; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G000050 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G000050
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Descriptionprotein FAM133-like isoform X1
Genome locationchr08:165364..171894
RNA-Seq ExpressionLsi08G000050
SyntenyLsi08G000050
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601610.1 hypothetical protein SDJN03_06843, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-5063.44Show/hide
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XP_008459690.1 PREDICTED: protein FAM133 isoform X1 [Cucumis melo]1.2e-4871.34Show/hide
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XP_022945862.1 protein FAM133-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.9e-4964.88Show/hide
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XP_023542895.1 protein FAM133-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-5065.48Show/hide
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        A  FLAW Y+KMGKNQAYKAMQKARLGS+S+ GPAE+EDGMVDGSFHSP WHAARLASLNTSHTITWEEYK+KQK                         
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                EDELKKGE+EADTDRMMKEYRAQLDAERARKLAHGRNRS SK+GHEK+++ ++ +++ +K
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XP_038889692.1 corepressor interacting with RBPJ 1-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.3e-4972.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWA3 Uncharacterized protein6.8e-5370.48Show/hide
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A0A1S3CAA6 protein FAM133 isoform X21.1e-4776.39Show/hide
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A0A1S3CBZ8 protein FAM133 isoform X16.0e-4971.34Show/hide
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A0A6J1DCJ7 protein FAM133B-like1.9e-4769.43Show/hide
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A0A6J1G233 protein FAM133-like isoform X19.2e-5064.88Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G43795.1 unknown protein1.6e-2246.62Show/hide
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        +DGSFHSP WHAARLASL T+HT+TWEEYK+KQK                                 E+ELKK E+EADTD++M+EYRAQLDAERA KL+
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AT2G43795.2 unknown protein3.3e-2350.81Show/hide
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         GRN SS  S+ G  +  +I+ AE
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AT3G59800.1 unknown protein5.2e-3756.05Show/hide
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        MGKNQAYKAMQ++R+GSSS+  P E+EDGMVDGSFH+P WHAARLASL T+HTITWEEYK+KQK                                 E+E
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        LKKGELEADTD++M+EYRAQLDAER+ KL+ GRN SS K+  +K+ R  ++++KK K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAGGCAGCGGGTTCGGATTTGGGAAATAGGGAAGGTTGTGCTGCCGATGGTCACTGTGATTGTGTGGCTGAATAGTTTTGAGGTGGGGATTATAATGAGAGTTGA
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GTACAATTGGGAACATACTAGGATTGTACACGCTATCCATGACTGAAGATGAGTTGAAAAAGGGGGAGCTGGAAGCAGATACGGATAGAATGATGAAAGAATATAGAGCA
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AATCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AATCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QLDAERARKLAHGRNRSSSKTGHEKEQRIKEAEQKKEKGADIVKLLLYPDSAILRFDNACSFELKNVKLDGPRKS