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Lsi08G002290 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G002290
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRrna intron-encoded homing endonuclease
Genome locationchr08:5128978..5129467
RNA-Seq ExpressionLsi08G002290
SyntenyLsi08G002290
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG8365712.1 hypothetical protein BUALT_Bualt17G0000400 [Buddleja alternifolia]1.6e-48100Show/hide
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PPR87549.1 hypothetical protein GOBAR_AA33147 [Gossypium barbadense]3.9e-4797.98Show/hide
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TKY45627.1 hypothetical protein E2542_SST30377 [Spatholobus suberectus]8.7e-4796.97Show/hide
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TXG51768.1 hypothetical protein EZV62_024292 [Acer yangbiense]1.3e-4798.99Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0R0GQW8 Uncharacterized protein1.0e-4594.95Show/hide
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A0A2P5W8Y1 Uncharacterized protein1.9e-4797.98Show/hide
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A0A4U5PNX9 Uncharacterized protein1.1e-4483.76Show/hide
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A0A5C7H450 Uncharacterized protein6.5e-4898.99Show/hide
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A0A6A5LDC5 Uncharacterized protein2.1e-4695.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAACTAGCTATGCGGAGATCATTGCAAT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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