ++    +L  ++V       G+ +G  GG  + S   EE K EKT F++
Subjt:  DPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISV------DGLDMGSEGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV

Query:  KLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        KLE F+A++KIK+IKE+RSFT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V+E
Subjt:  KLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

AT1G70190.2 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like6.4e-2844.24Show/hide
Query:  DPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISV------DGLDMGSEGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV
        D +  P  Y  PA +DP   R PP+D++  L + I +L+  E  ++G  + ++    +L  ++V       G+ +G  GG  + S   EE K EKT F++
Subjt:  DPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISV------DGLDMGSEGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDV

Query:  KLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        KLE F+A++KIK+IKE+RSFT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V+E
Subjt:  KLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.1 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein8.3e-6065.8Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKL  + R++++R    ++I   QVRF Q D      KAKPK+YKYP+ YDPYGPRP PS KI+ELAERI ALS +ER QIGP L E L+ PK Q IS D
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        G+    +    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR+FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN+II KIKA GG+AVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.2 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein8.3e-6065.8Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKL  + R++++R    ++I   QVRF Q D      KAKPK+YKYP+ YDPYGPRP PS KI+ELAERI ALS +ER QIGP L E L+ PK Q IS D
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        G+    +    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR+FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN+II KIKA GG+AVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.3 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein8.3e-6065.8Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD
        MKL  + R++++R    ++I   QVRF Q D      KAKPK+YKYP+ YDPYGPRP PS KI+ELAERI ALS +ER QIGP L E L+ PK Q IS D
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVD

Query:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME
        G+    +    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR+FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN+II KIKA GG+AVME
Subjt:  GLDMGSEGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGCTGACTGTAGTTGCACGATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTGCTAAAATAATTGGGTTGTCGCAGGTCCGCTTCTTTCAGCATGATTTTACTCCCAGAGACCC
AAAAGCCAAGCCAAAAAGATACAAGTATCCAGCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTGATAAAATCATTGAGCTTGCTGAAAGAATTGTAGCACTGT
CTACTGATGAGCGTTGCCAGATCGGTCCCACACTCCGCGAAAGACTTCAGAATCCTAAGCTGCAGCCAATTTCAGTGGATGGCTTGGACATGGGTTCGGAAGGAGGGGCA
GCAACAGGATCTTCTAAGGTGGAAGAGAAAAAAGAAAAAACTGCTTTTGATGTGAAGCTAGAGAAGTTTGATGCTGCTTCAAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTAAGGTC
TTTCACTAATCTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGGGTGACCAAGGAGGAGGCAAACGACATCATCGAAAAAATCA
AAGCTGCTGGTGGAGTTGCTGTGATGGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGCTGACTGTAGTTGCACGATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTGCTAAAATAATTGGGTTGTCGCAGGTCCGCTTCTTTCAGCATGATTTTACTCCCAGAGACCC
AAAAGCCAAGCCAAAAAGATACAAGTATCCAGCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTGATAAAATCATTGAGCTTGCTGAAAGAATTGTAGCACTGT
CTACTGATGAGCGTTGCCAGATCGGTCCCACACTCCGCGAAAGACTTCAGAATCCTAAGCTGCAGCCAATTTCAGTGGATGGCTTGGACATGGGTTCGGAAGGAGGGGCA
GCAACAGGATCTTCTAAGGTGGAAGAGAAAAAAGAAAAAACTGCTTTTGATGTGAAGCTAGAGAAGTTTGATGCTGCTTCAAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTAAGGTC
TTTCACTAATCTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGGGTGACCAAGGAGGAGGCAAACGACATCATCGAAAAAATCA
AAGCTGCTGGTGGAGTTGCTGTGATGGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLTVVARSLQARSTLAKIIGLSQVRFFQHDFTPRDPKAKPKRYKYPAFYDPYGPRPPPSDKIIELAERIVALSTDERCQIGPTLRERLQNPKLQPISVDGLDMGSEGGA
ATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRSFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANDIIEKIKAAGGVAVME