; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi07G012790 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi07G012790
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT4
Genome locationchr07:18633125..18635584
RNA-Seq ExpressionLsi07G012790
SyntenyLsi07G012790
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR006712 - HD-ZIP protein, N-terminal
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577673.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-13693.21Show/hide
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XP_023552456.1 homeobox-leucine zipper protein HAT4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.9e-13492.2Show/hide
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XP_038906160.1 homeobox-leucine zipper protein HAT4 [Benincasa hispida]8.7e-14597.85Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6T6 Homeobox domain-containing protein4.2e-12990Show/hide
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A0A1S3BJZ9 homeobox-leucine zipper protein HAT42.9e-13091.4Show/hide
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A0A5D3CLM5 Homeobox-leucine zipper protein HAT42.9e-13091.4Show/hide
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A0A6J1E9Y0 homeobox-leucine zipper protein HAT41.1e-13492.86Show/hide
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A0A6J1HKW5 homeobox-leucine zipper protein HAT4-like1.4e-13291.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46600 Homeobox-leucine zipper protein HAT12.0e-7258.14Show/hide
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        E+LKRC E LTEENRRL+KE  ELRALKLSP+ Y  M+PPTTL MCPSCERVA P S++               H+ R + ++PW        F+ + PR
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        S
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P46601 Homeobox-leucine zipper protein HAT23.7e-7459.48Show/hide
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        MM GK+D LGLSL L F  +H  LQ+NL P+S          WN   + D TS+     LR IDVN  P  ST +CEE+  +SSPNST+SS +SGKRSER
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        E        +G+D D    DR  SRG SDEE+  GETSRKKLRL+KDQSA LEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+L L  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
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        CE+LKRC E LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P S++               H+ RP+ INPW +          F 
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        AL PRS
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P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT31.8e-6855.38Show/hide
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        M+ +DD LGLSL LS   +      +LN MP                         ++W N   S   +   RS LRGIDVNR P +   D E+E A +S
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        SPNSTVSSV SGK+SERE+            ED + +RA CS  G SD+EDG     ++SRKKLRL+K+Q+ VLEE+FKEH+TLNPKQK+ALAKQL LR 
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        RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCCENLT+ENRRLQKEV ELRALKLSP  YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  S+S+         A P  + +
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         P+  ++PWA A+P R
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P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-47.5e-6753.92Show/hide
Query:  MAGKDDNLGLSLGLSFDSH---HLQLNLMP-----------------------------------SSWNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-STA
        M  +DD LGLSL L         L+LNLMP                                   SS    T+++R S+ G S LRG +VNR   S +  
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Query:  DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CSR----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGL
        D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CSR    G SD+ED   G+ SRKKLRL+KDQ+ VLEE+FKEH+TLNPKQKLALAKQL L
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        R RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCC+NLTEENRRLQKEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+         PST+  PTV  +G
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Query:  QAQPQAHHARPIHINPWAS
        +  PQ        + PW +
Subjt:  QAQPQAHHARPIHINPWAS

Q05466 Homeobox-leucine zipper protein HAT41.4e-8162.13Show/hide
Query:  MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHHLQLNLMP----------------SSWNND-----TSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS
        MM  KDD LGLSLGL+F    + L   P                SSWN        +SD + +  R+ +RGIDVNR PPS+    +E+A +SSPNSTVSS
Subjt:  MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHHLQLNLMP----------------SSWNND-----TSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS

Query:  VSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL
         +GKRSERE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL
Subjt:  VSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL

Query:  KRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAI---PARPFNALHPR
        +RCCENLTEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP    QP      QA   AHH R + +N WA A        F+AL PR
Subjt:  KRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAI---PARPFNALHPR

Query:  S
        S
Subjt:  S

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 45.4e-6853.92Show/hide
Query:  MAGKDDNLGLSLGLSFDSH---HLQLNLMP-----------------------------------SSWNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-STA
        M  +DD LGLSL L         L+LNLMP                                   SS    T+++R S+ G S LRG +VNR   S +  
Subjt:  MAGKDDNLGLSLGLSFDSH---HLQLNLMP-----------------------------------SSWNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-STA

Query:  DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CSR----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGL
        D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CSR    G SD+ED   G+ SRKKLRL+KDQ+ VLEE+FKEH+TLNPKQKLALAKQL L
Subjt:  DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CSR----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGL

Query:  RPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVA-------VPPSTSAQPTVTRMG
        R RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCC+NLTEENRRLQKEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+         PST+  PTV  +G
Subjt:  RPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVA-------VPPSTSAQPTVTRMG

Query:  QAQPQAHHARPIHINPWAS
        +  PQ        + PW +
Subjt:  QAQPQAHHARPIHINPWAS

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 31.3e-6955.38Show/hide
Query:  MAGKDDNLGLSLGLSFDSHH----LQLNLMP-------------------------SSWNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEE-AAMS
        M+ +DD LGLSL LS   +      +LN MP                         ++W N   S   +   RS LRGIDVNR P +   D E+E A +S
Subjt:  MAGKDDNLGLSLGLSFDSHH----LQLNLMP-------------------------SSWNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEE-AAMS

Query:  SPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGISDEEDG-----ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRP
        SPNSTVSSV SGK+SERE+            ED + +RA CS  G SD+EDG     ++SRKKLRL+K+Q+ VLEE+FKEH+TLNPKQK+ALAKQL LR 
Subjt:  SPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGISDEEDG-----ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRP

Query:  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHA
        RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCCENLT+ENRRLQKEV ELRALKLSP  YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  S+S+         A P  + +
Subjt:  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHA

Query:  RPI-HINPWASAIPAR
         P+  ++PWA A+P R
Subjt:  RPI-HINPWASAIPAR

AT4G16780.1 homeobox protein 21.0e-8262.13Show/hide
Query:  MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHHLQLNLMP----------------SSWNND-----TSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS
        MM  KDD LGLSLGL+F    + L   P                SSWN        +SD + +  R+ +RGIDVNR PPS+    +E+A +SSPNSTVSS
Subjt:  MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHHLQLNLMP----------------SSWNND-----TSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS

Query:  VSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL
         +GKRSERE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL
Subjt:  VSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL

Query:  KRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAI---PARPFNALHPR
        +RCCENLTEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP    QP      QA   AHH R + +N WA A        F+AL PR
Subjt:  KRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAI---PARPFNALHPR

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT4G17460.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein1.5e-7358.14Show/hide
Query:  MMAGKDDNLGLSLGLSF-DSHHLQLNLMPSS----------WNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SE
        MM GK+D LGLSL L F  +H LQLNL P+S          W N T    + +  +  LR IDVN +P  +T D EEE  +SSPNST+SS VSGKR  +E
Subjt:  MMAGKDDNLGLSLGLSF-DSHHLQLNLMPSS----------WNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SE

Query:  REMN-----GEDLD--GDRACSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDC
        RE       G+DLD   DR+ SRG SDEE+   GET RKKLRL+KDQSAVLE++FKEHNTLNPKQKLALAK+LGL  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDC
Subjt:  REMN-----GEDLD--GDRACSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDC

Query:  EFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAIPARPFNALHPR
        E+LKRC E LTEENRRL+KE  ELRALKLSP+ Y  M+PPTTL MCPSCERVA P S++               H+ R + ++PW        F+ + PR
Subjt:  EFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAIPARPFNALHPR

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT5G47370.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein2.6e-7559.48Show/hide
Query:  MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHH--LQLNLMPSS----------WNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSER
        MM GK+D LGLSL L F  +H  LQ+NL P+S          WN   + D TS+     LR IDVN  P  ST +CEE+  +SSPNST+SS +SGKRSER
Subjt:  MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHH--LQLNLMPSS----------WNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSER

Query:  E-------MNGEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
        E        +G+D D    DR  SRG SDEE+  GETSRKKLRL+KDQSA LEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+L L  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  E-------MNGEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWAS----AIPARPFN
        CE+LKRC E LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P S++               H+ RP+ INPW +          F 
Subjt:  CEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWAS----AIPARPFN

Query:  ALHPRS
        AL PRS
Subjt:  ALHPRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGCTGGGAAAGATGATAATCTTGGTTTAAGCCTTGGATTGAGCTTTGATTCTCATCATTTACAGCTCAATCTCATGCCTTCTTCTTGGAATAACGATACTTCTTC
AGATCGGACATCGGAAACAGGGCGATCGCTTCTCCGAGGCATCGATGTGAACAGGATGCCGCCGTCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGGCGATGTCGAGTCCTA
ACAGTACGGTTTCGAGTGTGAGTGGGAAACGGAGTGAACGAGAGATGAACGGCGAAGATCTGGACGGCGATAGAGCTTGTTCTAGAGGAATTAGTGATGAAGAAGACGGT
GAAACTTCTAGAAAAAAACTTCGCCTCACTAAAGATCAGTCCGCCGTCTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACACAACACTCTCAATCCTAAGCAAAAGTTAGCGTTGGCGAA
ACAATTGGGTTTACGGCCGAGACAAGTCGAAGTCTGGTTCCAAAACAGAAGGGCAAGGACAAAATTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAGTTTCTAAAGAGATGTTGTG
AGAATCTAACGGAGGAGAATAGGCGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTGAAACTTTCCCCACAGTTCTACATGCACATGACCCCACCTACCACTCTCACC
ATGTGCCCTTCATGTGAGCGAGTCGCGGTCCCACCCTCCACGTCAGCCCAACCTACAGTCACACGAATGGGCCAAGCCCAACCTCAGGCCCACCACGCTCGGCCCATCCA
CATCAACCCATGGGCCTCCGCTATCCCCGCCCGGCCCTTCAACGCCCTCCACCCTCGCTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGAAGAAGCAAAAGTGATGATTGGGGATAATTGGAGGGCCTTTCTTCTGACACTCTTTCACTTGTTTCCTTTCATCATTAATTTTGAGAAAACAAATTCCCCATTTCCTT
TTTTTTTTCTTTTTTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTATATAATCCTCTTTTCTCCCCTTCTACTTGGACCACAACTCCTCAACCTTCTTCTTCTTTCTCTCTACAAACT
CAAGAAATTTTCAGAGATCAAAAACTATGATGGCTGGGAAAGATGATAATCTTGGTTTAAGCCTTGGATTGAGCTTTGATTCTCATCATTTACAGCTCAATCTCATGCCT
TCTTCTTGGAATAACGATACTTCTTCAGATCGGACATCGGAAACAGGGCGATCGCTTCTCCGAGGCATCGATGTGAACAGGATGCCGCCGTCGTCGACGGCGGATTGTGA
AGAGGAGGCGGCGATGTCGAGTCCTAACAGTACGGTTTCGAGTGTGAGTGGGAAACGGAGTGAACGAGAGATGAACGGCGAAGATCTGGACGGCGATAGAGCTTGTTCTA
GAGGAATTAGTGATGAAGAAGACGGTGAAACTTCTAGAAAAAAACTTCGCCTCACTAAAGATCAGTCCGCCGTCTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACACAACACTCTCAAT
CCTAAGCAAAAGTTAGCGTTGGCGAAACAATTGGGTTTACGGCCGAGACAAGTCGAAGTCTGGTTCCAAAACAGAAGGGCAAGGACAAAATTGAAGCAAACGGAAGTAGA
TTGCGAGTTTCTAAAGAGATGTTGTGAGAATCTAACGGAGGAGAATAGGCGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTGAAACTTTCCCCACAGTTCTACATGC
ACATGACCCCACCTACCACTCTCACCATGTGCCCTTCATGTGAGCGAGTCGCGGTCCCACCCTCCACGTCAGCCCAACCTACAGTCACACGAATGGGCCAAGCCCAACCT
CAGGCCCACCACGCTCGGCCCATCCACATCAACCCATGGGCCTCCGCTATCCCCGCCCGGCCCTTCAACGCCCTCCACCCTCGCTCGTAAATACCCCTCCGCCCTCCTCC
ACCGACGAGGGCAACTCCATCTTTTCGCTACGTTAGGATCCGGTTGTTGGGCCGGGATTTGGTGGGCCTCTGTGTTTTGTAATGTTCGGCCCATCTTGTCATAATTAGGG
TTTGGAGTAGTTTATTTGTCTTAGCGGCAAGCAAATACCCTTTTTTTTCTTTTCTTTGTAATATTTTAGGGAAAATGAAGTGGGAAAAAAAATTATATATTATATATATA
TATGGTTGGAAGGTGATAGAAAAAAGGGGTTTTGAGTTGTAAAGTGAACAATGAGATGCCTAATTTTATTTTATTTTTTTTCAAATTTAAACTAATCTTAAATTTAATTC
ATTATTATACTCTCATTTCATTAATTATGATTGATTCTACAATGTTATATTATAAAAAAAAAATGGGTATCATGTTTTACATCATTAATTTCAAGTTTGGGAAAAAACCC
TAAAAAATTATGTTCGAACTTTCATCTCCTATCGAACTATTTACATAATCATAAAAGTGGTTTCAGATTAATTTTACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMAGKDDNLGLSLGLSFDSHHLQLNLMPSSWNNDTSSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSSTADCEEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDG
ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLT
MCPSCERVAVPPSTSAQPTVTRMGQAQPQAHHARPIHINPWASAIPARPFNALHPRS