; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Lsi08G002830 (gene) of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1 genome

Gene IDLsi08G002830
OrganismLagenaria siceraria USVL1VR-Ls (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-18
Genome locationchr08:7122120..7127750
RNA-Seq ExpressionLsi08G002830
SyntenyLsi08G002830
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607690.1 Ras-related protein RABC1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-11698.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        P+ NASAGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

XP_011657438.1 ras-related protein RABC1 isoform X1 [Cucumis sativus]6.5e-11698.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        PE+  SAGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

XP_016900129.1 PREDICTED: ras-related protein RABC1 isoform X1 [Cucumis melo]1.4e-11598.12Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        PE+  +AGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

XP_022153719.1 ras-related protein RABC1-like [Momordica charantia]6.5e-11698.12Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEID+YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        P++NAS GGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

XP_022926286.1 ras-related protein RABC1-like [Cucurbita moschata]3.8e-11698.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        P+ NASAGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KH59 Uncharacterized protein3.1e-11698.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        PE+  SAGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

A0A5A7V1Q4 Ras-related protein RABC1 isoform X17.0e-11698.12Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        PE+  +AGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

A0A6J1DJX3 ras-related protein RABC1-like3.1e-11698.12Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEID+YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        P++NAS GGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

A0A6J1EEF0 ras-related protein RABC1-like1.8e-11698.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        P+ NASAGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

A0A6J1IUG0 ras-related protein RABC1-like1.8e-11698.59Show/hide
Query:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
        MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE+LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE
Subjt:  MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
        TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP
Subjt:  TFTNLSDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKP

Query:  PESNASAGGCCSY
        P+ NASAGGCCSY
Subjt:  PESNASAGGCCSY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC12.6e-9984.62Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P + ++
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN

Query:  ASAGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASAGGCCS

O49841 Ras-related protein RABC2a1.8e-8471.01Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LL+ F S S EDL+PTIGVDFKIK +TVGGK+LKL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII+VYDVTRRETFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA
         D+W KEI+LYSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP     
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA

Query:  SAGGCCS
        +  GCCS
Subjt:  SAGGCCS

P36862 GTP-binding protein yptV31.2e-5963.13Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFED-LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAK
        DY FK+LL+GDSGVGKS +L RFTS  FE+  + TIGVDFK+K++T  GK+ KL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII VYDVTRR+TF +L   W +
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFED-LSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAK

Query:  EIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG
        E D+YST +  IKM+V NKVD  ++R VS +EG DFAR +GCLF+E SA+  + V Q F+EL+LKILDTP LL   + G
Subjt:  EIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTG

Q5ZLG1 Ras-related protein Rab-187.8e-5656.35Show/hide
Query:  KLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE-DLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAKEIDL
        K+L+IG+SGVGKS+LLLRFT D+F+ +L+ TIGVDFK+K ++V G K KLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQG+I+VYDVTRR+TF  L D W  E++ 
Subjt:  KLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFE-DLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWAKEIDL

Query:  YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNASAGGCCS
        Y T  D +KMLVGNK+DKE+ R V + EG+ FAR++  LF+E SAKT   V+  F+ELV KI+ TP L    S      +  ++      + GG CS
Subjt:  YSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNASAGGCCS

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b2.0e-7566.67Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA
        +DIWAKEI+LYSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P+  A
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA

Query:  SAGGCCS
          G CCS
Subjt:  SAGGCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B181.8e-10084.62Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P + ++
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN

Query:  ASAGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASAGGCCS

AT1G43890.2 RAB GTPASE HOMOLOG B181.8e-10084.62Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P + ++
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN

Query:  ASAGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASAGGCCS

AT1G43890.3 RAB GTPASE HOMOLOG B181.8e-10084.62Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS QPEFDYLFK+LLIGDSGVGKS+LLL FTS++F+DLSPTIGVDFK+K++T+G KKLKLAIWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGIIMVYDVTRR+TFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN
        SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESER VSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCF+ELVLKIL+TPSL A+GS+G KKNIFK+ P + ++
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPE-SN

Query:  ASAGGCCS
         S+  CCS
Subjt:  ASAGGCCS

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B1.4e-7666.67Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LLL F S S EDL+PTIGVDFKIK + V GK+LKL IWDTAGQE+FRTLT SY+RG+QGII+VYDVT+RETF NL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA
        +DIWAKEI+LYSTN DCIKMLVGNKVD+ESER VS++EG+  A++  CLF ECSA+TR NV  CF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+       P+  A
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA

Query:  SAGGCCS
          G CCS
Subjt:  SAGGCCS

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A1.3e-8571.01Show/hide
Query:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL
        SS Q  +D  FK+LLIGDSGVGKS+LL+ F S S EDL+PTIGVDFKIK +TVGGK+LKL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQGII+VYDVTRRETFTNL
Subjt:  SSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNL

Query:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA
         D+W KEI+LYSTNQ+C++MLVGNKVD+ESER VS++EGI  A+E  C+FLECSA+TR NVEQCF+EL LKI++ PSLL +GS+ +K+NI K+KP     
Subjt:  SDIWAKEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNA

Query:  SAGGCCS
        +  GCCS
Subjt:  SAGGCCS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCCGCACCGTCTTCGAGTCAACCGGAGTTTGATTACTTGTTTAAGTTGCTGTTGATCGGGGACTCTGGTGTAGGGAAGAGTACTCTTCTTTTGCGCTTCACTTC
CGATTCCTTTGAGGATCTTTCTCCCACTATTGGTGTGGATTTCAAGATTAAGCATGTTACAGTTGGGGGCAAGAAGTTGAAGCTTGCAATATGGGACACAGCTGGGCAGG
AGAGGTTTCGGACGCTAACAGGTTCATATTACAGAGGAGCTCAAGGAATCATTATGGTGTATGATGTGACCCGGCGAGAGACATTCACAAATCTGTCTGACATATGGGCT
AAAGAAATTGATCTGTACTCAACAAATCAGGATTGCATTAAGATGCTCGTCGGAAACAAAGTGGATAAGGAAAGTGAACGGGTAGTCAGTAAAAAAGAGGGAATTGACTT
TGCTCGAGAATATGGATGCCTATTTCTCGAATGCAGTGCGAAAACTCGGGTCAATGTGGAGCAATGCTTTGATGAGCTTGTGTTGAAGATATTGGACACGCCCAGTCTTT
TGGCTGATGGTTCAACAGGTTTAAAAAAGAATATCTTCAAAGAGAAACCTCCCGAATCGAATGCATCGGCCGGTGGCTGCTGCTCATATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAAGAAAGGAATCAATCGGTGAGAAAGCAACCAAATTTTCAATTCAGAGTGAAGAATAATTTCAAAGCTTTTTCCAATCTCTCTCTCTCTACTCATACTCATACTCAT
ACTCAGTACTTGCTGTGTTTCTAATGTCTTCCGCACCGTCTTCGAGTCAACCGGAGTTTGATTACTTGTTTAAGTTGCTGTTGATCGGGGACTCTGGTGTAGGGAAGAGT
ACTCTTCTTTTGCGCTTCACTTCCGATTCCTTTGAGGATCTTTCTCCCACTATTGGTGTGGATTTCAAGATTAAGCATGTTACAGTTGGGGGCAAGAAGTTGAAGCTTGC
AATATGGGACACAGCTGGGCAGGAGAGGTTTCGGACGCTAACAGGTTCATATTACAGAGGAGCTCAAGGAATCATTATGGTGTATGATGTGACCCGGCGAGAGACATTCA
CAAATCTGTCTGACATATGGGCTAAAGAAATTGATCTGTACTCAACAAATCAGGATTGCATTAAGATGCTCGTCGGAAACAAAGTGGATAAGGAAAGTGAACGGGTAGTC
AGTAAAAAAGAGGGAATTGACTTTGCTCGAGAATATGGATGCCTATTTCTCGAATGCAGTGCGAAAACTCGGGTCAATGTGGAGCAATGCTTTGATGAGCTTGTGTTGAA
GATATTGGACACGCCCAGTCTTTTGGCTGATGGTTCAACAGGTTTAAAAAAGAATATCTTCAAAGAGAAACCTCCCGAATCGAATGCATCGGCCGGTGGCTGCTGCTCAT
ATTGATTATATACTAAAAATTGAAGGAGCATTCTCATTTTGTTTTAGGCTACTCGTTCCACAGTTATTCCATTTCAGCACACACCCTGAAGTCAAAAGGTTTATGTTCAA
TTTTTCCTTTATGGATTTTTAGTTCATTCAACTAAAATGTCTGCCAGACAGTAAGTTCCTTGCATTCTTTTAGTCTTTGTCACTAGCATCACGATTAATTGATCTTTTCT
GGCGTGAATTTGATTTACCATGAACTTTCCGACTATCCCTCTCTCGTTAACTATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSAPSSSQPEFDYLFKLLLIGDSGVGKSTLLLRFTSDSFEDLSPTIGVDFKIKHVTVGGKKLKLAIWDTAGQERFRTLTGSYYRGAQGIIMVYDVTRRETFTNLSDIWA
KEIDLYSTNQDCIKMLVGNKVDKESERVVSKKEGIDFAREYGCLFLECSAKTRVNVEQCFDELVLKILDTPSLLADGSTGLKKNIFKEKPPESNASAGGCCSY