; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G012640 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G012640
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationchr07:18455285..18459579
RNA-Seq ExpressionLsi07G012640
SyntenyLsi07G012640
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0041057.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-90100Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

KAG7015700.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.3e-9497.81Show/hide
Query:  TFFFYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLV
        +F  YFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLV
Subjt:  TFFFYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLV

Query:  GNKSDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        GNKSDLTANKVVSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  GNKSDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

XP_004147230.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucumis sativus]1.5e-90100Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

XP_022923371.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita moschata]5.5e-9098.84Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        +VSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

XP_022965188.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita maxima]4.2e-9099.42Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5E9 Uncharacterized protein7.0e-91100Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A1S3BJX6 GTP-binding protein YPTM2-like7.0e-91100Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A5D3CJS0 GTP-binding protein YPTM2-like7.0e-91100Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1HN53 GTP-binding protein YPTM2-like2.0e-9099.42Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVSYE+AKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1KZK2 GTP-binding protein YPTM22.7e-9099.42Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a9.8e-8286.78Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVKQWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
         + YETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTVQIRGQPV QK+GCCS+
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

P40392 Ras-related protein RIC12.3e-7885.55Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYL+SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQ+SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DL  N+
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVQIRGQPVNQKSGCCS
        VVSYE  KA ADEIGIPF+ETSAK ATNVE+AFM MA EIKNRMA+QP  NA +P TVQ+RGQPV Q+S CCS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVQIRGQPVNQKSGCCS

Q05737 GTP-binding protein YPTM28.9e-8389.66Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTDQ+SFNNVKQWLNEIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLTANK
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VV+ ETAKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV+QAFMAMAA IK+RMA+QP   NARP TVQIRGQPVNQK+ CCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b4.4e-8287.86Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ K
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c1.7e-8187.28Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DLT+ K
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 57.0e-8386.78Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVKQWL+EIDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
         + YETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTVQIRGQPV QK+GCCS+
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E9.2e-5155.8Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SFNN++ W+  I+++AS++VNK+LVGNK+D+  +K
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  -VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQ--------PVNQKSGCCS
          V     +A ADE GI F ETSAK+  NVEQ F+++A +IK R+ T+    A P  ++I  Q          N+KS CCS
Subjt:  -VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQ--------PVNQKSGCCS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.6e-6670.52Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+E DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYD T+ +SFNNVKQWL+EIDRYA+E+V KLL+GNK+D+  +K
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVQIRGQPVNQKSGCC
        VVS ET +A ADE+GIPF+ETSAK + NVEQAF+ +A EIK +M +Q   N  + P TVQ++GQP+ Q +G C
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVQIRGQPVNQKSGCC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C1.2e-8287.28Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK DLT+ K
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A3.1e-8387.86Show/hide
Query:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK
        DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ K
Subjt:  DDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK

Query:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        VVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  VVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTCCTTCTGAGGTTTGCGGATTTACTTTCTTTTTCTATTTTCTTGCTCAACAGGATGATTCATATTTGGATAGCTACATTAGCACCATCGGGGTTGACTTTAAAAT
CCGCACAGTGGAACTTGATGGGAAGACTATAAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGACAAGAACGTTTTAGAACAATAACCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCACGGCA
TTATTGTTGTTTATGATGTCACAGACCAAGACAGTTTCAATAATGTTAAGCAGTGGTTAAATGAAATTGATCGTTATGCAAGTGAAAACGTGAACAAGCTTCTTGTGGGC
AACAAGTCTGACCTGACAGCAAACAAAGTCGTTTCCTATGAGACAGCGAAGGCGTTTGCGGATGAAATTGGGATTCCCTTTATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAA
CGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCAACTCAACCGATGAACAATGCACGGCCGCCAACTGTGCAAATTCGAGGACAGCCTGTGA
ACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCATCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAAAATCGTAAATCAGCGGATAACACGTGGCAACATCCAAAAGGCTGTCCTACGTCATCACGGAACTCCCATTTTCAAATTTATTGCCGTGCAGATTTCTAGGTTCTTC
AGAAAACGCAAATACAAATCATTCTTCTCCTTCTTTTCCTTTTACCTTCATTCAACAATTCCGTCTTCTCCGGCGAATTCCTCCGCATTCCGATCAAATCTCGCCGGCAA
AAGTTACGTCTCTCCAGCACCGTAAGGAATTCTCCTTGACTCCATCGATCTCCACCGCTTATCGCCATGACGCCTGAATATGATTATTTGTTTAAGCTCCTGCTTATTGG
AGATTCTGGTGTTGGAAAATCATGTCTCCTTCTGAGGTTTGCGGATTTACTTTCTTTTTCTATTTTCTTGCTCAACAGGATGATTCATATTTGGATAGCTACATTAGCAC
CATCGGGGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTGGAACTTGATGGGAAGACTATAAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGACAAGAACGTTTTAGAACAATAACCAGCAGCT
ACTACCGTGGTGCTCACGGCATTATTGTTGTTTATGATGTCACAGACCAAGACAGTTTCAATAATGTTAAGCAGTGGTTAAATGAAATTGATCGTTATGCAAGTGAAAAC
GTGAACAAGCTTCTTGTGGGCAACAAGTCTGACCTGACAGCAAACAAAGTCGTTTCCTATGAGACAGCGAAGGCGTTTGCGGATGAAATTGGGATTCCCTTTATGGAAAC
AAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCAACTCAACCGATGAACAATGCACGGCCGCCAACTGTGC
AAATTCGAGGACAGCCTGTGAACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCATCTTGAAGAAAAAAGGGAGATCTCTATGATTAGAACTGTACCGTAATACCCAGCCTCCCTGCATCT
AGATGTCCATTCAACCAGCGGGGACCTGTCCCGTGAGAAATTCCCGATTAGACGGGGAATGGGGGAGGGAGCGGGGAGACTTGATTCCCCATTCCCGACCCCGCCTCGCT
TCAATCATATATATATATTATTTAAAATTGAAGATTTAAATATGTTGTAATATTTAAAAATTTTAATTTTGAGAAATTATGGTAATTAAACACTTTAATTATATCCTCTA
CGCATTAAATATTATTGTTTTTAGCTACAAATTTCATAACGTTTTATTTAACTAAAAATTGTATTGTAAATTACCCATTGGATATAGAAAATTTTGAAAATTTTATTTGG
ATGAAAATAAATTAAAACAAGTTGTTAAAAAATGAATAAATTGGAAAAAAAAAATCAAAAGGAGAATTTTTTTCAGCGGGGAACTCGATCCCTGAGAAATCCCCGTGGGG
ATGGGAATTAAAATAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPSEVCGFTFFFYFLAQQDDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRYASENVNKLLVG
NKSDLTANKVVSYETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS